MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis B/Jali20/OT chromosome

Total Repeats: 20108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_012686	TA	3	6	317210	317215	50 %	50 %	0 %	0 %	237802706
6003	NC_012686	A	6	6	317330	317335	100 %	0 %	0 %	0 %	237802706
6004	NC_012686	AAG	2	6	317344	317349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802706
6005	NC_012686	TTTG	2	8	317413	317420	0 %	75 %	25 %	0 %	237802706
6006	NC_012686	AAAC	2	8	317462	317469	75 %	0 %	0 %	25 %	237802706
6007	NC_012686	CTT	2	6	317494	317499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802706
6008	NC_012686	A	6	6	317512	317517	100 %	0 %	0 %	0 %	237802706
6009	NC_012686	AAT	2	6	317759	317764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802707
6010	NC_012686	TCA	2	6	317794	317799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802707
6011	NC_012686	TAC	2	6	317838	317843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802707
6012	NC_012686	CTT	2	6	317861	317866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802707
6013	NC_012686	AATC	2	8	317870	317877	50 %	25 %	0 %	25 %	237802707
6014	NC_012686	CTT	2	6	317910	317915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802707
6015	NC_012686	ATC	2	6	317949	317954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802707
6016	NC_012686	TAAT	2	8	318091	318098	50 %	50 %	0 %	0 %	237802707
6017	NC_012686	AGCA	2	8	318188	318195	50 %	0 %	25 %	25 %	237802707
6018	NC_012686	AT	3	6	318210	318215	50 %	50 %	0 %	0 %	237802707
6019	NC_012686	A	6	6	318231	318236	100 %	0 %	0 %	0 %	237802707
6020	NC_012686	TTC	2	6	318288	318293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802707
6021	NC_012686	TCCGG	2	10	318316	318325	0 %	20 %	40 %	40 %	237802707
6022	NC_012686	GATT	2	8	318422	318429	25 %	50 %	25 %	0 %	237802707
6023	NC_012686	ATC	2	6	318447	318452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802707
6024	NC_012686	T	6	6	318456	318461	0 %	100 %	0 %	0 %	237802707
6025	NC_012686	TTC	2	6	318540	318545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802707
6026	NC_012686	CTC	2	6	318593	318598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237802707
6027	NC_012686	CAA	2	6	318701	318706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802707
6028	NC_012686	TTC	2	6	318823	318828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802707
6029	NC_012686	ATC	2	6	318837	318842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802707
6030	NC_012686	CTT	2	6	318887	318892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802707
6031	NC_012686	GCT	2	6	318899	318904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802707
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6033	NC_012686	TC	3	6	318932	318937	0 %	50 %	0 %	50 %	237802707
6034	NC_012686	ACT	2	6	318978	318983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802707
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6037	NC_012686	ACA	2	6	319096	319101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802707
6038	NC_012686	TACAAA	2	12	319107	319118	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	237802707
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6040	NC_012686	TTA	2	6	319148	319153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802708
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6043	NC_012686	A	6	6	319248	319253	100 %	0 %	0 %	0 %	237802708
6044	NC_012686	CTC	2	6	319390	319395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237802708
6045	NC_012686	CGT	2	6	319420	319425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802708
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6048	NC_012686	TCCAA	2	10	319503	319512	40 %	20 %	0 %	40 %	237802708
6049	NC_012686	ATTG	2	8	319520	319527	25 %	50 %	25 %	0 %	237802708
6050	NC_012686	TAT	2	6	319627	319632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802708
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6052	NC_012686	GAC	2	6	319657	319662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802708
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6054	NC_012686	TAA	2	6	319717	319722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802708
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6058	NC_012686	GAA	2	6	320389	320394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802709
6059	NC_012686	GAA	2	6	320414	320419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802709
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6062	NC_012686	ATTTA	2	10	320569	320578	40 %	60 %	0 %	0 %	237802709
6063	NC_012686	C	7	7	320584	320590	0 %	0 %	0 %	100 %	237802709
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6123	NC_012686	GAT	2	6	322943	322948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802710
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6238	NC_012686	CT	3	6	328433	328438	0 %	50 %	0 %	50 %	237802715
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6242	NC_012686	A	6	6	328690	328695	100 %	0 %	0 %	0 %	237802716
6243	NC_012686	GTT	2	6	328714	328719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802716
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6494	NC_012686	GA	3	6	340951	340956	50 %	0 %	50 %	0 %	237802725
6495	NC_012686	ATA	2	6	341053	341058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802725
6496	NC_012686	TC	3	6	341114	341119	0 %	50 %	0 %	50 %	237802725
6497	NC_012686	ATC	2	6	341175	341180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802725
6498	NC_012686	AAT	2	6	341247	341252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802725
6499	NC_012686	GTA	2	6	341418	341423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802725
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