MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis B/Jali20/OT chromosome

Total Repeats: 20108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012686	CTT	2	6	292488	292493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802681
5502	NC_012686	AGT	2	6	292526	292531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802681
5503	NC_012686	CTT	2	6	292635	292640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802681
5504	NC_012686	AAC	2	6	292657	292662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802681
5505	NC_012686	AAGT	2	8	292685	292692	50 %	25 %	25 %	0 %	237802681
5506	NC_012686	TGCT	2	8	292705	292712	0 %	50 %	25 %	25 %	237802681
5507	NC_012686	CTG	2	6	292728	292733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802681
5508	NC_012686	TAA	2	6	292752	292757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802681
5509	NC_012686	T	6	6	292885	292890	0 %	100 %	0 %	0 %	237802681
5510	NC_012686	TTTC	2	8	292894	292901	0 %	75 %	0 %	25 %	237802681
5511	NC_012686	TA	3	6	293012	293017	50 %	50 %	0 %	0 %	237802681
5512	NC_012686	CTT	2	6	293108	293113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802682
5513	NC_012686	AGT	2	6	293118	293123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802682
5514	NC_012686	AT	3	6	293135	293140	50 %	50 %	0 %	0 %	237802682
5515	NC_012686	A	6	6	293186	293191	100 %	0 %	0 %	0 %	237802682
5516	NC_012686	TCT	2	6	293200	293205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802682
5517	NC_012686	TC	3	6	293219	293224	0 %	50 %	0 %	50 %	237802682
5518	NC_012686	GAC	2	6	293246	293251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802682
5519	NC_012686	TTCC	2	8	293275	293282	0 %	50 %	0 %	50 %	237802682
5520	NC_012686	AGT	2	6	293454	293459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802682
5521	NC_012686	TAA	2	6	293505	293510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802682
5522	NC_012686	AAG	2	6	293624	293629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802682
5523	NC_012686	GCAATG	2	12	293665	293676	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	237802682
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5525	NC_012686	CTAA	2	8	293722	293729	50 %	25 %	0 %	25 %	237802682
5526	NC_012686	CAA	2	6	293765	293770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802682
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5529	NC_012686	CTT	2	6	294160	294165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802683
5530	NC_012686	CT	3	6	294223	294228	0 %	50 %	0 %	50 %	237802683
5531	NC_012686	CAG	2	6	294291	294296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802683
5532	NC_012686	CGACAT	2	12	294341	294352	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	237802683
5533	NC_012686	ATT	2	6	294384	294389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802683
5534	NC_012686	TAC	2	6	294439	294444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802683
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5536	NC_012686	AGCA	2	8	294541	294548	50 %	0 %	25 %	25 %	237802683
5537	NC_012686	T	6	6	294609	294614	0 %	100 %	0 %	0 %	237802684
5538	NC_012686	AGAT	2	8	294639	294646	50 %	25 %	25 %	0 %	237802684
5539	NC_012686	AGCT	2	8	294663	294670	25 %	25 %	25 %	25 %	237802684
5540	NC_012686	CGAG	2	8	294687	294694	25 %	0 %	50 %	25 %	237802684
5541	NC_012686	CTG	2	6	294732	294737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802684
5542	NC_012686	ATA	2	6	294834	294839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802684
5543	NC_012686	A	7	7	294952	294958	100 %	0 %	0 %	0 %	237802684
5544	NC_012686	GAA	2	6	295016	295021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802684
5545	NC_012686	CTA	2	6	295115	295120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802684
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5549	NC_012686	TCTT	2	8	295345	295352	0 %	75 %	0 %	25 %	237802685
5550	NC_012686	TCT	2	6	295405	295410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802685
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5552	NC_012686	TTAA	2	8	295444	295451	50 %	50 %	0 %	0 %	237802685
5553	NC_012686	ATG	2	6	295490	295495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802685
5554	NC_012686	ACT	2	6	295510	295515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802685
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5557	NC_012686	TCT	2	6	295622	295627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802685
5558	NC_012686	TTCT	2	8	295679	295686	0 %	75 %	0 %	25 %	237802685
5559	NC_012686	TGG	2	6	295698	295703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237802685
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5563	NC_012686	CCCTTA	2	12	295795	295806	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	237802685
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5565	NC_012686	A	7	7	295881	295887	100 %	0 %	0 %	0 %	237802685
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5570	NC_012686	CT	4	8	296105	296112	0 %	50 %	0 %	50 %	237802686
5571	NC_012686	TAA	2	6	296128	296133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802686
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5579	NC_012686	TAG	2	6	296496	296501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802686
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5594	NC_012686	CTT	3	9	297093	297101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802687
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5606	NC_012686	CAAAG	2	10	297637	297646	60 %	0 %	20 %	20 %	237802687
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5613	NC_012686	AAAATA	2	12	297893	297904	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	237802687
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5620	NC_012686	A	6	6	298180	298185	100 %	0 %	0 %	0 %	237802687
5621	NC_012686	GTT	2	6	298190	298195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802687
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