MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ

Total Repeats: 6687

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012654	ATG	2	6	62007	62012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587322
1502	NC_012654	AAT	2	6	62036	62041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587322
1503	NC_012654	GAT	2	6	62125	62130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587322
1504	NC_012654	ATAAAT	2	12	62150	62161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587323
1505	NC_012654	TA	3	6	62172	62177	50 %	50 %	0 %	0 %	229587323
1506	NC_012654	AAAGA	2	10	62231	62240	80 %	0 %	20 %	0 %	229587323
1507	NC_012654	TA	3	6	62263	62268	50 %	50 %	0 %	0 %	229587323
1508	NC_012654	ACTA	2	8	62278	62285	50 %	25 %	0 %	25 %	229587323
1509	NC_012654	TAT	2	6	62303	62308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587323
1510	NC_012654	ATGT	2	8	62352	62359	25 %	50 %	25 %	0 %	229587323
1511	NC_012654	AGA	2	6	62407	62412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587323
1512	NC_012654	T	6	6	62491	62496	0 %	100 %	0 %	0 %	229587323
1513	NC_012654	ATT	2	6	62539	62544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587323
1514	NC_012654	GAT	2	6	62567	62572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587323
1515	NC_012654	AT	4	8	62590	62597	50 %	50 %	0 %	0 %	229587323
1516	NC_012654	CTT	2	6	62613	62618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587323
1517	NC_012654	GAA	2	6	62633	62638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587323
1518	NC_012654	A	7	7	62661	62667	100 %	0 %	0 %	0 %	229587323
1519	NC_012654	AAAG	2	8	62693	62700	75 %	0 %	25 %	0 %	229587323
1520	NC_012654	AAT	2	6	62701	62706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587323
1521	NC_012654	T	6	6	62768	62773	0 %	100 %	0 %	0 %	229587323
1522	NC_012654	GAA	2	6	62780	62785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587323
1523	NC_012654	ATA	2	6	62814	62819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587323
1524	NC_012654	CAA	2	6	62846	62851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587323
1525	NC_012654	CTT	2	6	62865	62870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587323
1526	NC_012654	TAT	2	6	62876	62881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587323
1527	NC_012654	CTA	2	6	62901	62906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587323
1528	NC_012654	GA	3	6	62912	62917	50 %	0 %	50 %	0 %	229587323
1529	NC_012654	ATA	2	6	62970	62975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587323
1530	NC_012654	AAC	2	6	63024	63029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587323
1531	NC_012654	ATAAA	2	10	63042	63051	80 %	20 %	0 %	0 %	229587323
1532	NC_012654	TAA	2	6	63214	63219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587323
1533	NC_012654	ATT	2	6	63226	63231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587323
1534	NC_012654	GAT	2	6	63242	63247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587323
1535	NC_012654	ACT	2	6	63302	63307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587323
1536	NC_012654	TAA	2	6	63384	63389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587323
1537	NC_012654	TAA	2	6	63421	63426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587323
1538	NC_012654	TAGATT	2	12	63432	63443	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	229587323
1539	NC_012654	ATAA	2	8	63452	63459	75 %	25 %	0 %	0 %	229587323
1540	NC_012654	TAA	2	6	63544	63549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587323
1541	NC_012654	ATG	2	6	63648	63653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587323
1542	NC_012654	TAATT	2	10	63688	63697	40 %	60 %	0 %	0 %	229587323
1543	NC_012654	TAA	2	6	63703	63708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587323
1544	NC_012654	ATG	3	9	63747	63755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587323
1545	NC_012654	ACAAA	2	10	63770	63779	80 %	0 %	0 %	20 %	229587323
1546	NC_012654	AAT	2	6	63793	63798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587323
1547	NC_012654	AAG	2	6	63852	63857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587323
1548	NC_012654	GAT	2	6	63938	63943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587323
1549	NC_012654	TTA	2	6	63953	63958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587323
1550	NC_012654	TA	3	6	63965	63970	50 %	50 %	0 %	0 %	229587323
1551	NC_012654	GTAA	2	8	63971	63978	50 %	25 %	25 %	0 %	229587323
1552	NC_012654	AAAG	2	8	64023	64030	75 %	0 %	25 %	0 %	229587323
1553	NC_012654	TCA	2	6	64057	64062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587323
1554	NC_012654	ATT	2	6	64197	64202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587323
1555	NC_012654	TA	3	6	64204	64209	50 %	50 %	0 %	0 %	229587323
1556	NC_012654	ATT	2	6	64237	64242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587323
1557	NC_012654	GAA	2	6	64244	64249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587323
1558	NC_012654	GAA	2	6	64268	64273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587323
1559	NC_012654	AGA	2	6	64321	64326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587323
1560	NC_012654	A	6	6	64436	64441	100 %	0 %	0 %	0 %	229587323
1561	NC_012654	ATA	2	6	64470	64475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587323
1562	NC_012654	ATG	2	6	64479	64484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587323
1563	NC_012654	AAAGAA	2	12	64487	64498	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	229587323
1564	NC_012654	CAA	2	6	64508	64513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587323
1565	NC_012654	TAT	2	6	64519	64524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587323
1566	NC_012654	ATA	2	6	64840	64845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587324
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1568	NC_012654	TAA	2	6	64874	64879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587324
1569	NC_012654	AAG	2	6	64903	64908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587324
1570	NC_012654	ATT	2	6	64961	64966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587324
1571	NC_012654	A	6	6	64993	64998	100 %	0 %	0 %	0 %	229587324
1572	NC_012654	TTA	2	6	65011	65016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587324
1573	NC_012654	ATA	2	6	65023	65028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587324
1574	NC_012654	ATT	2	6	65032	65037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587324
1575	NC_012654	AT	3	6	65057	65062	50 %	50 %	0 %	0 %	229587324
1576	NC_012654	ATA	2	6	65116	65121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587324
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1579	NC_012654	TAT	2	6	65157	65162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587324
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1581	NC_012654	TAC	2	6	65222	65227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587324
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1583	NC_012654	T	9	9	65603	65611	0 %	100 %	0 %	0 %	229587325
1584	NC_012654	ATA	2	6	65620	65625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587325
1585	NC_012654	TAAA	2	8	65664	65671	75 %	25 %	0 %	0 %	229587325
1586	NC_012654	T	6	6	65695	65700	0 %	100 %	0 %	0 %	229587325
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1588	NC_012654	TAT	2	6	65719	65724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587325
1589	NC_012654	AGA	2	6	65741	65746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587325
1590	NC_012654	TAAC	2	8	65770	65777	50 %	25 %	0 %	25 %	229587325
1591	NC_012654	T	6	6	65844	65849	0 %	100 %	0 %	0 %	229587325
1592	NC_012654	TAC	2	6	65863	65868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587325
1593	NC_012654	ATTTA	2	10	66151	66160	40 %	60 %	0 %	0 %	229587326
1594	NC_012654	CTT	2	6	66174	66179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587326
1595	NC_012654	T	6	6	66251	66256	0 %	100 %	0 %	0 %	229587326
1596	NC_012654	TAT	2	6	66388	66393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587327
1597	NC_012654	CTT	2	6	66418	66423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587327
1598	NC_012654	AGTT	2	8	66479	66486	25 %	50 %	25 %	0 %	229587327
1599	NC_012654	TAT	2	6	66499	66504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587327
1600	NC_012654	A	6	6	66512	66517	100 %	0 %	0 %	0 %	229587327
1601	NC_012654	ATT	2	6	66549	66554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587327
1602	NC_012654	T	6	6	66553	66558	0 %	100 %	0 %	0 %	229587328
1603	NC_012654	CAT	2	6	66564	66569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587328
1604	NC_012654	ATA	2	6	66640	66645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587328
1605	NC_012654	CTT	2	6	66654	66659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587328
1606	NC_012654	T	6	6	66665	66670	0 %	100 %	0 %	0 %	229587328
1607	NC_012654	ATC	3	9	66766	66774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587328
1608	NC_012654	CTT	2	6	66777	66782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587328
1609	NC_012654	A	6	6	66784	66789	100 %	0 %	0 %	0 %	229587328
1610	NC_012654	TATC	2	8	66800	66807	25 %	50 %	0 %	25 %	229587328
1611	NC_012654	ATC	3	9	66805	66813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587328
1612	NC_012654	TAA	2	6	66817	66822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587328
1613	NC_012654	CTT	2	6	66825	66830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587328
1614	NC_012654	TTCT	2	8	66840	66847	0 %	75 %	0 %	25 %	229587328
1615	NC_012654	T	6	6	66880	66885	0 %	100 %	0 %	0 %	229587328
1616	NC_012654	TAA	2	6	66900	66905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587328
1617	NC_012654	T	6	6	66981	66986	0 %	100 %	0 %	0 %	229587329
1618	NC_012654	TTCCT	2	10	67038	67047	0 %	60 %	0 %	40 %	229587329
1619	NC_012654	T	7	7	67060	67066	0 %	100 %	0 %	0 %	229587329
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1622	NC_012654	ATT	2	6	67145	67150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587330
1623	NC_012654	T	6	6	67160	67165	0 %	100 %	0 %	0 %	229587330
1624	NC_012654	TCT	2	6	67200	67205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587330
1625	NC_012654	ACTAT	2	10	67236	67245	40 %	40 %	0 %	20 %	229587330
1626	NC_012654	AT	3	6	67276	67281	50 %	50 %	0 %	0 %	229587330
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