MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ

Total Repeats: 6687

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_012654	TAT	2	6	41447	41452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587306
1003	NC_012654	TTG	3	9	41459	41467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587306
1004	NC_012654	ATTTA	2	10	41468	41477	40 %	60 %	0 %	0 %	229587306
1005	NC_012654	ATA	2	6	41480	41485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587306
1006	NC_012654	TAAT	2	8	41654	41661	50 %	50 %	0 %	0 %	229587307
1007	NC_012654	GTA	2	6	41690	41695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587307
1008	NC_012654	GTT	2	6	41712	41717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587307
1009	NC_012654	TCT	2	6	41783	41788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587307
1010	NC_012654	AATC	2	8	41797	41804	50 %	25 %	0 %	25 %	229587307
1011	NC_012654	TC	3	6	41803	41808	0 %	50 %	0 %	50 %	229587307
1012	NC_012654	CTT	2	6	41862	41867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587308
1013	NC_012654	ACA	2	6	41930	41935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587308
1014	NC_012654	ATTAA	2	10	41951	41960	60 %	40 %	0 %	0 %	229587308
1015	NC_012654	AAT	2	6	41961	41966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587308
1016	NC_012654	TAT	2	6	41976	41981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587308
1017	NC_012654	AATCC	2	10	41995	42004	40 %	20 %	0 %	40 %	229587308
1018	NC_012654	TAA	2	6	42046	42051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587308
1019	NC_012654	AAT	2	6	42054	42059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587308
1020	NC_012654	CTT	2	6	42072	42077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587308
1021	NC_012654	ATC	2	6	42109	42114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587308
1022	NC_012654	AAT	2	6	42115	42120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587308
1023	NC_012654	TAA	3	9	42124	42132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587308
1024	NC_012654	TCTT	2	8	42140	42147	0 %	75 %	0 %	25 %	229587308
1025	NC_012654	TAT	2	6	42163	42168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587308
1026	NC_012654	A	7	7	42178	42184	100 %	0 %	0 %	0 %	229587308
1027	NC_012654	T	7	7	42190	42196	0 %	100 %	0 %	0 %	229587308
1028	NC_012654	TAAAA	2	10	42202	42211	80 %	20 %	0 %	0 %	229587308
1029	NC_012654	ATCTAT	2	12	42262	42273	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	229587308
1030	NC_012654	TAT	2	6	42280	42285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587308
1031	NC_012654	AC	3	6	42291	42296	50 %	0 %	0 %	50 %	229587308
1032	NC_012654	CTTT	2	8	42297	42304	0 %	75 %	0 %	25 %	229587308
1033	NC_012654	T	7	7	42312	42318	0 %	100 %	0 %	0 %	229587308
1034	NC_012654	TA	3	6	42406	42411	50 %	50 %	0 %	0 %	229587308
1035	NC_012654	TTA	2	6	42413	42418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587308
1036	NC_012654	CTT	2	6	42431	42436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587308
1037	NC_012654	TCTA	2	8	42445	42452	25 %	50 %	0 %	25 %	229587308
1038	NC_012654	ATT	2	6	42512	42517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587308
1039	NC_012654	CTT	2	6	42522	42527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587308
1040	NC_012654	ATA	2	6	42746	42751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587309
1041	NC_012654	A	6	6	42792	42797	100 %	0 %	0 %	0 %	229587309
1042	NC_012654	AAG	2	6	42800	42805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587309
1043	NC_012654	GTAT	2	8	42923	42930	25 %	50 %	25 %	0 %	229587309
1044	NC_012654	A	7	7	42932	42938	100 %	0 %	0 %	0 %	229587309
1045	NC_012654	A	6	6	42991	42996	100 %	0 %	0 %	0 %	229587309
1046	NC_012654	CAA	3	9	43009	43017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587309
1047	NC_012654	TAA	2	6	43038	43043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587309
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1050	NC_012654	CAAAAT	2	12	43087	43098	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	229587309
1051	NC_012654	TAA	2	6	43118	43123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587309
1052	NC_012654	CAA	2	6	43147	43152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587309
1053	NC_012654	CAA	2	6	43225	43230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587309
1054	NC_012654	TGA	2	6	43260	43265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587309
1055	NC_012654	ACC	2	6	43275	43280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587309
1056	NC_012654	AAT	2	6	43281	43286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587309
1057	NC_012654	TGG	2	6	43429	43434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587310
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1059	NC_012654	TA	3	6	43448	43453	50 %	50 %	0 %	0 %	229587310
1060	NC_012654	TAAT	2	8	43503	43510	50 %	50 %	0 %	0 %	229587310
1061	NC_012654	ATTA	2	8	43531	43538	50 %	50 %	0 %	0 %	229587310
1062	NC_012654	TAT	2	6	43539	43544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587310
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1065	NC_012654	TAT	2	6	43639	43644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587310
1066	NC_012654	A	7	7	43646	43652	100 %	0 %	0 %	0 %	229587310
1067	NC_012654	GAA	2	6	43661	43666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587310
1068	NC_012654	ATG	2	6	43695	43700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587310
1069	NC_012654	AAT	2	6	43724	43729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587310
1070	NC_012654	ATATA	2	10	43782	43791	60 %	40 %	0 %	0 %	229587310
1071	NC_012654	CCTAT	2	10	43871	43880	20 %	40 %	0 %	40 %	229587310
1072	NC_012654	TAATT	2	10	43906	43915	40 %	60 %	0 %	0 %	229587310
1073	NC_012654	A	6	6	44011	44016	100 %	0 %	0 %	0 %	229587310
1074	NC_012654	ATC	2	6	44020	44025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587310
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1078	NC_012654	AAT	3	9	44066	44074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587310
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1098	NC_012654	A	6	6	44832	44837	100 %	0 %	0 %	0 %	229587311
1099	NC_012654	A	6	6	44942	44947	100 %	0 %	0 %	0 %	229587311
1100	NC_012654	AT	3	6	44980	44985	50 %	50 %	0 %	0 %	229587311
1101	NC_012654	AT	3	6	45021	45026	50 %	50 %	0 %	0 %	229587311
1102	NC_012654	ACA	2	6	45063	45068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587311
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1106	NC_012654	CAA	2	6	45207	45212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587311
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1109	NC_012654	AAG	2	6	45364	45369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587311
1110	NC_012654	AGA	2	6	45431	45436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587311
1111	NC_012654	AAG	2	6	45487	45492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587311
1112	NC_012654	AT	3	6	45534	45539	50 %	50 %	0 %	0 %	229587311
1113	NC_012654	TATT	2	8	45649	45656	25 %	75 %	0 %	0 %	229587311
1114	NC_012654	TTA	2	6	45749	45754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587311
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1121	NC_012654	TA	3	6	45930	45935	50 %	50 %	0 %	0 %	229587311
1122	NC_012654	CAA	2	6	45947	45952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587311
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1127	NC_012654	A	6	6	46071	46076	100 %	0 %	0 %	0 %	229587311
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