MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ

Total Repeats: 6687

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012654	AAT	2	6	21187	21192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587285
502	NC_012654	AAC	2	6	21199	21204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587285
503	NC_012654	CTT	2	6	21219	21224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587285
504	NC_012654	TA	3	6	21256	21261	50 %	50 %	0 %	0 %	229587285
505	NC_012654	TA	3	6	21330	21335	50 %	50 %	0 %	0 %	229587286
506	NC_012654	T	7	7	21336	21342	0 %	100 %	0 %	0 %	229587286
507	NC_012654	T	7	7	21348	21354	0 %	100 %	0 %	0 %	229587286
508	NC_012654	ATGT	2	8	21359	21366	25 %	50 %	25 %	0 %	229587286
509	NC_012654	TTA	2	6	21369	21374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587286
510	NC_012654	CTTTT	2	10	21392	21401	0 %	80 %	0 %	20 %	229587286
511	NC_012654	TA	3	6	21412	21417	50 %	50 %	0 %	0 %	229587286
512	NC_012654	T	6	6	21438	21443	0 %	100 %	0 %	0 %	229587286
513	NC_012654	TAT	2	6	21680	21685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587287
514	NC_012654	CTATT	2	10	21707	21716	20 %	60 %	0 %	20 %	229587287
515	NC_012654	GTT	2	6	21769	21774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587287
516	NC_012654	GTA	2	6	21808	21813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587287
517	NC_012654	TAA	2	6	21816	21821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587287
518	NC_012654	AT	3	6	21845	21850	50 %	50 %	0 %	0 %	229587287
519	NC_012654	TAG	2	6	21996	22001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587287
520	NC_012654	A	7	7	22007	22013	100 %	0 %	0 %	0 %	229587287
521	NC_012654	ATCTAT	2	12	22047	22058	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	229587287
522	NC_012654	A	6	6	22059	22064	100 %	0 %	0 %	0 %	229587287
523	NC_012654	ATTT	2	8	22088	22095	25 %	75 %	0 %	0 %	229587287
524	NC_012654	T	6	6	22093	22098	0 %	100 %	0 %	0 %	229587287
525	NC_012654	AT	4	8	22122	22129	50 %	50 %	0 %	0 %	229587287
526	NC_012654	GAA	2	6	22137	22142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587287
527	NC_012654	AAT	2	6	22154	22159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587287
528	NC_012654	CTT	2	6	22254	22259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587288
529	NC_012654	T	7	7	22263	22269	0 %	100 %	0 %	0 %	229587288
530	NC_012654	TTTA	2	8	22273	22280	25 %	75 %	0 %	0 %	229587288
531	NC_012654	AAATCT	2	12	22295	22306	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	229587288
532	NC_012654	TGC	2	6	22327	22332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587288
533	NC_012654	TA	3	6	22341	22346	50 %	50 %	0 %	0 %	229587288
534	NC_012654	TAA	2	6	22371	22376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587288
535	NC_012654	TTTA	2	8	22402	22409	25 %	75 %	0 %	0 %	229587288
536	NC_012654	TAA	2	6	22419	22424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587288
537	NC_012654	TCA	2	6	22427	22432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587288
538	NC_012654	CTC	2	6	22614	22619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229587288
539	NC_012654	ACC	2	6	22636	22641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587288
540	NC_012654	CTA	2	6	22650	22655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587288
541	NC_012654	TTC	2	6	22662	22667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587288
542	NC_012654	ATTA	2	8	22720	22727	50 %	50 %	0 %	0 %	229587288
543	NC_012654	T	7	7	22753	22759	0 %	100 %	0 %	0 %	229587288
544	NC_012654	T	6	6	22767	22772	0 %	100 %	0 %	0 %	229587288
545	NC_012654	TGT	2	6	22796	22801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587288
546	NC_012654	T	6	6	22803	22808	0 %	100 %	0 %	0 %	229587288
547	NC_012654	TGT	2	6	22829	22834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587288
548	NC_012654	AAC	2	6	22840	22845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587288
549	NC_012654	CAT	2	6	22875	22880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587288
550	NC_012654	ATT	2	6	22930	22935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587288
551	NC_012654	AT	3	6	22994	22999	50 %	50 %	0 %	0 %	229587288
552	NC_012654	TTGT	2	8	23095	23102	0 %	75 %	25 %	0 %	229587288
553	NC_012654	GTT	2	6	23249	23254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587288
554	NC_012654	TCA	2	6	23303	23308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587288
555	NC_012654	ACTAT	2	10	23309	23318	40 %	40 %	0 %	20 %	229587288
556	NC_012654	TAAA	2	8	23373	23380	75 %	25 %	0 %	0 %	229587288
557	NC_012654	CTT	2	6	23398	23403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587289
558	NC_012654	CAA	2	6	23459	23464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587289
559	NC_012654	CTA	2	6	23474	23479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587289
560	NC_012654	TCT	2	6	23551	23556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587289
561	NC_012654	AAT	2	6	23558	23563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587289
562	NC_012654	CT	3	6	23634	23639	0 %	50 %	0 %	50 %	229587289
563	NC_012654	TTAA	2	8	23659	23666	50 %	50 %	0 %	0 %	229587289
564	NC_012654	ATA	2	6	23692	23697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587289
565	NC_012654	TAAT	2	8	23738	23745	50 %	50 %	0 %	0 %	229587289
566	NC_012654	T	6	6	23748	23753	0 %	100 %	0 %	0 %	229587289
567	NC_012654	T	6	6	23756	23761	0 %	100 %	0 %	0 %	229587289
568	NC_012654	TCA	2	6	23776	23781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587289
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570	NC_012654	AT	3	6	23792	23797	50 %	50 %	0 %	0 %	229587289
571	NC_012654	TTC	2	6	23852	23857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587289
572	NC_012654	CAT	2	6	23879	23884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587289
573	NC_012654	ATA	2	6	23899	23904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587289
574	NC_012654	TCA	2	6	23935	23940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587289
575	NC_012654	TCCT	2	8	23991	23998	0 %	50 %	0 %	50 %	229587289
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577	NC_012654	ATA	2	6	24101	24106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587289
578	NC_012654	TAA	2	6	24212	24217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587289
579	NC_012654	TGA	2	6	24390	24395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587289
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581	NC_012654	GCC	2	6	24433	24438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587289
582	NC_012654	TAA	2	6	24447	24452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587289
583	NC_012654	AT	3	6	24487	24492	50 %	50 %	0 %	0 %	229587289
584	NC_012654	CTG	2	6	24509	24514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587289
585	NC_012654	T	6	6	24565	24570	0 %	100 %	0 %	0 %	229587289
586	NC_012654	AT	3	6	24581	24586	50 %	50 %	0 %	0 %	229587289
587	NC_012654	T	6	6	24593	24598	0 %	100 %	0 %	0 %	229587289
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590	NC_012654	AT	3	6	24661	24666	50 %	50 %	0 %	0 %	229587289
591	NC_012654	TTG	3	9	24683	24691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587289
592	NC_012654	CTA	2	6	24776	24781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587289
593	NC_012654	TAT	2	6	24807	24812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587289
594	NC_012654	T	7	7	24846	24852	0 %	100 %	0 %	0 %	229587289
595	NC_012654	CT	3	6	24856	24861	0 %	50 %	0 %	50 %	229587289
596	NC_012654	TAC	2	6	24881	24886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587289
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598	NC_012654	ATTT	2	8	25139	25146	25 %	75 %	0 %	0 %	229587289
599	NC_012654	A	6	6	25147	25152	100 %	0 %	0 %	0 %	229587289
600	NC_012654	TCA	2	6	25159	25164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587289
601	NC_012654	T	6	6	25240	25245	0 %	100 %	0 %	0 %	229587289
602	NC_012654	TTTC	2	8	25248	25255	0 %	75 %	0 %	25 %	229587289
603	NC_012654	TCT	2	6	25267	25272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587289
604	NC_012654	TGT	2	6	25294	25299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587289
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608	NC_012654	TAT	2	6	25663	25668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587290
609	NC_012654	T	6	6	25668	25673	0 %	100 %	0 %	0 %	229587290
610	NC_012654	ACA	2	6	25677	25682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587290
611	NC_012654	CA	3	6	25681	25686	50 %	0 %	0 %	50 %	229587290
612	NC_012654	CAA	2	6	25690	25695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587290
613	NC_012654	TAA	2	6	25745	25750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587290
614	NC_012654	CAATA	2	10	25788	25797	60 %	20 %	0 %	20 %	229587290
615	NC_012654	GAG	2	6	25813	25818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229587290
616	NC_012654	AAT	2	6	25853	25858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587290
617	NC_012654	AAT	2	6	25862	25867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587290
618	NC_012654	ATTA	2	8	25871	25878	50 %	50 %	0 %	0 %	229587290
619	NC_012654	ATT	2	6	25884	25889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587290
620	NC_012654	GCTA	2	8	25910	25917	25 %	25 %	25 %	25 %	229587290
621	NC_012654	TAT	2	6	25952	25957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587290
622	NC_012654	ATT	3	9	25983	25991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587290
623	NC_012654	CTA	2	6	25996	26001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587290
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625	NC_012654	TAA	2	6	26041	26046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587290
626	NC_012654	TATTT	2	10	26048	26057	20 %	80 %	0 %	0 %	229587290
627	NC_012654	T	6	6	26055	26060	0 %	100 %	0 %	0 %	229587290
628	NC_012654	A	6	6	26134	26139	100 %	0 %	0 %	0 %	229587290
629	NC_012654	ACA	2	6	26157	26162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587290
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