MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ

Total Repeats: 6687

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_012654	AAG	2	6	240643	240648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587542
6002	NC_012654	TAA	2	6	240673	240678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587542
6003	NC_012654	ATTT	2	8	240710	240717	25 %	75 %	0 %	0 %	229587542
6004	NC_012654	TAC	2	6	240725	240730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587543
6005	NC_012654	ATTTA	2	10	240756	240765	40 %	60 %	0 %	0 %	229587543
6006	NC_012654	TAT	2	6	240774	240779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587543
6007	NC_012654	TTA	2	6	240790	240795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587543
6008	NC_012654	TAA	2	6	240843	240848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587543
6009	NC_012654	CTTT	2	8	240880	240887	0 %	75 %	0 %	25 %	229587543
6010	NC_012654	TTA	2	6	240907	240912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587543
6011	NC_012654	TGA	2	6	240913	240918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587543
6012	NC_012654	T	8	8	240995	241002	0 %	100 %	0 %	0 %	229587543
6013	NC_012654	TTTCT	2	10	241031	241040	0 %	80 %	0 %	20 %	229587543
6014	NC_012654	T	8	8	241115	241122	0 %	100 %	0 %	0 %	229587543
6015	NC_012654	TAA	2	6	241133	241138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587543
6016	NC_012654	T	7	7	241193	241199	0 %	100 %	0 %	0 %	229587543
6017	NC_012654	TCT	3	9	241264	241272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587543
6018	NC_012654	CAT	2	6	241295	241300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587543
6019	NC_012654	TTA	2	6	241313	241318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587543
6020	NC_012654	ATA	2	6	241355	241360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587543
6021	NC_012654	CT	3	6	241409	241414	0 %	50 %	0 %	50 %	229587543
6022	NC_012654	ATT	2	6	241458	241463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587543
6023	NC_012654	TCA	2	6	241561	241566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587543
6024	NC_012654	TAG	2	6	241640	241645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587543
6025	NC_012654	TCA	2	6	241672	241677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587543
6026	NC_012654	TA	3	6	241715	241720	50 %	50 %	0 %	0 %	229587543
6027	NC_012654	CT	3	6	241779	241784	0 %	50 %	0 %	50 %	229587543
6028	NC_012654	TA	4	8	241793	241800	50 %	50 %	0 %	0 %	229587543
6029	NC_012654	TTTA	2	8	241833	241840	25 %	75 %	0 %	0 %	229587543
6030	NC_012654	TAA	2	6	241848	241853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587543
6031	NC_012654	GAA	2	6	241897	241902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587543
6032	NC_012654	AT	3	6	241967	241972	50 %	50 %	0 %	0 %	229587543
6033	NC_012654	ACT	2	6	241999	242004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587543
6034	NC_012654	TGA	2	6	242050	242055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587543
6035	NC_012654	ATT	2	6	242056	242061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587543
6036	NC_012654	TTA	2	6	242066	242071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587543
6037	NC_012654	G	6	6	242092	242097	0 %	0 %	100 %	0 %	229587543
6038	NC_012654	T	7	7	242133	242139	0 %	100 %	0 %	0 %	229587543
6039	NC_012654	TTG	2	6	242148	242153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587543
6040	NC_012654	TTGA	2	8	242249	242256	25 %	50 %	25 %	0 %	229587543
6041	NC_012654	TCT	2	6	242260	242265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587543
6042	NC_012654	T	6	6	242295	242300	0 %	100 %	0 %	0 %	229587543
6043	NC_012654	TTTAT	2	10	242308	242317	20 %	80 %	0 %	0 %	229587543
6044	NC_012654	TCT	2	6	242326	242331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587543
6045	NC_012654	TTAA	2	8	242332	242339	50 %	50 %	0 %	0 %	229587543
6046	NC_012654	ATA	3	9	242351	242359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587543
6047	NC_012654	TAA	2	6	242363	242368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587543
6048	NC_012654	TAT	3	9	242381	242389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587543
6049	NC_012654	AACTT	2	10	242392	242401	40 %	40 %	0 %	20 %	229587543
6050	NC_012654	T	6	6	242475	242480	0 %	100 %	0 %	0 %	229587543
6051	NC_012654	ATT	2	6	242526	242531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587543
6052	NC_012654	A	6	6	242548	242553	100 %	0 %	0 %	0 %	229587543
6053	NC_012654	T	6	6	242629	242634	0 %	100 %	0 %	0 %	229587543
6054	NC_012654	ATC	2	6	242700	242705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587543
6055	NC_012654	TAT	2	6	242735	242740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587543
6056	NC_012654	T	6	6	242779	242784	0 %	100 %	0 %	0 %	229587543
6057	NC_012654	AT	4	8	242853	242860	50 %	50 %	0 %	0 %	229587543
6058	NC_012654	TGT	2	6	242867	242872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587543
6059	NC_012654	TAT	2	6	242873	242878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587543
6060	NC_012654	TATAA	2	10	242889	242898	60 %	40 %	0 %	0 %	229587543
6061	NC_012654	A	6	6	242907	242912	100 %	0 %	0 %	0 %	229587543
6062	NC_012654	GTT	2	6	242928	242933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587543
6063	NC_012654	A	7	7	242940	242946	100 %	0 %	0 %	0 %	229587543
6064	NC_012654	TAG	2	6	242966	242971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587543
6065	NC_012654	TCT	2	6	243009	243014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587543
6066	NC_012654	GCT	2	6	243035	243040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587543
6067	NC_012654	ATA	2	6	243066	243071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587543
6068	NC_012654	T	8	8	243072	243079	0 %	100 %	0 %	0 %	229587543
6069	NC_012654	ATA	2	6	243176	243181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587543
6070	NC_012654	TAT	2	6	243216	243221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587543
6071	NC_012654	TGG	2	6	243243	243248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587543
6072	NC_012654	TA	3	6	243269	243274	50 %	50 %	0 %	0 %	229587543
6073	NC_012654	CAT	2	6	243357	243362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587543
6074	NC_012654	ATTTT	2	10	243392	243401	20 %	80 %	0 %	0 %	229587543
6075	NC_012654	ATT	2	6	243418	243423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587543
6076	NC_012654	ATTAT	2	10	243475	243484	40 %	60 %	0 %	0 %	229587543
6077	NC_012654	AAT	2	6	243510	243515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587543
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6080	NC_012654	TAT	2	6	243629	243634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587543
6081	NC_012654	AAT	2	6	243647	243652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587543
6082	NC_012654	TAT	2	6	243668	243673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587543
6083	NC_012654	ATTT	2	8	243677	243684	25 %	75 %	0 %	0 %	229587543
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6094	NC_012654	TA	4	8	244476	244483	50 %	50 %	0 %	0 %	229587544
6095	NC_012654	ATC	2	6	244488	244493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587544
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6098	NC_012654	ATTT	2	8	244592	244599	25 %	75 %	0 %	0 %	229587544
6099	NC_012654	TCT	2	6	244606	244611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587544
6100	NC_012654	ATC	2	6	244617	244622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587544
6101	NC_012654	AT	3	6	244670	244675	50 %	50 %	0 %	0 %	229587544
6102	NC_012654	AT	3	6	244742	244747	50 %	50 %	0 %	0 %	229587544
6103	NC_012654	TAA	2	6	244767	244772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587544
6104	NC_012654	TACT	2	8	244781	244788	25 %	50 %	0 %	25 %	229587544
6105	NC_012654	ATT	2	6	244813	244818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587544
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6107	NC_012654	AT	3	6	244984	244989	50 %	50 %	0 %	0 %	229587544
6108	NC_012654	TTA	2	6	245246	245251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587545
6109	NC_012654	CTT	2	6	245265	245270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587545
6110	NC_012654	TA	3	6	245290	245295	50 %	50 %	0 %	0 %	229587545
6111	NC_012654	TAT	2	6	245302	245307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587545
6112	NC_012654	ATG	2	6	245404	245409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587545
6113	NC_012654	TAT	2	6	245487	245492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587545
6114	NC_012654	TTG	2	6	245617	245622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587545
6115	NC_012654	ATTGC	2	10	245625	245634	20 %	40 %	20 %	20 %	229587545
6116	NC_012654	T	6	6	245675	245680	0 %	100 %	0 %	0 %	229587545
6117	NC_012654	TTATAA	2	12	245693	245704	50 %	50 %	0 %	0 %	229587545
6118	NC_012654	ATA	2	6	245710	245715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587545
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6121	NC_012654	TTG	2	6	245826	245831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587545
6122	NC_012654	TAA	2	6	245840	245845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587545
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6124	NC_012654	TTTTA	2	10	245917	245926	20 %	80 %	0 %	0 %	229587545
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6499	NC_012654	ATT	2	6	262172	262177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587565
6500	NC_012654	CTA	2	6	262231	262236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587565

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