MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter lari RM2100 megaplasmid pCL2100

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012040	TGTT	2	8	504	511	0 %	75 %	25 %	0 %	222778488
2	NC_012040	AAAG	2	8	1138	1145	75 %	0 %	25 %	0 %	222778488
3	NC_012040	GAAC	2	8	1252	1259	50 %	0 %	25 %	25 %	222778488
4	NC_012040	TTCT	2	8	1874	1881	0 %	75 %	0 %	25 %	222778489
5	NC_012040	TTTA	2	8	1946	1953	25 %	75 %	0 %	0 %	222778489
6	NC_012040	TAAA	2	8	2016	2023	75 %	25 %	0 %	0 %	222778489
7	NC_012040	TGAA	2	8	2649	2656	50 %	25 %	25 %	0 %	222778489
8	NC_012040	TTAT	2	8	2964	2971	25 %	75 %	0 %	0 %	222778489
9	NC_012040	ATTA	2	8	3002	3009	50 %	50 %	0 %	0 %	222778489
10	NC_012040	CAAG	2	8	3048	3055	50 %	0 %	25 %	25 %	222778489
11	NC_012040	TTGG	2	8	3433	3440	0 %	50 %	50 %	0 %	222778489
12	NC_012040	TTGT	2	8	3915	3922	0 %	75 %	25 %	0 %	222778489
13	NC_012040	CTTT	2	8	3955	3962	0 %	75 %	0 %	25 %	222778489
14	NC_012040	GTTT	2	8	4063	4070	0 %	75 %	25 %	0 %	222778489
15	NC_012040	AAAT	2	8	4475	4482	75 %	25 %	0 %	0 %	222778489
16	NC_012040	TTTA	2	8	4571	4578	25 %	75 %	0 %	0 %	222778489
17	NC_012040	GCTA	2	8	4955	4962	25 %	25 %	25 %	25 %	222778489
18	NC_012040	TTTA	2	8	5216	5223	25 %	75 %	0 %	0 %	222778489
19	NC_012040	GATT	2	8	5259	5266	25 %	50 %	25 %	0 %	222778489
20	NC_012040	ATTT	2	8	5434	5441	25 %	75 %	0 %	0 %	222778489
21	NC_012040	TTTA	2	8	6020	6027	25 %	75 %	0 %	0 %	222778489
22	NC_012040	AAAT	2	8	6104	6111	75 %	25 %	0 %	0 %	222778489
23	NC_012040	ATTT	2	8	6487	6494	25 %	75 %	0 %	0 %	222778489
24	NC_012040	ATCT	2	8	6580	6587	25 %	50 %	0 %	25 %	222778489
25	NC_012040	ATTT	2	8	6799	6806	25 %	75 %	0 %	0 %	222778489
26	NC_012040	CATA	2	8	7514	7521	50 %	25 %	0 %	25 %	222778490
27	NC_012040	AGAA	2	8	7637	7644	75 %	0 %	25 %	0 %	222778490
28	NC_012040	ATTC	2	8	7823	7830	25 %	50 %	0 %	25 %	222778490
29	NC_012040	TATT	2	8	8350	8357	25 %	75 %	0 %	0 %	222778492
30	NC_012040	AATT	2	8	8404	8411	50 %	50 %	0 %	0 %	222778492
31	NC_012040	TAAA	2	8	9553	9560	75 %	25 %	0 %	0 %	222778493
32	NC_012040	TAAA	2	8	9745	9752	75 %	25 %	0 %	0 %	222778493
33	NC_012040	TTCC	2	8	9819	9826	0 %	50 %	0 %	50 %	222778493
34	NC_012040	TAAA	2	8	10033	10040	75 %	25 %	0 %	0 %	222778493
35	NC_012040	TTTG	2	8	11450	11457	0 %	75 %	25 %	0 %	222778495
36	NC_012040	AAGA	2	8	11796	11803	75 %	0 %	25 %	0 %	222778496
37	NC_012040	AATT	2	8	11977	11984	50 %	50 %	0 %	0 %	222778496
38	NC_012040	TTAC	2	8	11997	12004	25 %	50 %	0 %	25 %	222778496
39	NC_012040	TTTA	2	8	12286	12293	25 %	75 %	0 %	0 %	222778496
40	NC_012040	AAAC	2	8	12785	12792	75 %	0 %	0 %	25 %	222778496
41	NC_012040	ATCA	2	8	12795	12802	50 %	25 %	0 %	25 %	222778496
42	NC_012040	GAAA	2	8	13644	13651	75 %	0 %	25 %	0 %	222778496
43	NC_012040	ATTT	2	8	13804	13811	25 %	75 %	0 %	0 %	222778496
44	NC_012040	ATTT	2	8	14858	14865	25 %	75 %	0 %	0 %	222778497
45	NC_012040	TAAA	2	8	15975	15982	75 %	25 %	0 %	0 %	222778498
46	NC_012040	TAAA	2	8	17315	17322	75 %	25 %	0 %	0 %	222778500
47	NC_012040	ATGG	2	8	17877	17884	25 %	25 %	50 %	0 %	222778501
48	NC_012040	GTAT	2	8	17914	17921	25 %	50 %	25 %	0 %	222778501
49	NC_012040	TTTG	2	8	18690	18697	0 %	75 %	25 %	0 %	222778502
50	NC_012040	AGAA	2	8	18782	18789	75 %	0 %	25 %	0 %	222778502
51	NC_012040	AAAG	2	8	19067	19074	75 %	0 %	25 %	0 %	222778502
52	NC_012040	CTAT	2	8	19681	19688	25 %	50 %	0 %	25 %	222778503
53	NC_012040	ATTA	2	8	19802	19809	50 %	50 %	0 %	0 %	222778503
54	NC_012040	ACTA	2	8	19935	19942	50 %	25 %	0 %	25 %	222778503
55	NC_012040	CTTT	2	8	19988	19995	0 %	75 %	0 %	25 %	222778504
56	NC_012040	TATT	2	8	20214	20221	25 %	75 %	0 %	0 %	222778504
57	NC_012040	CTAA	2	8	20375	20382	50 %	25 %	0 %	25 %	222778504
58	NC_012040	AGCA	3	12	20387	20398	50 %	0 %	25 %	25 %	222778504
59	NC_012040	TACT	2	8	20593	20600	25 %	50 %	0 %	25 %	222778504
60	NC_012040	GAAA	2	8	21195	21202	75 %	0 %	25 %	0 %	222778505
61	NC_012040	TTAG	2	8	21541	21548	25 %	50 %	25 %	0 %	222778505
62	NC_012040	CCAA	2	8	21969	21976	50 %	0 %	0 %	50 %	222778505
63	NC_012040	AAAG	2	8	22055	22062	75 %	0 %	25 %	0 %	222778505
64	NC_012040	AAGT	2	8	22214	22221	50 %	25 %	25 %	0 %	222778506
65	NC_012040	AGAT	2	8	22279	22286	50 %	25 %	25 %	0 %	222778506
66	NC_012040	TTCT	2	8	22837	22844	0 %	75 %	0 %	25 %	222778506
67	NC_012040	AAAG	2	8	23251	23258	75 %	0 %	25 %	0 %	222778507
68	NC_012040	TTTC	2	8	23805	23812	0 %	75 %	0 %	25 %	222778508
69	NC_012040	ATCA	2	8	24942	24949	50 %	25 %	0 %	25 %	222778508
70	NC_012040	ACTT	2	8	26527	26534	25 %	50 %	0 %	25 %	222778510
71	NC_012040	AGTA	2	8	27099	27106	50 %	25 %	25 %	0 %	222778511
72	NC_012040	CTAA	2	8	27244	27251	50 %	25 %	0 %	25 %	222778511
73	NC_012040	CAAA	2	8	27258	27265	75 %	0 %	0 %	25 %	222778511
74	NC_012040	TGAA	2	8	27498	27505	50 %	25 %	25 %	0 %	222778511
75	NC_012040	AATG	2	8	27786	27793	50 %	25 %	25 %	0 %	222778512
76	NC_012040	GAAA	2	8	27861	27868	75 %	0 %	25 %	0 %	222778512
77	NC_012040	AACA	2	8	28198	28205	75 %	0 %	0 %	25 %	222778512
78	NC_012040	AAAT	2	8	28989	28996	75 %	25 %	0 %	0 %	222778513
79	NC_012040	CAAA	2	8	29747	29754	75 %	0 %	0 %	25 %	222778513
80	NC_012040	GTAA	2	8	29948	29955	50 %	25 %	25 %	0 %	222778513
81	NC_012040	AGGA	2	8	30574	30581	50 %	0 %	50 %	0 %	222778514
82	NC_012040	TAAC	2	8	31400	31407	50 %	25 %	0 %	25 %	222778515
83	NC_012040	GATA	2	8	32172	32179	50 %	25 %	25 %	0 %	222778515
84	NC_012040	TGAG	2	8	33557	33564	25 %	25 %	50 %	0 %	222778515
85	NC_012040	CAAA	2	8	33770	33777	75 %	0 %	0 %	25 %	222778515
86	NC_012040	ATGA	2	8	34399	34406	50 %	25 %	25 %	0 %	222778515
87	NC_012040	TTAT	2	8	35019	35026	25 %	75 %	0 %	0 %	222778515
88	NC_012040	ATTC	2	8	35622	35629	25 %	50 %	0 %	25 %	222778516
89	NC_012040	ATTT	2	8	35856	35863	25 %	75 %	0 %	0 %	222778517
90	NC_012040	AATT	2	8	37347	37354	50 %	50 %	0 %	0 %	222778518
91	NC_012040	ATTT	2	8	38009	38016	25 %	75 %	0 %	0 %	222778519
92	NC_012040	TTTA	2	8	39310	39317	25 %	75 %	0 %	0 %	222778521
93	NC_012040	ATAA	2	8	39357	39364	75 %	25 %	0 %	0 %	222778521
94	NC_012040	TAAG	2	8	39607	39614	50 %	25 %	25 %	0 %	222778521
95	NC_012040	CCAT	2	8	39920	39927	25 %	25 %	0 %	50 %	222778521
96	NC_012040	TAAT	2	8	39945	39952	50 %	50 %	0 %	0 %	222778521
97	NC_012040	GTTG	2	8	40000	40007	0 %	50 %	50 %	0 %	222778521
98	NC_012040	AACA	2	8	40156	40163	75 %	0 %	0 %	25 %	222778521
99	NC_012040	TTAA	2	8	40308	40315	50 %	50 %	0 %	0 %	222778522
100	NC_012040	GATA	2	8	40618	40625	50 %	25 %	25 %	0 %	222778522
101	NC_012040	AAGA	2	8	40645	40652	75 %	0 %	25 %	0 %	222778522
102	NC_012040	ATTT	2	8	41636	41643	25 %	75 %	0 %	0 %	222778524
103	NC_012040	GAAC	2	8	42031	42038	50 %	0 %	25 %	25 %	222778524
104	NC_012040	TTTA	2	8	43679	43686	25 %	75 %	0 %	0 %	222778526
105	NC_012040	ATAA	2	8	43726	43733	75 %	25 %	0 %	0 %	222778526
106	NC_012040	TAAG	2	8	43976	43983	50 %	25 %	25 %	0 %	222778526
107	NC_012040	CCAT	2	8	44289	44296	25 %	25 %	0 %	50 %	222778526
108	NC_012040	TAAT	2	8	44314	44321	50 %	50 %	0 %	0 %	222778526
109	NC_012040	GTTG	2	8	44369	44376	0 %	50 %	50 %	0 %	222778526
110	NC_012040	TGTT	2	8	44567	44574	0 %	75 %	25 %	0 %	222778527
111	NC_012040	ATTC	2	8	44620	44627	25 %	50 %	0 %	25 %	222778527
112	NC_012040	GATT	2	8	44743	44750	25 %	50 %	25 %	0 %	222778527
113	NC_012040	TTAA	2	8	44790	44797	50 %	50 %	0 %	0 %	222778527

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.