MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 84736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012032	CAGGC	2	10	87756	87765	20 %	0 %	40 %	40 %	222523376
1502	NC_012032	GGA	2	6	87824	87829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222523376
1503	NC_012032	TGC	2	6	87841	87846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523376
1504	NC_012032	ATC	2	6	87859	87864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523376
1505	NC_012032	GTC	2	6	87877	87882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523376
1506	NC_012032	ACTG	2	8	87914	87921	25 %	25 %	25 %	25 %	222523376
1507	NC_012032	GC	3	6	88073	88078	0 %	0 %	50 %	50 %	222523376
1508	NC_012032	CGG	2	6	88119	88124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523376
1509	NC_012032	CTG	2	6	88140	88145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523376
1510	NC_012032	TGAT	2	8	88219	88226	25 %	50 %	25 %	0 %	222523376
1511	NC_012032	CGT	2	6	88233	88238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523376
1512	NC_012032	TGC	2	6	88297	88302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523376
1513	NC_012032	AAC	2	6	88321	88326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523376
1514	NC_012032	AG	3	6	88334	88339	50 %	0 %	50 %	0 %	222523376
1515	NC_012032	GAG	2	6	88341	88346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222523376
1516	NC_012032	GCAG	2	8	88363	88370	25 %	0 %	50 %	25 %	222523376
1517	NC_012032	CGC	2	6	88404	88409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523376
1518	NC_012032	TTGA	2	8	88491	88498	25 %	50 %	25 %	0 %	222523376
1519	NC_012032	CAC	2	6	88562	88567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523376
1520	NC_012032	ACG	2	6	88642	88647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523376
1521	NC_012032	CAA	2	6	88814	88819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523376
1522	NC_012032	CGC	2	6	88940	88945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523376
1523	NC_012032	AG	3	6	88951	88956	50 %	0 %	50 %	0 %	222523376
1524	NC_012032	GAT	2	6	89004	89009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523376
1525	NC_012032	GCA	2	6	89013	89018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523376
1526	NC_012032	CGA	2	6	89084	89089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523376
1527	NC_012032	GAA	2	6	89142	89147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523376
1528	NC_012032	ACC	2	6	89199	89204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523376
1529	NC_012032	GGT	2	6	89223	89228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523376
1530	NC_012032	GC	3	6	89266	89271	0 %	0 %	50 %	50 %	222523376
1531	NC_012032	TGA	2	6	89449	89454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523376
1532	NC_012032	TGC	2	6	89643	89648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523377
1533	NC_012032	T	7	7	89702	89708	0 %	100 %	0 %	0 %	222523377
1534	NC_012032	CAG	2	6	89756	89761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523377
1535	NC_012032	GGGTG	3	15	89816	89830	0 %	20 %	80 %	0 %	222523377
1536	NC_012032	CTG	2	6	89831	89836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523377
1537	NC_012032	CAC	2	6	89850	89855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523377
1538	NC_012032	GCA	2	6	89879	89884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523377
1539	NC_012032	TCTG	2	8	89914	89921	0 %	50 %	25 %	25 %	222523377
1540	NC_012032	CAT	2	6	89989	89994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523377
1541	NC_012032	TG	3	6	90034	90039	0 %	50 %	50 %	0 %	222523377
1542	NC_012032	TGT	2	6	90096	90101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523377
1543	NC_012032	GCTACG	2	12	90148	90159	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222523377
1544	NC_012032	TAT	2	6	90299	90304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222523377
1545	NC_012032	GGCC	2	8	90330	90337	0 %	0 %	50 %	50 %	222523377
1546	NC_012032	CTG	3	9	90338	90346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523377
1547	NC_012032	AGTGC	2	10	90347	90356	20 %	20 %	40 %	20 %	222523377
1548	NC_012032	GAT	2	6	90395	90400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523377
1549	NC_012032	TTG	2	6	90656	90661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523377
1550	NC_012032	TGC	2	6	90733	90738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523377
1551	NC_012032	TTG	2	6	90749	90754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523377
1552	NC_012032	CGG	2	6	90773	90778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523377
1553	NC_012032	TTG	3	9	90783	90791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523377
1554	NC_012032	GCT	2	6	90817	90822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523377
1555	NC_012032	GGC	2	6	90823	90828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523377
1556	NC_012032	TCT	2	6	90846	90851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222523377
1557	NC_012032	TGGT	2	8	90867	90874	0 %	50 %	50 %	0 %	222523377
1558	NC_012032	CTGG	2	8	90889	90896	0 %	25 %	50 %	25 %	222523377
1559	NC_012032	TGG	2	6	90925	90930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523377
1560	NC_012032	GCGA	2	8	90994	91001	25 %	0 %	50 %	25 %	222523377
1561	NC_012032	GA	4	8	91016	91023	50 %	0 %	50 %	0 %	222523377
1562	NC_012032	TCC	2	6	91291	91296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222523378
1563	NC_012032	ATT	2	6	91305	91310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222523378
1564	NC_012032	GGA	2	6	91322	91327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222523378
1565	NC_012032	GCT	2	6	91331	91336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523378
1566	NC_012032	T	7	7	91402	91408	0 %	100 %	0 %	0 %	222523378
1567	NC_012032	CACT	2	8	91452	91459	25 %	25 %	0 %	50 %	222523378
1568	NC_012032	CG	3	6	91523	91528	0 %	0 %	50 %	50 %	222523378
1569	NC_012032	GC	3	6	91543	91548	0 %	0 %	50 %	50 %	222523378
1570	NC_012032	GGCT	2	8	91566	91573	0 %	25 %	50 %	25 %	222523378
1571	NC_012032	CAAA	2	8	91606	91613	75 %	0 %	0 %	25 %	222523378
1572	NC_012032	AAT	2	6	91805	91810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222523378
1573	NC_012032	ATGAG	2	10	91821	91830	40 %	20 %	40 %	0 %	222523378
1574	NC_012032	GAA	2	6	91835	91840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523378
1575	NC_012032	CAA	2	6	91844	91849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523378
1576	NC_012032	AATG	2	8	91912	91919	50 %	25 %	25 %	0 %	222523378
1577	NC_012032	CAA	2	6	91959	91964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523378
1578	NC_012032	TC	3	6	92114	92119	0 %	50 %	0 %	50 %	222523379
1579	NC_012032	ATC	2	6	92123	92128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523379
1580	NC_012032	TG	3	6	92165	92170	0 %	50 %	50 %	0 %	222523379
1581	NC_012032	AC	3	6	92322	92327	50 %	0 %	0 %	50 %	222523379
1582	NC_012032	TTA	2	6	92329	92334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222523379
1583	NC_012032	ACC	2	6	92409	92414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523379
1584	NC_012032	TAG	2	6	92425	92430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523379
1585	NC_012032	ACG	2	6	92438	92443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523379
1586	NC_012032	CGA	2	6	92471	92476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523379
1587	NC_012032	ATC	2	6	92520	92525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523379
1588	NC_012032	GTG	2	6	92535	92540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523379
1589	NC_012032	AAC	2	6	92644	92649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523379
1590	NC_012032	ATT	2	6	92688	92693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222523379
1591	NC_012032	GCA	2	6	92694	92699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523379
1592	NC_012032	TCAG	2	8	92709	92716	25 %	25 %	25 %	25 %	222523379
1593	NC_012032	TACA	2	8	92733	92740	50 %	25 %	0 %	25 %	222523379
1594	NC_012032	GTTC	2	8	92779	92786	0 %	50 %	25 %	25 %	222523379
1595	NC_012032	GAC	2	6	92814	92819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523379
1596	NC_012032	TGA	2	6	92864	92869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523379
1597	NC_012032	CGA	2	6	92951	92956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523379
1598	NC_012032	GAA	2	6	92985	92990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523379
1599	NC_012032	CTT	2	6	93041	93046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222523379
1600	NC_012032	CAA	2	6	93090	93095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523379
1601	NC_012032	TGAA	2	8	93103	93110	50 %	25 %	25 %	0 %	222523379
1602	NC_012032	AAG	2	6	93139	93144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523379
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1605	NC_012032	CCG	2	6	93539	93544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523380
1606	NC_012032	AGC	2	6	93563	93568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523380
1607	NC_012032	CAT	2	6	93672	93677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523380
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1609	NC_012032	GGC	2	6	93834	93839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523380
1610	NC_012032	TCT	2	6	93848	93853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222523380
1611	NC_012032	GCG	2	6	93882	93887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523380
1612	NC_012032	ACCGG	2	10	93898	93907	20 %	0 %	40 %	40 %	222523380
1613	NC_012032	CAC	2	6	93908	93913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523380
1614	NC_012032	TTA	2	6	94054	94059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222523380
1615	NC_012032	AGA	2	6	94173	94178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523380
1616	NC_012032	CAC	2	6	94263	94268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523380
1617	NC_012032	GGAA	2	8	94277	94284	50 %	0 %	50 %	0 %	222523380
1618	NC_012032	GCG	2	6	94319	94324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523380
1619	NC_012032	CTAT	2	8	94532	94539	25 %	50 %	0 %	25 %	222523380
1620	NC_012032	GGC	2	6	95245	95250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523381
1621	NC_012032	CCT	2	6	95285	95290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222523381
1622	NC_012032	CCG	2	6	95296	95301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523381
1623	NC_012032	CGAC	2	8	95356	95363	25 %	0 %	25 %	50 %	222523381
1624	NC_012032	GAT	2	6	95393	95398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523381
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1626	NC_012032	CCTCGT	2	12	95462	95473	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	222523381
1627	NC_012032	CCCG	2	8	95497	95504	0 %	0 %	25 %	75 %	222523381
1628	NC_012032	GCA	3	9	95525	95533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523381
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1655	NC_012032	TGGG	2	8	97646	97653	0 %	25 %	75 %	0 %	222523383
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1744	NC_012032	CA	3	6	103917	103922	50 %	0 %	0 %	50 %	222523386
1745	NC_012032	CCA	2	6	103941	103946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523386
1746	NC_012032	GCC	2	6	104034	104039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523386
1747	NC_012032	GTC	2	6	104090	104095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523386
1748	NC_012032	GCAA	2	8	104099	104106	50 %	0 %	25 %	25 %	222523386
1749	NC_012032	GGC	2	6	104111	104116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523386
1750	NC_012032	TGGCAG	2	12	104223	104234	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222523386
1751	NC_012032	GCT	2	6	104339	104344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523386
1752	NC_012032	TGC	2	6	104365	104370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523386
1753	NC_012032	TGT	2	6	104381	104386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523386
1754	NC_012032	GAT	2	6	104388	104393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523386
1755	NC_012032	GTT	2	6	104414	104419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523386
1756	NC_012032	TG	3	6	104567	104572	0 %	50 %	50 %	0 %	222523386
1757	NC_012032	CGC	2	6	104656	104661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523386
1758	NC_012032	CTG	2	6	104667	104672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523386
1759	NC_012032	GGCT	2	8	104812	104819	0 %	25 %	50 %	25 %	222523386
1760	NC_012032	GTTCG	2	10	104837	104846	0 %	40 %	40 %	20 %	222523386
1761	NC_012032	TGG	2	6	104850	104855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523386
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1766	NC_012032	GC	3	6	105272	105277	0 %	0 %	50 %	50 %	222523387
1767	NC_012032	CCAG	2	8	105330	105337	25 %	0 %	25 %	50 %	222523387
1768	NC_012032	GTCC	2	8	105515	105522	0 %	25 %	25 %	50 %	222523387
1769	NC_012032	GAC	2	6	105548	105553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523387
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1772	NC_012032	TGC	2	6	105641	105646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523387
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1774	NC_012032	GGA	2	6	105727	105732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222523387
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1781	NC_012032	ACGC	2	8	106000	106007	25 %	0 %	25 %	50 %	222523387
1782	NC_012032	TCA	3	9	106030	106038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523387
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1785	NC_012032	ACG	2	6	106131	106136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523387
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1863	NC_012032	GACA	2	8	110236	110243	50 %	0 %	25 %	25 %	222523392
1864	NC_012032	GC	4	8	110259	110266	0 %	0 %	50 %	50 %	222523392
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1866	NC_012032	TGA	2	6	110285	110290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523392
1867	NC_012032	GC	3	6	110349	110354	0 %	0 %	50 %	50 %	222523392
1868	NC_012032	GTG	2	6	110372	110377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523392
1869	NC_012032	GC	3	6	110424	110429	0 %	0 %	50 %	50 %	222523392
1870	NC_012032	GC	4	8	110435	110442	0 %	0 %	50 %	50 %	222523392
1871	NC_012032	TGC	2	6	110449	110454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523392
1872	NC_012032	GTG	2	6	110460	110465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523392
1873	NC_012032	GC	3	6	110512	110517	0 %	0 %	50 %	50 %	222523392
1874	NC_012032	GC	4	8	110523	110530	0 %	0 %	50 %	50 %	222523392
1875	NC_012032	TGC	2	6	110537	110542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523392
1876	NC_012032	ATGA	2	8	110550	110557	50 %	25 %	25 %	0 %	222523392
1877	NC_012032	CGG	2	6	110810	110815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523393
1878	NC_012032	GGC	2	6	110817	110822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523393
1879	NC_012032	CGC	2	6	110880	110885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523393
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1882	NC_012032	CTGC	2	8	111217	111224	0 %	25 %	25 %	50 %	222523393
1883	NC_012032	GAG	3	9	111260	111268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222523393
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1889	NC_012032	CTTC	2	8	111447	111454	0 %	50 %	0 %	50 %	222523393
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1891	NC_012032	CGG	2	6	111581	111586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523393
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1989	NC_012032	CGT	2	6	124256	124261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523399
1990	NC_012032	CAG	2	6	124292	124297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523399
1991	NC_012032	GCTG	2	8	124322	124329	0 %	25 %	50 %	25 %	222523399
1992	NC_012032	ACT	2	6	124331	124336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523399
1993	NC_012032	TTCA	2	8	124347	124354	25 %	50 %	0 %	25 %	222523399
1994	NC_012032	ACT	2	6	124378	124383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523399
1995	NC_012032	CGCA	2	8	124457	124464	25 %	0 %	25 %	50 %	222523399
1996	NC_012032	CAG	2	6	124474	124479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523399
1997	NC_012032	GGC	2	6	124499	124504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523399
1998	NC_012032	CGC	2	6	124571	124576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523399
1999	NC_012032	CCG	2	6	124591	124596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523399
2000	NC_012032	TCT	2	6	124645	124650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222523399

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