MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 84736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_012032	CTGGC	2	10	618906	618915	0 %	20 %	40 %	40 %	222523810
10002	NC_012032	CAC	2	6	618919	618924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523810
10003	NC_012032	CTG	2	6	618936	618941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523810
10004	NC_012032	TGGC	2	8	618989	618996	0 %	25 %	50 %	25 %	222523810
10005	NC_012032	GCA	2	6	619086	619091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523810
10006	NC_012032	CGG	2	6	619159	619164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523810
10007	NC_012032	TGC	2	6	619178	619183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523810
10008	NC_012032	CCGC	2	8	619229	619236	0 %	0 %	25 %	75 %	222523810
10009	NC_012032	GCTG	2	8	619336	619343	0 %	25 %	50 %	25 %	222523810
10010	NC_012032	CGC	2	6	619358	619363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523810
10011	NC_012032	ACG	2	6	619386	619391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523810
10012	NC_012032	TGC	2	6	619466	619471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523810
10013	NC_012032	GCA	2	6	619557	619562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523810
10014	NC_012032	GCT	2	6	619581	619586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523810
10015	NC_012032	CGAG	2	8	619592	619599	25 %	0 %	50 %	25 %	222523810
10016	NC_012032	CGG	3	9	619666	619674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523810
10017	NC_012032	TGG	2	6	619765	619770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523810
10018	NC_012032	GTT	2	6	619868	619873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523810
10019	NC_012032	CAGT	2	8	619957	619964	25 %	25 %	25 %	25 %	222523810
10020	NC_012032	ACC	2	6	619991	619996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523810
10021	NC_012032	GCT	2	6	620045	620050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523810
10022	NC_012032	CTT	2	6	620081	620086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222523810
10023	NC_012032	CGT	2	6	620103	620108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523810
10024	NC_012032	TC	3	6	620343	620348	0 %	50 %	0 %	50 %	222523811
10025	NC_012032	GTT	2	6	620362	620367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523811
10026	NC_012032	CAA	2	6	620386	620391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523811
10027	NC_012032	CAT	2	6	620593	620598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523811
10028	NC_012032	CGA	2	6	620610	620615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523811
10029	NC_012032	CGA	2	6	620756	620761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523811
10030	NC_012032	TGG	2	6	621120	621125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523811
10031	NC_012032	CCG	2	6	621126	621131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523811
10032	NC_012032	GA	3	6	621147	621152	50 %	0 %	50 %	0 %	222523811
10033	NC_012032	CAT	2	6	621253	621258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523811
10034	NC_012032	AAC	2	6	621500	621505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523812
10035	NC_012032	GGT	2	6	621570	621575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523812
10036	NC_012032	GTA	2	6	621640	621645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523812
10037	NC_012032	GTG	2	6	621745	621750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523812
10038	NC_012032	AGA	2	6	621764	621769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523812
10039	NC_012032	CTC	2	6	621873	621878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222523812
10040	NC_012032	TGA	2	6	621890	621895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523812
10041	NC_012032	GC	3	6	621960	621965	0 %	0 %	50 %	50 %	222523812
10042	NC_012032	ACT	2	6	622034	622039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523813
10043	NC_012032	CCTCA	2	10	622149	622158	20 %	20 %	0 %	60 %	222523813
10044	NC_012032	GTCA	2	8	622215	622222	25 %	25 %	25 %	25 %	222523813
10045	NC_012032	ACATT	2	10	622268	622277	40 %	40 %	0 %	20 %	222523813
10046	NC_012032	ACG	2	6	622299	622304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523813
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10048	NC_012032	CGA	2	6	622448	622453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523813
10049	NC_012032	GCA	2	6	622575	622580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523813
10050	NC_012032	GTG	2	6	622611	622616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523813
10051	NC_012032	GCC	3	9	622694	622702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523813
10052	NC_012032	ACC	2	6	622703	622708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523813
10053	NC_012032	ATT	2	6	622749	622754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222523813
10054	NC_012032	GCA	2	6	622787	622792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523813
10055	NC_012032	GAA	2	6	622812	622817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523813
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10057	NC_012032	CAG	2	6	622933	622938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523813
10058	NC_012032	GGTA	2	8	623021	623028	25 %	25 %	50 %	0 %	222523813
10059	NC_012032	AGT	2	6	623070	623075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523813
10060	NC_012032	ACCA	2	8	623159	623166	50 %	0 %	0 %	50 %	222523813
10061	NC_012032	TCG	2	6	623167	623172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523813
10062	NC_012032	TTA	2	6	623226	623231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222523813
10063	NC_012032	TCGC	2	8	623416	623423	0 %	25 %	25 %	50 %	222523813
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10067	NC_012032	CGAC	2	8	623678	623685	25 %	0 %	25 %	50 %	222523813
10068	NC_012032	GTG	2	6	623718	623723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523813
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10071	NC_012032	GGA	2	6	623816	623821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222523813
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10073	NC_012032	CAT	2	6	624094	624099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523814
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10087	NC_012032	GCA	2	6	625587	625592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523816
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10102	NC_012032	GGC	2	6	626384	626389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523817
10103	NC_012032	CTGA	2	8	626437	626444	25 %	25 %	25 %	25 %	222523817
10104	NC_012032	CAT	2	6	626445	626450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523817
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10107	NC_012032	CAG	2	6	626536	626541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523817
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10109	NC_012032	ACC	2	6	626597	626602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523817
10110	NC_012032	ATCAG	2	10	626657	626666	40 %	20 %	20 %	20 %	222523817
10111	NC_012032	AC	3	6	626730	626735	50 %	0 %	0 %	50 %	222523817
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10117	NC_012032	ACTA	2	8	627160	627167	50 %	25 %	0 %	25 %	222523818
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10119	NC_012032	GCC	2	6	627213	627218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523818
10120	NC_012032	CTGAT	2	10	627231	627240	20 %	40 %	20 %	20 %	222523818
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10239	NC_012032	CTT	2	6	633736	633741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222523823
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10354	NC_012032	ATG	2	6	640934	640939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523828
10355	NC_012032	TCGT	3	12	641031	641042	0 %	50 %	25 %	25 %	222523828
10356	NC_012032	GCCGAT	2	12	641075	641086	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222523828
10357	NC_012032	GTG	2	6	641118	641123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523828
10358	NC_012032	AAG	2	6	641214	641219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523828
10359	NC_012032	CAG	2	6	641255	641260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523828
10360	NC_012032	TGG	2	6	641263	641268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523828
10361	NC_012032	AAG	2	6	641279	641284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523828
10362	NC_012032	GTG	2	6	641391	641396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523829
10363	NC_012032	GCC	2	6	641448	641453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523829
10364	NC_012032	GGC	2	6	641459	641464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523829
10365	NC_012032	ATC	2	6	641604	641609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523829
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10368	NC_012032	CAT	2	6	641737	641742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523829
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10370	NC_012032	CGG	2	6	642031	642036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523829
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10372	NC_012032	TGG	2	6	642102	642107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523829
10373	NC_012032	CCG	2	6	642116	642121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523829
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10376	NC_012032	GC	3	6	642169	642174	0 %	0 %	50 %	50 %	222523829
10377	NC_012032	TCTA	2	8	642351	642358	25 %	50 %	0 %	25 %	222523829
10378	NC_012032	TCCG	2	8	642543	642550	0 %	25 %	25 %	50 %	222523829
10379	NC_012032	ACGCG	2	10	642653	642662	20 %	0 %	40 %	40 %	222523829
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10384	NC_012032	GC	3	6	642963	642968	0 %	0 %	50 %	50 %	222523830
10385	NC_012032	GAT	2	6	642973	642978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523830
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10389	NC_012032	ACC	2	6	643315	643320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523830
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10420	NC_012032	GACA	2	8	645463	645470	50 %	0 %	25 %	25 %	222523832
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10423	NC_012032	C	6	6	645571	645576	0 %	0 %	0 %	100 %	222523832
10424	NC_012032	GGCC	2	8	645584	645591	0 %	0 %	50 %	50 %	222523832
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10429	NC_012032	CAC	2	6	645707	645712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523832
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10432	NC_012032	GGGCCA	2	12	645934	645945	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222523832
10433	NC_012032	GCC	2	6	645996	646001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523832
10434	NC_012032	TCG	2	6	646035	646040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523832
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10437	NC_012032	ATT	2	6	646091	646096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222523832
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10440	NC_012032	TGC	2	6	646695	646700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523833
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10442	NC_012032	ATC	2	6	646921	646926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523833
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10475	NC_012032	T	6	6	648612	648617	0 %	100 %	0 %	0 %	222523835
10476	NC_012032	TCG	2	6	648664	648669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523835
10477	NC_012032	AGC	2	6	648698	648703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523835
10478	NC_012032	TCA	2	6	648706	648711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523835
10479	NC_012032	GTG	2	6	648794	648799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523835
10480	NC_012032	CAA	2	6	648848	648853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523835
10481	NC_012032	CGG	2	6	648881	648886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523835
10482	NC_012032	CTT	2	6	648936	648941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222523835
10483	NC_012032	GTT	2	6	648999	649004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523835
10484	NC_012032	GGT	2	6	649044	649049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523835
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10486	NC_012032	CGG	2	6	649125	649130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523835
10487	NC_012032	TGT	2	6	649133	649138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523835
10488	NC_012032	TTG	2	6	649254	649259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523835
10489	NC_012032	ACCT	2	8	649263	649270	25 %	25 %	0 %	50 %	222523835
10490	NC_012032	TCA	2	6	649283	649288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523835
10491	NC_012032	CTTT	2	8	649417	649424	0 %	75 %	0 %	25 %	222523836
10492	NC_012032	TCGAC	2	10	649443	649452	20 %	20 %	20 %	40 %	222523836
10493	NC_012032	CGAAG	2	10	649488	649497	40 %	0 %	40 %	20 %	222523836
10494	NC_012032	C	6	6	649498	649503	0 %	0 %	0 %	100 %	222523836
10495	NC_012032	AAT	2	6	649587	649592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222523836
10496	NC_012032	TCG	2	6	649595	649600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523836
10497	NC_012032	GATC	2	8	649614	649621	25 %	25 %	25 %	25 %	222523836
10498	NC_012032	TGG	2	6	649644	649649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523836
10499	NC_012032	GTC	2	6	649652	649657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523836
10500	NC_012032	AGT	2	6	649700	649705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523836

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