MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 84736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_012032	TGG	2	6	379934	379939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523611
6002	NC_012032	TGA	2	6	380060	380065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523611
6003	NC_012032	TGGT	2	8	380078	380085	0 %	50 %	50 %	0 %	222523611
6004	NC_012032	TCG	2	6	380135	380140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523611
6005	NC_012032	ACC	2	6	380146	380151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523611
6006	NC_012032	GAT	2	6	380152	380157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523611
6007	NC_012032	CGG	2	6	380270	380275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523611
6008	NC_012032	ACC	2	6	380320	380325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523611
6009	NC_012032	TCA	2	6	380372	380377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523611
6010	NC_012032	TGC	2	6	380483	380488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523611
6011	NC_012032	GCCT	2	8	380513	380520	0 %	25 %	25 %	50 %	222523611
6012	NC_012032	GGT	2	6	380536	380541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523611
6013	NC_012032	GCC	2	6	380561	380566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523611
6014	NC_012032	ATC	2	6	380584	380589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523611
6015	NC_012032	AGC	2	6	380614	380619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523611
6016	NC_012032	GGC	3	9	380629	380637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523611
6017	NC_012032	CCGGTA	2	12	380657	380668	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222523611
6018	NC_012032	CAA	2	6	380697	380702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523611
6019	NC_012032	TGC	2	6	380703	380708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523611
6020	NC_012032	GGT	2	6	380719	380724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523611
6021	NC_012032	CAT	2	6	380763	380768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523611
6022	NC_012032	AAT	2	6	380857	380862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222523611
6023	NC_012032	CGG	2	6	380865	380870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523611
6024	NC_012032	GCTC	2	8	380888	380895	0 %	25 %	25 %	50 %	222523611
6025	NC_012032	CTC	2	6	380974	380979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222523611
6026	NC_012032	ACA	2	6	380984	380989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523611
6027	NC_012032	CGG	2	6	380994	380999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523611
6028	NC_012032	ACC	2	6	381018	381023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523611
6029	NC_012032	ATA	2	6	381053	381058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222523611
6030	NC_012032	GTG	2	6	381083	381088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523611
6031	NC_012032	AAC	2	6	381127	381132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523611
6032	NC_012032	GGC	2	6	381133	381138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523611
6033	NC_012032	GCG	2	6	381221	381226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523611
6034	NC_012032	CA	3	6	381476	381481	50 %	0 %	0 %	50 %	222523612
6035	NC_012032	TCA	2	6	381518	381523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523612
6036	NC_012032	ATC	2	6	381526	381531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523612
6037	NC_012032	TCG	2	6	381545	381550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523612
6038	NC_012032	TCGC	2	8	381563	381570	0 %	25 %	25 %	50 %	222523612
6039	NC_012032	TCA	2	6	381586	381591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523612
6040	NC_012032	GGT	2	6	381609	381614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523612
6041	NC_012032	GCA	2	6	381647	381652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523612
6042	NC_012032	GTG	2	6	381667	381672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523612
6043	NC_012032	CAC	2	6	381678	381683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523612
6044	NC_012032	TCC	2	6	381729	381734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222523612
6045	NC_012032	TCG	2	6	381741	381746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523612
6046	NC_012032	TGG	2	6	381846	381851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523612
6047	NC_012032	CTC	2	6	381892	381897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222523612
6048	NC_012032	TTG	2	6	381901	381906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523612
6049	NC_012032	CTG	3	9	381937	381945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523612
6050	NC_012032	CGA	2	6	381946	381951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523612
6051	NC_012032	ACT	2	6	381975	381980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523612
6052	NC_012032	GGC	2	6	382273	382278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523613
6053	NC_012032	GGT	2	6	382419	382424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523613
6054	NC_012032	GCC	2	6	382498	382503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523613
6055	NC_012032	CTA	2	6	382521	382526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523613
6056	NC_012032	GCG	2	6	382565	382570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523613
6057	NC_012032	AGC	2	6	382573	382578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523613
6058	NC_012032	CGA	2	6	382623	382628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523613
6059	NC_012032	CAG	2	6	382641	382646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523613
6060	NC_012032	CT	3	6	382727	382732	0 %	50 %	0 %	50 %	222523613
6061	NC_012032	CCG	2	6	382787	382792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523613
6062	NC_012032	GGC	2	6	382852	382857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523613
6063	NC_012032	GGGT	2	8	383042	383049	0 %	25 %	75 %	0 %	222523613
6064	NC_012032	TGC	2	6	383096	383101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523613
6065	NC_012032	CAC	2	6	383194	383199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523614
6066	NC_012032	GGT	2	6	383264	383269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523614
6067	NC_012032	GATG	2	8	383446	383453	25 %	25 %	50 %	0 %	222523614
6068	NC_012032	GGAA	2	8	383467	383474	50 %	0 %	50 %	0 %	222523614
6069	NC_012032	TCA	2	6	383553	383558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523614
6070	NC_012032	ATC	2	6	383564	383569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523614
6071	NC_012032	GCT	2	6	383587	383592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523614
6072	NC_012032	CAG	2	6	383599	383604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523614
6073	NC_012032	CAT	2	6	383701	383706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523614
6074	NC_012032	GCT	3	9	383776	383784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523614
6075	NC_012032	TGGG	2	8	383889	383896	0 %	25 %	75 %	0 %	222523614
6076	NC_012032	ATC	2	6	383909	383914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523614
6077	NC_012032	CAT	2	6	383917	383922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523614
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6082	NC_012032	GCTC	2	8	384345	384352	0 %	25 %	25 %	50 %	222523615
6083	NC_012032	GGA	2	6	384379	384384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222523615
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6085	NC_012032	GGAT	2	8	384459	384466	25 %	25 %	50 %	0 %	222523615
6086	NC_012032	CATCG	2	10	384486	384495	20 %	20 %	20 %	40 %	222523615
6087	NC_012032	GCT	2	6	384535	384540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523615
6088	NC_012032	GAC	2	6	384541	384546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523615
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6090	NC_012032	GGAGCG	2	12	384610	384621	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	222523615
6091	NC_012032	CGG	3	9	384633	384641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523615
6092	NC_012032	CGG	3	9	384750	384758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523615
6093	NC_012032	AAC	2	6	384805	384810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523615
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6100	NC_012032	GTTC	2	8	384941	384948	0 %	50 %	25 %	25 %	222523615
6101	NC_012032	AAC	2	6	384952	384957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523615
6102	NC_012032	GCA	2	6	384958	384963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523615
6103	NC_012032	GCG	3	9	384971	384979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523615
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6105	NC_012032	AAC	2	6	385033	385038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523615
6106	NC_012032	GCG	3	9	385130	385138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523615
6107	NC_012032	ACCA	2	8	385186	385193	50 %	0 %	0 %	50 %	222523615
6108	NC_012032	CGG	2	6	385209	385214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523615
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6110	NC_012032	CAAC	2	8	385274	385281	50 %	0 %	0 %	50 %	222523615
6111	NC_012032	GGC	3	9	385282	385290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523615
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6114	NC_012032	AAC	2	6	385417	385422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523615
6115	NC_012032	CGG	3	9	385434	385442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523615
6116	NC_012032	ACGTTG	2	12	385459	385470	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222523615
6117	NC_012032	CAT	2	6	385479	385484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523615
6118	NC_012032	CAT	2	6	385596	385601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523615
6119	NC_012032	GCCT	2	8	385638	385645	0 %	25 %	25 %	50 %	222523615
6120	NC_012032	CAA	2	6	385716	385721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523615
6121	NC_012032	AGT	2	6	385768	385773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523615
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6123	NC_012032	CGC	2	6	385860	385865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523615
6124	NC_012032	CGG	2	6	385941	385946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523615
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6129	NC_012032	CGGCAA	2	12	386103	386114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523615
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6223	NC_012032	AACG	2	8	393527	393534	50 %	0 %	25 %	25 %	222523621
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6229	NC_012032	CGA	2	6	393820	393825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523621
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6232	NC_012032	AGC	2	6	394008	394013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523621
6233	NC_012032	AGGT	2	8	394020	394027	25 %	25 %	50 %	0 %	222523621
6234	NC_012032	GCC	2	6	394135	394140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523621
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6237	NC_012032	CGCTCA	2	12	394281	394292	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222523621
6238	NC_012032	TCG	2	6	394356	394361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523621
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6240	NC_012032	CGG	2	6	394423	394428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523621
6241	NC_012032	CTG	2	6	394472	394477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523621
6242	NC_012032	GGT	2	6	394508	394513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523621
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6245	NC_012032	CAT	2	6	394649	394654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523621
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6247	NC_012032	GCG	2	6	394724	394729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523621
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6250	NC_012032	TGC	2	6	394757	394762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523621
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6255	NC_012032	GATC	2	8	395022	395029	25 %	25 %	25 %	25 %	222523622
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6354	NC_012032	ATAC	2	8	402044	402051	50 %	25 %	0 %	25 %	222523630
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6358	NC_012032	GGTCA	2	10	402273	402282	20 %	20 %	40 %	20 %	222523630
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6362	NC_012032	GC	3	6	402428	402433	0 %	0 %	50 %	50 %	222523630
6363	NC_012032	CTG	2	6	402627	402632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523630
6364	NC_012032	TGA	2	6	402662	402667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523630
6365	NC_012032	CAA	2	6	402774	402779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523630
6366	NC_012032	TGC	2	6	402803	402808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523630
6367	NC_012032	CAA	3	9	402830	402838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523630
6368	NC_012032	TGG	2	6	402857	402862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523630
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6370	NC_012032	CTT	2	6	402959	402964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222523630
6371	NC_012032	CGTG	2	8	403256	403263	0 %	25 %	50 %	25 %	222523631
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6373	NC_012032	CAG	2	6	403362	403367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523632
6374	NC_012032	TATC	2	8	403476	403483	25 %	50 %	0 %	25 %	222523632
6375	NC_012032	AGG	2	6	403518	403523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222523632
6376	NC_012032	CCG	2	6	403581	403586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523632
6377	NC_012032	TGC	2	6	403597	403602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523632
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6380	NC_012032	CTC	2	6	403739	403744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222523632
6381	NC_012032	GCC	2	6	403784	403789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523632
6382	NC_012032	ATG	2	6	403811	403816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523632
6383	NC_012032	ATT	2	6	403817	403822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222523632
6384	NC_012032	CTTA	2	8	403858	403865	25 %	50 %	0 %	25 %	222523632
6385	NC_012032	TGA	2	6	403875	403880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523632
6386	NC_012032	CTG	2	6	403913	403918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523632
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6388	NC_012032	CTG	2	6	404069	404074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523632
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6390	NC_012032	GTATGG	2	12	404097	404108	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	222523632
6391	NC_012032	CCG	2	6	404238	404243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523632
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6393	NC_012032	CCTG	2	8	404261	404268	0 %	25 %	25 %	50 %	222523632
6394	NC_012032	CAA	2	6	404283	404288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523632
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6397	NC_012032	CGT	2	6	404535	404540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523633
6398	NC_012032	CGAA	2	8	404697	404704	50 %	0 %	25 %	25 %	222523633
6399	NC_012032	ATG	2	6	404789	404794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523633
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6401	NC_012032	GAT	2	6	404976	404981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523633
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6403	NC_012032	GATCTT	2	12	405040	405051	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222523633
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6422	NC_012032	AGT	2	6	406359	406364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523635
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6425	NC_012032	GAT	2	6	406478	406483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523635
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6429	NC_012032	CCGAT	2	10	406755	406764	20 %	20 %	20 %	40 %	222523636
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6433	NC_012032	CAT	2	6	406823	406828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523636
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6435	NC_012032	CGTTG	2	10	407076	407085	0 %	40 %	40 %	20 %	222523636
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6442	NC_012032	AGTC	2	8	407536	407543	25 %	25 %	25 %	25 %	222523636
6443	NC_012032	ACT	2	6	407550	407555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523636
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6450	NC_012032	CAG	2	6	407940	407945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523637
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6454	NC_012032	CCAG	2	8	408107	408114	25 %	0 %	25 %	50 %	222523637
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6463	NC_012032	CGT	2	6	408812	408817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523638
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6472	NC_012032	GAT	2	6	409963	409968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523639
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6474	NC_012032	GAA	2	6	410038	410043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523639
6475	NC_012032	GATA	2	8	410145	410152	50 %	25 %	25 %	0 %	222523639
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6483	NC_012032	GA	3	6	410639	410644	50 %	0 %	50 %	0 %	222523640
6484	NC_012032	CAT	2	6	410718	410723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523640
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6487	NC_012032	TCT	2	6	410816	410821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222523640
6488	NC_012032	TCA	2	6	410828	410833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523640
6489	NC_012032	AT	3	6	410838	410843	50 %	50 %	0 %	0 %	222523640
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6491	NC_012032	GC	3	6	410934	410939	0 %	0 %	50 %	50 %	222523640
6492	NC_012032	TCG	2	6	410963	410968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523640
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