MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 84736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012032	TCAC	2	8	349385	349392	25 %	25 %	0 %	50 %	222523582
5502	NC_012032	GCC	2	6	349415	349420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523582
5503	NC_012032	CCA	2	6	349449	349454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523582
5504	NC_012032	ATC	2	6	349504	349509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523582
5505	NC_012032	TCA	2	6	349551	349556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523582
5506	NC_012032	TGAAG	2	10	349583	349592	40 %	20 %	40 %	0 %	222523582
5507	NC_012032	ATCAAG	2	12	349594	349605	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	222523582
5508	NC_012032	GCC	2	6	349616	349621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523582
5509	NC_012032	AAT	2	6	349624	349629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222523582
5510	NC_012032	GCT	2	6	349692	349697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523582
5511	NC_012032	CAG	2	6	349720	349725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523582
5512	NC_012032	CTG	2	6	349873	349878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523582
5513	NC_012032	GATG	2	8	349903	349910	25 %	25 %	50 %	0 %	222523582
5514	NC_012032	ACCA	2	8	349930	349937	50 %	0 %	0 %	50 %	222523582
5515	NC_012032	GGT	2	6	349943	349948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523582
5516	NC_012032	CATA	2	8	349965	349972	50 %	25 %	0 %	25 %	222523582
5517	NC_012032	GTTG	2	8	350261	350268	0 %	50 %	50 %	0 %	222523583
5518	NC_012032	CCAG	2	8	350269	350276	25 %	0 %	25 %	50 %	222523583
5519	NC_012032	CTG	2	6	350284	350289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523583
5520	NC_012032	CCA	2	6	350323	350328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523583
5521	NC_012032	AGC	2	6	350370	350375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523583
5522	NC_012032	TTG	2	6	350405	350410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523583
5523	NC_012032	TGA	2	6	350435	350440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523583
5524	NC_012032	ATG	2	6	350466	350471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523583
5525	NC_012032	GCA	2	6	350518	350523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523583
5526	NC_012032	CGA	2	6	350545	350550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523583
5527	NC_012032	CAA	2	6	350551	350556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523583
5528	NC_012032	AAT	2	6	350612	350617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222523583
5529	NC_012032	TGC	2	6	350663	350668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523583
5530	NC_012032	AGG	2	6	350716	350721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222523583
5531	NC_012032	ATC	2	6	350739	350744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523583
5532	NC_012032	CAA	2	6	350747	350752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523583
5533	NC_012032	GCC	2	6	350773	350778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523583
5534	NC_012032	GCC	3	9	350835	350843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523583
5535	NC_012032	CGG	2	6	350851	350856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523583
5536	NC_012032	G	6	6	350921	350926	0 %	0 %	100 %	0 %	222523583
5537	NC_012032	CCG	2	6	350957	350962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523583
5538	NC_012032	AAT	2	6	350984	350989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222523583
5539	NC_012032	GCA	2	6	351010	351015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523583
5540	NC_012032	GA	3	6	351352	351357	50 %	0 %	50 %	0 %	222523584
5541	NC_012032	GCA	2	6	351395	351400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523584
5542	NC_012032	CAGGA	2	10	351415	351424	40 %	0 %	40 %	20 %	222523584
5543	NC_012032	GGTC	2	8	351438	351445	0 %	25 %	50 %	25 %	222523584
5544	NC_012032	TCA	2	6	351467	351472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523584
5545	NC_012032	TGT	2	6	351503	351508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523584
5546	NC_012032	GTG	2	6	351522	351527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523584
5547	NC_012032	GCCGG	2	10	351530	351539	0 %	0 %	60 %	40 %	222523584
5548	NC_012032	ACC	2	6	351545	351550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523584
5549	NC_012032	CA	3	6	351636	351641	50 %	0 %	0 %	50 %	222523584
5550	NC_012032	TCG	2	6	351644	351649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523584
5551	NC_012032	TCACG	2	10	351711	351720	20 %	20 %	20 %	40 %	222523584
5552	NC_012032	ACCG	2	8	351841	351848	25 %	0 %	25 %	50 %	222523584
5553	NC_012032	A	7	7	351940	351946	100 %	0 %	0 %	0 %	222523584
5554	NC_012032	TCAG	2	8	351992	351999	25 %	25 %	25 %	25 %	222523584
5555	NC_012032	ACC	2	6	352163	352168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523584
5556	NC_012032	CGG	2	6	352185	352190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523584
5557	NC_012032	CGA	2	6	352205	352210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523584
5558	NC_012032	CATT	2	8	352233	352240	25 %	50 %	0 %	25 %	222523584
5559	NC_012032	CAG	2	6	352954	352959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523585
5560	NC_012032	TGAT	2	8	353162	353169	25 %	50 %	25 %	0 %	222523585
5561	NC_012032	CTG	2	6	353173	353178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523585
5562	NC_012032	CGG	2	6	353184	353189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523585
5563	NC_012032	TCT	2	6	353306	353311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222523585
5564	NC_012032	TGA	2	6	354116	354121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523586
5565	NC_012032	A	6	6	354205	354210	100 %	0 %	0 %	0 %	222523586
5566	NC_012032	AACGCA	2	12	354249	354260	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	222523586
5567	NC_012032	ACA	2	6	354313	354318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523586
5568	NC_012032	GGTTTC	2	12	354388	354399	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	222523586
5569	NC_012032	TGC	2	6	354416	354421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523586
5570	NC_012032	AGA	2	6	354429	354434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523586
5571	NC_012032	TCG	2	6	354459	354464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523586
5572	NC_012032	CCG	2	6	354508	354513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523586
5573	NC_012032	AG	3	6	354516	354521	50 %	0 %	50 %	0 %	222523586
5574	NC_012032	TAT	2	6	354529	354534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222523586
5575	NC_012032	ATT	2	6	354537	354542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222523586
5576	NC_012032	T	6	6	354595	354600	0 %	100 %	0 %	0 %	222523586
5577	NC_012032	TCC	2	6	354726	354731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222523586
5578	NC_012032	ATT	2	6	354796	354801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222523586
5579	NC_012032	TTG	2	6	354811	354816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523586
5580	NC_012032	GAA	2	6	354832	354837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523586
5581	NC_012032	GCG	2	6	354863	354868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523586
5582	NC_012032	TGA	2	6	354888	354893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523586
5583	NC_012032	ATG	2	6	354965	354970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523586
5584	NC_012032	TGG	2	6	355050	355055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523586
5585	NC_012032	TGC	2	6	355098	355103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523586
5586	NC_012032	TGG	2	6	355119	355124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523586
5587	NC_012032	CGC	2	6	355288	355293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523586
5588	NC_012032	GCG	2	6	355341	355346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523586
5589	NC_012032	GCG	2	6	355548	355553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523587
5590	NC_012032	CGCT	2	8	355570	355577	0 %	25 %	25 %	50 %	222523587
5591	NC_012032	CAG	2	6	355608	355613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523587
5592	NC_012032	GCA	2	6	355616	355621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523587
5593	NC_012032	CCG	2	6	355637	355642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523587
5594	NC_012032	AACC	2	8	355710	355717	50 %	0 %	0 %	50 %	222523587
5595	NC_012032	CCG	2	6	355800	355805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523587
5596	NC_012032	TCT	2	6	355815	355820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222523587
5597	NC_012032	GCG	2	6	355827	355832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523587
5598	NC_012032	TGCAGA	2	12	355857	355868	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222523587
5599	NC_012032	GGC	2	6	355880	355885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523587
5600	NC_012032	GTG	2	6	355890	355895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523587
5601	NC_012032	CGC	2	6	355944	355949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523587
5602	NC_012032	GGGC	2	8	355951	355958	0 %	0 %	75 %	25 %	222523587
5603	NC_012032	CAT	2	6	355963	355968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523587
5604	NC_012032	GAT	2	6	356029	356034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523587
5605	NC_012032	TCAT	2	8	356048	356055	25 %	50 %	0 %	25 %	222523587
5606	NC_012032	TTC	2	6	356114	356119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222523587
5607	NC_012032	GGT	2	6	356120	356125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523587
5608	NC_012032	CGGGT	2	10	356349	356358	0 %	20 %	60 %	20 %	222523587
5609	NC_012032	GAA	2	6	356392	356397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523587
5610	NC_012032	AGCGGT	2	12	356432	356443	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222523587
5611	NC_012032	CTC	2	6	356526	356531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222523588
5612	NC_012032	GTT	2	6	356534	356539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523588
5613	NC_012032	TCAC	2	8	356656	356663	25 %	25 %	0 %	50 %	222523588
5614	NC_012032	TGT	2	6	356664	356669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523588
5615	NC_012032	TACA	2	8	356685	356692	50 %	25 %	0 %	25 %	222523588
5616	NC_012032	CCG	2	6	357240	357245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523589
5617	NC_012032	TGGCCG	2	12	357254	357265	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222523589
5618	NC_012032	GCAT	2	8	357317	357324	25 %	25 %	25 %	25 %	222523589
5619	NC_012032	GAT	2	6	357338	357343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523589
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5621	NC_012032	ATCC	2	8	357483	357490	25 %	25 %	0 %	50 %	222523589
5622	NC_012032	GC	3	6	357516	357521	0 %	0 %	50 %	50 %	222523589
5623	NC_012032	AGG	2	6	357624	357629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222523589
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5625	NC_012032	CCGT	2	8	357691	357698	0 %	25 %	25 %	50 %	222523589
5626	NC_012032	GCC	2	6	357703	357708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523589
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5661	NC_012032	TGG	3	9	361613	361621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523592
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5728	NC_012032	CACCG	2	10	366331	366340	20 %	0 %	20 %	60 %	222523595
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5733	NC_012032	ATC	2	6	366871	366876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523596
5734	NC_012032	GCTT	2	8	366880	366887	0 %	50 %	25 %	25 %	222523596
5735	NC_012032	C	6	6	366919	366924	0 %	0 %	0 %	100 %	222523596
5736	NC_012032	GC	3	6	367096	367101	0 %	0 %	50 %	50 %	222523596
5737	NC_012032	CGC	2	6	367171	367176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523596
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5739	NC_012032	TC	3	6	367197	367202	0 %	50 %	0 %	50 %	222523596
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5853	NC_012032	TGC	2	6	371700	371705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523601
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5856	NC_012032	CAAT	2	8	371765	371772	50 %	25 %	0 %	25 %	222523601
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5858	NC_012032	TCG	2	6	371848	371853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523601
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5863	NC_012032	GCCAGC	2	12	372152	372163	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222523602
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5984	NC_012032	GCC	2	6	378495	378500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523610
5985	NC_012032	CCG	2	6	378509	378514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523610
5986	NC_012032	ACCA	2	8	378549	378556	50 %	0 %	0 %	50 %	222523610
5987	NC_012032	GGT	2	6	378563	378568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523610
5988	NC_012032	CCAA	2	8	378672	378679	50 %	0 %	0 %	50 %	222523610
5989	NC_012032	ATC	2	6	378717	378722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523610
5990	NC_012032	CA	3	6	378834	378839	50 %	0 %	0 %	50 %	222523610
5991	NC_012032	CTG	2	6	378845	378850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523610
5992	NC_012032	CAA	2	6	378892	378897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523610
5993	NC_012032	CGA	2	6	378963	378968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523610
5994	NC_012032	AGAGGC	2	12	379052	379063	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222523610
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5996	NC_012032	GGT	2	6	379265	379270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523610
5997	NC_012032	GGTG	2	8	379400	379407	0 %	25 %	75 %	0 %	222523610
5998	NC_012032	AGA	3	9	379408	379416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523610
5999	NC_012032	CAA	2	6	379471	379476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523610
6000	NC_012032	CAG	2	6	379481	379486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523610

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