MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clostridium cellulolyticum H10 chromosome

Total Repeats: 45438

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011898	ATT	2	6	68	73	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927460
2	NC_011898	CTG	2	6	166	171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220927460
3	NC_011898	TAA	2	6	176	181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927460
4	NC_011898	TCA	2	6	543	548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220927460
5	NC_011898	GAT	2	6	585	590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927460
6	NC_011898	GAA	2	6	597	602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927460
7	NC_011898	GAA	3	9	678	686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927460
8	NC_011898	CCT	2	6	750	755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220927460
9	NC_011898	TGA	2	6	893	898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927460
10	NC_011898	ATA	2	6	996	1001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927460
11	NC_011898	CAA	2	6	1040	1045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220927460
12	NC_011898	ATT	2	6	1056	1061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927460
13	NC_011898	AAG	2	6	1081	1086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927460
14	NC_011898	TGA	2	6	1115	1120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927460
15	NC_011898	AGA	2	6	1134	1139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927460
16	NC_011898	GGT	2	6	1230	1235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220927460
17	NC_011898	TAA	2	6	1274	1279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927460
18	NC_011898	TAA	2	6	1286	1291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927460
19	NC_011898	AAC	2	6	1669	1674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220927461
20	NC_011898	GAT	2	6	1709	1714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927461
21	NC_011898	AAG	2	6	1828	1833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927461
22	NC_011898	TAA	2	6	1870	1875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927461
23	NC_011898	TTG	2	6	1884	1889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220927461
24	NC_011898	TGT	2	6	1951	1956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220927461
25	NC_011898	TGA	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927461
26	NC_011898	AGA	2	6	2129	2134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927461
27	NC_011898	TGA	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927461
28	NC_011898	GTT	2	6	2258	2263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220927461
29	NC_011898	GGA	2	6	2280	2285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220927461
30	NC_011898	TTA	3	9	2358	2366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927461
31	NC_011898	ATA	2	6	2462	2467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927461
32	NC_011898	GAA	2	6	2588	2593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927461
33	NC_011898	TAC	2	6	2614	2619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220927461
34	NC_011898	GGA	2	6	2728	2733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220927462
35	NC_011898	TTA	2	6	2754	2759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927462
36	NC_011898	TAA	2	6	3133	3138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927463
37	NC_011898	GGT	2	6	3186	3191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220927463
38	NC_011898	TTA	2	6	3215	3220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927463
39	NC_011898	AAG	2	6	3231	3236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927463
40	NC_011898	AGA	2	6	3314	3319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927463
41	NC_011898	AGA	2	6	3351	3356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927463
42	NC_011898	TTG	2	6	3361	3366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220927463
43	NC_011898	CAA	2	6	3411	3416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220927463
44	NC_011898	AAC	2	6	3433	3438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220927463
45	NC_011898	CAG	2	6	3461	3466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220927463
46	NC_011898	GCA	2	6	3522	3527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220927463
47	NC_011898	TAT	2	6	3530	3535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927463
48	NC_011898	AAG	2	6	3542	3547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927463
49	NC_011898	AAT	2	6	3557	3562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927463
50	NC_011898	GAT	2	6	3660	3665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927463
51	NC_011898	TAC	2	6	3737	3742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220927463
52	NC_011898	GAT	2	6	3759	3764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927463
53	NC_011898	ACA	2	6	3815	3820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220927463
54	NC_011898	GAT	2	6	3903	3908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927463
55	NC_011898	TTA	2	6	3976	3981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927463
56	NC_011898	TAT	2	6	4012	4017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927463
57	NC_011898	TGT	2	6	4164	4169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220927464
58	NC_011898	ACA	3	9	4210	4218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220927464
59	NC_011898	GAA	3	9	4255	4263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927464
60	NC_011898	GGA	2	6	4284	4289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220927464
61	NC_011898	TAT	2	6	4305	4310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927464
62	NC_011898	ATC	2	6	4353	4358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220927464
63	NC_011898	AAT	2	6	4457	4462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927465
64	NC_011898	CAT	2	6	4562	4567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220927465
65	NC_011898	TGA	2	6	4597	4602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927465
66	NC_011898	ATT	2	6	4625	4630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927465
67	NC_011898	TAC	2	6	4743	4748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220927465
68	NC_011898	GGA	2	6	4754	4759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220927465
69	NC_011898	GTT	2	6	4817	4822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220927465
70	NC_011898	GAA	2	6	4982	4987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927465
71	NC_011898	TGA	2	6	5068	5073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927465
72	NC_011898	GGT	2	6	5114	5119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220927465
73	NC_011898	TAA	2	6	5143	5148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927465
74	NC_011898	ATG	2	6	5166	5171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927465
75	NC_011898	ATA	2	6	5268	5273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927465
76	NC_011898	ACT	2	6	5279	5284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220927465
77	NC_011898	AGC	2	6	5314	5319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220927465
78	NC_011898	TTG	2	6	5499	5504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220927465
79	NC_011898	TGT	2	6	5509	5514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220927465
80	NC_011898	ATT	2	6	5524	5529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927465
81	NC_011898	AGA	2	6	5539	5544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927465
82	NC_011898	CGG	2	6	5550	5555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220927465
83	NC_011898	ATT	2	6	5564	5569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927465
84	NC_011898	AGC	2	6	5605	5610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220927465
85	NC_011898	TTG	2	6	5721	5726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220927465
86	NC_011898	TTA	2	6	5865	5870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927465
87	NC_011898	TGA	2	6	5893	5898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927465
88	NC_011898	TAC	2	6	5979	5984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220927465
89	NC_011898	TTC	2	6	5993	5998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220927465
90	NC_011898	TTG	2	6	6015	6020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220927465
91	NC_011898	CCT	2	6	6047	6052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220927465
92	NC_011898	AGA	2	6	6076	6081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927465
93	NC_011898	TAT	2	6	6083	6088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927465
94	NC_011898	ATG	2	6	6093	6098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927465
95	NC_011898	GAT	2	6	6143	6148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927465
96	NC_011898	ACA	2	6	6212	6217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220927465
97	NC_011898	ATA	2	6	6239	6244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927465
98	NC_011898	CTG	2	6	6270	6275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220927465
99	NC_011898	ATA	2	6	6648	6653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927466
100	NC_011898	ACA	2	6	6690	6695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220927466
101	NC_011898	ACA	2	6	6771	6776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220927466
102	NC_011898	ATG	2	6	6820	6825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927466
103	NC_011898	TTA	2	6	6826	6831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927466
104	NC_011898	ATG	2	6	6835	6840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927466
105	NC_011898	ATT	2	6	6857	6862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927466
106	NC_011898	TAT	2	6	7001	7006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927466
107	NC_011898	TCC	2	6	7016	7021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220927466
108	NC_011898	TAT	2	6	7092	7097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927466
109	NC_011898	TGA	2	6	7120	7125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927466
110	NC_011898	AGA	2	6	7229	7234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927466
111	NC_011898	AAT	2	6	7322	7327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927466
112	NC_011898	ATG	2	6	7333	7338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927466
113	NC_011898	GAA	2	6	7377	7382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927466
114	NC_011898	GGT	2	6	7403	7408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220927466
115	NC_011898	AGA	3	9	7474	7482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927467
116	NC_011898	TGA	3	9	7549	7557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927467
117	NC_011898	TAT	2	6	7609	7614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927467
118	NC_011898	AAT	2	6	7642	7647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927467
119	NC_011898	AAG	2	6	7657	7662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927467
120	NC_011898	AGA	2	6	7768	7773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927467
121	NC_011898	GAA	2	6	7787	7792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927467
122	NC_011898	GAT	2	6	7910	7915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927467
123	NC_011898	ATT	2	6	7928	7933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927467
124	NC_011898	TTA	2	6	7971	7976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927467
125	NC_011898	GCT	2	6	8003	8008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220927467
126	NC_011898	AAG	2	6	8060	8065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927467
127	NC_011898	AAT	2	6	8078	8083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927467
128	NC_011898	ATG	2	6	8220	8225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927467
129	NC_011898	ATT	2	6	8236	8241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927467
130	NC_011898	TAA	2	6	8545	8550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927468
131	NC_011898	AGA	2	6	8690	8695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927468
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