MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium cellulolyticum H10 chromosome

Total Repeats: 73276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011898	ATA	2	6	25681	25686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927483
502	NC_011898	AAT	2	6	25694	25699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927483
503	NC_011898	TGC	2	6	25706	25711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220927483
504	NC_011898	AACA	2	8	25712	25719	75 %	0 %	0 %	25 %	220927483
505	NC_011898	TGC	2	6	25736	25741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220927483
506	NC_011898	AAT	2	6	25820	25825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927483
507	NC_011898	CGGAG	2	10	25898	25907	20 %	0 %	60 %	20 %	220927483
508	NC_011898	ATC	2	6	25960	25965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220927483
509	NC_011898	TTA	2	6	25969	25974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927483
510	NC_011898	GAT	2	6	26064	26069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927483
511	NC_011898	TTTA	2	8	26270	26277	25 %	75 %	0 %	0 %	220927484
512	NC_011898	TTG	2	6	26317	26322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220927484
513	NC_011898	GAA	2	6	26331	26336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927484
514	NC_011898	AGC	2	6	26401	26406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220927484
515	NC_011898	ATT	2	6	26409	26414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927484
516	NC_011898	GGA	2	6	26937	26942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220927484
517	NC_011898	A	6	6	26968	26973	100 %	0 %	0 %	0 %	220927484
518	NC_011898	AGA	3	9	27047	27055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927485
519	NC_011898	TAC	2	6	27098	27103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220927485
520	NC_011898	TA	4	8	27190	27197	50 %	50 %	0 %	0 %	220927485
521	NC_011898	GAAG	2	8	27245	27252	50 %	0 %	50 %	0 %	220927485
522	NC_011898	CTGT	2	8	27273	27280	0 %	50 %	25 %	25 %	220927485
523	NC_011898	A	7	7	27317	27323	100 %	0 %	0 %	0 %	220927485
524	NC_011898	GA	3	6	27350	27355	50 %	0 %	50 %	0 %	220927485
525	NC_011898	ATA	2	6	27367	27372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927485
526	NC_011898	ATA	2	6	27394	27399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927485
527	NC_011898	TAA	2	6	27400	27405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927485
528	NC_011898	A	8	8	27421	27428	100 %	0 %	0 %	0 %	220927485
529	NC_011898	AGG	2	6	27454	27459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220927485
530	NC_011898	T	6	6	27493	27498	0 %	100 %	0 %	0 %	220927485
531	NC_011898	ATTT	2	8	27556	27563	25 %	75 %	0 %	0 %	220927486
532	NC_011898	CCG	2	6	27673	27678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220927486
533	NC_011898	CAA	2	6	27758	27763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220927486
534	NC_011898	AGG	2	6	27769	27774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220927486
535	NC_011898	GGAA	2	8	27784	27791	50 %	0 %	50 %	0 %	220927486
536	NC_011898	AGAAA	2	10	27795	27804	80 %	0 %	20 %	0 %	220927486
537	NC_011898	AAT	2	6	27890	27895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927486
538	NC_011898	A	6	6	27958	27963	100 %	0 %	0 %	0 %	220927486
539	NC_011898	ATG	2	6	28008	28013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927486
540	NC_011898	ATT	2	6	28015	28020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927486
541	NC_011898	ATCA	2	8	28053	28060	50 %	25 %	0 %	25 %	220927486
542	NC_011898	TGA	2	6	28063	28068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927486
543	NC_011898	TGA	2	6	28124	28129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927486
544	NC_011898	AGAA	2	8	28196	28203	75 %	0 %	25 %	0 %	220927486
545	NC_011898	TA	3	6	28221	28226	50 %	50 %	0 %	0 %	220927486
546	NC_011898	AAT	2	6	28256	28261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927486
547	NC_011898	AGA	2	6	28277	28282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927486
548	NC_011898	AAGA	2	8	28342	28349	75 %	0 %	25 %	0 %	220927486
549	NC_011898	AGA	3	9	28347	28355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927486
550	NC_011898	CTAT	2	8	28463	28470	25 %	50 %	0 %	25 %	220927487
551	NC_011898	TCT	2	6	28471	28476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220927487
552	NC_011898	GAT	2	6	28501	28506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927487
553	NC_011898	TACA	2	8	28513	28520	50 %	25 %	0 %	25 %	220927487
554	NC_011898	A	6	6	28528	28533	100 %	0 %	0 %	0 %	220927487
555	NC_011898	A	6	6	28556	28561	100 %	0 %	0 %	0 %	220927487
556	NC_011898	CAA	2	6	28601	28606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220927487
557	NC_011898	A	6	6	28608	28613	100 %	0 %	0 %	0 %	220927487
558	NC_011898	CAC	2	6	28628	28633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220927487
559	NC_011898	AGA	2	6	28642	28647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927487
560	NC_011898	AGAA	2	8	28662	28669	75 %	0 %	25 %	0 %	220927487
561	NC_011898	CCT	2	6	28864	28869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220927487
562	NC_011898	AAG	2	6	28910	28915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927487
563	NC_011898	AGA	2	6	28932	28937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927487
564	NC_011898	ACCTTA	2	12	28958	28969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220927487
565	NC_011898	A	6	6	29003	29008	100 %	0 %	0 %	0 %	220927487
566	NC_011898	T	8	8	29087	29094	0 %	100 %	0 %	0 %	220927487
567	NC_011898	TGA	2	6	29211	29216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927487
568	NC_011898	ACT	2	6	29299	29304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220927487
569	NC_011898	GTA	2	6	29372	29377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927487
570	NC_011898	GGTAAA	2	12	29401	29412	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	220927487
571	NC_011898	A	8	8	29428	29435	100 %	0 %	0 %	0 %	220927487
572	NC_011898	TTG	2	6	29450	29455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220927487
573	NC_011898	AAT	2	6	29466	29471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927487
574	NC_011898	ATA	2	6	29560	29565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927487
575	NC_011898	CAG	2	6	29579	29584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220927487
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577	NC_011898	ACA	2	6	29736	29741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220927487
578	NC_011898	ACA	2	6	29813	29818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220927487
579	NC_011898	AGG	2	6	29843	29848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220927487
580	NC_011898	AAGA	2	8	29853	29860	75 %	0 %	25 %	0 %	220927487
581	NC_011898	GGAGAA	2	12	29887	29898	50 %	0 %	50 %	0 %	220927487
582	NC_011898	T	6	6	29932	29937	0 %	100 %	0 %	0 %	220927487
583	NC_011898	TAC	2	6	30086	30091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220927488
584	NC_011898	AG	3	6	30110	30115	50 %	0 %	50 %	0 %	220927488
585	NC_011898	TA	3	6	30137	30142	50 %	50 %	0 %	0 %	220927488
586	NC_011898	GCT	2	6	30211	30216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220927488
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589	NC_011898	AAG	2	6	30292	30297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927488
590	NC_011898	TGC	2	6	30357	30362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220927488
591	NC_011898	T	6	6	30406	30411	0 %	100 %	0 %	0 %	220927488
592	NC_011898	AGA	2	6	30465	30470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927488
593	NC_011898	GAT	2	6	30514	30519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927488
594	NC_011898	TATAT	2	10	30523	30532	40 %	60 %	0 %	0 %	220927488
595	NC_011898	CAG	2	6	30576	30581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220927488
596	NC_011898	TGA	2	6	30615	30620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927488
597	NC_011898	TCA	2	6	30652	30657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220927488
598	NC_011898	TA	3	6	30692	30697	50 %	50 %	0 %	0 %	220927488
599	NC_011898	ATT	2	6	30711	30716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927488
600	NC_011898	TTTAT	2	10	30748	30757	20 %	80 %	0 %	0 %	220927488
601	NC_011898	ATG	2	6	30758	30763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927488
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603	NC_011898	T	6	6	30803	30808	0 %	100 %	0 %	0 %	220927488
604	NC_011898	TTA	2	6	30827	30832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927488
605	NC_011898	TAA	2	6	30867	30872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927488
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609	NC_011898	TCA	2	6	31081	31086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220927488
610	NC_011898	ATT	2	6	31144	31149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927488
611	NC_011898	AAAG	2	8	31151	31158	75 %	0 %	25 %	0 %	220927488
612	NC_011898	TTTG	2	8	31172	31179	0 %	75 %	25 %	0 %	220927488
613	NC_011898	TAA	2	6	31187	31192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927488
614	NC_011898	A	6	6	31191	31196	100 %	0 %	0 %	0 %	220927488
615	NC_011898	GATA	2	8	31215	31222	50 %	25 %	25 %	0 %	220927488
616	NC_011898	AATC	2	8	31325	31332	50 %	25 %	0 %	25 %	220927488
617	NC_011898	AT	3	6	31437	31442	50 %	50 %	0 %	0 %	220927488
618	NC_011898	TA	3	6	31497	31502	50 %	50 %	0 %	0 %	220927488
619	NC_011898	ATT	3	9	31537	31545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927488
620	NC_011898	GAA	2	6	31576	31581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927488
621	NC_011898	GCA	2	6	31653	31658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220927488
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624	NC_011898	ATTTT	2	10	31775	31784	20 %	80 %	0 %	0 %	220927488
625	NC_011898	TAT	2	6	31797	31802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927488
626	NC_011898	TATT	2	8	31856	31863	25 %	75 %	0 %	0 %	220927488
627	NC_011898	ATA	2	6	32046	32051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927489
628	NC_011898	AG	3	6	32068	32073	50 %	0 %	50 %	0 %	220927489
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