MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742502

Total Repeats: 2260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011885	GCA	2	6	80372	80377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910678
1002	NC_011885	TGG	2	6	80391	80396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220910678
1003	NC_011885	ATG	2	6	80397	80402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910678
1004	NC_011885	TCA	2	6	82204	82209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910679
1005	NC_011885	AGT	2	6	82210	82215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910679
1006	NC_011885	CAT	2	6	82236	82241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910679
1007	NC_011885	GTC	2	6	82248	82253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910679
1008	NC_011885	TCA	2	6	82274	82279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910679
1009	NC_011885	GAG	2	6	82294	82299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220910679
1010	NC_011885	GCA	2	6	82331	82336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910679
1011	NC_011885	ACA	2	6	82393	82398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220910679
1012	NC_011885	GGC	2	6	82461	82466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220910679
1013	NC_011885	CAC	2	6	82542	82547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910679
1014	NC_011885	GAT	2	6	82637	82642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910679
1015	NC_011885	TGC	2	6	82663	82668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910679
1016	NC_011885	CTC	2	6	82704	82709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220910679
1017	NC_011885	CTG	2	6	82716	82721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910679
1018	NC_011885	GCTT	2	8	82723	82730	0 %	50 %	25 %	25 %	220910679
1019	NC_011885	TGC	2	6	82777	82782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910679
1020	NC_011885	GCT	2	6	82856	82861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910679
1021	NC_011885	ACC	2	6	83047	83052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910679
1022	NC_011885	AC	3	6	83108	83113	50 %	0 %	0 %	50 %	220910679
1023	NC_011885	GGGA	2	8	83129	83136	25 %	0 %	75 %	0 %	220910679
1024	NC_011885	CCAA	2	8	83165	83172	50 %	0 %	0 %	50 %	220910679
1025	NC_011885	CAGCA	2	10	83226	83235	40 %	0 %	20 %	40 %	220910679
1026	NC_011885	TGA	2	6	83266	83271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910679
1027	NC_011885	GCA	2	6	83976	83981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910680
1028	NC_011885	TGGC	2	8	83997	84004	0 %	25 %	50 %	25 %	220910680
1029	NC_011885	AAT	2	6	84038	84043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220910680
1030	NC_011885	ATG	2	6	84050	84055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910680
1031	NC_011885	GGC	2	6	84071	84076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220910680
1032	NC_011885	TCA	2	6	84082	84087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910680
1033	NC_011885	ACTG	2	8	84112	84119	25 %	25 %	25 %	25 %	220910680
1034	NC_011885	AGG	2	6	84141	84146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220910680
1035	NC_011885	TTC	2	6	84204	84209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220910680
1036	NC_011885	TCA	2	6	84225	84230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910680
1037	NC_011885	CAG	2	6	84263	84268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910680
1038	NC_011885	GCT	2	6	84304	84309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910680
1039	NC_011885	GGC	2	6	84377	84382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220910680
1040	NC_011885	GCG	2	6	84528	84533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220910680
1041	NC_011885	GA	3	6	84549	84554	50 %	0 %	50 %	0 %	220910680
1042	NC_011885	GCA	2	6	84607	84612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910680
1043	NC_011885	AGA	2	6	86854	86859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220910681
1044	NC_011885	CAG	2	6	86966	86971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910681
1045	NC_011885	T	7	7	87003	87009	0 %	100 %	0 %	0 %	220910681
1046	NC_011885	CAA	2	6	87014	87019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220910681
1047	NC_011885	ACG	2	6	87028	87033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910681
1048	NC_011885	CTT	2	6	87228	87233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220910682
1049	NC_011885	CGA	2	6	87331	87336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910682
1050	NC_011885	TTC	2	6	87453	87458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220910682
1051	NC_011885	GCG	2	6	87479	87484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220910682
1052	NC_011885	CCGT	2	8	87535	87542	0 %	25 %	25 %	50 %	220910682
1053	NC_011885	TCG	2	6	87556	87561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910682
1054	NC_011885	G	6	6	87578	87583	0 %	0 %	100 %	0 %	220910682
1055	NC_011885	TGG	2	6	87745	87750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220910682
1056	NC_011885	CG	3	6	87847	87852	0 %	0 %	50 %	50 %	220910682
1057	NC_011885	ATCG	2	8	87853	87860	25 %	25 %	25 %	25 %	220910682
1058	NC_011885	TGAG	2	8	87880	87887	25 %	25 %	50 %	0 %	220910682
1059	NC_011885	CTG	2	6	87927	87932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910682
1060	NC_011885	T	6	6	87960	87965	0 %	100 %	0 %	0 %	220910682
1061	NC_011885	CAT	2	6	88005	88010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910682
1062	NC_011885	GCA	2	6	88073	88078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910682
1063	NC_011885	GCG	2	6	88079	88084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220910682
1064	NC_011885	CCA	2	6	88115	88120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910682
1065	NC_011885	TCA	2	6	88157	88162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910682
1066	NC_011885	AGC	2	6	88251	88256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910682
1067	NC_011885	ACCT	2	8	88272	88279	25 %	25 %	0 %	50 %	220910682
1068	NC_011885	TGT	2	6	88318	88323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220910682
1069	NC_011885	TCC	2	6	88442	88447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220910682
1070	NC_011885	ACC	2	6	88466	88471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910682
1071	NC_011885	CGAT	2	8	88582	88589	25 %	25 %	25 %	25 %	220910682
1072	NC_011885	CTCA	2	8	88670	88677	25 %	25 %	0 %	50 %	220910682
1073	NC_011885	AGG	2	6	88708	88713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220910682
1074	NC_011885	AATC	2	8	88775	88782	50 %	25 %	0 %	25 %	220910682
1075	NC_011885	GGGC	2	8	88812	88819	0 %	0 %	75 %	25 %	220910682
1076	NC_011885	GTT	2	6	88829	88834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220910682
1077	NC_011885	GCC	2	6	88837	88842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220910682
1078	NC_011885	TTA	2	6	89454	89459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220910683
1079	NC_011885	CCG	2	6	89576	89581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220910683
1080	NC_011885	CCT	2	6	89611	89616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220910683
1081	NC_011885	AAAT	2	8	89664	89671	75 %	25 %	0 %	0 %	220910683
1082	NC_011885	CAA	2	6	89863	89868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220910684
1083	NC_011885	CGAT	2	8	89924	89931	25 %	25 %	25 %	25 %	220910684
1084	NC_011885	AGGC	2	8	89951	89958	25 %	0 %	50 %	25 %	220910684
1085	NC_011885	T	7	7	89963	89969	0 %	100 %	0 %	0 %	220910684
1086	NC_011885	CAG	2	6	89975	89980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910684
1087	NC_011885	TCT	2	6	90032	90037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220910684
1088	NC_011885	GAA	2	6	90055	90060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220910684
1089	NC_011885	TTGT	2	8	90769	90776	0 %	75 %	25 %	0 %	220910685
1090	NC_011885	TAG	2	6	90793	90798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910685
1091	NC_011885	GCT	2	6	90814	90819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910685
1092	NC_011885	AATT	2	8	90825	90832	50 %	50 %	0 %	0 %	220910685
1093	NC_011885	TGA	2	6	90860	90865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910685
1094	NC_011885	ATA	2	6	90936	90941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220910685
1095	NC_011885	CAG	2	6	91080	91085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910685
1096	NC_011885	GCA	2	6	91258	91263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910686
1097	NC_011885	CGAC	2	8	91270	91277	25 %	0 %	25 %	50 %	220910686
1098	NC_011885	TTAA	2	8	91324	91331	50 %	50 %	0 %	0 %	220910686
1099	NC_011885	AATG	2	8	91377	91384	50 %	25 %	25 %	0 %	220910686
1100	NC_011885	CAC	2	6	91419	91424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910686
1101	NC_011885	GAT	2	6	91434	91439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910686
1102	NC_011885	TTG	2	6	91448	91453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220910686
1103	NC_011885	TGTCTT	2	12	91560	91571	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	220910686
1104	NC_011885	CAG	2	6	91573	91578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910686
1105	NC_011885	CAG	2	6	91627	91632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910686
1106	NC_011885	GCC	2	6	91689	91694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220910686
1107	NC_011885	CACTT	2	10	91870	91879	20 %	40 %	0 %	40 %	220910686
1108	NC_011885	AGG	2	6	91914	91919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220910686
1109	NC_011885	GTC	2	6	91948	91953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910686
1110	NC_011885	AAC	2	6	92156	92161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220910686
1111	NC_011885	CCA	2	6	92547	92552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910687
1112	NC_011885	GCA	2	6	92558	92563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910687
1113	NC_011885	TAT	2	6	92592	92597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220910687
1114	NC_011885	CTA	2	6	92602	92607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910687
1115	NC_011885	TGA	2	6	92634	92639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910687
1116	NC_011885	TCA	2	6	92742	92747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910687
1117	NC_011885	AGC	2	6	92983	92988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910688
1118	NC_011885	AGA	2	6	93016	93021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220910688
1119	NC_011885	AGA	2	6	93115	93120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220910688
1120	NC_011885	GCAA	2	8	93231	93238	50 %	0 %	25 %	25 %	220910688
1121	NC_011885	ACC	2	6	93356	93361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910688
1122	NC_011885	GCA	2	6	93373	93378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910688
1123	NC_011885	TGGC	2	8	93451	93458	0 %	25 %	50 %	25 %	220910688
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1370	NC_011885	TCT	2	6	111864	111869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220910704
1371	NC_011885	ATC	2	6	111935	111940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910704
1372	NC_011885	AGC	2	6	112001	112006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910704
1373	NC_011885	G	6	6	112013	112018	0 %	0 %	100 %	0 %	220910704
1374	NC_011885	GCA	2	6	112152	112157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910704
1375	NC_011885	AAC	2	6	112190	112195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220910704
1376	NC_011885	TTC	2	6	112220	112225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220910704
1377	NC_011885	T	6	6	112615	112620	0 %	100 %	0 %	0 %	220910705
1378	NC_011885	AGTTG	2	10	112929	112938	20 %	40 %	40 %	0 %	220910705
1379	NC_011885	AGT	2	6	112977	112982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910705
1380	NC_011885	CAT	2	6	113053	113058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910705
1381	NC_011885	AATCA	2	10	113068	113077	60 %	20 %	0 %	20 %	220910705
1382	NC_011885	TGC	2	6	113087	113092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910705
1383	NC_011885	GTTT	2	8	113111	113118	0 %	75 %	25 %	0 %	220910705
1384	NC_011885	CCA	2	6	113147	113152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910705
1385	NC_011885	CAG	2	6	113155	113160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910705
1386	NC_011885	CGAT	2	8	113208	113215	25 %	25 %	25 %	25 %	220910705
1387	NC_011885	GT	3	6	113253	113258	0 %	50 %	50 %	0 %	220910705
1388	NC_011885	TGA	2	6	113270	113275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910705
1389	NC_011885	CTG	2	6	113344	113349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910705
1390	NC_011885	AGC	2	6	113392	113397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910705
1391	NC_011885	CTG	2	6	113494	113499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910706
1392	NC_011885	ATC	2	6	113532	113537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910706
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1394	NC_011885	CTG	2	6	113654	113659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910706
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1402	NC_011885	GGT	2	6	114472	114477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220910707
1403	NC_011885	GGA	2	6	114511	114516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220910707
1404	NC_011885	TGC	2	6	114519	114524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910707
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1410	NC_011885	GCA	2	6	114786	114791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910707
1411	NC_011885	CTG	2	6	114797	114802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910707
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1413	NC_011885	GCT	2	6	114966	114971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910707
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1426	NC_011885	TGT	2	6	116107	116112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220910709
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1451	NC_011885	ACTTTT	2	12	118427	118438	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	220910711
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1455	NC_011885	CATTT	2	10	118755	118764	20 %	60 %	0 %	20 %	220910712
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1459	NC_011885	GAT	2	6	119743	119748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910714
1460	NC_011885	TGC	2	6	119793	119798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910714
1461	NC_011885	G	6	6	119948	119953	0 %	0 %	100 %	0 %	220910715
1462	NC_011885	TGA	2	6	119968	119973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910715
1463	NC_011885	AGGT	2	8	120060	120067	25 %	25 %	50 %	0 %	220910715
1464	NC_011885	TAA	2	6	120156	120161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220910715
1465	NC_011885	TAC	2	6	120177	120182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910715
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1471	NC_011885	TCC	2	6	120931	120936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220910716
1472	NC_011885	CATG	2	8	120999	121006	25 %	25 %	25 %	25 %	220910716
1473	NC_011885	CAG	2	6	121050	121055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910716
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1475	NC_011885	CA	3	6	121542	121547	50 %	0 %	0 %	50 %	220910717
1476	NC_011885	GTT	2	6	121625	121630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220910717
1477	NC_011885	CGC	2	6	121719	121724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220910717
1478	NC_011885	ATTC	2	8	121790	121797	25 %	50 %	0 %	25 %	220910717
1479	NC_011885	TTG	2	6	121836	121841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220910717
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1481	NC_011885	GGTTG	2	10	121874	121883	0 %	40 %	60 %	0 %	220910717
1482	NC_011885	TCT	2	6	121984	121989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220910717
1483	NC_011885	AGCG	2	8	122009	122016	25 %	0 %	50 %	25 %	220910717
1484	NC_011885	AAATT	2	10	122083	122092	60 %	40 %	0 %	0 %	220910717
1485	NC_011885	TAACC	2	10	122478	122487	40 %	20 %	0 %	40 %	220910718
1486	NC_011885	ATT	2	6	122502	122507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220910718
1487	NC_011885	TCT	2	6	122508	122513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220910718
1488	NC_011885	CTTG	2	8	122521	122528	0 %	50 %	25 %	25 %	220910718
1489	NC_011885	ATCA	2	8	122603	122610	50 %	25 %	0 %	25 %	220910718
1490	NC_011885	AGC	2	6	122646	122651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910718
1491	NC_011885	TGT	2	6	122694	122699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220910718
1492	NC_011885	ACTTC	2	10	122704	122713	20 %	40 %	0 %	40 %	220910718
1493	NC_011885	GCT	2	6	122717	122722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910718
1494	NC_011885	CAG	2	6	122804	122809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910718
1495	NC_011885	CAC	2	6	122831	122836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910718
1496	NC_011885	GCA	2	6	122928	122933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910718
1497	NC_011885	TAA	2	6	123008	123013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220910718
1498	NC_011885	CTG	2	6	123052	123057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910718
1499	NC_011885	GTC	2	6	123131	123136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910718
1500	NC_011885	AAG	2	6	123143	123148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220910718

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