MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742502

Total Repeats: 2260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011885	GTG	2	6	41854	41859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220910646
502	NC_011885	GCT	2	6	41899	41904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910646
503	NC_011885	GTTCA	2	10	41963	41972	20 %	40 %	20 %	20 %	220910646
504	NC_011885	TGC	2	6	41987	41992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910646
505	NC_011885	CCCA	2	8	42015	42022	25 %	0 %	0 %	75 %	220910646
506	NC_011885	T	6	6	42047	42052	0 %	100 %	0 %	0 %	220910646
507	NC_011885	AAGA	2	8	42101	42108	75 %	0 %	25 %	0 %	220910646
508	NC_011885	GCG	2	6	42139	42144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220910646
509	NC_011885	AG	3	6	42212	42217	50 %	0 %	50 %	0 %	220910646
510	NC_011885	CGG	2	6	42218	42223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220910646
511	NC_011885	G	6	6	42281	42286	0 %	0 %	100 %	0 %	220910646
512	NC_011885	G	6	6	42315	42320	0 %	0 %	100 %	0 %	220910646
513	NC_011885	CAC	2	6	42341	42346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910646
514	NC_011885	TCGG	2	8	42393	42400	0 %	25 %	50 %	25 %	220910646
515	NC_011885	T	8	8	42444	42451	0 %	100 %	0 %	0 %	220910646
516	NC_011885	ATC	2	6	42477	42482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910646
517	NC_011885	C	7	7	42490	42496	0 %	0 %	0 %	100 %	220910646
518	NC_011885	AAT	2	6	42716	42721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220910646
519	NC_011885	G	6	6	42772	42777	0 %	0 %	100 %	0 %	220910646
520	NC_011885	G	9	9	42788	42796	0 %	0 %	100 %	0 %	220910646
521	NC_011885	GTG	2	6	43530	43535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220910647
522	NC_011885	AT	4	8	43843	43850	50 %	50 %	0 %	0 %	220910647
523	NC_011885	CCA	2	6	43874	43879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910647
524	NC_011885	ATT	2	6	43896	43901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220910647
525	NC_011885	AAAG	2	8	43913	43920	75 %	0 %	25 %	0 %	220910647
526	NC_011885	CTG	2	6	43929	43934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910647
527	NC_011885	CCTG	2	8	43958	43965	0 %	25 %	25 %	50 %	220910647
528	NC_011885	GAT	2	6	44184	44189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910647
529	NC_011885	TGC	2	6	44219	44224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910647
530	NC_011885	C	6	6	44239	44244	0 %	0 %	0 %	100 %	220910647
531	NC_011885	AGG	2	6	44410	44415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220910647
532	NC_011885	GTC	2	6	44428	44433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910647
533	NC_011885	TGGAT	2	10	44494	44503	20 %	40 %	40 %	0 %	220910647
534	NC_011885	G	6	6	44739	44744	0 %	0 %	100 %	0 %	220910647
535	NC_011885	ATT	2	6	44748	44753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220910647
536	NC_011885	TTGG	2	8	44802	44809	0 %	50 %	50 %	0 %	220910647
537	NC_011885	CTGG	2	8	44828	44835	0 %	25 %	50 %	25 %	220910647
538	NC_011885	CAA	2	6	44856	44861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220910647
539	NC_011885	ATT	2	6	44907	44912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220910647
540	NC_011885	CAG	3	9	45012	45020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910647
541	NC_011885	CAG	2	6	45109	45114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910647
542	NC_011885	ATC	2	6	45132	45137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910647
543	NC_011885	GA	3	6	45257	45262	50 %	0 %	50 %	0 %	220910647
544	NC_011885	CCA	2	6	45349	45354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910647
545	NC_011885	GCA	2	6	45453	45458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910647
546	NC_011885	GCAG	2	8	45539	45546	25 %	0 %	50 %	25 %	220910647
547	NC_011885	TGCAG	2	10	45630	45639	20 %	20 %	40 %	20 %	220910647
548	NC_011885	CAA	2	6	45663	45668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220910647
549	NC_011885	CGAT	2	8	45702	45709	25 %	25 %	25 %	25 %	220910647
550	NC_011885	CAA	2	6	45729	45734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220910647
551	NC_011885	TGGT	2	8	45782	45789	0 %	50 %	50 %	0 %	220910647
552	NC_011885	CTA	2	6	45816	45821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910647
553	NC_011885	AG	3	6	45978	45983	50 %	0 %	50 %	0 %	220910647
554	NC_011885	GCA	2	6	46007	46012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910647
555	NC_011885	GGAA	2	8	46255	46262	50 %	0 %	50 %	0 %	220910647
556	NC_011885	TA	3	6	46281	46286	50 %	50 %	0 %	0 %	220910647
557	NC_011885	AGCC	2	8	47479	47486	25 %	0 %	25 %	50 %	220910648
558	NC_011885	AGA	2	6	47542	47547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220910648
559	NC_011885	G	6	6	47653	47658	0 %	0 %	100 %	0 %	220910648
560	NC_011885	AAG	2	6	47760	47765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220910648
561	NC_011885	CAG	2	6	47886	47891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910649
562	NC_011885	GCA	2	6	47898	47903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910649
563	NC_011885	CAC	3	9	48036	48044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910649
564	NC_011885	ACT	2	6	48062	48067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910649
565	NC_011885	CTG	2	6	48180	48185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910649
566	NC_011885	CCCA	2	8	48186	48193	25 %	0 %	0 %	75 %	220910649
567	NC_011885	CGG	2	6	48199	48204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220910649
568	NC_011885	GTT	2	6	48258	48263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220910649
569	NC_011885	CAA	2	6	48449	48454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220910649
570	NC_011885	CTG	2	6	48458	48463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910649
571	NC_011885	AAACA	2	10	48529	48538	80 %	0 %	0 %	20 %	220910649
572	NC_011885	CCAC	2	8	48558	48565	25 %	0 %	0 %	75 %	220910649
573	NC_011885	CTCGT	2	10	48596	48605	0 %	40 %	20 %	40 %	220910649
574	NC_011885	GCT	2	6	48624	48629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910649
575	NC_011885	CCA	2	6	48640	48645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910649
576	NC_011885	CCG	2	6	48770	48775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220910649
577	NC_011885	ACT	2	6	48796	48801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910649
578	NC_011885	GGCAG	2	10	48842	48851	20 %	0 %	60 %	20 %	220910649
579	NC_011885	GCCA	2	8	48861	48868	25 %	0 %	25 %	50 %	220910649
580	NC_011885	CTG	2	6	48940	48945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910649
581	NC_011885	GGT	2	6	48958	48963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220910649
582	NC_011885	CTTG	2	8	49080	49087	0 %	50 %	25 %	25 %	220910649
583	NC_011885	TCT	2	6	49298	49303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220910649
584	NC_011885	GCT	2	6	49331	49336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910649
585	NC_011885	AAT	2	6	49470	49475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220910650
586	NC_011885	GTCA	2	8	49542	49549	25 %	25 %	25 %	25 %	220910650
587	NC_011885	TCT	2	6	49737	49742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220910651
588	NC_011885	GTT	2	6	49809	49814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220910651
589	NC_011885	AAAT	2	8	50024	50031	75 %	25 %	0 %	0 %	220910651
590	NC_011885	CCG	2	6	50036	50041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220910651
591	NC_011885	TCA	2	6	50047	50052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910651
592	NC_011885	TCA	2	6	50066	50071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910651
593	NC_011885	ATCG	2	8	50202	50209	25 %	25 %	25 %	25 %	220910652
594	NC_011885	TGCT	2	8	50211	50218	0 %	50 %	25 %	25 %	220910652
595	NC_011885	CTTG	2	8	50667	50674	0 %	50 %	25 %	25 %	220910653
596	NC_011885	TTA	2	6	50687	50692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220910653
597	NC_011885	TTC	2	6	50706	50711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220910653
598	NC_011885	A	6	6	50718	50723	100 %	0 %	0 %	0 %	220910653
599	NC_011885	AGA	2	6	50819	50824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220910654
600	NC_011885	GCA	2	6	50825	50830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910654
601	NC_011885	TTA	2	6	50841	50846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220910654
602	NC_011885	AAG	2	6	50911	50916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220910654
603	NC_011885	CTA	2	6	50936	50941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910654
604	NC_011885	A	6	6	50943	50948	100 %	0 %	0 %	0 %	220910654
605	NC_011885	CCAA	2	8	50949	50956	50 %	0 %	0 %	50 %	220910654
606	NC_011885	AAC	2	6	50972	50977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220910654
607	NC_011885	CAC	2	6	51012	51017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910654
608	NC_011885	TTG	2	6	51259	51264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220910655
609	NC_011885	TGCT	2	8	51283	51290	0 %	50 %	25 %	25 %	220910655
610	NC_011885	GCT	2	6	51336	51341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910655
611	NC_011885	CCCA	2	8	51619	51626	25 %	0 %	0 %	75 %	220910656
612	NC_011885	TCG	2	6	51634	51639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910656
613	NC_011885	AAG	2	6	51656	51661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220910656
614	NC_011885	GGT	2	6	51678	51683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220910656
615	NC_011885	G	6	6	51693	51698	0 %	0 %	100 %	0 %	220910656
616	NC_011885	CT	3	6	51760	51765	0 %	50 %	0 %	50 %	220910656
617	NC_011885	TGC	2	6	51802	51807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910656
618	NC_011885	ACCC	2	8	51811	51818	25 %	0 %	0 %	75 %	220910656
619	NC_011885	GAT	2	6	52367	52372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910657
620	NC_011885	GAA	2	6	52422	52427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220910657
621	NC_011885	AGA	2	6	52547	52552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220910657
622	NC_011885	TAG	3	9	52767	52775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910658
623	NC_011885	AAT	2	6	52790	52795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220910658
624	NC_011885	CTG	2	6	53051	53056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910658
625	NC_011885	CGG	3	9	53143	53151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220910658
626	NC_011885	GTG	2	6	53172	53177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220910658
627	NC_011885	TGC	2	6	53609	53614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910659
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629	NC_011885	ATC	2	6	53778	53783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910659
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758	NC_011885	CAC	2	6	62457	62462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910668
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