MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 3303

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011884	ATTCA	2	10	720	729	40 %	40 %	0 %	20 %	220905644
2	NC_011884	CTGGA	2	10	2727	2736	20 %	20 %	40 %	20 %	220905645
3	NC_011884	GTTGG	2	10	7243	7252	0 %	40 %	60 %	0 %	220905649
4	NC_011884	ACTGT	2	10	9154	9163	20 %	40 %	20 %	20 %	220905650
5	NC_011884	AGGAT	2	10	9258	9267	40 %	20 %	40 %	0 %	220905650
6	NC_011884	ATCCC	2	10	9958	9967	20 %	20 %	0 %	60 %	220905651
7	NC_011884	GGGTC	2	10	11646	11655	0 %	20 %	60 %	20 %	220905652
8	NC_011884	CTGCT	2	10	12487	12496	0 %	40 %	20 %	40 %	220905653
9	NC_011884	CGCCA	2	10	12547	12556	20 %	0 %	20 %	60 %	220905653
10	NC_011884	GAGAA	2	10	12770	12779	60 %	0 %	40 %	0 %	220905653
11	NC_011884	ATTAA	2	10	13610	13619	60 %	40 %	0 %	0 %	220905655
12	NC_011884	CGCGG	2	10	17128	17137	0 %	0 %	60 %	40 %	220905658
13	NC_011884	AAACC	2	10	17715	17724	60 %	0 %	0 %	40 %	220905659
14	NC_011884	CGGGC	2	10	18889	18898	0 %	0 %	60 %	40 %	220905659
15	NC_011884	CTGGG	2	10	20810	20819	0 %	20 %	60 %	20 %	220905661
16	NC_011884	CAGGT	2	10	22186	22195	20 %	20 %	40 %	20 %	220905662
17	NC_011884	GGGTT	2	10	23425	23434	0 %	40 %	60 %	0 %	220905663
18	NC_011884	GCGGG	2	10	29070	29079	0 %	0 %	80 %	20 %	220905669
19	NC_011884	ATGGG	2	10	29304	29313	20 %	20 %	60 %	0 %	220905669
20	NC_011884	AGACC	2	10	33346	33355	40 %	0 %	20 %	40 %	220905673
21	NC_011884	CAGGT	2	10	38169	38178	20 %	20 %	40 %	20 %	220905680
22	NC_011884	CACAT	2	10	38324	38333	40 %	20 %	0 %	40 %	220905680
23	NC_011884	TCTCC	2	10	39694	39703	0 %	40 %	0 %	60 %	220905682
24	NC_011884	CCCAA	2	10	39846	39855	40 %	0 %	0 %	60 %	220905682
25	NC_011884	AATCA	2	10	40184	40193	60 %	20 %	0 %	20 %	220905682
26	NC_011884	CCGTA	2	10	42832	42841	20 %	20 %	20 %	40 %	220905685
27	NC_011884	TTCTG	2	10	44103	44112	0 %	60 %	20 %	20 %	220905687
28	NC_011884	CCCCT	2	10	44696	44705	0 %	20 %	0 %	80 %	220905687
29	NC_011884	CTGGG	2	10	46777	46786	0 %	20 %	60 %	20 %	220905689
30	NC_011884	CCAGG	2	10	47114	47123	20 %	0 %	40 %	40 %	220905690
31	NC_011884	GAAAG	2	10	48510	48519	60 %	0 %	40 %	0 %	220905692
32	NC_011884	GGAGC	2	10	48700	48709	20 %	0 %	60 %	20 %	220905692
33	NC_011884	ACCAA	2	10	49025	49034	60 %	0 %	0 %	40 %	220905693
34	NC_011884	TAAAA	2	10	50649	50658	80 %	20 %	0 %	0 %	220905695
35	NC_011884	CAGCA	2	10	51213	51222	40 %	0 %	20 %	40 %	220905696
36	NC_011884	GGGGA	2	10	52354	52363	20 %	0 %	80 %	0 %	220905697
37	NC_011884	GTAAT	2	10	52815	52824	40 %	40 %	20 %	0 %	220905698
38	NC_011884	ATGGG	2	10	57947	57956	20 %	20 %	60 %	0 %	220905701
39	NC_011884	GGGCT	2	10	58054	58063	0 %	20 %	60 %	20 %	220905701
40	NC_011884	CCCAG	2	10	58634	58643	20 %	0 %	20 %	60 %	220905701
41	NC_011884	GATCC	2	10	62357	62366	20 %	20 %	20 %	40 %	220905705
42	NC_011884	CCGAC	2	10	63590	63599	20 %	0 %	20 %	60 %	220905706
43	NC_011884	GGGCG	2	10	64037	64046	0 %	0 %	80 %	20 %	220905706
44	NC_011884	CAGAA	2	10	64143	64152	60 %	0 %	20 %	20 %	220905706
45	NC_011884	CTGAT	2	10	64655	64664	20 %	40 %	20 %	20 %	220905707
46	NC_011884	TTTTG	2	10	64765	64774	0 %	80 %	20 %	0 %	220905707
47	NC_011884	GTTGC	2	10	66268	66277	0 %	40 %	40 %	20 %	220905710
48	NC_011884	TCGCC	2	10	68970	68979	0 %	20 %	20 %	60 %	220905711
49	NC_011884	CTGTC	2	10	69476	69485	0 %	40 %	20 %	40 %	220905712
50	NC_011884	CAGGG	2	10	69897	69906	20 %	0 %	60 %	20 %	220905712
51	NC_011884	GGCAG	2	10	69921	69930	20 %	0 %	60 %	20 %	220905712
52	NC_011884	GTCCA	2	10	70019	70028	20 %	20 %	20 %	40 %	220905712
53	NC_011884	CGCCC	2	10	70144	70153	0 %	0 %	20 %	80 %	220905712
54	NC_011884	GCTGA	2	10	71075	71084	20 %	20 %	40 %	20 %	220905712
55	NC_011884	GCACC	2	10	71560	71569	20 %	0 %	20 %	60 %	220905712
56	NC_011884	TCCTT	2	10	74545	74554	0 %	60 %	0 %	40 %	220905714
57	NC_011884	TGCGT	2	10	74651	74660	0 %	40 %	40 %	20 %	220905715
58	NC_011884	CCCCT	2	10	75395	75404	0 %	20 %	0 %	80 %	220905715
59	NC_011884	AAGTG	2	10	77793	77802	40 %	20 %	40 %	0 %	220905717
60	NC_011884	GCAAA	2	10	82490	82499	60 %	0 %	20 %	20 %	220905722
61	NC_011884	ATCCC	2	10	83836	83845	20 %	20 %	0 %	60 %	220905724
62	NC_011884	CAATC	2	10	84255	84264	40 %	20 %	0 %	40 %	220905724
63	NC_011884	AGCAT	2	10	85805	85814	40 %	20 %	20 %	20 %	220905726
64	NC_011884	TAAAA	2	10	87045	87054	80 %	20 %	0 %	0 %	220905727
65	NC_011884	CGGGT	2	10	87143	87152	0 %	20 %	60 %	20 %	220905727
66	NC_011884	CATTA	2	10	88631	88640	40 %	40 %	0 %	20 %	220905729
67	NC_011884	ACTTT	2	10	88969	88978	20 %	60 %	0 %	20 %	220905730
68	NC_011884	CTGAT	2	10	89681	89690	20 %	40 %	20 %	20 %	220905731
69	NC_011884	GGCGG	2	10	90488	90497	0 %	0 %	80 %	20 %	220905732
70	NC_011884	TGATT	2	10	91382	91391	20 %	60 %	20 %	0 %	220905732
71	NC_011884	TGACC	2	10	91631	91640	20 %	20 %	20 %	40 %	220905732
72	NC_011884	ACAGG	2	10	94190	94199	40 %	0 %	40 %	20 %	220905734
73	NC_011884	CATAC	2	10	94293	94302	40 %	20 %	0 %	40 %	220905734
74	NC_011884	GCTTC	2	10	94562	94571	0 %	40 %	20 %	40 %	220905735
75	NC_011884	CCACC	2	10	96341	96350	20 %	0 %	0 %	80 %	220905738
76	NC_011884	TGGCC	2	10	100596	100605	0 %	20 %	40 %	40 %	220905742
77	NC_011884	AAATT	2	10	100886	100895	60 %	40 %	0 %	0 %	220905742
78	NC_011884	TGACC	2	10	102458	102467	20 %	20 %	20 %	40 %	220905744
79	NC_011884	ACCCA	2	10	104273	104282	40 %	0 %	0 %	60 %	220905746
80	NC_011884	AGACG	2	10	110036	110045	40 %	0 %	40 %	20 %	220905753
81	NC_011884	TGTTT	2	10	110105	110114	0 %	80 %	20 %	0 %	220905753
82	NC_011884	ACCAA	2	10	112850	112859	60 %	0 %	0 %	40 %	220905756
83	NC_011884	GGTGA	2	10	116537	116546	20 %	20 %	60 %	0 %	220905762
84	NC_011884	TGGCA	2	10	117339	117348	20 %	20 %	40 %	20 %	220905763
85	NC_011884	CCACG	2	10	117533	117542	20 %	0 %	20 %	60 %	220905763
86	NC_011884	ATGGT	2	10	118066	118075	20 %	40 %	40 %	0 %	220905763
87	NC_011884	GCCGT	2	10	118862	118871	0 %	20 %	40 %	40 %	220905763
88	NC_011884	ATTGG	2	10	122432	122441	20 %	40 %	40 %	0 %	220905766
89	NC_011884	CAGAC	2	10	124271	124280	40 %	0 %	20 %	40 %	220905768
90	NC_011884	TATCC	2	10	124461	124470	20 %	40 %	0 %	40 %	220905768
91	NC_011884	GCCCA	2	10	127012	127021	20 %	0 %	20 %	60 %	220905771
92	NC_011884	GGCTG	2	10	129624	129633	0 %	20 %	60 %	20 %	220905773
93	NC_011884	CCTGG	2	10	129717	129726	0 %	20 %	40 %	40 %	220905774
94	NC_011884	AACGG	2	10	130468	130477	40 %	0 %	40 %	20 %	220905774
95	NC_011884	GCGTT	2	10	131059	131068	0 %	40 %	40 %	20 %	220905775
96	NC_011884	ACAGC	2	10	132831	132840	40 %	0 %	20 %	40 %	220905777
97	NC_011884	ACTGA	2	10	133179	133188	40 %	20 %	20 %	20 %	220905777
98	NC_011884	TCCTG	2	10	133658	133667	0 %	40 %	20 %	40 %	220905777
99	NC_011884	GGCCG	2	10	134601	134610	0 %	0 %	60 %	40 %	220905777
100	NC_011884	CTGAA	2	10	134635	134644	40 %	20 %	20 %	20 %	220905777
101	NC_011884	AGTCG	2	10	134814	134823	20 %	20 %	40 %	20 %	220905777
102	NC_011884	GACCA	2	10	134847	134856	40 %	0 %	20 %	40 %	220905777
103	NC_011884	TGCTG	2	10	136496	136505	0 %	40 %	40 %	20 %	220905778
104	NC_011884	GTTGC	2	10	143483	143492	0 %	40 %	40 %	20 %	220905787
105	NC_011884	GTTGA	2	10	144436	144445	20 %	40 %	40 %	0 %	220905787
106	NC_011884	ACCAG	2	10	145950	145959	40 %	0 %	20 %	40 %	220905787
107	NC_011884	TGGTC	2	10	146262	146271	0 %	40 %	40 %	20 %	220905788
108	NC_011884	AAGCC	2	10	146298	146307	40 %	0 %	20 %	40 %	220905788
109	NC_011884	GGCTG	2	10	152157	152166	0 %	20 %	60 %	20 %	220905795
110	NC_011884	CGGGC	2	10	152269	152278	0 %	0 %	60 %	40 %	220905795
111	NC_011884	CGCCA	2	10	154830	154839	20 %	0 %	20 %	60 %	220905797
112	NC_011884	TTCAC	2	10	156588	156597	20 %	40 %	0 %	40 %	220905799
113	NC_011884	CTGGA	2	10	158681	158690	20 %	20 %	40 %	20 %	220905801
114	NC_011884	TCCCC	2	10	158934	158943	0 %	20 %	0 %	80 %	220905801
115	NC_011884	CCAGC	2	10	161543	161552	20 %	0 %	20 %	60 %	220905803
116	NC_011884	ACCGC	2	10	162377	162386	20 %	0 %	20 %	60 %	220905805
117	NC_011884	CTCAA	2	10	163124	163133	40 %	20 %	0 %	40 %	220905806
118	NC_011884	ACCTG	2	10	163135	163144	20 %	20 %	20 %	40 %	220905806
119	NC_011884	GACTG	2	10	163322	163331	20 %	20 %	40 %	20 %	220905806
120	NC_011884	GGGCA	3	15	163436	163450	20 %	0 %	60 %	20 %	220905806
121	NC_011884	ATCCG	2	10	163612	163621	20 %	20 %	20 %	40 %	220905806
122	NC_011884	TGGCA	2	10	165877	165886	20 %	20 %	40 %	20 %	220905808
123	NC_011884	GCCAG	2	10	168991	169000	20 %	0 %	40 %	40 %	220905810
124	NC_011884	GGGCT	2	10	170307	170316	0 %	20 %	60 %	20 %	220905812
125	NC_011884	GGATG	2	10	170993	171002	20 %	20 %	60 %	0 %	220905812
126	NC_011884	GGAAC	2	10	171582	171591	40 %	0 %	40 %	20 %	220905813
127	NC_011884	AACCC	2	10	173583	173592	40 %	0 %	0 %	60 %	220905816
128	NC_011884	GGTCA	2	10	175716	175725	20 %	20 %	40 %	20 %	220905819
129	NC_011884	AGGAG	2	10	177585	177594	40 %	0 %	60 %	0 %	220905821
130	NC_011884	CGAAG	2	10	179563	179572	40 %	0 %	40 %	20 %	220905823
131	NC_011884	GATCA	2	10	179882	179891	40 %	20 %	20 %	20 %	220905823
132	NC_011884	TTAGC	2	10	180702	180711	20 %	40 %	20 %	20 %	220905823
133	NC_011884	GAGTA	2	10	181294	181303	40 %	20 %	40 %	0 %	220905825
134	NC_011884	TGCCC	2	10	184289	184298	0 %	20 %	20 %	60 %	220905829
135	NC_011884	CGGGC	2	10	184901	184910	0 %	0 %	60 %	40 %	220905829
136	NC_011884	CAGGT	2	10	185775	185784	20 %	20 %	40 %	20 %	220905829
137	NC_011884	AGCAG	2	10	185828	185837	40 %	0 %	40 %	20 %	220905829
138	NC_011884	GCCAT	2	10	186837	186846	20 %	20 %	20 %	40 %	220905830
139	NC_011884	GGGAG	2	10	187090	187099	20 %	0 %	80 %	0 %	220905830
140	NC_011884	TGATG	2	10	188356	188365	20 %	40 %	40 %	0 %	220905832
141	NC_011884	TACCG	2	10	189004	189013	20 %	20 %	20 %	40 %	220905833
142	NC_011884	ACGGA	2	10	189815	189824	40 %	0 %	40 %	20 %	220905833
143	NC_011884	TACCT	2	10	190671	190680	20 %	40 %	0 %	40 %	220905834
144	NC_011884	CCTCA	2	10	191798	191807	20 %	20 %	0 %	60 %	220905835
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146	NC_011884	AGCGG	2	10	194115	194124	20 %	0 %	60 %	20 %	220905837
147	NC_011884	CTTCG	2	10	194793	194802	0 %	40 %	20 %	40 %	220905838
148	NC_011884	CGATC	2	10	196834	196843	20 %	20 %	20 %	40 %	220905839
149	NC_011884	AGGGT	2	10	197070	197079	20 %	20 %	60 %	0 %	220905839
150	NC_011884	CCATG	2	10	197176	197185	20 %	20 %	20 %	40 %	220905839
151	NC_011884	CCCCG	2	10	201511	201520	0 %	0 %	20 %	80 %	220905844
152	NC_011884	GCCAG	2	10	202179	202188	20 %	0 %	40 %	40 %	220905845
153	NC_011884	AGGAA	2	10	207161	207170	60 %	0 %	40 %	0 %	220905849
154	NC_011884	AATCC	2	10	207403	207412	40 %	20 %	0 %	40 %	220905850
155	NC_011884	CTGAC	2	10	207564	207573	20 %	20 %	20 %	40 %	220905850
156	NC_011884	CTGGC	2	10	208103	208112	0 %	20 %	40 %	40 %	220905851
157	NC_011884	CCAAC	2	10	209000	209009	40 %	0 %	0 %	60 %	220905851
158	NC_011884	TTCAG	2	10	210854	210863	20 %	40 %	20 %	20 %	220905852
159	NC_011884	AAAGA	2	10	211731	211740	80 %	0 %	20 %	0 %	220905854
160	NC_011884	TTTCT	2	10	211835	211844	0 %	80 %	0 %	20 %	220905854
161	NC_011884	CGGGG	2	10	213525	213534	0 %	0 %	80 %	20 %	220905855
162	NC_011884	ATAAA	2	10	215704	215713	80 %	20 %	0 %	0 %	220905857
163	NC_011884	ATGTG	2	10	215787	215796	20 %	40 %	40 %	0 %	220905857
164	NC_011884	AACGA	2	10	217723	217732	60 %	0 %	20 %	20 %	220905858
165	NC_011884	CCAGA	2	10	219908	219917	40 %	0 %	20 %	40 %	220905860
166	NC_011884	TCAGG	2	10	221578	221587	20 %	20 %	40 %	20 %	220905862
167	NC_011884	AATTT	2	10	223359	223368	40 %	60 %	0 %	0 %	220905865
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170	NC_011884	GAGCC	2	10	228621	228630	20 %	0 %	40 %	40 %	220905869
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180	NC_011884	GCTCT	2	10	244278	244287	0 %	40 %	20 %	40 %	220905885
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183	NC_011884	GCTGG	2	10	249800	249809	0 %	20 %	60 %	20 %	220905890
184	NC_011884	TTTCA	2	10	256825	256834	20 %	60 %	0 %	20 %	220905898
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189	NC_011884	TTTTC	2	10	264519	264528	0 %	80 %	0 %	20 %	220905907
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201	NC_011884	CGATC	2	10	285018	285027	20 %	20 %	20 %	40 %	220905928
202	NC_011884	ATCAG	2	10	285155	285164	40 %	20 %	20 %	20 %	220905928
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231	NC_011884	AGGCG	2	10	333628	333637	20 %	0 %	60 %	20 %	220905969
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234	NC_011884	TAAGT	2	10	340403	340412	40 %	40 %	20 %	0 %	220905975
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236	NC_011884	GAAGG	2	10	345262	345271	40 %	0 %	60 %	0 %	220905978
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241	NC_011884	ATTCC	2	10	353130	353139	20 %	40 %	0 %	40 %	220905985
242	NC_011884	TTACC	2	10	353217	353226	20 %	40 %	0 %	40 %	220905985
243	NC_011884	CGGCC	2	10	353312	353321	0 %	0 %	40 %	60 %	220905985
244	NC_011884	GAGCA	2	10	355677	355686	40 %	0 %	40 %	20 %	220905986
245	NC_011884	TCCTG	2	10	356399	356408	0 %	40 %	20 %	40 %	220905987
246	NC_011884	CAGAT	2	10	358363	358372	40 %	20 %	20 %	20 %	220905988
247	NC_011884	ATCGG	2	10	358414	358423	20 %	20 %	40 %	20 %	220905988
248	NC_011884	AGTTG	2	10	360508	360517	20 %	40 %	40 %	0 %	220905991
249	NC_011884	TCCAA	2	10	361708	361717	40 %	20 %	0 %	40 %	220905994
250	NC_011884	GTGAA	2	10	363637	363646	40 %	20 %	40 %	0 %	220905996
251	NC_011884	AAACC	2	10	364791	364800	60 %	0 %	0 %	40 %	220905998
252	NC_011884	GTCCC	2	10	366303	366312	0 %	20 %	20 %	60 %	220905999
253	NC_011884	CGGTG	2	10	366460	366469	0 %	20 %	60 %	20 %	220905999
254	NC_011884	CGGCA	2	10	368836	368845	20 %	0 %	40 %	40 %	220906002
255	NC_011884	CCACA	2	10	369564	369573	40 %	0 %	0 %	60 %	220906003
256	NC_011884	TCTGG	2	10	371928	371937	0 %	40 %	40 %	20 %	220906004
257	NC_011884	TCCCC	2	10	372163	372172	0 %	20 %	0 %	80 %	220906005
258	NC_011884	CTGCC	2	10	373842	373851	0 %	20 %	20 %	60 %	220906006
259	NC_011884	GGTTC	2	10	374240	374249	0 %	40 %	40 %	20 %	220906007
260	NC_011884	GCCCC	2	10	374996	375005	0 %	0 %	20 %	80 %	220906008
261	NC_011884	CCAGG	2	10	376409	376418	20 %	0 %	40 %	40 %	220906008
262	NC_011884	TGGTC	2	10	378279	378288	0 %	40 %	40 %	20 %	220906009
263	NC_011884	GACCA	2	10	379258	379267	40 %	0 %	20 %	40 %	220906011
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