MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 84300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011884	TGG	2	6	253321	253326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905893
4002	NC_011884	GGGT	2	8	253348	253355	0 %	25 %	75 %	0 %	220905893
4003	NC_011884	GAA	2	6	253391	253396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905893
4004	NC_011884	TTG	2	6	253407	253412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905893
4005	NC_011884	AGG	2	6	253558	253563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905893
4006	NC_011884	CCG	2	6	253590	253595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905893
4007	NC_011884	GCA	2	6	253747	253752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905893
4008	NC_011884	ACA	2	6	253813	253818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905893
4009	NC_011884	A	6	6	254063	254068	100 %	0 %	0 %	0 %	220905894
4010	NC_011884	TTC	2	6	254074	254079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905894
4011	NC_011884	GAT	2	6	254095	254100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905894
4012	NC_011884	TTC	2	6	254117	254122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905894
4013	NC_011884	T	6	6	254183	254188	0 %	100 %	0 %	0 %	220905894
4014	NC_011884	GGCA	2	8	254598	254605	25 %	0 %	50 %	25 %	220905895
4015	NC_011884	TCA	2	6	254637	254642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905895
4016	NC_011884	TGG	2	6	254742	254747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905895
4017	NC_011884	TCA	2	6	254765	254770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905895
4018	NC_011884	CTA	2	6	254803	254808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905895
4019	NC_011884	GCG	2	6	254821	254826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905895
4020	NC_011884	TGT	2	6	254883	254888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905895
4021	NC_011884	TGT	2	6	254895	254900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905895
4022	NC_011884	GGAA	2	8	255080	255087	50 %	0 %	50 %	0 %	220905895
4023	NC_011884	GCTT	2	8	255176	255183	0 %	50 %	25 %	25 %	220905895
4024	NC_011884	CAG	2	6	255747	255752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905896
4025	NC_011884	CGC	2	6	255786	255791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905896
4026	NC_011884	GTA	2	6	255802	255807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905896
4027	NC_011884	TGGA	2	8	255824	255831	25 %	25 %	50 %	0 %	220905896
4028	NC_011884	TC	3	6	255854	255859	0 %	50 %	0 %	50 %	220905896
4029	NC_011884	TGT	2	6	256000	256005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905896
4030	NC_011884	TGG	2	6	256007	256012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905896
4031	NC_011884	TAC	2	6	256024	256029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905896
4032	NC_011884	AGG	2	6	256082	256087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905896
4033	NC_011884	TCT	2	6	256088	256093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905896
4034	NC_011884	CTC	2	6	256118	256123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905896
4035	NC_011884	GGT	2	6	256251	256256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905897
4036	NC_011884	CGA	2	6	256290	256295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905897
4037	NC_011884	CTG	2	6	256381	256386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905897
4038	NC_011884	TGA	2	6	256394	256399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905897
4039	NC_011884	ATCG	2	8	256449	256456	25 %	25 %	25 %	25 %	220905897
4040	NC_011884	GAC	2	6	256475	256480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905897
4041	NC_011884	TTC	2	6	256543	256548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905897
4042	NC_011884	ACG	2	6	256676	256681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905898
4043	NC_011884	TTC	2	6	256726	256731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905898
4044	NC_011884	CTG	2	6	256771	256776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905898
4045	NC_011884	TGA	2	6	256782	256787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905898
4046	NC_011884	TTTCA	2	10	256825	256834	20 %	60 %	0 %	20 %	220905898
4047	NC_011884	CGC	2	6	256857	256862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905898
4048	NC_011884	GCT	2	6	256867	256872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905898
4049	NC_011884	TGG	2	6	256879	256884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905898
4050	NC_011884	ATT	2	6	256888	256893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905898
4051	NC_011884	G	6	6	256914	256919	0 %	0 %	100 %	0 %	220905898
4052	NC_011884	TC	3	6	256986	256991	0 %	50 %	0 %	50 %	220905898
4053	NC_011884	AAG	2	6	257024	257029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905898
4054	NC_011884	CTG	2	6	257148	257153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905899
4055	NC_011884	TCA	2	6	257164	257169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905899
4056	NC_011884	CTG	2	6	257191	257196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905899
4057	NC_011884	TGTCC	2	10	257236	257245	0 %	40 %	20 %	40 %	220905899
4058	NC_011884	ATC	2	6	257316	257321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905899
4059	NC_011884	GAT	2	6	257377	257382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905899
4060	NC_011884	CAT	2	6	257413	257418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905899
4061	NC_011884	TTG	2	6	257435	257440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905899
4062	NC_011884	GCT	2	6	257473	257478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905899
4063	NC_011884	CTG	2	6	257543	257548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905899
4064	NC_011884	GAA	2	6	257795	257800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905899
4065	NC_011884	GTC	2	6	257822	257827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905899
4066	NC_011884	CTG	2	6	257864	257869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905899
4067	NC_011884	CTG	2	6	257913	257918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905899
4068	NC_011884	CAG	2	6	257947	257952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905899
4069	NC_011884	C	6	6	257967	257972	0 %	0 %	0 %	100 %	220905899
4070	NC_011884	GTC	2	6	257994	257999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905899
4071	NC_011884	TCG	2	6	258021	258026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905899
4072	NC_011884	G	7	7	258089	258095	0 %	0 %	100 %	0 %	220905899
4073	NC_011884	ATT	2	6	258101	258106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905899
4074	NC_011884	CAC	2	6	258337	258342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905899
4075	NC_011884	CTA	2	6	258379	258384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905899
4076	NC_011884	AGT	2	6	258392	258397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905899
4077	NC_011884	CCT	2	6	258507	258512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905899
4078	NC_011884	GAA	2	6	258620	258625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905899
4079	NC_011884	GCC	2	6	258826	258831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905900
4080	NC_011884	ACT	2	6	258882	258887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905900
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4082	NC_011884	CT	3	6	258937	258942	0 %	50 %	0 %	50 %	220905900
4083	NC_011884	G	6	6	258956	258961	0 %	0 %	100 %	0 %	220905900
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4086	NC_011884	GCTG	2	8	259073	259080	0 %	25 %	50 %	25 %	220905900
4087	NC_011884	A	7	7	259101	259107	100 %	0 %	0 %	0 %	220905900
4088	NC_011884	GAT	2	6	259125	259130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905900
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4090	NC_011884	AGC	2	6	259173	259178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905900
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4096	NC_011884	CTGT	2	8	259597	259604	0 %	50 %	25 %	25 %	220905901
4097	NC_011884	TGC	2	6	259605	259610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905901
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4099	NC_011884	CCGC	2	8	259669	259676	0 %	0 %	25 %	75 %	220905901
4100	NC_011884	CTG	2	6	259730	259735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905901
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4102	NC_011884	GT	3	6	259892	259897	0 %	50 %	50 %	0 %	220905901
4103	NC_011884	TGGGG	2	10	259958	259967	0 %	20 %	80 %	0 %	220905901
4104	NC_011884	ATT	2	6	260009	260014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905901
4105	NC_011884	C	8	8	260075	260082	0 %	0 %	0 %	100 %	220905901
4106	NC_011884	GCA	2	6	260134	260139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905901
4107	NC_011884	TGG	2	6	260187	260192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905901
4108	NC_011884	TCAG	2	8	260202	260209	25 %	25 %	25 %	25 %	220905901
4109	NC_011884	GGCA	2	8	260220	260227	25 %	0 %	50 %	25 %	220905901
4110	NC_011884	GGCG	2	8	260301	260308	0 %	0 %	75 %	25 %	220905901
4111	NC_011884	TCCC	2	8	260328	260335	0 %	25 %	0 %	75 %	220905901
4112	NC_011884	AAT	2	6	260446	260451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905901
4113	NC_011884	C	6	6	260491	260496	0 %	0 %	0 %	100 %	220905902
4114	NC_011884	CCA	2	6	260507	260512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905902
4115	NC_011884	GCCT	2	8	260538	260545	0 %	25 %	25 %	50 %	220905902
4116	NC_011884	CAC	2	6	260589	260594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905902
4117	NC_011884	G	6	6	260622	260627	0 %	0 %	100 %	0 %	220905902
4118	NC_011884	GAC	2	6	260727	260732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905902
4119	NC_011884	CGG	2	6	260738	260743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905902
4120	NC_011884	GATCG	2	10	260748	260757	20 %	20 %	40 %	20 %	220905902
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4122	NC_011884	TAG	2	6	260826	260831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905902
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4124	NC_011884	AGA	2	6	260892	260897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905902
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4239	NC_011884	CGAT	2	8	268718	268725	25 %	25 %	25 %	25 %	220905911
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4242	NC_011884	G	6	6	268992	268997	0 %	0 %	100 %	0 %	220905911
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4481	NC_011884	TCG	2	6	282758	282763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905928
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4487	NC_011884	GCA	2	6	282965	282970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905928
4488	NC_011884	GAGG	2	8	282991	282998	25 %	0 %	75 %	0 %	220905928
4489	NC_011884	GGC	2	6	283030	283035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905928
4490	NC_011884	TTCA	2	8	283063	283070	25 %	50 %	0 %	25 %	220905928
4491	NC_011884	CCA	2	6	283092	283097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905928
4492	NC_011884	GCA	2	6	283107	283112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905928
4493	NC_011884	CGT	2	6	283128	283133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905928
4494	NC_011884	CAC	2	6	283162	283167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905928
4495	NC_011884	GTTC	2	8	283290	283297	0 %	50 %	25 %	25 %	220905928
4496	NC_011884	AGA	2	6	283305	283310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905928
4497	NC_011884	TCA	2	6	283463	283468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905928
4498	NC_011884	GGT	2	6	283486	283491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905928
4499	NC_011884	CA	4	8	283510	283517	50 %	0 %	0 %	50 %	220905928
4500	NC_011884	GCG	2	6	283528	283533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905928

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