MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 84300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011884	TCCC	2	8	222124	222131	0 %	25 %	0 %	75 %	220905863
3502	NC_011884	GAG	2	6	222296	222301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905864
3503	NC_011884	CAA	2	6	222341	222346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905864
3504	NC_011884	CAGT	2	8	222460	222467	25 %	25 %	25 %	25 %	220905864
3505	NC_011884	GGC	2	6	222468	222473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905864
3506	NC_011884	TG	3	6	222540	222545	0 %	50 %	50 %	0 %	220905864
3507	NC_011884	GCA	2	6	222551	222556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905864
3508	NC_011884	GAG	2	6	222650	222655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905864
3509	NC_011884	AGG	2	6	222720	222725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905864
3510	NC_011884	TC	3	6	222731	222736	0 %	50 %	0 %	50 %	220905864
3511	NC_011884	A	7	7	222784	222790	100 %	0 %	0 %	0 %	220905864
3512	NC_011884	TC	4	8	223019	223026	0 %	50 %	0 %	50 %	220905864
3513	NC_011884	A	6	6	223027	223032	100 %	0 %	0 %	0 %	220905864
3514	NC_011884	CCA	2	6	223315	223320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905865
3515	NC_011884	AATTT	2	10	223359	223368	40 %	60 %	0 %	0 %	220905865
3516	NC_011884	AAT	2	6	223389	223394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905865
3517	NC_011884	CCA	2	6	223433	223438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905865
3518	NC_011884	GAG	2	6	223461	223466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905865
3519	NC_011884	TGT	2	6	223512	223517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905865
3520	NC_011884	TCA	2	6	223578	223583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905865
3521	NC_011884	GCC	2	6	223787	223792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905865
3522	NC_011884	TTTG	2	8	223855	223862	0 %	75 %	25 %	0 %	220905865
3523	NC_011884	AAAT	2	8	223872	223879	75 %	25 %	0 %	0 %	220905865
3524	NC_011884	TCA	3	9	224054	224062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905865
3525	NC_011884	AATATC	2	12	224065	224076	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	220905865
3526	NC_011884	AATG	2	8	224079	224086	50 %	25 %	25 %	0 %	220905865
3527	NC_011884	GTT	2	6	224129	224134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905865
3528	NC_011884	GAA	2	6	224149	224154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905865
3529	NC_011884	TTG	2	6	224168	224173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905865
3530	NC_011884	ACG	2	6	224183	224188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905865
3531	NC_011884	AAG	2	6	224207	224212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905865
3532	NC_011884	CAG	2	6	224238	224243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905865
3533	NC_011884	GTG	3	9	224407	224415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905866
3534	NC_011884	CTG	2	6	224461	224466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905866
3535	NC_011884	GGA	2	6	224485	224490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905866
3536	NC_011884	AG	3	6	224548	224553	50 %	0 %	50 %	0 %	220905866
3537	NC_011884	ATCG	2	8	224620	224627	25 %	25 %	25 %	25 %	220905866
3538	NC_011884	ATC	2	6	224644	224649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905866
3539	NC_011884	CCA	2	6	224658	224663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905866
3540	NC_011884	GGGT	2	8	224691	224698	0 %	25 %	75 %	0 %	220905866
3541	NC_011884	TTG	2	6	224714	224719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905866
3542	NC_011884	TAG	2	6	224771	224776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905866
3543	NC_011884	GTT	2	6	224823	224828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905866
3544	NC_011884	CAGAA	2	10	224852	224861	60 %	0 %	20 %	20 %	220905866
3545	NC_011884	CAC	2	6	224919	224924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905866
3546	NC_011884	CAAT	2	8	224990	224997	50 %	25 %	0 %	25 %	220905866
3547	NC_011884	GCC	2	6	225008	225013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905866
3548	NC_011884	TGG	2	6	225033	225038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905866
3549	NC_011884	ATCG	2	8	225041	225048	25 %	25 %	25 %	25 %	220905866
3550	NC_011884	GCC	2	6	225098	225103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905866
3551	NC_011884	A	6	6	225133	225138	100 %	0 %	0 %	0 %	220905866
3552	NC_011884	ACC	2	6	225262	225267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905866
3553	NC_011884	CAG	2	6	225331	225336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905866
3554	NC_011884	GCG	2	6	225536	225541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905866
3555	NC_011884	TGC	2	6	225567	225572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905866
3556	NC_011884	GCC	2	6	225610	225615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905866
3557	NC_011884	C	6	6	225689	225694	0 %	0 %	0 %	100 %	220905866
3558	NC_011884	GA	3	6	225737	225742	50 %	0 %	50 %	0 %	220905866
3559	NC_011884	TGC	2	6	225749	225754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905866
3560	NC_011884	GTA	2	6	225823	225828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905866
3561	NC_011884	CCA	2	6	226138	226143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905867
3562	NC_011884	ACC	2	6	226182	226187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905867
3563	NC_011884	GAA	2	6	226190	226195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905867
3564	NC_011884	CGGCAT	2	12	226216	226227	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220905867
3565	NC_011884	GAGT	2	8	226239	226246	25 %	25 %	50 %	0 %	220905867
3566	NC_011884	C	6	6	226249	226254	0 %	0 %	0 %	100 %	220905867
3567	NC_011884	ACC	2	6	226269	226274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905867
3568	NC_011884	CTT	2	6	226276	226281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905867
3569	NC_011884	GCT	2	6	226320	226325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905867
3570	NC_011884	TGG	2	6	226354	226359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905867
3571	NC_011884	AAT	2	6	226493	226498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905867
3572	NC_011884	CTGG	2	8	226502	226509	0 %	25 %	50 %	25 %	220905867
3573	NC_011884	T	6	6	226532	226537	0 %	100 %	0 %	0 %	220905867
3574	NC_011884	TCA	2	6	226588	226593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905867
3575	NC_011884	TGG	2	6	226651	226656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905867
3576	NC_011884	CTG	2	6	226687	226692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905867
3577	NC_011884	TGA	2	6	226704	226709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905867
3578	NC_011884	TGG	2	6	226750	226755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905867
3579	NC_011884	CAC	2	6	226766	226771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905867
3580	NC_011884	CTGC	2	8	226783	226790	0 %	25 %	25 %	50 %	220905867
3581	NC_011884	TGC	2	6	226799	226804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905867
3582	NC_011884	TTCC	2	8	226831	226838	0 %	50 %	0 %	50 %	220905867
3583	NC_011884	CAC	2	6	226919	226924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905867
3584	NC_011884	CTT	2	6	226930	226935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905867
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3586	NC_011884	GCTGGT	2	12	227460	227471	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	220905868
3587	NC_011884	CTG	3	9	227491	227499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905868
3588	NC_011884	AAT	2	6	227516	227521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905868
3589	NC_011884	GTT	2	6	227527	227532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905868
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3591	NC_011884	GTA	2	6	227581	227586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905868
3592	NC_011884	GGC	2	6	227627	227632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905868
3593	NC_011884	GCC	2	6	227689	227694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905868
3594	NC_011884	CAG	2	6	227732	227737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905868
3595	NC_011884	CTT	2	6	227753	227758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905868
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3601	NC_011884	GTGG	2	8	228048	228055	0 %	25 %	75 %	0 %	220905869
3602	NC_011884	C	6	6	228094	228099	0 %	0 %	0 %	100 %	220905869
3603	NC_011884	ATT	2	6	228114	228119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905869
3604	NC_011884	TTC	2	6	228174	228179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905869
3605	NC_011884	CACACT	2	12	228246	228257	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	220905869
3606	NC_011884	GTT	2	6	228347	228352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905869
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3608	NC_011884	CGAG	2	8	228406	228413	25 %	0 %	50 %	25 %	220905869
3609	NC_011884	CAA	2	6	228456	228461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905869
3610	NC_011884	CCT	2	6	228560	228565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905869
3611	NC_011884	CTG	2	6	228591	228596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905869
3612	NC_011884	TTGGT	2	10	228601	228610	0 %	60 %	40 %	0 %	220905869
3613	NC_011884	GAGCC	2	10	228621	228630	20 %	0 %	40 %	40 %	220905869
3614	NC_011884	TGG	2	6	228635	228640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905869
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3617	NC_011884	TCGA	2	8	228844	228851	25 %	25 %	25 %	25 %	220905869
3618	NC_011884	CAG	2	6	228858	228863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905869
3619	NC_011884	GCA	2	6	229006	229011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905870
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3622	NC_011884	CAT	2	6	229106	229111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905870
3623	NC_011884	CTG	2	6	229168	229173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905870
3624	NC_011884	GCCC	2	8	229216	229223	0 %	0 %	25 %	75 %	220905870
3625	NC_011884	TCGA	2	8	229224	229231	25 %	25 %	25 %	25 %	220905870
3626	NC_011884	AGG	2	6	229281	229286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905870
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3628	NC_011884	GTA	2	6	229307	229312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905870
3629	NC_011884	GCACT	2	10	229363	229372	20 %	20 %	20 %	40 %	220905870
3630	NC_011884	ACT	2	6	229745	229750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905871
3631	NC_011884	GCT	2	6	229902	229907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905871
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3633	NC_011884	TGGA	2	8	230042	230049	25 %	25 %	50 %	0 %	220905871
3634	NC_011884	TGG	2	6	230102	230107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905871
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3647	NC_011884	GAT	2	6	230860	230865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905872
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3650	NC_011884	TCT	2	6	230974	230979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905872
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3695	NC_011884	G	11	11	232824	232834	0 %	0 %	100 %	0 %	220905873
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3732	NC_011884	GTT	2	6	235200	235205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905873
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3739	NC_011884	TCAATT	2	12	235476	235487	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	220905873
3740	NC_011884	T	6	6	235654	235659	0 %	100 %	0 %	0 %	220905873
3741	NC_011884	CGT	2	6	235682	235687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905873
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3866	NC_011884	TGA	2	6	244217	244222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905885
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3986	NC_011884	ATC	2	6	252303	252308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905892
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3989	NC_011884	GCT	2	6	252682	252687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905893
3990	NC_011884	GTA	2	6	252713	252718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905893
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3999	NC_011884	CA	3	6	253225	253230	50 %	0 %	0 %	50 %	220905893
4000	NC_011884	CTT	2	6	253303	253308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905893

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