MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 84300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011884	CCT	2	6	193044	193049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905836
3002	NC_011884	GAAC	2	8	193051	193058	50 %	0 %	25 %	25 %	220905836
3003	NC_011884	CCTG	2	8	193079	193086	0 %	25 %	25 %	50 %	220905836
3004	NC_011884	GAAG	2	8	193102	193109	50 %	0 %	50 %	0 %	220905836
3005	NC_011884	A	6	6	193135	193140	100 %	0 %	0 %	0 %	220905836
3006	NC_011884	AGC	2	6	193293	193298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905836
3007	NC_011884	AGC	2	6	193402	193407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905837
3008	NC_011884	TCG	2	6	193538	193543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905837
3009	NC_011884	C	6	6	193615	193620	0 %	0 %	0 %	100 %	220905837
3010	NC_011884	TGG	2	6	193632	193637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905837
3011	NC_011884	CATC	2	8	193667	193674	25 %	25 %	0 %	50 %	220905837
3012	NC_011884	TACT	2	8	193677	193684	25 %	50 %	0 %	25 %	220905837
3013	NC_011884	AGTG	2	8	193709	193716	25 %	25 %	50 %	0 %	220905837
3014	NC_011884	GCC	2	6	193740	193745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905837
3015	NC_011884	C	7	7	193783	193789	0 %	0 %	0 %	100 %	220905837
3016	NC_011884	CTG	2	6	193824	193829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905837
3017	NC_011884	C	6	6	193840	193845	0 %	0 %	0 %	100 %	220905837
3018	NC_011884	TTC	2	6	193855	193860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905837
3019	NC_011884	CCAA	2	8	193868	193875	50 %	0 %	0 %	50 %	220905837
3020	NC_011884	CCCA	2	8	193899	193906	25 %	0 %	0 %	75 %	220905837
3021	NC_011884	TC	3	6	193933	193938	0 %	50 %	0 %	50 %	220905837
3022	NC_011884	TGGA	2	8	193953	193960	25 %	25 %	50 %	0 %	220905837
3023	NC_011884	TTG	2	6	193966	193971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905837
3024	NC_011884	GTG	2	6	194043	194048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905837
3025	NC_011884	GGGTG	2	10	194063	194072	0 %	20 %	80 %	0 %	220905837
3026	NC_011884	TGG	2	6	194074	194079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905837
3027	NC_011884	AGCGG	2	10	194115	194124	20 %	0 %	60 %	20 %	220905837
3028	NC_011884	GAA	2	6	194127	194132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905837
3029	NC_011884	CAAA	2	8	194157	194164	75 %	0 %	0 %	25 %	220905837
3030	NC_011884	TCT	2	6	194169	194174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905837
3031	NC_011884	CTC	2	6	194183	194188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905837
3032	NC_011884	AGC	2	6	194201	194206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905837
3033	NC_011884	G	6	6	194429	194434	0 %	0 %	100 %	0 %	220905838
3034	NC_011884	TGC	2	6	194439	194444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905838
3035	NC_011884	AAAG	2	8	194493	194500	75 %	0 %	25 %	0 %	220905838
3036	NC_011884	GA	3	6	194768	194773	50 %	0 %	50 %	0 %	220905838
3037	NC_011884	AC	3	6	194774	194779	50 %	0 %	0 %	50 %	220905838
3038	NC_011884	CTTCG	2	10	194793	194802	0 %	40 %	20 %	40 %	220905838
3039	NC_011884	CCG	2	6	194863	194868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905838
3040	NC_011884	TTC	2	6	194907	194912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905838
3041	NC_011884	CAG	2	6	195033	195038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905838
3042	NC_011884	ATTA	2	8	195042	195049	50 %	50 %	0 %	0 %	220905838
3043	NC_011884	GATC	2	8	195242	195249	25 %	25 %	25 %	25 %	220905838
3044	NC_011884	G	7	7	195275	195281	0 %	0 %	100 %	0 %	220905838
3045	NC_011884	TCGA	2	8	195439	195446	25 %	25 %	25 %	25 %	220905838
3046	NC_011884	ACGC	2	8	195447	195454	25 %	0 %	25 %	50 %	220905838
3047	NC_011884	CGG	2	6	195470	195475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905838
3048	NC_011884	CTG	2	6	195477	195482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905838
3049	NC_011884	TTCA	2	8	195555	195562	25 %	50 %	0 %	25 %	220905838
3050	NC_011884	T	6	6	195664	195669	0 %	100 %	0 %	0 %	220905838
3051	NC_011884	GGT	2	6	195687	195692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905838
3052	NC_011884	C	6	6	195697	195702	0 %	0 %	0 %	100 %	220905838
3053	NC_011884	CTGG	2	8	195732	195739	0 %	25 %	50 %	25 %	220905838
3054	NC_011884	GCT	2	6	195770	195775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905838
3055	NC_011884	GGT	2	6	195786	195791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905838
3056	NC_011884	TGC	2	6	195853	195858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905838
3057	NC_011884	GTT	2	6	195930	195935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905838
3058	NC_011884	GCG	2	6	195963	195968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905838
3059	NC_011884	CCA	2	6	196154	196159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905838
3060	NC_011884	GGAC	2	8	196228	196235	25 %	0 %	50 %	25 %	220905838
3061	NC_011884	CGG	2	6	196248	196253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905838
3062	NC_011884	ATG	2	6	196266	196271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905838
3063	NC_011884	ATC	2	6	196318	196323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905838
3064	NC_011884	CCTG	2	8	196426	196433	0 %	25 %	25 %	50 %	220905838
3065	NC_011884	CAGC	2	8	196619	196626	25 %	0 %	25 %	50 %	220905838
3066	NC_011884	TTAA	2	8	196696	196703	50 %	50 %	0 %	0 %	220905839
3067	NC_011884	GAT	2	6	196762	196767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905839
3068	NC_011884	CGATC	2	10	196834	196843	20 %	20 %	20 %	40 %	220905839
3069	NC_011884	GCC	2	6	196913	196918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905839
3070	NC_011884	GCCC	2	8	196988	196995	0 %	0 %	25 %	75 %	220905839
3071	NC_011884	AGGGT	2	10	197070	197079	20 %	20 %	60 %	0 %	220905839
3072	NC_011884	CTTT	2	8	197091	197098	0 %	75 %	0 %	25 %	220905839
3073	NC_011884	C	6	6	197106	197111	0 %	0 %	0 %	100 %	220905839
3074	NC_011884	AGT	2	6	197137	197142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905839
3075	NC_011884	GAT	2	6	197147	197152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905839
3076	NC_011884	CAC	2	6	197168	197173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905839
3077	NC_011884	CCATG	2	10	197176	197185	20 %	20 %	20 %	40 %	220905839
3078	NC_011884	TGG	2	6	197209	197214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905839
3079	NC_011884	GA	3	6	197257	197262	50 %	0 %	50 %	0 %	220905839
3080	NC_011884	AAG	2	6	197274	197279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905839
3081	NC_011884	CCAG	2	8	197359	197366	25 %	0 %	25 %	50 %	220905839
3082	NC_011884	GCT	2	6	197373	197378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905839
3083	NC_011884	ATT	2	6	197394	197399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905839
3084	NC_011884	CTG	2	6	197873	197878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905840
3085	NC_011884	AAG	2	6	197889	197894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905840
3086	NC_011884	A	6	6	197930	197935	100 %	0 %	0 %	0 %	220905840
3087	NC_011884	CAA	2	6	198013	198018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905840
3088	NC_011884	GCT	2	6	198029	198034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905840
3089	NC_011884	CAA	2	6	198040	198045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905840
3090	NC_011884	ATT	2	6	198077	198082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905840
3091	NC_011884	CGC	2	6	198097	198102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905840
3092	NC_011884	TGA	2	6	198127	198132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905840
3093	NC_011884	GAA	2	6	198230	198235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905840
3094	NC_011884	CT	3	6	198422	198427	0 %	50 %	0 %	50 %	220905840
3095	NC_011884	ATA	2	6	198433	198438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905840
3096	NC_011884	AGA	2	6	198661	198666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905841
3097	NC_011884	ATT	2	6	198813	198818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905841
3098	NC_011884	ATC	2	6	198912	198917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905841
3099	NC_011884	GTC	2	6	198919	198924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905841
3100	NC_011884	GT	3	6	198981	198986	0 %	50 %	50 %	0 %	220905841
3101	NC_011884	TGC	2	6	199054	199059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905841
3102	NC_011884	TGG	2	6	199060	199065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905841
3103	NC_011884	AGG	2	6	199096	199101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905841
3104	NC_011884	GTC	2	6	199158	199163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905841
3105	NC_011884	G	6	6	199183	199188	0 %	0 %	100 %	0 %	220905841
3106	NC_011884	CCA	2	6	199201	199206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905841
3107	NC_011884	G	6	6	199296	199301	0 %	0 %	100 %	0 %	220905841
3108	NC_011884	TTCC	2	8	199360	199367	0 %	50 %	0 %	50 %	220905841
3109	NC_011884	A	6	6	199471	199476	100 %	0 %	0 %	0 %	220905841
3110	NC_011884	CGG	2	6	199627	199632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905842
3111	NC_011884	AAT	2	6	199674	199679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905842
3112	NC_011884	ATGG	2	8	199796	199803	25 %	25 %	50 %	0 %	220905842
3113	NC_011884	GAT	2	6	199830	199835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905842
3114	NC_011884	GTG	2	6	199878	199883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905842
3115	NC_011884	CAG	2	6	199893	199898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905842
3116	NC_011884	CGG	2	6	200032	200037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905842
3117	NC_011884	ATT	2	6	200124	200129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905842
3118	NC_011884	GCT	2	6	200189	200194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905842
3119	NC_011884	C	6	6	200226	200231	0 %	0 %	0 %	100 %	220905842
3120	NC_011884	TGC	2	6	200240	200245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905842
3121	NC_011884	CGG	2	6	200302	200307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905842
3122	NC_011884	CGA	2	6	200333	200338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905842
3123	NC_011884	CCG	2	6	200480	200485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905842
3124	NC_011884	TTC	2	6	200639	200644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905843
3125	NC_011884	CTG	2	6	200776	200781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905843
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3129	NC_011884	CTCAAT	2	12	200961	200972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905843
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3132	NC_011884	CT	4	8	201121	201128	0 %	50 %	0 %	50 %	220905843
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3233	NC_011884	ATCG	2	8	206892	206899	25 %	25 %	25 %	25 %	220905849
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3240	NC_011884	GC	3	6	207203	207208	0 %	0 %	50 %	50 %	220905849
3241	NC_011884	CTA	2	6	207245	207250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905849
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3243	NC_011884	TG	3	6	207366	207371	0 %	50 %	50 %	0 %	220905850
3244	NC_011884	AATCC	2	10	207403	207412	40 %	20 %	0 %	40 %	220905850
3245	NC_011884	TGC	2	6	207418	207423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905850
3246	NC_011884	TGC	2	6	207444	207449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905850
3247	NC_011884	CGG	3	9	207456	207464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905850
3248	NC_011884	CTGAC	2	10	207564	207573	20 %	20 %	20 %	40 %	220905850
3249	NC_011884	GGC	2	6	207578	207583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905850
3250	NC_011884	TGG	2	6	207612	207617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905850
3251	NC_011884	C	6	6	207635	207640	0 %	0 %	0 %	100 %	220905850
3252	NC_011884	GGTGCT	2	12	207664	207675	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	220905850
3253	NC_011884	GAT	2	6	207698	207703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905850
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3256	NC_011884	TGA	2	6	207990	207995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905850
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3259	NC_011884	CTGGC	2	10	208103	208112	0 %	20 %	40 %	40 %	220905851
3260	NC_011884	GCTG	2	8	208198	208205	0 %	25 %	50 %	25 %	220905851
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3263	NC_011884	CTG	2	6	208499	208504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905851
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3268	NC_011884	GCTG	2	8	208761	208768	0 %	25 %	50 %	25 %	220905851
3269	NC_011884	TGA	2	6	208791	208796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905851
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3272	NC_011884	GAT	2	6	208861	208866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905851
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3342	NC_011884	AC	5	10	213167	213176	50 %	0 %	0 %	50 %	220905855
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3354	NC_011884	CGAT	2	8	214236	214243	25 %	25 %	25 %	25 %	220905856
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3364	NC_011884	TA	3	6	214575	214580	50 %	50 %	0 %	0 %	220905856
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3373	NC_011884	AGTT	2	8	215088	215095	25 %	50 %	25 %	0 %	220905856
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3484	NC_011884	TAA	2	6	221197	221202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905862
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3489	NC_011884	TGC	2	6	221358	221363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905862
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3491	NC_011884	ATTG	2	8	221489	221496	25 %	50 %	25 %	0 %	220905862
3492	NC_011884	GTTT	2	8	221507	221514	0 %	75 %	25 %	0 %	220905862
3493	NC_011884	GCA	2	6	221515	221520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905862
3494	NC_011884	CAG	2	6	221560	221565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905862
3495	NC_011884	TCAGG	2	10	221578	221587	20 %	20 %	40 %	20 %	220905862
3496	NC_011884	AACC	2	8	221738	221745	50 %	0 %	0 %	50 %	220905862
3497	NC_011884	CAC	2	6	221776	221781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905862
3498	NC_011884	ATT	2	6	221805	221810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905862
3499	NC_011884	AGA	2	6	222041	222046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905863
3500	NC_011884	T	7	7	222103	222109	0 %	100 %	0 %	0 %	220905863

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