MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 84300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011884	AAT	2	6	162450	162455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905805
2502	NC_011884	GCA	2	6	162488	162493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905805
2503	NC_011884	CAC	2	6	162573	162578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905805
2504	NC_011884	CTG	2	6	162603	162608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905805
2505	NC_011884	TTC	2	6	162624	162629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905805
2506	NC_011884	CAG	2	6	162705	162710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905805
2507	NC_011884	GTT	2	6	162809	162814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905805
2508	NC_011884	GCT	2	6	162818	162823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905805
2509	NC_011884	TGC	2	6	162831	162836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905805
2510	NC_011884	TTC	2	6	162933	162938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905805
2511	NC_011884	CTCAA	2	10	163124	163133	40 %	20 %	0 %	40 %	220905806
2512	NC_011884	ACCTG	2	10	163135	163144	20 %	20 %	20 %	40 %	220905806
2513	NC_011884	AGAT	2	8	163267	163274	50 %	25 %	25 %	0 %	220905806
2514	NC_011884	TC	3	6	163282	163287	0 %	50 %	0 %	50 %	220905806
2515	NC_011884	GACTG	2	10	163322	163331	20 %	20 %	40 %	20 %	220905806
2516	NC_011884	GGCC	2	8	163332	163339	0 %	0 %	50 %	50 %	220905806
2517	NC_011884	CTC	2	6	163353	163358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905806
2518	NC_011884	GGGCA	3	15	163436	163450	20 %	0 %	60 %	20 %	220905806
2519	NC_011884	ATCCG	2	10	163612	163621	20 %	20 %	20 %	40 %	220905806
2520	NC_011884	TGG	2	6	163661	163666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905806
2521	NC_011884	TGT	2	6	163807	163812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905806
2522	NC_011884	TTGA	2	8	164016	164023	25 %	50 %	25 %	0 %	220905806
2523	NC_011884	TGG	2	6	164090	164095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905806
2524	NC_011884	TCAC	2	8	164161	164168	25 %	25 %	0 %	50 %	220905806
2525	NC_011884	GTG	2	6	164176	164181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905806
2526	NC_011884	CCA	2	6	164364	164369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905807
2527	NC_011884	TGC	2	6	164379	164384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905807
2528	NC_011884	TGG	2	6	164493	164498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905807
2529	NC_011884	TTA	2	6	164623	164628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905807
2530	NC_011884	ACC	2	6	164643	164648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905807
2531	NC_011884	CTG	2	6	164748	164753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905807
2532	NC_011884	TCA	2	6	164842	164847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905807
2533	NC_011884	GCTG	2	8	164880	164887	0 %	25 %	50 %	25 %	220905807
2534	NC_011884	GCT	2	6	164893	164898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905807
2535	NC_011884	GCAG	2	8	164938	164945	25 %	0 %	50 %	25 %	220905807
2536	NC_011884	GCA	2	6	165059	165064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905807
2537	NC_011884	ATTA	2	8	165082	165089	50 %	50 %	0 %	0 %	220905807
2538	NC_011884	GATG	2	8	165158	165165	25 %	25 %	50 %	0 %	220905807
2539	NC_011884	GTG	2	6	165185	165190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905808
2540	NC_011884	CATC	2	8	165339	165346	25 %	25 %	0 %	50 %	220905808
2541	NC_011884	CAT	3	9	165352	165360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905808
2542	NC_011884	AG	4	8	165404	165411	50 %	0 %	50 %	0 %	220905808
2543	NC_011884	GTG	2	6	165476	165481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905808
2544	NC_011884	TCA	2	6	165494	165499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905808
2545	NC_011884	CCA	3	9	165501	165509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905808
2546	NC_011884	TAGA	2	8	165583	165590	50 %	25 %	25 %	0 %	220905808
2547	NC_011884	AAT	2	6	165652	165657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905808
2548	NC_011884	GAA	2	6	165712	165717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905808
2549	NC_011884	CATCCC	2	12	165751	165762	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	220905808
2550	NC_011884	TCA	2	6	165830	165835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905808
2551	NC_011884	TCC	2	6	165868	165873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905808
2552	NC_011884	TGGCA	2	10	165877	165886	20 %	20 %	40 %	20 %	220905808
2553	NC_011884	CA	3	6	165898	165903	50 %	0 %	0 %	50 %	220905808
2554	NC_011884	TCA	2	6	165909	165914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905808
2555	NC_011884	TGGG	2	8	165929	165936	0 %	25 %	75 %	0 %	220905808
2556	NC_011884	GCA	2	6	165962	165967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905808
2557	NC_011884	GT	3	6	166001	166006	0 %	50 %	50 %	0 %	220905808
2558	NC_011884	GCA	4	12	166047	166058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905808
2559	NC_011884	GTG	2	6	166061	166066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905808
2560	NC_011884	T	7	7	166154	166160	0 %	100 %	0 %	0 %	220905808
2561	NC_011884	C	6	6	166237	166242	0 %	0 %	0 %	100 %	220905808
2562	NC_011884	CT	3	6	166259	166264	0 %	50 %	0 %	50 %	220905808
2563	NC_011884	T	6	6	166297	166302	0 %	100 %	0 %	0 %	220905808
2564	NC_011884	CAG	2	6	166447	166452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905808
2565	NC_011884	CTG	2	6	166524	166529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905808
2566	NC_011884	AATA	2	8	166566	166573	75 %	25 %	0 %	0 %	220905808
2567	NC_011884	TCA	2	6	166679	166684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905808
2568	NC_011884	GCT	2	6	166727	166732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905808
2569	NC_011884	AG	3	6	166833	166838	50 %	0 %	50 %	0 %	220905808
2570	NC_011884	CAGC	2	8	166867	166874	25 %	0 %	25 %	50 %	220905808
2571	NC_011884	ATCACC	2	12	166942	166953	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	220905808
2572	NC_011884	TTC	2	6	167005	167010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905808
2573	NC_011884	CTG	2	6	167064	167069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905808
2574	NC_011884	CTA	2	6	167111	167116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905808
2575	NC_011884	CT	3	6	167174	167179	0 %	50 %	0 %	50 %	220905808
2576	NC_011884	A	6	6	167182	167187	100 %	0 %	0 %	0 %	220905808
2577	NC_011884	TTCT	2	8	167211	167218	0 %	75 %	0 %	25 %	220905808
2578	NC_011884	AAC	2	6	167231	167236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905808
2579	NC_011884	TTC	2	6	167269	167274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905808
2580	NC_011884	AGT	2	6	167310	167315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905808
2581	NC_011884	CTGC	2	8	167407	167414	0 %	25 %	25 %	50 %	220905808
2582	NC_011884	CTG	2	6	167428	167433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905808
2583	NC_011884	CTG	2	6	167437	167442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905808
2584	NC_011884	TGCT	2	8	167452	167459	0 %	50 %	25 %	25 %	220905808
2585	NC_011884	TGG	2	6	167540	167545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905808
2586	NC_011884	GAT	2	6	167548	167553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905808
2587	NC_011884	GGC	2	6	167710	167715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905808
2588	NC_011884	AAT	2	6	167815	167820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905808
2589	NC_011884	GGA	2	6	167835	167840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905808
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2591	NC_011884	GTT	2	6	168018	168023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905808
2592	NC_011884	TGCA	2	8	168053	168060	25 %	25 %	25 %	25 %	220905808
2593	NC_011884	CAA	2	6	168096	168101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905808
2594	NC_011884	ATC	2	6	168322	168327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905808
2595	NC_011884	TGAT	2	8	168360	168367	25 %	50 %	25 %	0 %	220905808
2596	NC_011884	ACT	2	6	168760	168765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905809
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2598	NC_011884	TCC	2	6	168905	168910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905810
2599	NC_011884	GCCAG	2	10	168991	169000	20 %	0 %	40 %	40 %	220905810
2600	NC_011884	A	6	6	169014	169019	100 %	0 %	0 %	0 %	220905810
2601	NC_011884	A	7	7	169025	169031	100 %	0 %	0 %	0 %	220905810
2602	NC_011884	GGC	2	6	169058	169063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905810
2603	NC_011884	GCA	2	6	169145	169150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905810
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2605	NC_011884	ATT	2	6	169417	169422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905811
2606	NC_011884	TTTC	2	8	169432	169439	0 %	75 %	0 %	25 %	220905811
2607	NC_011884	GGC	2	6	169442	169447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905811
2608	NC_011884	CGA	2	6	169492	169497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905811
2609	NC_011884	ATC	2	6	169501	169506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905811
2610	NC_011884	AGA	2	6	169514	169519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905811
2611	NC_011884	GAT	2	6	169532	169537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905811
2612	NC_011884	TTCT	2	8	169636	169643	0 %	75 %	0 %	25 %	220905811
2613	NC_011884	T	6	6	169646	169651	0 %	100 %	0 %	0 %	220905811
2614	NC_011884	TTC	2	6	169658	169663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905811
2615	NC_011884	TGCC	2	8	169671	169678	0 %	25 %	25 %	50 %	220905811
2616	NC_011884	CAT	2	6	169683	169688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905811
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2618	NC_011884	CAAA	2	8	169704	169711	75 %	0 %	0 %	25 %	220905811
2619	NC_011884	GAA	2	6	170023	170028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905812
2620	NC_011884	CTG	2	6	170103	170108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905812
2621	NC_011884	TGA	2	6	170113	170118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905812
2622	NC_011884	CTA	2	6	170130	170135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905812
2623	NC_011884	AACTCA	2	12	170141	170152	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	220905812
2624	NC_011884	CCT	3	9	170161	170169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905812
2625	NC_011884	ACCA	2	8	170256	170263	50 %	0 %	0 %	50 %	220905812
2626	NC_011884	ACA	2	6	170266	170271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905812
2627	NC_011884	CTA	2	6	170278	170283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905812
2628	NC_011884	GGGCT	2	10	170307	170316	0 %	20 %	60 %	20 %	220905812
2629	NC_011884	G	6	6	170372	170377	0 %	0 %	100 %	0 %	220905812
2630	NC_011884	TTAT	2	8	170433	170440	25 %	75 %	0 %	0 %	220905812
2631	NC_011884	GCA	2	6	170473	170478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905812
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2634	NC_011884	ACT	2	6	170601	170606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905812
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2636	NC_011884	CT	3	6	170639	170644	0 %	50 %	0 %	50 %	220905812
2637	NC_011884	ACTC	2	8	170710	170717	25 %	25 %	0 %	50 %	220905812
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2640	NC_011884	TCTG	2	8	170897	170904	0 %	50 %	25 %	25 %	220905812
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2643	NC_011884	GGATG	2	10	170993	171002	20 %	20 %	60 %	0 %	220905812
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2867	NC_011884	AAC	2	6	184975	184980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905829
2868	NC_011884	CGT	2	6	185000	185005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905829
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2871	NC_011884	TGA	2	6	185128	185133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905829
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2973	NC_011884	CCCT	2	8	191659	191666	0 %	25 %	0 %	75 %	220905835
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2977	NC_011884	CCTCA	2	10	191798	191807	20 %	20 %	0 %	60 %	220905835
2978	NC_011884	ACC	2	6	191886	191891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905835
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2983	NC_011884	ATA	2	6	192124	192129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905835
2984	NC_011884	TGC	2	6	192149	192154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905835
2985	NC_011884	CTCC	2	8	192191	192198	0 %	25 %	0 %	75 %	220905835
2986	NC_011884	TGGCAG	2	12	192329	192340	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	220905835
2987	NC_011884	GCA	2	6	192362	192367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905835
2988	NC_011884	TTG	2	6	192370	192375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905835
2989	NC_011884	G	6	6	192384	192389	0 %	0 %	100 %	0 %	220905835
2990	NC_011884	ACC	2	6	192406	192411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905835
2991	NC_011884	TCT	2	6	192439	192444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905835
2992	NC_011884	TCC	2	6	192456	192461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905835
2993	NC_011884	TGGA	2	8	192526	192533	25 %	25 %	50 %	0 %	220905836
2994	NC_011884	A	6	6	192551	192556	100 %	0 %	0 %	0 %	220905836
2995	NC_011884	GAT	2	6	192600	192605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905836
2996	NC_011884	GGAC	2	8	192609	192616	25 %	0 %	50 %	25 %	220905836
2997	NC_011884	CTG	2	6	192733	192738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905836
2998	NC_011884	GCC	2	6	192845	192850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905836
2999	NC_011884	ATG	2	6	192887	192892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905836
3000	NC_011884	CAA	2	6	192985	192990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905836

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