MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 84300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011884	T	6	6	98478	98483	0 %	100 %	0 %	0 %	220905740
1502	NC_011884	GAA	2	6	98571	98576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905740
1503	NC_011884	TTG	2	6	98630	98635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905740
1504	NC_011884	CTT	2	6	98700	98705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905740
1505	NC_011884	TGC	2	6	98809	98814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905740
1506	NC_011884	TGT	2	6	98975	98980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905741
1507	NC_011884	GCA	2	6	99088	99093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905741
1508	NC_011884	C	6	6	99135	99140	0 %	0 %	0 %	100 %	220905741
1509	NC_011884	CCT	2	6	99172	99177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905741
1510	NC_011884	GTT	2	6	99281	99286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905741
1511	NC_011884	C	6	6	99303	99308	0 %	0 %	0 %	100 %	220905741
1512	NC_011884	CCT	2	6	99340	99345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905741
1513	NC_011884	CAG	2	6	99462	99467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905741
1514	NC_011884	TGT	2	6	99479	99484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905741
1515	NC_011884	CAT	2	6	99500	99505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905741
1516	NC_011884	GTG	2	6	99538	99543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905741
1517	NC_011884	ACT	2	6	99580	99585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905741
1518	NC_011884	GCA	2	6	99604	99609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905741
1519	NC_011884	AGG	2	6	99631	99636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905741
1520	NC_011884	TGT	2	6	99647	99652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905741
1521	NC_011884	CCG	2	6	99770	99775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905741
1522	NC_011884	CCT	2	6	99789	99794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905741
1523	NC_011884	AGA	2	6	99799	99804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905741
1524	NC_011884	TGT	2	6	99815	99820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905741
1525	NC_011884	CCT	2	6	99844	99849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905741
1526	NC_011884	AGG	2	6	99967	99972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905741
1527	NC_011884	TTA	2	6	100021	100026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905741
1528	NC_011884	CCA	2	6	100036	100041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905741
1529	NC_011884	TGG	2	6	100106	100111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905741
1530	NC_011884	CTG	2	6	100175	100180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905741
1531	NC_011884	AGT	2	6	100290	100295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905741
1532	NC_011884	TGGCC	2	10	100596	100605	0 %	20 %	40 %	40 %	220905742
1533	NC_011884	ACA	2	6	100685	100690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905742
1534	NC_011884	AAATT	2	10	100886	100895	60 %	40 %	0 %	0 %	220905742
1535	NC_011884	CAT	2	6	100923	100928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905742
1536	NC_011884	TGG	2	6	100955	100960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905742
1537	NC_011884	ACC	2	6	100991	100996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905742
1538	NC_011884	AAT	2	6	101006	101011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905742
1539	NC_011884	CCG	2	6	101551	101556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905743
1540	NC_011884	TAA	2	6	101644	101649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905743
1541	NC_011884	G	6	6	101715	101720	0 %	0 %	100 %	0 %	220905743
1542	NC_011884	AGG	2	6	101779	101784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905743
1543	NC_011884	CAT	2	6	101799	101804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905743
1544	NC_011884	TG	3	6	102094	102099	0 %	50 %	50 %	0 %	220905744
1545	NC_011884	GTT	2	6	102150	102155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905744
1546	NC_011884	GAA	4	12	102159	102170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905744
1547	NC_011884	GTG	2	6	102209	102214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905744
1548	NC_011884	TCC	2	6	102275	102280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905744
1549	NC_011884	CAG	2	6	102333	102338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905744
1550	NC_011884	AGC	3	9	102346	102354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905744
1551	NC_011884	AAC	2	6	102355	102360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905744
1552	NC_011884	TTC	2	6	102389	102394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905744
1553	NC_011884	CTC	2	6	102430	102435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905744
1554	NC_011884	CTG	2	6	102445	102450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905744
1555	NC_011884	TGACC	2	10	102458	102467	20 %	20 %	20 %	40 %	220905744
1556	NC_011884	GCG	2	6	102557	102562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905744
1557	NC_011884	ACA	2	6	102574	102579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905744
1558	NC_011884	CCA	2	6	102688	102693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905744
1559	NC_011884	AAT	2	6	102756	102761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905744
1560	NC_011884	TCC	2	6	102825	102830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905744
1561	NC_011884	AGGG	2	8	102931	102938	25 %	0 %	75 %	0 %	220905744
1562	NC_011884	ACCC	2	8	103069	103076	25 %	0 %	0 %	75 %	220905745
1563	NC_011884	CTTC	2	8	103117	103124	0 %	50 %	0 %	50 %	220905745
1564	NC_011884	CTG	2	6	103229	103234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905745
1565	NC_011884	AAG	2	6	103284	103289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905745
1566	NC_011884	CA	3	6	104150	104155	50 %	0 %	0 %	50 %	220905746
1567	NC_011884	CAA	2	6	104221	104226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905746
1568	NC_011884	AG	3	6	104264	104269	50 %	0 %	50 %	0 %	220905746
1569	NC_011884	ACCCA	2	10	104273	104282	40 %	0 %	0 %	60 %	220905746
1570	NC_011884	TGAG	2	8	104389	104396	25 %	25 %	50 %	0 %	220905746
1571	NC_011884	GAA	2	6	104573	104578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905746
1572	NC_011884	TTCA	2	8	104672	104679	25 %	50 %	0 %	25 %	220905746
1573	NC_011884	CAAA	2	8	105002	105009	75 %	0 %	0 %	25 %	220905747
1574	NC_011884	TAT	2	6	105036	105041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905747
1575	NC_011884	AAT	2	6	105078	105083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905747
1576	NC_011884	CAA	2	6	105114	105119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905747
1577	NC_011884	A	6	6	105132	105137	100 %	0 %	0 %	0 %	220905747
1578	NC_011884	AGA	2	6	105161	105166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905747
1579	NC_011884	TGG	2	6	105194	105199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905747
1580	NC_011884	GAA	2	6	105255	105260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905747
1581	NC_011884	GAT	3	9	105272	105280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905747
1582	NC_011884	TGAT	2	8	105364	105371	25 %	50 %	25 %	0 %	220905747
1583	NC_011884	CT	3	6	105414	105419	0 %	50 %	0 %	50 %	220905747
1584	NC_011884	TAA	2	6	105775	105780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905748
1585	NC_011884	GGC	2	6	105782	105787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905748
1586	NC_011884	ATC	2	6	105840	105845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905748
1587	NC_011884	AGGT	2	8	105892	105899	25 %	25 %	50 %	0 %	220905748
1588	NC_011884	CT	3	6	105904	105909	0 %	50 %	0 %	50 %	220905748
1589	NC_011884	TACCTG	2	12	105938	105949	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	220905748
1590	NC_011884	TTCC	2	8	106016	106023	0 %	50 %	0 %	50 %	220905748
1591	NC_011884	TTC	2	6	106038	106043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905748
1592	NC_011884	GCA	2	6	106168	106173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905748
1593	NC_011884	TGC	2	6	106218	106223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905748
1594	NC_011884	GCA	2	6	106500	106505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905749
1595	NC_011884	CAG	2	6	106507	106512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905749
1596	NC_011884	TCG	2	6	106602	106607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905749
1597	NC_011884	CAG	2	6	106626	106631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905749
1598	NC_011884	ATAA	2	8	106730	106737	75 %	25 %	0 %	0 %	220905749
1599	NC_011884	ATT	2	6	107311	107316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905750
1600	NC_011884	CGGG	2	8	107345	107352	0 %	0 %	75 %	25 %	220905750
1601	NC_011884	CAT	2	6	107380	107385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905750
1602	NC_011884	CAA	2	6	107391	107396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905750
1603	NC_011884	GGGAGA	2	12	107458	107469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905750
1604	NC_011884	CTT	2	6	107807	107812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905751
1605	NC_011884	TC	3	6	107882	107887	0 %	50 %	0 %	50 %	220905751
1606	NC_011884	TC	3	6	107904	107909	0 %	50 %	0 %	50 %	220905751
1607	NC_011884	CTG	2	6	108093	108098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905752
1608	NC_011884	CAT	2	6	108130	108135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905752
1609	NC_011884	CTT	2	6	108172	108177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905752
1610	NC_011884	CAA	2	6	108193	108198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905752
1611	NC_011884	GAA	2	6	108294	108299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905752
1612	NC_011884	AGC	2	6	108315	108320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905752
1613	NC_011884	TGC	2	6	108362	108367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905752
1614	NC_011884	CTG	2	6	108370	108375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905752
1615	NC_011884	AGG	2	6	108488	108493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905752
1616	NC_011884	GAA	2	6	108530	108535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905752
1617	NC_011884	TTC	2	6	108545	108550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905752
1618	NC_011884	CAT	2	6	108601	108606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905752
1619	NC_011884	GAA	2	6	108668	108673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905752
1620	NC_011884	ATA	2	6	108744	108749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905752
1621	NC_011884	TCC	2	6	108762	108767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905752
1622	NC_011884	TGC	2	6	108782	108787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905752
1623	NC_011884	ATT	2	6	108876	108881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905752
1624	NC_011884	GCT	2	6	108915	108920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905752
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1651	NC_011884	CCAT	2	8	110925	110932	25 %	25 %	0 %	50 %	220905754
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1853	NC_011884	CGAT	2	8	124257	124264	25 %	25 %	25 %	25 %	220905768
1854	NC_011884	CAGAC	2	10	124271	124280	40 %	0 %	20 %	40 %	220905768
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1856	NC_011884	GAT	2	6	124316	124321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905768
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1858	NC_011884	GCA	2	6	124475	124480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905768
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1860	NC_011884	TAT	2	6	124695	124700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905769
1861	NC_011884	CGC	2	6	124779	124784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905769
1862	NC_011884	A	6	6	124928	124933	100 %	0 %	0 %	0 %	220905769
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1864	NC_011884	CAT	2	6	125045	125050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905769
1865	NC_011884	TTC	2	6	125063	125068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905769
1866	NC_011884	GAAA	2	8	125090	125097	75 %	0 %	25 %	0 %	220905769
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1868	NC_011884	ATC	2	6	125137	125142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905769
1869	NC_011884	TTG	2	6	125215	125220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905769
1870	NC_011884	CGA	2	6	125306	125311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905769
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1873	NC_011884	T	7	7	125428	125434	0 %	100 %	0 %	0 %	220905769
1874	NC_011884	T	7	7	125457	125463	0 %	100 %	0 %	0 %	220905769
1875	NC_011884	TCGA	2	8	125989	125996	25 %	25 %	25 %	25 %	220905770
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1882	NC_011884	GAG	2	6	126325	126330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905770
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1884	NC_011884	TGC	2	6	126553	126558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905771
1885	NC_011884	GCA	2	6	126606	126611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905771
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1887	NC_011884	GCT	2	6	126680	126685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905771
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1905	NC_011884	CTGA	2	8	127553	127560	25 %	25 %	25 %	25 %	220905772
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1919	NC_011884	TCA	2	6	128592	128597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905773
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1943	NC_011884	GATT	2	8	130340	130347	25 %	50 %	25 %	0 %	220905774
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1980	NC_011884	GCGG	2	8	132689	132696	0 %	0 %	75 %	25 %	220905777
1981	NC_011884	ATCG	2	8	132743	132750	25 %	25 %	25 %	25 %	220905777
1982	NC_011884	CTGGAA	2	12	132789	132800	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	220905777
1983	NC_011884	ACAGC	2	10	132831	132840	40 %	0 %	20 %	40 %	220905777
1984	NC_011884	CCA	2	6	132852	132857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905777
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1986	NC_011884	CGG	2	6	133062	133067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905777
1987	NC_011884	ATT	2	6	133071	133076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905777
1988	NC_011884	ATCA	2	8	133113	133120	50 %	25 %	0 %	25 %	220905777
1989	NC_011884	AAC	2	6	133136	133141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905777
1990	NC_011884	TTG	2	6	133171	133176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905777
1991	NC_011884	ACTGA	2	10	133179	133188	40 %	20 %	20 %	20 %	220905777
1992	NC_011884	GCA	2	6	133220	133225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905777
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1998	NC_011884	CAGC	2	8	133541	133548	25 %	0 %	25 %	50 %	220905777
1999	NC_011884	GCA	2	6	133562	133567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905777
2000	NC_011884	A	6	6	133639	133644	100 %	0 %	0 %	0 %	220905777

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