MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 84300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011884	G	6	6	32680	32685	0 %	0 %	100 %	0 %	220905673
502	NC_011884	GCT	2	6	32703	32708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905673
503	NC_011884	G	6	6	32718	32723	0 %	0 %	100 %	0 %	220905673
504	NC_011884	GCA	2	6	32741	32746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905673
505	NC_011884	GAC	2	6	32813	32818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905673
506	NC_011884	CCATTT	2	12	32852	32863	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	220905673
507	NC_011884	GAG	2	6	32923	32928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905673
508	NC_011884	TGGC	2	8	32966	32973	0 %	25 %	50 %	25 %	220905673
509	NC_011884	TCC	2	6	32982	32987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905673
510	NC_011884	CAG	2	6	33078	33083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905673
511	NC_011884	CAGCAA	2	12	33105	33116	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	220905673
512	NC_011884	AGG	2	6	33122	33127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905673
513	NC_011884	A	6	6	33154	33159	100 %	0 %	0 %	0 %	220905673
514	NC_011884	GAG	2	6	33215	33220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905673
515	NC_011884	GCT	2	6	33226	33231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905673
516	NC_011884	CAC	2	6	33267	33272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905673
517	NC_011884	GCT	2	6	33280	33285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905673
518	NC_011884	CAG	2	6	33320	33325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905673
519	NC_011884	AGACC	2	10	33346	33355	40 %	0 %	20 %	40 %	220905673
520	NC_011884	CAA	2	6	33374	33379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905673
521	NC_011884	TGA	2	6	33634	33639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905674
522	NC_011884	TTAC	2	8	33666	33673	25 %	50 %	0 %	25 %	220905674
523	NC_011884	ATT	2	6	33677	33682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905674
524	NC_011884	CTT	2	6	33683	33688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905674
525	NC_011884	TCTT	2	8	33737	33744	0 %	75 %	0 %	25 %	220905674
526	NC_011884	TGT	2	6	33757	33762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905674
527	NC_011884	CCTG	2	8	33815	33822	0 %	25 %	25 %	50 %	220905674
528	NC_011884	TCC	2	6	33846	33851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905674
529	NC_011884	CGG	2	6	33853	33858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905674
530	NC_011884	AAT	2	6	33905	33910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905674
531	NC_011884	TTCC	2	8	34011	34018	0 %	50 %	0 %	50 %	220905674
532	NC_011884	T	6	6	34109	34114	0 %	100 %	0 %	0 %	220905674
533	NC_011884	CAC	2	6	34117	34122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905674
534	NC_011884	T	6	6	34142	34147	0 %	100 %	0 %	0 %	220905674
535	NC_011884	GCA	2	6	34165	34170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905674
536	NC_011884	CT	3	6	34173	34178	0 %	50 %	0 %	50 %	220905674
537	NC_011884	TCAG	2	8	34299	34306	25 %	25 %	25 %	25 %	220905674
538	NC_011884	CGA	2	6	34310	34315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905674
539	NC_011884	CTA	2	6	34324	34329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905674
540	NC_011884	CTG	2	6	34373	34378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905675
541	NC_011884	GTT	2	6	34389	34394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905675
542	NC_011884	GCA	2	6	34442	34447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905675
543	NC_011884	GCG	3	9	34520	34528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905675
544	NC_011884	GTG	2	6	34611	34616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905675
545	NC_011884	CAC	2	6	34705	34710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905675
546	NC_011884	ATCG	2	8	34757	34764	25 %	25 %	25 %	25 %	220905675
547	NC_011884	CCA	2	6	34824	34829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905675
548	NC_011884	ATG	2	6	34913	34918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905676
549	NC_011884	AGG	2	6	34967	34972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905676
550	NC_011884	CGG	2	6	35008	35013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905676
551	NC_011884	GTG	2	6	35116	35121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905676
552	NC_011884	GAA	2	6	35179	35184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905676
553	NC_011884	GGC	2	6	35409	35414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905677
554	NC_011884	CCT	2	6	35465	35470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905677
555	NC_011884	CTG	2	6	35517	35522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905677
556	NC_011884	AAT	2	6	35535	35540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905677
557	NC_011884	ACAG	2	8	35560	35567	50 %	0 %	25 %	25 %	220905677
558	NC_011884	GTT	2	6	35591	35596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905677
559	NC_011884	GAC	2	6	35601	35606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905677
560	NC_011884	CA	3	6	35674	35679	50 %	0 %	0 %	50 %	220905677
561	NC_011884	GCA	2	6	35780	35785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905677
562	NC_011884	AAC	2	6	35824	35829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905677
563	NC_011884	TGC	2	6	35872	35877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905677
564	NC_011884	AAG	2	6	35902	35907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905677
565	NC_011884	CTG	2	6	35967	35972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905678
566	NC_011884	ATC	2	6	36075	36080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905678
567	NC_011884	TAGG	2	8	36170	36177	25 %	25 %	50 %	0 %	220905678
568	NC_011884	ACC	2	6	36229	36234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905678
569	NC_011884	TCC	2	6	36289	36294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905678
570	NC_011884	GCC	2	6	36407	36412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905678
571	NC_011884	CAC	2	6	36421	36426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905678
572	NC_011884	TTTTTC	2	12	36533	36544	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	220905678
573	NC_011884	GCTC	2	8	36687	36694	0 %	25 %	25 %	50 %	220905678
574	NC_011884	GTG	2	6	36729	36734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905678
575	NC_011884	CAG	2	6	36791	36796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905678
576	NC_011884	G	7	7	36808	36814	0 %	0 %	100 %	0 %	220905678
577	NC_011884	GCA	2	6	36835	36840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905678
578	NC_011884	GAT	2	6	36850	36855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905678
579	NC_011884	G	6	6	36866	36871	0 %	0 %	100 %	0 %	220905678
580	NC_011884	GGC	2	6	36907	36912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905678
581	NC_011884	GGGT	2	8	36931	36938	0 %	25 %	75 %	0 %	220905678
582	NC_011884	GGC	2	6	36982	36987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905678
583	NC_011884	GAA	2	6	36999	37004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905678
584	NC_011884	TTG	2	6	37010	37015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905678
585	NC_011884	AAC	2	6	37131	37136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905678
586	NC_011884	CTG	2	6	37173	37178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905678
587	NC_011884	GCA	2	6	37197	37202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905678
588	NC_011884	AGG	3	9	37341	37349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905679
589	NC_011884	G	7	7	37348	37354	0 %	0 %	100 %	0 %	220905679
590	NC_011884	CGAT	2	8	37375	37382	25 %	25 %	25 %	25 %	220905679
591	NC_011884	AG	3	6	37398	37403	50 %	0 %	50 %	0 %	220905679
592	NC_011884	TTC	2	6	37572	37577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905680
593	NC_011884	TCC	2	6	37608	37613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905680
594	NC_011884	AAT	2	6	37631	37636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905680
595	NC_011884	CAAA	2	8	37682	37689	75 %	0 %	0 %	25 %	220905680
596	NC_011884	G	6	6	37697	37702	0 %	0 %	100 %	0 %	220905680
597	NC_011884	ACC	2	6	37712	37717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905680
598	NC_011884	TTCT	2	8	37772	37779	0 %	75 %	0 %	25 %	220905680
599	NC_011884	ACC	2	6	37798	37803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905680
600	NC_011884	A	6	6	37988	37993	100 %	0 %	0 %	0 %	220905680
601	NC_011884	AAGC	2	8	38055	38062	50 %	0 %	25 %	25 %	220905680
602	NC_011884	TTG	2	6	38087	38092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905680
603	NC_011884	CAG	2	6	38105	38110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905680
604	NC_011884	AGG	2	6	38160	38165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905680
605	NC_011884	CAGGT	2	10	38169	38178	20 %	20 %	40 %	20 %	220905680
606	NC_011884	CACAT	2	10	38324	38333	40 %	20 %	0 %	40 %	220905680
607	NC_011884	C	6	6	38334	38339	0 %	0 %	0 %	100 %	220905680
608	NC_011884	CGCT	2	8	38398	38405	0 %	25 %	25 %	50 %	220905680
609	NC_011884	CCA	2	6	38421	38426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905680
610	NC_011884	TAGC	2	8	38551	38558	25 %	25 %	25 %	25 %	220905681
611	NC_011884	GATC	2	8	38655	38662	25 %	25 %	25 %	25 %	220905681
612	NC_011884	GAGC	2	8	38689	38696	25 %	0 %	50 %	25 %	220905681
613	NC_011884	CAC	2	6	38754	38759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905681
614	NC_011884	GCG	2	6	38786	38791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905681
615	NC_011884	TCC	2	6	38810	38815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905681
616	NC_011884	GGA	2	6	38822	38827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905681
617	NC_011884	CAGC	2	8	38862	38869	25 %	0 %	25 %	50 %	220905681
618	NC_011884	AGT	2	6	38896	38901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905681
619	NC_011884	AGC	2	6	39067	39072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905681
620	NC_011884	GGC	2	6	39082	39087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905681
621	NC_011884	CAT	2	6	39108	39113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905681
622	NC_011884	CAC	2	6	39166	39171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905681
623	NC_011884	CTG	2	6	39192	39197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905681
624	NC_011884	A	7	7	39229	39235	100 %	0 %	0 %	0 %	220905681
625	NC_011884	AAT	2	6	39241	39246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905681
626	NC_011884	AGC	3	9	39274	39282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905681
627	NC_011884	TCGA	2	8	39295	39302	25 %	25 %	25 %	25 %	220905681
628	NC_011884	ACA	2	6	39359	39364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905681
629	NC_011884	TCTCC	2	10	39694	39703	0 %	40 %	0 %	60 %	220905682
630	NC_011884	TGC	2	6	39704	39709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905682
631	NC_011884	GCT	3	9	39763	39771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905682
632	NC_011884	CCCAA	2	10	39846	39855	40 %	0 %	0 %	60 %	220905682
633	NC_011884	ATT	2	6	39860	39865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905682
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641	NC_011884	ATC	2	6	40168	40173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905682
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643	NC_011884	CTA	2	6	40258	40263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905683
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646	NC_011884	GAA	3	9	40504	40512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905683
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654	NC_011884	T	6	6	40738	40743	0 %	100 %	0 %	0 %	220905683
655	NC_011884	TGC	2	6	41078	41083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905684
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658	NC_011884	CCA	2	6	41265	41270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905684
659	NC_011884	CCAT	2	8	41399	41406	25 %	25 %	0 %	50 %	220905684
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661	NC_011884	ACTG	2	8	41535	41542	25 %	25 %	25 %	25 %	220905684
662	NC_011884	GC	4	8	41950	41957	0 %	0 %	50 %	50 %	220905685
663	NC_011884	CCA	2	6	42077	42082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905685
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750	NC_011884	C	6	6	48309	48314	0 %	0 %	0 %	100 %	220905692
751	NC_011884	TGAC	2	8	48320	48327	25 %	25 %	25 %	25 %	220905692
752	NC_011884	CAG	2	6	48382	48387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905692
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