MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 84300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011884	CTGC	2	8	314903	314910	0 %	25 %	25 %	50 %	220905957
5002	NC_011884	CTATT	2	10	314939	314948	20 %	60 %	0 %	20 %	220905957
5003	NC_011884	T	6	6	314998	315003	0 %	100 %	0 %	0 %	220905957
5004	NC_011884	GAGAC	2	10	315018	315027	40 %	0 %	40 %	20 %	220905957
5005	NC_011884	AGT	2	6	315030	315035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905957
5006	NC_011884	CTG	2	6	315270	315275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905958
5007	NC_011884	CCA	2	6	315278	315283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905958
5008	NC_011884	CATCC	2	10	315288	315297	20 %	20 %	0 %	60 %	220905958
5009	NC_011884	CAC	2	6	315302	315307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905958
5010	NC_011884	GGA	2	6	315344	315349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905958
5011	NC_011884	CTG	2	6	315660	315665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905959
5012	NC_011884	CAA	2	6	315669	315674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905959
5013	NC_011884	CAC	2	6	315692	315697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905959
5014	NC_011884	CTGC	2	8	315708	315715	0 %	25 %	25 %	50 %	220905959
5015	NC_011884	GAA	2	6	315735	315740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905959
5016	NC_011884	TGA	2	6	315837	315842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905959
5017	NC_011884	A	6	6	315842	315847	100 %	0 %	0 %	0 %	220905960
5018	NC_011884	CTA	2	6	315962	315967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905960
5019	NC_011884	TAA	2	6	316006	316011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905960
5020	NC_011884	GAT	2	6	316304	316309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905960
5021	NC_011884	GTT	2	6	316431	316436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905960
5022	NC_011884	TTCC	2	8	316545	316552	0 %	50 %	0 %	50 %	220905960
5023	NC_011884	ATT	2	6	316801	316806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905960
5024	NC_011884	GGC	2	6	316817	316822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905960
5025	NC_011884	GTCA	2	8	316892	316899	25 %	25 %	25 %	25 %	220905960
5026	NC_011884	GCG	2	6	316990	316995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905960
5027	NC_011884	GGGTAA	2	12	317017	317028	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	220905960
5028	NC_011884	TTG	2	6	317124	317129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905960
5029	NC_011884	GGA	2	6	317134	317139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905960
5030	NC_011884	AGC	2	6	317178	317183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905960
5031	NC_011884	TCCTC	2	10	317239	317248	0 %	40 %	0 %	60 %	220905960
5032	NC_011884	TCAC	2	8	317288	317295	25 %	25 %	0 %	50 %	220905960
5033	NC_011884	CTA	2	6	317332	317337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905960
5034	NC_011884	TGG	2	6	317442	317447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905960
5035	NC_011884	TGG	2	6	317468	317473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905960
5036	NC_011884	CAG	2	6	317558	317563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905960
5037	NC_011884	TGC	2	6	317614	317619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905960
5038	NC_011884	CGG	2	6	317635	317640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905960
5039	NC_011884	AT	3	6	317650	317655	50 %	50 %	0 %	0 %	220905960
5040	NC_011884	AATC	2	8	317810	317817	50 %	25 %	0 %	25 %	220905960
5041	NC_011884	AAG	2	6	317892	317897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905960
5042	NC_011884	TGC	2	6	317901	317906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905960
5043	NC_011884	TG	3	6	317909	317914	0 %	50 %	50 %	0 %	220905960
5044	NC_011884	CCGG	2	8	317962	317969	0 %	0 %	50 %	50 %	220905960
5045	NC_011884	TGT	2	6	317983	317988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905960
5046	NC_011884	ACG	2	6	318048	318053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905960
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5048	NC_011884	CCAATG	2	12	318107	318118	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	220905960
5049	NC_011884	ATTT	2	8	318136	318143	25 %	75 %	0 %	0 %	220905961
5050	NC_011884	AGC	2	6	318262	318267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905961
5051	NC_011884	AACTG	2	10	318299	318308	40 %	20 %	20 %	20 %	220905961
5052	NC_011884	CT	3	6	318483	318488	0 %	50 %	0 %	50 %	220905961
5053	NC_011884	T	6	6	318497	318502	0 %	100 %	0 %	0 %	220905961
5054	NC_011884	TC	3	6	318656	318661	0 %	50 %	0 %	50 %	220905961
5055	NC_011884	ATT	2	6	318686	318691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905961
5056	NC_011884	GCT	2	6	318695	318700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905961
5057	NC_011884	GAT	2	6	318713	318718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905961
5058	NC_011884	CTG	2	6	318768	318773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905961
5059	NC_011884	TCA	2	6	318776	318781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905961
5060	NC_011884	CCTG	2	8	318824	318831	0 %	25 %	25 %	50 %	220905961
5061	NC_011884	CAA	2	6	318922	318927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905961
5062	NC_011884	CTGA	2	8	318939	318946	25 %	25 %	25 %	25 %	220905961
5063	NC_011884	CGAT	2	8	318963	318970	25 %	25 %	25 %	25 %	220905961
5064	NC_011884	AGA	2	6	319061	319066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905961
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5069	NC_011884	TTTA	2	8	319396	319403	25 %	75 %	0 %	0 %	220905961
5070	NC_011884	GAA	2	6	319491	319496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905961
5071	NC_011884	CAG	2	6	319536	319541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905961
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5073	NC_011884	CGAT	2	8	319742	319749	25 %	25 %	25 %	25 %	220905962
5074	NC_011884	CTT	2	6	319752	319757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905962
5075	NC_011884	CAG	2	6	319762	319767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905962
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5077	NC_011884	A	6	6	319810	319815	100 %	0 %	0 %	0 %	220905962
5078	NC_011884	A	6	6	319819	319824	100 %	0 %	0 %	0 %	220905962
5079	NC_011884	GCT	2	6	319879	319884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905962
5080	NC_011884	CGAT	2	8	319961	319968	25 %	25 %	25 %	25 %	220905962
5081	NC_011884	ACA	2	6	319980	319985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905962
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5086	NC_011884	CAT	2	6	320340	320345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905962
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5088	NC_011884	CAG	2	6	320398	320403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905962
5089	NC_011884	AAC	2	6	320458	320463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905962
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5091	NC_011884	GCTA	2	8	320539	320546	25 %	25 %	25 %	25 %	220905962
5092	NC_011884	CAA	2	6	320569	320574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905962
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5095	NC_011884	GGCA	2	8	320811	320818	25 %	0 %	50 %	25 %	220905962
5096	NC_011884	GTA	2	6	320869	320874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905962
5097	NC_011884	TGA	2	6	320880	320885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905962
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5100	NC_011884	CAA	2	6	321044	321049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905962
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5102	NC_011884	G	6	6	321118	321123	0 %	0 %	100 %	0 %	220905962
5103	NC_011884	GATA	2	8	321129	321136	50 %	25 %	25 %	0 %	220905962
5104	NC_011884	CCA	2	6	321204	321209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905962
5105	NC_011884	CAA	2	6	321217	321222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905962
5106	NC_011884	AAT	2	6	321283	321288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905962
5107	NC_011884	GTC	2	6	321298	321303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905962
5108	NC_011884	TAC	2	6	321368	321373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905962
5109	NC_011884	GAA	2	6	321436	321441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905962
5110	NC_011884	AGC	2	6	321504	321509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905962
5111	NC_011884	TAGT	2	8	321560	321567	25 %	50 %	25 %	0 %	220905962
5112	NC_011884	A	7	7	321583	321589	100 %	0 %	0 %	0 %	220905962
5113	NC_011884	ACT	2	6	321632	321637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905962
5114	NC_011884	GA	3	6	321668	321673	50 %	0 %	50 %	0 %	220905962
5115	NC_011884	CCT	2	6	321701	321706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905962
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5119	NC_011884	ACA	2	6	321855	321860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905962
5120	NC_011884	GCCA	2	8	321864	321871	25 %	0 %	25 %	50 %	220905962
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5122	NC_011884	TGG	2	6	321923	321928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905962
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5124	NC_011884	GAGT	2	8	322106	322113	25 %	25 %	50 %	0 %	220905962
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5355	NC_011884	CGAT	2	8	335280	335287	25 %	25 %	25 %	25 %	220905970
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5365	NC_011884	GAACAG	2	12	335809	335820	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	220905971
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5489	NC_011884	CGG	2	6	342534	342539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905976
5490	NC_011884	A	6	6	342541	342546	100 %	0 %	0 %	0 %	220905976
5491	NC_011884	ATTC	2	8	342585	342592	25 %	50 %	0 %	25 %	220905976
5492	NC_011884	AAT	2	6	342633	342638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905976
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5494	NC_011884	C	7	7	342690	342696	0 %	0 %	0 %	100 %	220905976
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