MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 84300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011884	ATG	2	6	283571	283576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905928
4502	NC_011884	GCTC	2	8	283589	283596	0 %	25 %	25 %	50 %	220905928
4503	NC_011884	CAG	2	6	283603	283608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905928
4504	NC_011884	C	6	6	283620	283625	0 %	0 %	0 %	100 %	220905928
4505	NC_011884	GATCG	2	10	283762	283771	20 %	20 %	40 %	20 %	220905928
4506	NC_011884	GCA	2	6	283779	283784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905928
4507	NC_011884	CGA	2	6	283883	283888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905928
4508	NC_011884	TCC	2	6	283903	283908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905928
4509	NC_011884	GCA	2	6	284012	284017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905928
4510	NC_011884	TCG	2	6	284084	284089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905928
4511	NC_011884	G	6	6	284118	284123	0 %	0 %	100 %	0 %	220905928
4512	NC_011884	CTGG	2	8	284263	284270	0 %	25 %	50 %	25 %	220905928
4513	NC_011884	CAT	2	6	284371	284376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905928
4514	NC_011884	GGA	2	6	284385	284390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905928
4515	NC_011884	ATC	2	6	284443	284448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905928
4516	NC_011884	CCA	2	6	284514	284519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905928
4517	NC_011884	AGA	2	6	284535	284540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905928
4518	NC_011884	CAC	2	6	284548	284553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905928
4519	NC_011884	GCA	2	6	284592	284597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905928
4520	NC_011884	CTT	2	6	284625	284630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905928
4521	NC_011884	AGC	2	6	284642	284647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905928
4522	NC_011884	CCG	2	6	284726	284731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905928
4523	NC_011884	GTC	2	6	284749	284754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905928
4524	NC_011884	CCA	2	6	284766	284771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905928
4525	NC_011884	GTT	2	6	284776	284781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905928
4526	NC_011884	CTG	2	6	284827	284832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905928
4527	NC_011884	CCG	2	6	284880	284885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905928
4528	NC_011884	CAG	2	6	284893	284898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905928
4529	NC_011884	TAA	2	6	284910	284915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905928
4530	NC_011884	TCC	2	6	285008	285013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905928
4531	NC_011884	CGATC	2	10	285018	285027	20 %	20 %	20 %	40 %	220905928
4532	NC_011884	ATT	2	6	285031	285036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905928
4533	NC_011884	CAGA	2	8	285078	285085	50 %	0 %	25 %	25 %	220905928
4534	NC_011884	TCT	2	6	285146	285151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905928
4535	NC_011884	ATCAG	2	10	285155	285164	40 %	20 %	20 %	20 %	220905928
4536	NC_011884	TGG	2	6	285204	285209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905928
4537	NC_011884	GCT	2	6	285245	285250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905928
4538	NC_011884	GGAC	2	8	285276	285283	25 %	0 %	50 %	25 %	220905928
4539	NC_011884	CAG	2	6	285298	285303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905928
4540	NC_011884	CCA	2	6	285375	285380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905928
4541	NC_011884	TG	3	6	285502	285507	0 %	50 %	50 %	0 %	220905928
4542	NC_011884	AAT	2	6	285559	285564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905928
4543	NC_011884	CGAG	2	8	285634	285641	25 %	0 %	50 %	25 %	220905928
4544	NC_011884	CTT	2	6	285672	285677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905928
4545	NC_011884	CTGG	2	8	285697	285704	0 %	25 %	50 %	25 %	220905928
4546	NC_011884	CAC	2	6	285763	285768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905928
4547	NC_011884	AAC	2	6	285791	285796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905928
4548	NC_011884	GCC	2	6	285912	285917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905928
4549	NC_011884	CCA	2	6	285957	285962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905928
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4551	NC_011884	ATA	2	6	285989	285994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905928
4552	NC_011884	AGTT	2	8	286023	286030	25 %	50 %	25 %	0 %	220905928
4553	NC_011884	AAT	2	6	286045	286050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905928
4554	NC_011884	CGA	2	6	286086	286091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905928
4555	NC_011884	CAT	2	6	286135	286140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905928
4556	NC_011884	CAC	2	6	286260	286265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905928
4557	NC_011884	CCG	2	6	286302	286307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905928
4558	NC_011884	CTT	2	6	286324	286329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905928
4559	NC_011884	G	6	6	286331	286336	0 %	0 %	100 %	0 %	220905928
4560	NC_011884	TTG	2	6	286481	286486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905928
4561	NC_011884	A	6	6	286498	286503	100 %	0 %	0 %	0 %	220905928
4562	NC_011884	TGT	2	6	286607	286612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905929
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4564	NC_011884	TGGA	2	8	286685	286692	25 %	25 %	50 %	0 %	220905929
4565	NC_011884	TCT	2	6	286753	286758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905929
4566	NC_011884	CGT	2	6	286766	286771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905929
4567	NC_011884	CTG	2	6	286863	286868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905929
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4570	NC_011884	TGT	2	6	286961	286966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905929
4571	NC_011884	TCGA	2	8	287005	287012	25 %	25 %	25 %	25 %	220905929
4572	NC_011884	TCCA	2	8	287097	287104	25 %	25 %	0 %	50 %	220905929
4573	NC_011884	ATCA	2	8	287178	287185	50 %	25 %	0 %	25 %	220905929
4574	NC_011884	CCT	2	6	287186	287191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905929
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4577	NC_011884	GATG	2	8	287279	287286	25 %	25 %	50 %	0 %	220905929
4578	NC_011884	CAC	2	6	287358	287363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905929
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4587	NC_011884	GGCTTC	2	12	287826	287837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905929
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4589	NC_011884	CGA	2	6	287903	287908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905929
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4591	NC_011884	CAG	2	6	288063	288068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905929
4592	NC_011884	CAGC	2	8	288122	288129	25 %	0 %	25 %	50 %	220905929
4593	NC_011884	CCAT	2	8	288283	288290	25 %	25 %	0 %	50 %	220905929
4594	NC_011884	CAC	2	6	288342	288347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905929
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4596	NC_011884	TTG	2	6	288637	288642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905930
4597	NC_011884	CAGA	2	8	288720	288727	50 %	0 %	25 %	25 %	220905930
4598	NC_011884	CGGGG	2	10	288773	288782	0 %	0 %	80 %	20 %	220905930
4599	NC_011884	ATC	2	6	288834	288839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905930
4600	NC_011884	C	6	6	288925	288930	0 %	0 %	0 %	100 %	220905930
4601	NC_011884	ACC	2	6	288942	288947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905930
4602	NC_011884	CCCG	2	8	289130	289137	0 %	0 %	25 %	75 %	220905930
4603	NC_011884	TCA	2	6	289204	289209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905930
4604	NC_011884	GAT	2	6	289238	289243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905930
4605	NC_011884	TTA	2	6	289390	289395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905930
4606	NC_011884	CAC	2	6	289458	289463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905930
4607	NC_011884	GGT	2	6	289477	289482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905930
4608	NC_011884	CCA	2	6	289520	289525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905930
4609	NC_011884	TCGC	2	8	289595	289602	0 %	25 %	25 %	50 %	220905930
4610	NC_011884	TTC	2	6	289611	289616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905930
4611	NC_011884	CTGAT	2	10	289623	289632	20 %	40 %	20 %	20 %	220905930
4612	NC_011884	TCT	2	6	289762	289767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905930
4613	NC_011884	CAT	2	6	289829	289834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905930
4614	NC_011884	CAC	2	6	290139	290144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905930
4615	NC_011884	TCG	2	6	290263	290268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905930
4616	NC_011884	AG	3	6	290287	290292	50 %	0 %	50 %	0 %	220905930
4617	NC_011884	GTG	3	9	290350	290358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905930
4618	NC_011884	CATCGG	2	12	290408	290419	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220905930
4619	NC_011884	TCT	2	6	290452	290457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905930
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4621	NC_011884	GAC	2	6	290705	290710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905930
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4986	NC_011884	ATC	2	6	313907	313912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905956
4987	NC_011884	TGC	2	6	313920	313925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905956
4988	NC_011884	ATT	2	6	314005	314010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905956
4989	NC_011884	GTG	2	6	314045	314050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905956
4990	NC_011884	ACC	2	6	314126	314131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905956
4991	NC_011884	GTC	2	6	314150	314155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905956
4992	NC_011884	ACG	2	6	314224	314229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905956
4993	NC_011884	ATG	2	6	314347	314352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905956
4994	NC_011884	CT	3	6	314359	314364	0 %	50 %	0 %	50 %	220905956
4995	NC_011884	GCT	2	6	314387	314392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905956
4996	NC_011884	TGCCA	2	10	314530	314539	20 %	20 %	20 %	40 %	220905956
4997	NC_011884	GGA	2	6	314547	314552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905956
4998	NC_011884	CTG	2	6	314855	314860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905957
4999	NC_011884	CCA	2	6	314863	314868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905957
5000	NC_011884	CAC	2	6	314887	314892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905957

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