MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742501

Total Repeats: 162

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011880	TC	3	6	726	731	0 %	50 %	0 %	50 %	219883097
2	NC_011880	GC	3	6	1296	1301	0 %	0 %	50 %	50 %	219883097
3	NC_011880	TA	3	6	2869	2874	50 %	50 %	0 %	0 %	219883098
4	NC_011880	GC	3	6	6614	6619	0 %	0 %	50 %	50 %	219883103
5	NC_011880	AT	3	6	8880	8885	50 %	50 %	0 %	0 %	219883105
6	NC_011880	TG	3	6	10573	10578	0 %	50 %	50 %	0 %	219883108
7	NC_011880	AC	3	6	11370	11375	50 %	0 %	0 %	50 %	219883109
8	NC_011880	CT	3	6	12097	12102	0 %	50 %	0 %	50 %	219883110
9	NC_011880	TC	3	6	13879	13884	0 %	50 %	0 %	50 %	219883111
10	NC_011880	AT	3	6	14541	14546	50 %	50 %	0 %	0 %	219883112
11	NC_011880	TG	3	6	16181	16186	0 %	50 %	50 %	0 %	219883112
12	NC_011880	TC	3	6	16247	16252	0 %	50 %	0 %	50 %	219883112
13	NC_011880	TC	3	6	18190	18195	0 %	50 %	0 %	50 %	219883113
14	NC_011880	GA	3	6	18723	18728	50 %	0 %	50 %	0 %	219883113
15	NC_011880	TG	3	6	18809	18814	0 %	50 %	50 %	0 %	219883113
16	NC_011880	AT	3	6	18920	18925	50 %	50 %	0 %	0 %	219883113
17	NC_011880	CT	3	6	19401	19406	0 %	50 %	0 %	50 %	219883113
18	NC_011880	AC	3	6	19965	19970	50 %	0 %	0 %	50 %	219883114
19	NC_011880	CA	3	6	23301	23306	50 %	0 %	0 %	50 %	219883116
20	NC_011880	GA	3	6	24461	24466	50 %	0 %	50 %	0 %	219883117
21	NC_011880	AT	3	6	27058	27063	50 %	50 %	0 %	0 %	219883119
22	NC_011880	GT	3	6	28273	28278	0 %	50 %	50 %	0 %	219883120
23	NC_011880	GT	3	6	28390	28395	0 %	50 %	50 %	0 %	219883120
24	NC_011880	TC	3	6	28811	28816	0 %	50 %	0 %	50 %	219883120
25	NC_011880	TC	3	6	31892	31897	0 %	50 %	0 %	50 %	219883123
26	NC_011880	GC	3	6	35015	35020	0 %	0 %	50 %	50 %	219883126
27	NC_011880	GT	3	6	35667	35672	0 %	50 %	50 %	0 %	219883126
28	NC_011880	GA	3	6	36597	36602	50 %	0 %	50 %	0 %	219883127
29	NC_011880	GT	3	6	37921	37926	0 %	50 %	50 %	0 %	219883128
30	NC_011880	TG	3	6	42972	42977	0 %	50 %	50 %	0 %	219883133
31	NC_011880	TG	3	6	43591	43596	0 %	50 %	50 %	0 %	219883134
32	NC_011880	TC	3	6	46483	46488	0 %	50 %	0 %	50 %	219883135
33	NC_011880	CT	3	6	47508	47513	0 %	50 %	0 %	50 %	219883136
34	NC_011880	AT	3	6	52037	52042	50 %	50 %	0 %	0 %	219883142
35	NC_011880	AG	3	6	55737	55742	50 %	0 %	50 %	0 %	219883145
36	NC_011880	AT	3	6	57144	57149	50 %	50 %	0 %	0 %	219883146
37	NC_011880	CT	3	6	57775	57780	0 %	50 %	0 %	50 %	219883146
38	NC_011880	GA	3	6	57982	57987	50 %	0 %	50 %	0 %	219883146
39	NC_011880	AT	3	6	61010	61015	50 %	50 %	0 %	0 %	219883147
40	NC_011880	CT	3	6	61081	61086	0 %	50 %	0 %	50 %	219883147
41	NC_011880	CT	3	6	61484	61489	0 %	50 %	0 %	50 %	219883147
42	NC_011880	AG	3	6	61866	61871	50 %	0 %	50 %	0 %	219883147
43	NC_011880	GA	3	6	62747	62752	50 %	0 %	50 %	0 %	219883148
44	NC_011880	GA	3	6	62805	62810	50 %	0 %	50 %	0 %	219883148
45	NC_011880	GA	3	6	64348	64353	50 %	0 %	50 %	0 %	219883149
46	NC_011880	GA	3	6	65460	65465	50 %	0 %	50 %	0 %	219883149
47	NC_011880	TA	3	6	66815	66820	50 %	50 %	0 %	0 %	219883150
48	NC_011880	AG	3	6	67033	67038	50 %	0 %	50 %	0 %	219883150
49	NC_011880	CA	3	6	67883	67888	50 %	0 %	0 %	50 %	219883150
50	NC_011880	GA	3	6	68204	68209	50 %	0 %	50 %	0 %	219883150
51	NC_011880	TC	3	6	68650	68655	0 %	50 %	0 %	50 %	219883150
52	NC_011880	AT	3	6	68706	68711	50 %	50 %	0 %	0 %	219883150
53	NC_011880	CT	3	6	68759	68764	0 %	50 %	0 %	50 %	219883150
54	NC_011880	AT	3	6	69181	69186	50 %	50 %	0 %	0 %	219883150
55	NC_011880	TA	3	6	70587	70592	50 %	50 %	0 %	0 %	219883150
56	NC_011880	CT	3	6	71284	71289	0 %	50 %	0 %	50 %	219883150
57	NC_011880	AT	3	6	74781	74786	50 %	50 %	0 %	0 %	219883151
58	NC_011880	CA	3	6	74843	74848	50 %	0 %	0 %	50 %	219883151
59	NC_011880	CT	3	6	75487	75492	0 %	50 %	0 %	50 %	219883151
60	NC_011880	GT	3	6	76118	76123	0 %	50 %	50 %	0 %	219883151
61	NC_011880	CA	3	6	80627	80632	50 %	0 %	0 %	50 %	219883155
62	NC_011880	AG	3	6	82846	82851	50 %	0 %	50 %	0 %	219883155
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64	NC_011880	TG	3	6	83847	83852	0 %	50 %	50 %	0 %	219883156
65	NC_011880	AT	3	6	85208	85213	50 %	50 %	0 %	0 %	219883157
66	NC_011880	TA	3	6	85388	85393	50 %	50 %	0 %	0 %	219883157
67	NC_011880	AT	3	6	85567	85572	50 %	50 %	0 %	0 %	219883157
68	NC_011880	CT	3	6	86638	86643	0 %	50 %	0 %	50 %	219883159
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70	NC_011880	TC	3	6	91187	91192	0 %	50 %	0 %	50 %	219883162
71	NC_011880	GA	3	6	92509	92514	50 %	0 %	50 %	0 %	219883162
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74	NC_011880	TC	3	6	95009	95014	0 %	50 %	0 %	50 %	219883164
75	NC_011880	TG	3	6	96525	96530	0 %	50 %	50 %	0 %	219883165
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93	NC_011880	AG	3	6	115778	115783	50 %	0 %	50 %	0 %	219883186
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105	NC_011880	TG	3	6	125598	125603	0 %	50 %	50 %	0 %	219883191
106	NC_011880	AG	3	6	125712	125717	50 %	0 %	50 %	0 %	219883191
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108	NC_011880	GA	3	6	127836	127841	50 %	0 %	50 %	0 %	219883193
109	NC_011880	CT	3	6	128468	128473	0 %	50 %	0 %	50 %	219883194
110	NC_011880	GA	3	6	128996	129001	50 %	0 %	50 %	0 %	219883194
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112	NC_011880	TA	3	6	130926	130931	50 %	50 %	0 %	0 %	219883197
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124	NC_011880	CT	3	6	155151	155156	0 %	50 %	0 %	50 %	219883216
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126	NC_011880	GA	3	6	156984	156989	50 %	0 %	50 %	0 %	219883216
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.