MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742501

Total Repeats: 400

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011880	AAGC	2	8	97	104	50 %	0 %	25 %	25 %	219883097
2	NC_011880	ATGC	2	8	323	330	25 %	25 %	25 %	25 %	219883097
3	NC_011880	GCTG	2	8	431	438	0 %	25 %	50 %	25 %	219883097
4	NC_011880	AGGT	2	8	1030	1037	25 %	25 %	50 %	0 %	219883097
5	NC_011880	ATGC	2	8	1877	1884	25 %	25 %	25 %	25 %	219883097
6	NC_011880	AAAC	2	8	1993	2000	75 %	0 %	0 %	25 %	219883097
7	NC_011880	CAGT	2	8	5055	5062	25 %	25 %	25 %	25 %	219883101
8	NC_011880	GGGA	2	8	5292	5299	25 %	0 %	75 %	0 %	219883102
9	NC_011880	GTGG	2	8	6279	6286	0 %	25 %	75 %	0 %	219883103
10	NC_011880	CTGG	2	8	6704	6711	0 %	25 %	50 %	25 %	219883103
11	NC_011880	TGAT	2	8	8575	8582	25 %	50 %	25 %	0 %	219883104
12	NC_011880	GGCA	2	8	10268	10275	25 %	0 %	50 %	25 %	219883108
13	NC_011880	TTTG	2	8	10455	10462	0 %	75 %	25 %	0 %	219883108
14	NC_011880	TGAT	2	8	11029	11036	25 %	50 %	25 %	0 %	219883109
15	NC_011880	GATC	2	8	11435	11442	25 %	25 %	25 %	25 %	219883109
16	NC_011880	GAAT	2	8	11750	11757	50 %	25 %	25 %	0 %	219883110
17	NC_011880	TTCT	2	8	12323	12330	0 %	75 %	0 %	25 %	219883111
18	NC_011880	CGGG	2	8	12402	12409	0 %	0 %	75 %	25 %	219883111
19	NC_011880	CGGA	2	8	13416	13423	25 %	0 %	50 %	25 %	219883111
20	NC_011880	CGAT	2	8	14039	14046	25 %	25 %	25 %	25 %	219883111
21	NC_011880	TGAT	2	8	14479	14486	25 %	50 %	25 %	0 %	219883112
22	NC_011880	TTCT	2	8	14748	14755	0 %	75 %	0 %	25 %	219883112
23	NC_011880	TTTG	2	8	14906	14913	0 %	75 %	25 %	0 %	219883112
24	NC_011880	TCAT	2	8	15458	15465	25 %	50 %	0 %	25 %	219883112
25	NC_011880	TAAT	2	8	15564	15571	50 %	50 %	0 %	0 %	219883112
26	NC_011880	ACAA	2	8	15589	15596	75 %	0 %	0 %	25 %	219883112
27	NC_011880	AGCA	2	8	16135	16142	50 %	0 %	25 %	25 %	219883112
28	NC_011880	TTTA	2	8	16657	16664	25 %	75 %	0 %	0 %	219883112
29	NC_011880	CTAG	2	8	17295	17302	25 %	25 %	25 %	25 %	219883113
30	NC_011880	TCTT	2	8	17517	17524	0 %	75 %	0 %	25 %	219883113
31	NC_011880	TAAA	2	8	18220	18227	75 %	25 %	0 %	0 %	219883113
32	NC_011880	TAAG	2	8	18583	18590	50 %	25 %	25 %	0 %	219883113
33	NC_011880	AGAA	2	8	18896	18903	75 %	0 %	25 %	0 %	219883113
34	NC_011880	TGCT	2	8	19043	19050	0 %	50 %	25 %	25 %	219883113
35	NC_011880	GGCA	2	8	19408	19415	25 %	0 %	50 %	25 %	219883113
36	NC_011880	TTCG	2	8	19489	19496	0 %	50 %	25 %	25 %	219883113
37	NC_011880	GGCT	2	8	19929	19936	0 %	25 %	50 %	25 %	219883114
38	NC_011880	CCAA	2	8	20115	20122	50 %	0 %	0 %	50 %	219883114
39	NC_011880	CCAC	2	8	20410	20417	25 %	0 %	0 %	75 %	219883114
40	NC_011880	GCCC	2	8	20830	20837	0 %	0 %	25 %	75 %	219883114
41	NC_011880	ACGC	2	8	21066	21073	25 %	0 %	25 %	50 %	219883114
42	NC_011880	CTTC	2	8	21341	21348	0 %	50 %	0 %	50 %	219883115
43	NC_011880	ATAA	2	8	21640	21647	75 %	25 %	0 %	0 %	219883115
44	NC_011880	ATCA	2	8	24674	24681	50 %	25 %	0 %	25 %	219883117
45	NC_011880	CATT	2	8	24899	24906	25 %	50 %	0 %	25 %	219883117
46	NC_011880	CAGT	2	8	25020	25027	25 %	25 %	25 %	25 %	219883117
47	NC_011880	CAAA	2	8	25440	25447	75 %	0 %	0 %	25 %	219883117
48	NC_011880	CAGG	2	8	25786	25793	25 %	0 %	50 %	25 %	219883118
49	NC_011880	GTCA	2	8	26218	26225	25 %	25 %	25 %	25 %	219883118
50	NC_011880	CAAG	2	8	26653	26660	50 %	0 %	25 %	25 %	219883118
51	NC_011880	TTGC	2	8	26862	26869	0 %	50 %	25 %	25 %	219883119
52	NC_011880	TTGG	2	8	26922	26929	0 %	50 %	50 %	0 %	219883119
53	NC_011880	ATGG	2	8	27196	27203	25 %	25 %	50 %	0 %	219883119
54	NC_011880	GGAG	2	8	27796	27803	25 %	0 %	75 %	0 %	219883120
55	NC_011880	CAAC	2	8	28080	28087	50 %	0 %	0 %	50 %	219883120
56	NC_011880	GTTG	2	8	28229	28236	0 %	50 %	50 %	0 %	219883120
57	NC_011880	AGGC	2	8	28793	28800	25 %	0 %	50 %	25 %	219883120
58	NC_011880	GTTT	2	8	28802	28809	0 %	75 %	25 %	0 %	219883120
59	NC_011880	CAGG	2	8	28896	28903	25 %	0 %	50 %	25 %	219883120
60	NC_011880	ATCA	2	8	29044	29051	50 %	25 %	0 %	25 %	219883121
61	NC_011880	CCCA	2	8	29311	29318	25 %	0 %	0 %	75 %	219883121
62	NC_011880	TGGC	2	8	29333	29340	0 %	25 %	50 %	25 %	219883121
63	NC_011880	CCAC	2	8	29705	29712	25 %	0 %	0 %	75 %	219883122
64	NC_011880	CGAC	2	8	31993	32000	25 %	0 %	25 %	50 %	219883123
65	NC_011880	TCAG	2	8	32326	32333	25 %	25 %	25 %	25 %	219883123
66	NC_011880	TCAT	2	8	32722	32729	25 %	50 %	0 %	25 %	219883124
67	NC_011880	TTCA	2	8	33267	33274	25 %	50 %	0 %	25 %	219883124
68	NC_011880	CTGC	2	8	33549	33556	0 %	25 %	25 %	50 %	219883125
69	NC_011880	ATTT	2	8	34515	34522	25 %	75 %	0 %	0 %	219883126
70	NC_011880	GTTG	2	8	34558	34565	0 %	50 %	50 %	0 %	219883126
71	NC_011880	GGTT	2	8	35261	35268	0 %	50 %	50 %	0 %	219883126
72	NC_011880	GTTT	2	8	35563	35570	0 %	75 %	25 %	0 %	219883126
73	NC_011880	TAAA	2	8	35856	35863	75 %	25 %	0 %	0 %	219883126
74	NC_011880	ACTG	2	8	35941	35948	25 %	25 %	25 %	25 %	219883126
75	NC_011880	TGGA	2	8	35978	35985	25 %	25 %	50 %	0 %	219883126
76	NC_011880	AGCC	2	8	36416	36423	25 %	0 %	25 %	50 %	219883127
77	NC_011880	AAGG	2	8	37060	37067	50 %	0 %	50 %	0 %	219883127
78	NC_011880	AATT	2	8	37107	37114	50 %	50 %	0 %	0 %	219883127
79	NC_011880	CTTT	2	8	37774	37781	0 %	75 %	0 %	25 %	219883128
80	NC_011880	AATC	2	8	38030	38037	50 %	25 %	0 %	25 %	219883129
81	NC_011880	AAGG	2	8	38835	38842	50 %	0 %	50 %	0 %	219883130
82	NC_011880	AGCC	2	8	39012	39019	25 %	0 %	25 %	50 %	219883130
83	NC_011880	TAGG	2	8	40257	40264	25 %	25 %	50 %	0 %	219883131
84	NC_011880	ATCA	2	8	40395	40402	50 %	25 %	0 %	25 %	219883131
85	NC_011880	CAGG	2	8	40670	40677	25 %	0 %	50 %	25 %	219883131
86	NC_011880	GAAG	2	8	41317	41324	50 %	0 %	50 %	0 %	219883131
87	NC_011880	AGCC	2	8	42081	42088	25 %	0 %	25 %	50 %	219883132
88	NC_011880	CCTA	2	8	42173	42180	25 %	25 %	0 %	50 %	219883132
89	NC_011880	CCAG	2	8	43161	43168	25 %	0 %	25 %	50 %	219883133
90	NC_011880	CAAG	2	8	43867	43874	50 %	0 %	25 %	25 %	219883134
91	NC_011880	TTAA	2	8	46689	46696	50 %	50 %	0 %	0 %	219883135
92	NC_011880	GGTA	2	8	46762	46769	25 %	25 %	50 %	0 %	219883135
93	NC_011880	TCAG	2	8	46790	46797	25 %	25 %	25 %	25 %	219883136
94	NC_011880	GCAG	2	8	47308	47315	25 %	0 %	50 %	25 %	219883136
95	NC_011880	CCAC	2	8	47326	47333	25 %	0 %	0 %	75 %	219883136
96	NC_011880	GTGC	2	8	47698	47705	0 %	25 %	50 %	25 %	219883136
97	NC_011880	ACCC	2	8	51082	51089	25 %	0 %	0 %	75 %	219883139
98	NC_011880	CCAC	2	8	51358	51365	25 %	0 %	0 %	75 %	219883140
99	NC_011880	ATTA	2	8	54643	54650	50 %	50 %	0 %	0 %	219883145
100	NC_011880	GATC	2	8	55119	55126	25 %	25 %	25 %	25 %	219883145
101	NC_011880	CTCC	2	8	56001	56008	0 %	25 %	0 %	75 %	219883145
102	NC_011880	GCGG	2	8	56073	56080	0 %	0 %	75 %	25 %	219883145
103	NC_011880	ACCC	2	8	56273	56280	25 %	0 %	0 %	75 %	219883145
104	NC_011880	CTGG	2	8	56478	56485	0 %	25 %	50 %	25 %	219883145
105	NC_011880	CCAG	2	8	56764	56771	25 %	0 %	25 %	50 %	219883146
106	NC_011880	GATC	2	8	56887	56894	25 %	25 %	25 %	25 %	219883146
107	NC_011880	GTTG	2	8	57224	57231	0 %	50 %	50 %	0 %	219883146
108	NC_011880	GTTT	2	8	57264	57271	0 %	75 %	25 %	0 %	219883146
109	NC_011880	TCCA	2	8	57297	57304	25 %	25 %	0 %	50 %	219883146
110	NC_011880	CTGG	2	8	57626	57633	0 %	25 %	50 %	25 %	219883146
111	NC_011880	CTGA	2	8	58160	58167	25 %	25 %	25 %	25 %	219883146
112	NC_011880	CCCA	2	8	58392	58399	25 %	0 %	0 %	75 %	219883146
113	NC_011880	GATC	2	8	59077	59084	25 %	25 %	25 %	25 %	219883146
114	NC_011880	TCGA	2	8	59556	59563	25 %	25 %	25 %	25 %	219883146
115	NC_011880	CCAC	2	8	59811	59818	25 %	0 %	0 %	75 %	219883146
116	NC_011880	GCTG	2	8	60989	60996	0 %	25 %	50 %	25 %	219883147
117	NC_011880	CCTG	2	8	61367	61374	0 %	25 %	25 %	50 %	219883147
118	NC_011880	CTTT	2	8	62531	62538	0 %	75 %	0 %	25 %	219883147
119	NC_011880	GCCA	2	8	62549	62556	25 %	0 %	25 %	50 %	219883147
120	NC_011880	ATCG	2	8	63271	63278	25 %	25 %	25 %	25 %	219883149
121	NC_011880	TGCT	2	8	63384	63391	0 %	50 %	25 %	25 %	219883149
122	NC_011880	AAAT	2	8	64682	64689	75 %	25 %	0 %	0 %	219883149
123	NC_011880	CACC	2	8	65772	65779	25 %	0 %	0 %	75 %	219883150
124	NC_011880	ATCC	2	8	66400	66407	25 %	25 %	0 %	50 %	219883150
125	NC_011880	TAAA	2	8	66527	66534	75 %	25 %	0 %	0 %	219883150
126	NC_011880	GCTC	2	8	66947	66954	0 %	25 %	25 %	50 %	219883150
127	NC_011880	TGAT	2	8	67291	67298	25 %	50 %	25 %	0 %	219883150
128	NC_011880	GTAA	2	8	67363	67370	50 %	25 %	25 %	0 %	219883150
129	NC_011880	TTGG	2	8	67695	67702	0 %	50 %	50 %	0 %	219883150
130	NC_011880	TTGC	2	8	67869	67876	0 %	50 %	25 %	25 %	219883150
131	NC_011880	TAGT	2	8	68417	68424	25 %	50 %	25 %	0 %	219883150
132	NC_011880	TGAT	2	8	68560	68567	25 %	50 %	25 %	0 %	219883150
133	NC_011880	TTTG	2	8	68598	68605	0 %	75 %	25 %	0 %	219883150
134	NC_011880	ACTA	2	8	68883	68890	50 %	25 %	0 %	25 %	219883150
135	NC_011880	CAAA	2	8	69322	69329	75 %	0 %	0 %	25 %	219883150
136	NC_011880	TAAT	2	8	69908	69915	50 %	50 %	0 %	0 %	219883150
137	NC_011880	TTGT	2	8	70062	70069	0 %	75 %	25 %	0 %	219883150
138	NC_011880	ATCG	2	8	70106	70113	25 %	25 %	25 %	25 %	219883150
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.