MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742501

Total Repeats: 2770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011880	AAG	2	6	71564	71569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883150
1002	NC_011880	T	6	6	71715	71720	0 %	100 %	0 %	0 %	219883150
1003	NC_011880	TTGC	2	8	71815	71822	0 %	50 %	25 %	25 %	219883150
1004	NC_011880	CCT	2	6	71848	71853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883150
1005	NC_011880	AAT	2	6	71865	71870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883150
1006	NC_011880	ATT	2	6	72264	72269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883150
1007	NC_011880	TGC	2	6	72274	72279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883150
1008	NC_011880	CGA	3	9	72301	72309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883150
1009	NC_011880	AAG	2	6	72319	72324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883150
1010	NC_011880	TGG	2	6	72393	72398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883150
1011	NC_011880	GGA	2	6	72425	72430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883150
1012	NC_011880	CAA	2	6	72447	72452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883150
1013	NC_011880	AAG	2	6	72486	72491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883150
1014	NC_011880	AGG	2	6	72525	72530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883150
1015	NC_011880	TGC	2	6	72745	72750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883150
1016	NC_011880	CAT	2	6	72752	72757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883150
1017	NC_011880	CAA	2	6	72792	72797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883150
1018	NC_011880	ATC	2	6	72852	72857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883150
1019	NC_011880	CCTT	2	8	72967	72974	0 %	50 %	0 %	50 %	219883150
1020	NC_011880	ATC	2	6	72990	72995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883150
1021	NC_011880	ATG	2	6	73019	73024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883150
1022	NC_011880	GTC	2	6	73035	73040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883150
1023	NC_011880	CTG	2	6	73052	73057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883150
1024	NC_011880	CCA	2	6	73059	73064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883150
1025	NC_011880	AGA	2	6	73121	73126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883150
1026	NC_011880	CAG	2	6	73178	73183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883150
1027	NC_011880	ATT	2	6	73254	73259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883150
1028	NC_011880	ATC	2	6	73350	73355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883150
1029	NC_011880	TTG	2	6	73404	73409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883150
1030	NC_011880	TGT	2	6	73433	73438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883150
1031	NC_011880	TGTA	2	8	73455	73462	25 %	50 %	25 %	0 %	219883150
1032	NC_011880	AAT	2	6	73581	73586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883151
1033	NC_011880	TCT	3	9	73624	73632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883151
1034	NC_011880	CTT	2	6	73661	73666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883151
1035	NC_011880	GTTTG	2	10	73786	73795	0 %	60 %	40 %	0 %	219883151
1036	NC_011880	GCA	2	6	73836	73841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883151
1037	NC_011880	GTA	2	6	73979	73984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883151
1038	NC_011880	AGGAAA	2	12	74045	74056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883151
1039	NC_011880	CACC	2	8	74120	74127	25 %	0 %	0 %	75 %	219883151
1040	NC_011880	AAT	2	6	74128	74133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883151
1041	NC_011880	AGA	2	6	74155	74160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883151
1042	NC_011880	ATT	2	6	74187	74192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883151
1043	NC_011880	ACA	2	6	74205	74210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883151
1044	NC_011880	TAAC	2	8	74257	74264	50 %	25 %	0 %	25 %	219883151
1045	NC_011880	CCT	2	6	74267	74272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883151
1046	NC_011880	CCA	2	6	74321	74326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883151
1047	NC_011880	CTG	2	6	74410	74415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883151
1048	NC_011880	TTTG	2	8	74435	74442	0 %	75 %	25 %	0 %	219883151
1049	NC_011880	ATC	2	6	74444	74449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883151
1050	NC_011880	TCTAAA	2	12	74454	74465	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	219883151
1051	NC_011880	AAG	2	6	74475	74480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883151
1052	NC_011880	CTG	2	6	74504	74509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883151
1053	NC_011880	ATTTGA	2	12	74651	74662	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	219883151
1054	NC_011880	TAG	2	6	74705	74710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883151
1055	NC_011880	AT	3	6	74781	74786	50 %	50 %	0 %	0 %	219883151
1056	NC_011880	GGC	2	6	74818	74823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883151
1057	NC_011880	CA	3	6	74843	74848	50 %	0 %	0 %	50 %	219883151
1058	NC_011880	AAG	2	6	74964	74969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883151
1059	NC_011880	CTA	2	6	75016	75021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883151
1060	NC_011880	T	6	6	75058	75063	0 %	100 %	0 %	0 %	219883151
1061	NC_011880	GGA	2	6	75078	75083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883151
1062	NC_011880	ATCG	2	8	75266	75273	25 %	25 %	25 %	25 %	219883151
1063	NC_011880	A	6	6	75360	75365	100 %	0 %	0 %	0 %	219883151
1064	NC_011880	CTT	2	6	75394	75399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883151
1065	NC_011880	CTT	2	6	75403	75408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883151
1066	NC_011880	CTTTC	2	10	75421	75430	0 %	60 %	0 %	40 %	219883151
1067	NC_011880	CT	3	6	75487	75492	0 %	50 %	0 %	50 %	219883151
1068	NC_011880	GTC	2	6	75640	75645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883151
1069	NC_011880	ACCA	2	8	75660	75667	50 %	0 %	0 %	50 %	219883151
1070	NC_011880	GCC	2	6	75739	75744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883151
1071	NC_011880	CTC	2	6	75761	75766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883151
1072	NC_011880	CTGC	2	8	75898	75905	0 %	25 %	25 %	50 %	219883151
1073	NC_011880	GCA	2	6	75994	75999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883151
1074	NC_011880	CCG	3	9	76003	76011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883151
1075	NC_011880	CTTC	2	8	76027	76034	0 %	50 %	0 %	50 %	219883151
1076	NC_011880	TTC	2	6	76091	76096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883151
1077	NC_011880	G	6	6	76108	76113	0 %	0 %	100 %	0 %	219883151
1078	NC_011880	GT	3	6	76118	76123	0 %	50 %	50 %	0 %	219883151
1079	NC_011880	CTGT	2	8	76126	76133	0 %	50 %	25 %	25 %	219883151
1080	NC_011880	TACA	2	8	76154	76161	50 %	25 %	0 %	25 %	219883151
1081	NC_011880	CAC	2	6	76178	76183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883151
1082	NC_011880	TTG	2	6	76254	76259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883151
1083	NC_011880	GCT	2	6	76276	76281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883151
1084	NC_011880	T	6	6	76313	76318	0 %	100 %	0 %	0 %	219883151
1085	NC_011880	GAGC	2	8	76328	76335	25 %	0 %	50 %	25 %	219883151
1086	NC_011880	TCT	2	6	76342	76347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883151
1087	NC_011880	CCA	2	6	76438	76443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883151
1088	NC_011880	CCG	2	6	76471	76476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883151
1089	NC_011880	CAG	2	6	76484	76489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883151
1090	NC_011880	CTA	2	6	76552	76557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883151
1091	NC_011880	C	6	6	76560	76565	0 %	0 %	0 %	100 %	219883151
1092	NC_011880	CAAA	2	8	76705	76712	75 %	0 %	0 %	25 %	219883151
1093	NC_011880	TCG	2	6	76805	76810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883151
1094	NC_011880	TTC	2	6	76820	76825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883151
1095	NC_011880	CTC	2	6	76922	76927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883151
1096	NC_011880	AGA	2	6	76933	76938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883151
1097	NC_011880	CAT	2	6	76952	76957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883151
1098	NC_011880	GCC	2	6	76968	76973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883151
1099	NC_011880	TGATCC	2	12	77019	77030	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219883151
1100	NC_011880	CTG	2	6	77102	77107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883151
1101	NC_011880	AGG	2	6	77127	77132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883151
1102	NC_011880	TCC	2	6	77151	77156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883151
1103	NC_011880	CCG	2	6	77168	77173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883151
1104	NC_011880	TTC	2	6	77213	77218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883151
1105	NC_011880	CGT	2	6	77252	77257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883151
1106	NC_011880	GGCA	2	8	77323	77330	25 %	0 %	50 %	25 %	219883151
1107	NC_011880	CAT	2	6	77342	77347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883151
1108	NC_011880	TGC	2	6	77363	77368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883151
1109	NC_011880	ACC	2	6	77415	77420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883151
1110	NC_011880	ACC	3	9	77469	77477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883151
1111	NC_011880	TGC	2	6	77538	77543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883151
1112	NC_011880	CCT	2	6	77557	77562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883151
1113	NC_011880	ACTG	2	8	77638	77645	25 %	25 %	25 %	25 %	219883151
1114	NC_011880	CTC	2	6	77654	77659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883151
1115	NC_011880	CCG	2	6	77710	77715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883151
1116	NC_011880	TGA	2	6	77787	77792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883151
1117	NC_011880	GCC	2	6	78072	78077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883152
1118	NC_011880	CTG	2	6	78140	78145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883152
1119	NC_011880	CACC	2	8	78166	78173	25 %	0 %	0 %	75 %	219883152
1120	NC_011880	C	7	7	78187	78193	0 %	0 %	0 %	100 %	219883152
1121	NC_011880	AAT	2	6	78194	78199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883152
1122	NC_011880	TCCAG	2	10	78229	78238	20 %	20 %	20 %	40 %	219883152
1123	NC_011880	GACT	2	8	78244	78251	25 %	25 %	25 %	25 %	219883152
1124	NC_011880	G	7	7	78311	78317	0 %	0 %	100 %	0 %	219883152
1125	NC_011880	CAA	2	6	78343	78348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883152
1126	NC_011880	GCT	2	6	78476	78481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883152
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1377	NC_011880	GGC	2	6	93425	93430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883163
1378	NC_011880	CTGTC	2	10	93543	93552	0 %	40 %	20 %	40 %	219883163
1379	NC_011880	CCTG	2	8	93629	93636	0 %	25 %	25 %	50 %	219883163
1380	NC_011880	CCA	2	6	93652	93657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883163
1381	NC_011880	CTCA	2	8	93708	93715	25 %	25 %	0 %	50 %	219883163
1382	NC_011880	CAT	2	6	93780	93785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883163
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1402	NC_011880	GAACT	2	10	94730	94739	40 %	20 %	20 %	20 %	219883164
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1482	NC_011880	GCT	2	6	101147	101152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883170
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1488	NC_011880	TAGC	2	8	101793	101800	25 %	25 %	25 %	25 %	219883172
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1495	NC_011880	AGT	2	6	102300	102305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883172
1496	NC_011880	AAAT	2	8	102307	102314	75 %	25 %	0 %	0 %	219883172
1497	NC_011880	TTG	2	6	102317	102322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883172
1498	NC_011880	CTA	2	6	102714	102719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883173
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1500	NC_011880	CGT	2	6	102845	102850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883173

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