MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742501

Total Repeats: 2770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011880	ACC	2	6	32743	32748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883124
502	NC_011880	TCCTGT	2	12	32767	32778	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	219883124
503	NC_011880	CAG	2	6	32915	32920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883124
504	NC_011880	GCA	2	6	33002	33007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883124
505	NC_011880	GGC	2	6	33087	33092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883124
506	NC_011880	TCC	2	6	33180	33185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883124
507	NC_011880	TTCA	2	8	33267	33274	25 %	50 %	0 %	25 %	219883124
508	NC_011880	ATTGC	2	10	33296	33305	20 %	40 %	20 %	20 %	219883124
509	NC_011880	CAT	2	6	33306	33311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883124
510	NC_011880	GAG	2	6	33395	33400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883125
511	NC_011880	TGT	2	6	33403	33408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883125
512	NC_011880	G	6	6	33409	33414	0 %	0 %	100 %	0 %	219883125
513	NC_011880	AGC	2	6	33418	33423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883125
514	NC_011880	CTT	2	6	33462	33467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883125
515	NC_011880	CTGC	2	8	33549	33556	0 %	25 %	25 %	50 %	219883125
516	NC_011880	CTG	2	6	33613	33618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883125
517	NC_011880	GTT	3	9	33768	33776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883125
518	NC_011880	CTG	2	6	33790	33795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883125
519	NC_011880	G	6	6	33829	33834	0 %	0 %	100 %	0 %	219883125
520	NC_011880	TGG	2	6	33900	33905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883125
521	NC_011880	AAT	2	6	34439	34444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883126
522	NC_011880	ATTT	2	8	34515	34522	25 %	75 %	0 %	0 %	219883126
523	NC_011880	GTTG	2	8	34558	34565	0 %	50 %	50 %	0 %	219883126
524	NC_011880	AATGG	2	10	34696	34705	40 %	20 %	40 %	0 %	219883126
525	NC_011880	GATTG	2	10	34910	34919	20 %	40 %	40 %	0 %	219883126
526	NC_011880	GCATG	2	10	34970	34979	20 %	20 %	40 %	20 %	219883126
527	NC_011880	GC	3	6	35015	35020	0 %	0 %	50 %	50 %	219883126
528	NC_011880	GGTT	2	8	35261	35268	0 %	50 %	50 %	0 %	219883126
529	NC_011880	GGAGAT	2	12	35273	35284	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	219883126
530	NC_011880	GTG	2	6	35427	35432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883126
531	NC_011880	TGA	2	6	35505	35510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883126
532	NC_011880	GTTT	2	8	35563	35570	0 %	75 %	25 %	0 %	219883126
533	NC_011880	GGGCA	2	10	35571	35580	20 %	0 %	60 %	20 %	219883126
534	NC_011880	GT	3	6	35667	35672	0 %	50 %	50 %	0 %	219883126
535	NC_011880	GAA	2	6	35731	35736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883126
536	NC_011880	TAAA	2	8	35856	35863	75 %	25 %	0 %	0 %	219883126
537	NC_011880	ACTG	2	8	35941	35948	25 %	25 %	25 %	25 %	219883126
538	NC_011880	TGGA	2	8	35978	35985	25 %	25 %	50 %	0 %	219883126
539	NC_011880	TGG	2	6	36072	36077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883127
540	NC_011880	T	6	6	36078	36083	0 %	100 %	0 %	0 %	219883127
541	NC_011880	TTG	2	6	36151	36156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883127
542	NC_011880	GCA	2	6	36192	36197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883127
543	NC_011880	TGA	2	6	36306	36311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883127
544	NC_011880	A	6	6	36403	36408	100 %	0 %	0 %	0 %	219883127
545	NC_011880	AGCC	2	8	36416	36423	25 %	0 %	25 %	50 %	219883127
546	NC_011880	TGA	2	6	36462	36467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883127
547	NC_011880	TGG	2	6	36554	36559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883127
548	NC_011880	GTT	2	6	36570	36575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883127
549	NC_011880	GA	3	6	36597	36602	50 %	0 %	50 %	0 %	219883127
550	NC_011880	TGG	2	6	36656	36661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883127
551	NC_011880	GGT	2	6	36662	36667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883127
552	NC_011880	TGG	2	6	36692	36697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883127
553	NC_011880	A	6	6	36752	36757	100 %	0 %	0 %	0 %	219883127
554	NC_011880	TTACCG	2	12	36882	36893	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219883127
555	NC_011880	GTG	2	6	37029	37034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883127
556	NC_011880	AAGG	2	8	37060	37067	50 %	0 %	50 %	0 %	219883127
557	NC_011880	AATT	2	8	37107	37114	50 %	50 %	0 %	0 %	219883127
558	NC_011880	GAA	2	6	37197	37202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883128
559	NC_011880	GAA	2	6	37314	37319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883128
560	NC_011880	GTC	2	6	37351	37356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883128
561	NC_011880	CCT	2	6	37399	37404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883128
562	NC_011880	TGT	2	6	37462	37467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883128
563	NC_011880	TTC	2	6	37575	37580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883128
564	NC_011880	TGC	2	6	37693	37698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883128
565	NC_011880	ATGAA	2	10	37741	37750	60 %	20 %	20 %	0 %	219883128
566	NC_011880	G	6	6	37768	37773	0 %	0 %	100 %	0 %	219883128
567	NC_011880	CTTT	2	8	37774	37781	0 %	75 %	0 %	25 %	219883128
568	NC_011880	GCA	2	6	37804	37809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883128
569	NC_011880	CTT	2	6	37867	37872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883128
570	NC_011880	GT	3	6	37921	37926	0 %	50 %	50 %	0 %	219883128
571	NC_011880	AATC	2	8	38030	38037	50 %	25 %	0 %	25 %	219883129
572	NC_011880	GAA	2	6	38218	38223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883129
573	NC_011880	GGA	2	6	38263	38268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883129
574	NC_011880	TGG	2	6	38318	38323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883129
575	NC_011880	A	6	6	38379	38384	100 %	0 %	0 %	0 %	219883130
576	NC_011880	GAT	2	6	38390	38395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883130
577	NC_011880	TCC	2	6	38510	38515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883130
578	NC_011880	GAT	2	6	38580	38585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883130
579	NC_011880	AGC	2	6	38637	38642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883130
580	NC_011880	TGG	2	6	38747	38752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883130
581	NC_011880	GCA	2	6	38804	38809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883130
582	NC_011880	AAGG	2	8	38835	38842	50 %	0 %	50 %	0 %	219883130
583	NC_011880	AGCC	2	8	39012	39019	25 %	0 %	25 %	50 %	219883130
584	NC_011880	ACC	2	6	39162	39167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883130
585	NC_011880	GGC	2	6	39195	39200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883130
586	NC_011880	TTG	2	6	39244	39249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883130
587	NC_011880	GGT	2	6	39279	39284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883130
588	NC_011880	TTG	2	6	39369	39374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883130
589	NC_011880	A	6	6	39375	39380	100 %	0 %	0 %	0 %	219883130
590	NC_011880	TGG	2	6	39416	39421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883130
591	NC_011880	ATC	2	6	39448	39453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883130
592	NC_011880	TAT	2	6	39471	39476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883130
593	NC_011880	CGC	2	6	39537	39542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883130
594	NC_011880	AACCC	2	10	39633	39642	40 %	0 %	0 %	60 %	219883130
595	NC_011880	AGC	2	6	39726	39731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883130
596	NC_011880	TTG	2	6	39814	39819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883130
597	NC_011880	GTC	2	6	39864	39869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883130
598	NC_011880	GAT	2	6	39888	39893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883130
599	NC_011880	GTT	2	6	39935	39940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883130
600	NC_011880	T	6	6	39986	39991	0 %	100 %	0 %	0 %	219883130
601	NC_011880	GAAAC	2	10	39993	40002	60 %	0 %	20 %	20 %	219883130
602	NC_011880	TGGGG	2	10	40023	40032	0 %	20 %	80 %	0 %	219883130
603	NC_011880	AGT	2	6	40067	40072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883131
604	NC_011880	TCA	2	6	40083	40088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883131
605	NC_011880	GAA	2	6	40113	40118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883131
606	NC_011880	AGC	2	6	40206	40211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883131
607	NC_011880	TAAGGA	2	12	40216	40227	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	219883131
608	NC_011880	TAGG	2	8	40257	40264	25 %	25 %	50 %	0 %	219883131
609	NC_011880	TGA	2	6	40279	40284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883131
610	NC_011880	ACT	2	6	40308	40313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883131
611	NC_011880	ATCA	2	8	40395	40402	50 %	25 %	0 %	25 %	219883131
612	NC_011880	CAGG	2	8	40670	40677	25 %	0 %	50 %	25 %	219883131
613	NC_011880	TCA	2	6	40691	40696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883131
614	NC_011880	GGA	2	6	40853	40858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883131
615	NC_011880	TCA	2	6	40901	40906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883131
616	NC_011880	A	7	7	40973	40979	100 %	0 %	0 %	0 %	219883131
617	NC_011880	TGG	2	6	41021	41026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883131
618	NC_011880	AACAA	2	10	41068	41077	80 %	0 %	0 %	20 %	219883131
619	NC_011880	TTCAA	2	10	41203	41212	40 %	40 %	0 %	20 %	219883131
620	NC_011880	GGAAG	2	10	41271	41280	40 %	0 %	60 %	0 %	219883131
621	NC_011880	GAAG	2	8	41317	41324	50 %	0 %	50 %	0 %	219883131
622	NC_011880	ACC	2	6	41346	41351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883131
623	NC_011880	ACG	2	6	41372	41377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883131
624	NC_011880	GAT	2	6	41510	41515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883131
625	NC_011880	AGA	2	6	41539	41544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883131
626	NC_011880	CTG	2	6	41726	41731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883132
627	NC_011880	AGCC	2	8	42081	42088	25 %	0 %	25 %	50 %	219883132
628	NC_011880	GAA	2	6	42091	42096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883132
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757	NC_011880	GGC	2	6	57433	57438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883146
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764	NC_011880	GGA	2	6	57681	57686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883146
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