MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Clostridium kluyveri NBRC 12016 plasmid pCKL1

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011836	GATA	2	8	102	109	50 %	25 %	25 %	0 %	219684029
2	NC_011836	AAAG	2	8	118	125	75 %	0 %	25 %	0 %	219684029
3	NC_011836	AAAC	2	8	521	528	75 %	0 %	0 %	25 %	219684029
4	NC_011836	AGCA	2	8	612	619	50 %	0 %	25 %	25 %	219684029
5	NC_011836	TTTG	2	8	2007	2014	0 %	75 %	25 %	0 %	219684029
6	NC_011836	ACAA	2	8	2363	2370	75 %	0 %	0 %	25 %	219684029
7	NC_011836	ATTT	2	8	2567	2574	25 %	75 %	0 %	0 %	219684029
8	NC_011836	GCGA	2	8	2869	2876	25 %	0 %	50 %	25 %	219684029
9	NC_011836	ACAA	2	8	3768	3775	75 %	0 %	0 %	25 %	219684029
10	NC_011836	GCAA	2	8	4138	4145	50 %	0 %	25 %	25 %	219684029
11	NC_011836	GAAA	2	8	5728	5735	75 %	0 %	25 %	0 %	219684029
12	NC_011836	ACAG	2	8	6066	6073	50 %	0 %	25 %	25 %	219684029
13	NC_011836	GAAT	2	8	6522	6529	50 %	25 %	25 %	0 %	219684029
14	NC_011836	AGTA	2	8	8206	8213	50 %	25 %	25 %	0 %	219684030
15	NC_011836	CATT	2	8	9471	9478	25 %	50 %	0 %	25 %	219684031
16	NC_011836	ATGG	2	8	9847	9854	25 %	25 %	50 %	0 %	219684032
17	NC_011836	GATA	2	8	9929	9936	50 %	25 %	25 %	0 %	219684032
18	NC_011836	AAAG	2	8	9986	9993	75 %	0 %	25 %	0 %	219684032
19	NC_011836	AAAC	2	8	10263	10270	75 %	0 %	0 %	25 %	219684032
20	NC_011836	GAAG	2	8	10440	10447	50 %	0 %	50 %	0 %	219684032
21	NC_011836	ATAG	2	8	10578	10585	50 %	25 %	25 %	0 %	219684032
22	NC_011836	AAAT	2	8	10816	10823	75 %	25 %	0 %	0 %	219684032
23	NC_011836	ATTA	2	8	11190	11197	50 %	50 %	0 %	0 %	219684032
24	NC_011836	ACTA	2	8	11199	11206	50 %	25 %	0 %	25 %	219684032
25	NC_011836	ATAA	2	8	11322	11329	75 %	25 %	0 %	0 %	219684032
26	NC_011836	TACT	2	8	11669	11676	25 %	50 %	0 %	25 %	219684032
27	NC_011836	TGGA	2	8	12979	12986	25 %	25 %	50 %	0 %	219684034
28	NC_011836	CTAT	2	8	13627	13634	25 %	50 %	0 %	25 %	219684035
29	NC_011836	TTAT	2	8	14363	14370	25 %	75 %	0 %	0 %	219684036
30	NC_011836	GTTA	2	8	14661	14668	25 %	50 %	25 %	0 %	219684036
31	NC_011836	AAAG	2	8	15169	15176	75 %	0 %	25 %	0 %	219684037
32	NC_011836	TAAA	2	8	15342	15349	75 %	25 %	0 %	0 %	219684037
33	NC_011836	AATT	2	8	15458	15465	50 %	50 %	0 %	0 %	219684037
34	NC_011836	GGAT	2	8	15569	15576	25 %	25 %	50 %	0 %	219684038
35	NC_011836	GACA	2	8	15850	15857	50 %	0 %	25 %	25 %	219684038
36	NC_011836	AAGA	2	8	15932	15939	75 %	0 %	25 %	0 %	219684038
37	NC_011836	TTCT	2	8	16167	16174	0 %	75 %	0 %	25 %	219684038
38	NC_011836	AACT	2	8	17139	17146	50 %	25 %	0 %	25 %	219684039
39	NC_011836	ATCT	2	8	17297	17304	25 %	50 %	0 %	25 %	219684039
40	NC_011836	TTTA	2	8	17666	17673	25 %	75 %	0 %	0 %	219684039
41	NC_011836	AAAT	2	8	18194	18201	75 %	25 %	0 %	0 %	219684040
42	NC_011836	TAAA	2	8	18307	18314	75 %	25 %	0 %	0 %	219684040
43	NC_011836	TAAC	2	8	20485	20492	50 %	25 %	0 %	25 %	219684042
44	NC_011836	TATT	2	8	20523	20530	25 %	75 %	0 %	0 %	219684042
45	NC_011836	CCAA	2	8	20886	20893	50 %	0 %	0 %	50 %	219684042
46	NC_011836	AATT	2	8	21016	21023	50 %	50 %	0 %	0 %	219684042
47	NC_011836	CCTT	2	8	21373	21380	0 %	50 %	0 %	50 %	219684043
48	NC_011836	TTAT	2	8	21973	21980	25 %	75 %	0 %	0 %	219684044
49	NC_011836	AATT	2	8	22124	22131	50 %	50 %	0 %	0 %	219684044
50	NC_011836	ATGT	2	8	22188	22195	25 %	50 %	25 %	0 %	219684044
51	NC_011836	TTTA	2	8	22512	22519	25 %	75 %	0 %	0 %	219684045
52	NC_011836	TAAG	2	8	22550	22557	50 %	25 %	25 %	0 %	219684045
53	NC_011836	CTAT	2	8	24910	24917	25 %	50 %	0 %	25 %	219684048
54	NC_011836	TTTA	2	8	25304	25311	25 %	75 %	0 %	0 %	219684048
55	NC_011836	AAAT	2	8	25908	25915	75 %	25 %	0 %	0 %	219684048
56	NC_011836	TTTA	2	8	25925	25932	25 %	75 %	0 %	0 %	219684048
57	NC_011836	AATT	2	8	26011	26018	50 %	50 %	0 %	0 %	219684048
58	NC_011836	CATT	2	8	27500	27507	25 %	50 %	0 %	25 %	219684050
59	NC_011836	TTTC	2	8	27712	27719	0 %	75 %	0 %	25 %	219684050
60	NC_011836	AGCA	2	8	28641	28648	50 %	0 %	25 %	25 %	219684051
61	NC_011836	TAGC	2	8	29736	29743	25 %	25 %	25 %	25 %	219684053
62	NC_011836	GCTT	2	8	29883	29890	0 %	50 %	25 %	25 %	219684053
63	NC_011836	TGGA	2	8	31294	31301	25 %	25 %	50 %	0 %	219684055
64	NC_011836	AGAA	2	8	31370	31377	75 %	0 %	25 %	0 %	219684055
65	NC_011836	AATG	2	8	32189	32196	50 %	25 %	25 %	0 %	219684056
66	NC_011836	TCAA	2	8	32275	32282	50 %	25 %	0 %	25 %	219684056
67	NC_011836	CACT	2	8	32341	32348	25 %	25 %	0 %	50 %	219684056
68	NC_011836	AAAT	2	8	33620	33627	75 %	25 %	0 %	0 %	219684057
69	NC_011836	AATA	2	8	33872	33879	75 %	25 %	0 %	0 %	219684057
70	NC_011836	TCAG	2	8	33881	33888	25 %	25 %	25 %	25 %	219684057
71	NC_011836	TTAT	2	8	34447	34454	25 %	75 %	0 %	0 %	219684057
72	NC_011836	ACAA	2	8	34573	34580	75 %	0 %	0 %	25 %	219684057
73	NC_011836	TAAT	2	8	34687	34694	50 %	50 %	0 %	0 %	219684057
74	NC_011836	ATAA	2	8	34920	34927	75 %	25 %	0 %	0 %	219684057
75	NC_011836	AAAT	2	8	35051	35058	75 %	25 %	0 %	0 %	219684057
76	NC_011836	TACT	2	8	35323	35330	25 %	50 %	0 %	25 %	219684057
77	NC_011836	AAAG	2	8	35423	35430	75 %	0 %	25 %	0 %	219684057
78	NC_011836	AAGA	2	8	35532	35539	75 %	0 %	25 %	0 %	219684057
79	NC_011836	CTAA	2	8	35820	35827	50 %	25 %	0 %	25 %	219684057
80	NC_011836	AAAG	2	8	35981	35988	75 %	0 %	25 %	0 %	219684057
81	NC_011836	AAGA	2	8	36221	36228	75 %	0 %	25 %	0 %	219684057
82	NC_011836	TTAT	2	8	37086	37093	25 %	75 %	0 %	0 %	219684057
83	NC_011836	AGGT	2	8	37214	37221	25 %	25 %	50 %	0 %	219684057
84	NC_011836	AGGC	2	8	37822	37829	25 %	0 %	50 %	25 %	219684059
85	NC_011836	AGGA	2	8	39490	39497	50 %	0 %	50 %	0 %	219684061
86	NC_011836	TATT	2	8	39523	39530	25 %	75 %	0 %	0 %	219684061
87	NC_011836	AGAA	2	8	39717	39724	75 %	0 %	25 %	0 %	219684061
88	NC_011836	AGGT	2	8	40667	40674	25 %	25 %	50 %	0 %	219684063
89	NC_011836	CAAA	2	8	40767	40774	75 %	0 %	0 %	25 %	219684063
90	NC_011836	ATTT	2	8	41379	41386	25 %	75 %	0 %	0 %	219684064
91	NC_011836	ATAA	2	8	42138	42145	75 %	25 %	0 %	0 %	219684065
92	NC_011836	AGAA	2	8	42412	42419	75 %	0 %	25 %	0 %	219684065
93	NC_011836	TAAA	2	8	42427	42434	75 %	25 %	0 %	0 %	219684065
94	NC_011836	GAAT	2	8	42674	42681	50 %	25 %	25 %	0 %	219684066
95	NC_011836	TCAG	2	8	42810	42817	25 %	25 %	25 %	25 %	219684066
96	NC_011836	GAAA	2	8	43230	43237	75 %	0 %	25 %	0 %	219684067
97	NC_011836	TCCA	2	8	43699	43706	25 %	25 %	0 %	50 %	219684068
98	NC_011836	AAAG	2	8	44117	44124	75 %	0 %	25 %	0 %	219684068
99	NC_011836	CTGG	2	8	44408	44415	0 %	25 %	50 %	25 %	219684068
100	NC_011836	TAAA	2	8	44785	44792	75 %	25 %	0 %	0 %	219684068
101	NC_011836	TTTA	2	8	44818	44825	25 %	75 %	0 %	0 %	219684068
102	NC_011836	ATAA	2	8	44958	44965	75 %	25 %	0 %	0 %	219684068
103	NC_011836	TTTG	2	8	44993	45000	0 %	75 %	25 %	0 %	219684068
104	NC_011836	AATT	2	8	45083	45090	50 %	50 %	0 %	0 %	219684068
105	NC_011836	ATTA	2	8	45200	45207	50 %	50 %	0 %	0 %	219684068
106	NC_011836	TAAA	2	8	45544	45551	75 %	25 %	0 %	0 %	219684068
107	NC_011836	TTGA	2	8	45564	45571	25 %	50 %	25 %	0 %	219684068
108	NC_011836	TAAA	2	8	47258	47265	75 %	25 %	0 %	0 %	219684069
109	NC_011836	ATTA	2	8	48305	48312	50 %	50 %	0 %	0 %	219684071
110	NC_011836	GCCA	2	8	48328	48335	25 %	0 %	25 %	50 %	219684071
111	NC_011836	TTAA	2	8	48351	48358	50 %	50 %	0 %	0 %	219684071
112	NC_011836	CAAA	2	8	49325	49332	75 %	0 %	0 %	25 %	219684073
113	NC_011836	GATA	2	8	49623	49630	50 %	25 %	25 %	0 %	219684073
114	NC_011836	ACCA	2	8	49698	49705	50 %	0 %	0 %	50 %	219684073
115	NC_011836	TTCA	2	8	50597	50604	25 %	50 %	0 %	25 %	219684073
116	NC_011836	ACTG	2	8	51370	51377	25 %	25 %	25 %	25 %	219684073
117	NC_011836	CAAT	2	8	51479	51486	50 %	25 %	0 %	25 %	219684073
118	NC_011836	ATGT	2	8	51721	51728	25 %	50 %	25 %	0 %	219684073
119	NC_011836	TAAT	2	8	52079	52086	50 %	50 %	0 %	0 %	219684073
120	NC_011836	AGTT	2	8	52116	52123	25 %	50 %	25 %	0 %	219684073
121	NC_011836	ATTT	2	8	52156	52163	25 %	75 %	0 %	0 %	219684074
122	NC_011836	GTAA	2	8	52401	52408	50 %	25 %	25 %	0 %	219684074
123	NC_011836	GAAA	2	8	52802	52809	75 %	0 %	25 %	0 %	219684074
124	NC_011836	ATTT	2	8	52841	52848	25 %	75 %	0 %	0 %	219684074
125	NC_011836	TTTG	2	8	52865	52872	0 %	75 %	25 %	0 %	219684074
126	NC_011836	TTTA	2	8	53422	53429	25 %	75 %	0 %	0 %	219684075
127	NC_011836	CTAT	2	8	53779	53786	25 %	50 %	0 %	25 %	219684075
128	NC_011836	GAAA	3	12	54031	54042	75 %	0 %	25 %	0 %	219684075
129	NC_011836	ACTG	2	8	54229	54236	25 %	25 %	25 %	25 %	219684076
130	NC_011836	AAAT	2	8	54718	54725	75 %	25 %	0 %	0 %	219684076
131	NC_011836	TATG	2	8	54931	54938	25 %	50 %	25 %	0 %	219684076
132	NC_011836	TGAA	2	8	55589	55596	50 %	25 %	25 %	0 %	219684077
133	NC_011836	ATTG	2	8	56296	56303	25 %	50 %	25 %	0 %	219684079
134	NC_011836	AACT	2	8	56506	56513	50 %	25 %	0 %	25 %	219684079
135	NC_011836	CAAG	2	8	56841	56848	50 %	0 %	25 %	25 %	219684080
136	NC_011836	AACC	2	8	57679	57686	50 %	0 %	0 %	50 %	219684081
137	NC_011836	AATT	2	8	57892	57899	50 %	50 %	0 %	0 %	219684081
138	NC_011836	GTCT	2	8	58177	58184	0 %	50 %	25 %	25 %	219684082
139	NC_011836	AACT	2	8	58198	58205	50 %	25 %	0 %	25 %	219684082

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.