MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium kluyveri NBRC 12016 plasmid pCKL1

Total Repeats: 1116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011836	GATA	2	8	102	109	50 %	25 %	25 %	0 %	219684029
2	NC_011836	AAAG	2	8	118	125	75 %	0 %	25 %	0 %	219684029
3	NC_011836	A	6	6	150	155	100 %	0 %	0 %	0 %	219684029
4	NC_011836	A	6	6	194	199	100 %	0 %	0 %	0 %	219684029
5	NC_011836	ATA	2	6	217	222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219684029
6	NC_011836	CAG	2	6	232	237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684029
7	NC_011836	AAC	2	6	268	273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219684029
8	NC_011836	ATG	2	6	283	288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684029
9	NC_011836	TGA	2	6	306	311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684029
10	NC_011836	AGC	3	9	333	341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684029
11	NC_011836	A	6	6	370	375	100 %	0 %	0 %	0 %	219684029
12	NC_011836	ATG	2	6	389	394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684029
13	NC_011836	TAA	2	6	399	404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219684029
14	NC_011836	AAT	2	6	436	441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219684029
15	NC_011836	ATACA	2	10	461	470	60 %	20 %	0 %	20 %	219684029
16	NC_011836	AAAC	2	8	521	528	75 %	0 %	0 %	25 %	219684029
17	NC_011836	AATAA	2	10	529	538	80 %	20 %	0 %	0 %	219684029
18	NC_011836	GAA	2	6	574	579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219684029
19	NC_011836	A	6	6	586	591	100 %	0 %	0 %	0 %	219684029
20	NC_011836	AGCA	2	8	612	619	50 %	0 %	25 %	25 %	219684029
21	NC_011836	GCT	2	6	901	906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684029
22	NC_011836	TCT	2	6	907	912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219684029
23	NC_011836	TGT	2	6	942	947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219684029
24	NC_011836	GCA	2	6	1018	1023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684029
25	NC_011836	GAT	2	6	1210	1215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684029
26	NC_011836	GCT	2	6	1216	1221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684029
27	NC_011836	TGC	2	6	1452	1457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684029
28	NC_011836	GCA	2	6	1468	1473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684029
29	NC_011836	CAG	2	6	1529	1534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684029
30	NC_011836	AAG	2	6	1547	1552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219684029
31	NC_011836	TAG	2	6	1643	1648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684029
32	NC_011836	AGC	2	6	1668	1673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684029
33	NC_011836	AGG	2	6	1674	1679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219684029
34	NC_011836	TGGCT	2	10	1698	1707	0 %	40 %	40 %	20 %	219684029
35	NC_011836	GCT	2	6	1756	1761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684029
36	NC_011836	GCC	2	6	1771	1776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219684029
37	NC_011836	GCA	2	6	1786	1791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684029
38	NC_011836	CAG	2	6	1793	1798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684029
39	NC_011836	TGC	2	6	1809	1814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684029
40	NC_011836	AGCTGG	2	12	1821	1832	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219684029
41	NC_011836	TGC	2	6	1848	1853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684029
42	NC_011836	AGG	2	6	1857	1862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219684029
43	NC_011836	GCA	2	6	1876	1881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684029
44	NC_011836	GCA	2	6	1894	1899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684029
45	NC_011836	GCG	2	6	1939	1944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219684029
46	NC_011836	TA	3	6	1958	1963	50 %	50 %	0 %	0 %	219684029
47	NC_011836	CAGAC	2	10	1982	1991	40 %	0 %	20 %	40 %	219684029
48	NC_011836	TTTG	2	8	2007	2014	0 %	75 %	25 %	0 %	219684029
49	NC_011836	CAA	2	6	2164	2169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219684029
50	NC_011836	TAC	2	6	2196	2201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219684029
51	NC_011836	TGAAA	2	10	2268	2277	60 %	20 %	20 %	0 %	219684029
52	NC_011836	TAA	2	6	2310	2315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219684029
53	NC_011836	AAT	2	6	2320	2325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219684029
54	NC_011836	ACAA	2	8	2363	2370	75 %	0 %	0 %	25 %	219684029
55	NC_011836	AAC	2	6	2399	2404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219684029
56	NC_011836	A	7	7	2405	2411	100 %	0 %	0 %	0 %	219684029
57	NC_011836	TGC	2	6	2520	2525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684029
58	NC_011836	ATTT	2	8	2567	2574	25 %	75 %	0 %	0 %	219684029
59	NC_011836	AAC	2	6	2603	2608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219684029
60	NC_011836	GAGAA	2	10	2639	2648	60 %	0 %	40 %	0 %	219684029
61	NC_011836	A	6	6	2647	2652	100 %	0 %	0 %	0 %	219684029
62	NC_011836	A	6	6	2654	2659	100 %	0 %	0 %	0 %	219684029
63	NC_011836	TA	3	6	2688	2693	50 %	50 %	0 %	0 %	219684029
64	NC_011836	AAT	2	6	2707	2712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219684029
65	NC_011836	AGTAA	2	10	2812	2821	60 %	20 %	20 %	0 %	219684029
66	NC_011836	GCGA	2	8	2869	2876	25 %	0 %	50 %	25 %	219684029
67	NC_011836	AAT	2	6	2955	2960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219684029
68	NC_011836	GTT	2	6	3076	3081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219684029
69	NC_011836	ATG	2	6	3104	3109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684029
70	NC_011836	A	6	6	3177	3182	100 %	0 %	0 %	0 %	219684029
71	NC_011836	TAA	2	6	3213	3218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219684029
72	NC_011836	TAG	2	6	3224	3229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684029
73	NC_011836	CAC	2	6	3314	3319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219684029
74	NC_011836	GAA	2	6	3340	3345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219684029
75	NC_011836	GGC	2	6	3370	3375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219684029
76	NC_011836	TTA	2	6	3383	3388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219684029
77	NC_011836	CAAAA	2	10	3435	3444	80 %	0 %	0 %	20 %	219684029
78	NC_011836	TAC	2	6	3453	3458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219684029
79	NC_011836	ATG	2	6	3548	3553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684029
80	NC_011836	CACAGC	2	12	3681	3692	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	219684029
81	NC_011836	AAT	2	6	3724	3729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219684029
82	NC_011836	CTA	2	6	3743	3748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219684029
83	NC_011836	ACAA	2	8	3768	3775	75 %	0 %	0 %	25 %	219684029
84	NC_011836	AAT	2	6	3778	3783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219684029
85	NC_011836	TAA	2	6	3818	3823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219684029
86	NC_011836	ATA	2	6	3833	3838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219684029
87	NC_011836	AGA	2	6	3963	3968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219684029
88	NC_011836	AAT	2	6	4066	4071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219684029
89	NC_011836	GCAA	2	8	4138	4145	50 %	0 %	25 %	25 %	219684029
90	NC_011836	TAA	2	6	4197	4202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219684029
91	NC_011836	AAT	2	6	4228	4233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219684029
92	NC_011836	ACT	2	6	4237	4242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219684029
93	NC_011836	TAACT	2	10	4254	4263	40 %	40 %	0 %	20 %	219684029
94	NC_011836	CGG	2	6	4274	4279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219684029
95	NC_011836	TAA	2	6	4359	4364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219684029
96	NC_011836	AAT	2	6	4384	4389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219684029
97	NC_011836	CTG	2	6	4463	4468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684029
98	NC_011836	ATT	2	6	4510	4515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219684029
99	NC_011836	ACA	2	6	4567	4572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219684029
100	NC_011836	CAAAA	2	10	4642	4651	80 %	0 %	0 %	20 %	219684029
101	NC_011836	G	6	6	4675	4680	0 %	0 %	100 %	0 %	219684029
102	NC_011836	CTGGA	2	10	4742	4751	20 %	20 %	40 %	20 %	219684029
103	NC_011836	TGG	2	6	4773	4778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219684029
104	NC_011836	GCA	3	9	4912	4920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684029
105	NC_011836	AT	3	6	4929	4934	50 %	50 %	0 %	0 %	219684029
106	NC_011836	TA	3	6	4955	4960	50 %	50 %	0 %	0 %	219684029
107	NC_011836	GGA	2	6	5095	5100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219684029
108	NC_011836	AAT	2	6	5113	5118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219684029
109	NC_011836	A	6	6	5235	5240	100 %	0 %	0 %	0 %	219684029
110	NC_011836	AGC	2	6	5298	5303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684029
111	NC_011836	A	6	6	5380	5385	100 %	0 %	0 %	0 %	219684029
112	NC_011836	GGC	2	6	5433	5438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219684029
113	NC_011836	AAT	2	6	5455	5460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219684029
114	NC_011836	CAG	2	6	5479	5484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684029
115	NC_011836	ATG	2	6	5705	5710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684029
116	NC_011836	GAAA	2	8	5728	5735	75 %	0 %	25 %	0 %	219684029
117	NC_011836	AAG	2	6	5750	5755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219684029
118	NC_011836	GAA	2	6	5788	5793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219684029
119	NC_011836	AAT	2	6	5836	5841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219684029
120	NC_011836	AGC	2	6	5874	5879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684029
121	NC_011836	ACAG	2	8	6066	6073	50 %	0 %	25 %	25 %	219684029
122	NC_011836	TGC	2	6	6132	6137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219684029
123	NC_011836	AGT	2	6	6166	6171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684029
124	NC_011836	TGA	2	6	6174	6179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684029
125	NC_011836	GAA	2	6	6226	6231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219684029
126	NC_011836	A	6	6	6242	6247	100 %	0 %	0 %	0 %	219684029
127	NC_011836	AGA	2	6	6249	6254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219684029
128	NC_011836	TAC	2	6	6321	6326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219684029
129	NC_011836	AGA	2	6	6327	6332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219684029
130	NC_011836	AGC	2	6	6341	6346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684029
131	NC_011836	AAG	2	6	6370	6375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219684029
132	NC_011836	TGA	2	6	6429	6434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684029
133	NC_011836	CAATT	2	10	6440	6449	40 %	40 %	0 %	20 %	219684029
134	NC_011836	A	6	6	6496	6501	100 %	0 %	0 %	0 %	219684029
135	NC_011836	GCA	2	6	6504	6509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219684029
136	NC_011836	GAAT	2	8	6522	6529	50 %	25 %	25 %	0 %	219684029
137	NC_011836	TGA	2	6	6552	6557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684029
138	NC_011836	TGA	2	6	6597	6602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684029
139	NC_011836	ATA	2	6	6617	6622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219684029
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154	NC_011836	A	6	6	7216	7221	100 %	0 %	0 %	0 %	219684029
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157	NC_011836	A	6	6	7301	7306	100 %	0 %	0 %	0 %	219684029
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179	NC_011836	AGA	2	6	8176	8181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219684030
180	NC_011836	AGTA	2	8	8206	8213	50 %	25 %	25 %	0 %	219684030
181	NC_011836	TA	3	6	8313	8318	50 %	50 %	0 %	0 %	219684030
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249	NC_011836	T	6	6	11333	11338	0 %	100 %	0 %	0 %	219684032
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259	NC_011836	TACT	2	8	11669	11676	25 %	50 %	0 %	25 %	219684032
260	NC_011836	GTG	2	6	11701	11706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219684032
261	NC_011836	GGA	2	6	11724	11729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219684032
262	NC_011836	AGA	2	6	11882	11887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219684032
263	NC_011836	GGGAA	2	10	11923	11932	40 %	0 %	60 %	0 %	219684032
264	NC_011836	ATGGTG	2	12	11941	11952	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	219684032
265	NC_011836	ATG	2	6	12100	12105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684032
266	NC_011836	CTT	3	9	12112	12120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219684032
267	NC_011836	ACAATC	2	12	12152	12163	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	219684032
268	NC_011836	T	6	6	12221	12226	0 %	100 %	0 %	0 %	219684032
269	NC_011836	AAC	2	6	12233	12238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219684032
270	NC_011836	TAA	2	6	12259	12264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219684032
271	NC_011836	CTA	2	6	12274	12279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219684032
272	NC_011836	GTT	2	6	12441	12446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219684033
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278	NC_011836	TAA	2	6	12820	12825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219684033
279	NC_011836	AGG	2	6	12871	12876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219684033
280	NC_011836	A	6	6	12913	12918	100 %	0 %	0 %	0 %	219684033
281	NC_011836	TGGA	2	8	12979	12986	25 %	25 %	50 %	0 %	219684034
282	NC_011836	AT	3	6	12990	12995	50 %	50 %	0 %	0 %	219684034
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287	NC_011836	TAA	2	6	13101	13106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219684034
288	NC_011836	ATT	2	6	13170	13175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219684034
289	NC_011836	AT	4	8	13253	13260	50 %	50 %	0 %	0 %	219684034
290	NC_011836	TGA	2	6	13261	13266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684034
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292	NC_011836	GA	3	6	13290	13295	50 %	0 %	50 %	0 %	219684034
293	NC_011836	ATC	2	6	13607	13612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219684035
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297	NC_011836	TACTT	2	10	13827	13836	20 %	60 %	0 %	20 %	219684035
298	NC_011836	CTA	2	6	13884	13889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219684035
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300	NC_011836	TAG	2	6	13961	13966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684035
301	NC_011836	A	6	6	13983	13988	100 %	0 %	0 %	0 %	219684035
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305	NC_011836	T	6	6	14233	14238	0 %	100 %	0 %	0 %	219684036
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392	NC_011836	ATT	2	6	20187	20192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219684042
393	NC_011836	AATTTA	2	12	20323	20334	50 %	50 %	0 %	0 %	219684042
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