MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 3030

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011831	TCACG	2	10	1426	1435	20 %	20 %	20 %	40 %	219846957
2	NC_011831	CACGC	2	10	8369	8378	20 %	0 %	20 %	60 %	219846965
3	NC_011831	GTTCG	2	10	10153	10162	0 %	40 %	40 %	20 %	219846966
4	NC_011831	TGCGC	2	10	10972	10981	0 %	20 %	40 %	40 %	219846966
5	NC_011831	TGGCT	2	10	14721	14730	0 %	40 %	40 %	20 %	219846968
6	NC_011831	CGCAA	2	10	15125	15134	40 %	0 %	20 %	40 %	219846968
7	NC_011831	CTCAT	2	10	15668	15677	20 %	40 %	0 %	40 %	219846968
8	NC_011831	ATGAG	2	10	16368	16377	40 %	20 %	40 %	0 %	219846968
9	NC_011831	CATTG	2	10	17137	17146	20 %	40 %	20 %	20 %	219846968
10	NC_011831	GGTAT	2	10	20249	20258	20 %	40 %	40 %	0 %	219846968
11	NC_011831	CGATC	2	10	20419	20428	20 %	20 %	20 %	40 %	219846968
12	NC_011831	TACAA	2	10	20444	20453	60 %	20 %	0 %	20 %	219846968
13	NC_011831	TCGCG	2	10	21054	21063	0 %	20 %	40 %	40 %	219846968
14	NC_011831	TGTAG	2	10	21624	21633	20 %	40 %	40 %	0 %	219846969
15	NC_011831	GCGTG	2	10	24728	24737	0 %	20 %	60 %	20 %	219846971
16	NC_011831	GAGCA	2	10	25487	25496	40 %	0 %	40 %	20 %	219846971
17	NC_011831	CAGGG	2	10	25606	25615	20 %	0 %	60 %	20 %	219846971
18	NC_011831	TCCAT	2	10	26827	26836	20 %	40 %	0 %	40 %	219846971
19	NC_011831	TTTAG	2	10	28767	28776	20 %	60 %	20 %	0 %	219846974
20	NC_011831	GCCAG	2	10	28906	28915	20 %	0 %	40 %	40 %	219846974
21	NC_011831	ATGCG	2	10	31631	31640	20 %	20 %	40 %	20 %	219846976
22	NC_011831	CGTAC	2	10	35284	35293	20 %	20 %	20 %	40 %	219846979
23	NC_011831	TAGCA	2	10	37282	37291	40 %	20 %	20 %	20 %	219846979
24	NC_011831	GGTCG	2	10	37500	37509	0 %	20 %	60 %	20 %	219846979
25	NC_011831	GCTCA	2	10	38985	38994	20 %	20 %	20 %	40 %	219846980
26	NC_011831	CGATC	2	10	39941	39950	20 %	20 %	20 %	40 %	219846980
27	NC_011831	ACGTA	2	10	40143	40152	40 %	20 %	20 %	20 %	219846980
28	NC_011831	GCGCG	2	10	44088	44097	0 %	0 %	60 %	40 %	219846984
29	NC_011831	ATGCA	2	10	44962	44971	40 %	20 %	20 %	20 %	219846984
30	NC_011831	CAACT	2	10	47557	47566	40 %	20 %	0 %	40 %	219846986
31	NC_011831	CGCGC	2	10	50372	50381	0 %	0 %	40 %	60 %	219846988
32	NC_011831	GATCT	2	10	50498	50507	20 %	40 %	20 %	20 %	219846988
33	NC_011831	GCACC	2	10	52621	52630	20 %	0 %	20 %	60 %	219846989
34	NC_011831	CCGGC	2	10	53230	53239	0 %	0 %	40 %	60 %	219846989
35	NC_011831	CATAT	2	10	56496	56505	40 %	40 %	0 %	20 %	219846990
36	NC_011831	GATCT	2	10	56626	56635	20 %	40 %	20 %	20 %	219846991
37	NC_011831	CCTTG	2	10	59767	59776	0 %	40 %	20 %	40 %	219846993
38	NC_011831	CACAC	2	10	60991	61000	40 %	0 %	0 %	60 %	219846994
39	NC_011831	TTGGG	2	10	63242	63251	0 %	40 %	60 %	0 %	219846996
40	NC_011831	GCGTG	2	10	65101	65110	0 %	20 %	60 %	20 %	219846999
41	NC_011831	TCGGC	2	10	65230	65239	0 %	20 %	40 %	40 %	219846999
42	NC_011831	CGAAT	2	10	66100	66109	40 %	20 %	20 %	20 %	219846999
43	NC_011831	GGAGA	2	10	67311	67320	40 %	0 %	60 %	0 %	219847000
44	NC_011831	CAACC	2	10	68062	68071	40 %	0 %	0 %	60 %	219847001
45	NC_011831	GCGCG	2	10	69073	69082	0 %	0 %	60 %	40 %	219847002
46	NC_011831	CTTGT	2	10	72358	72367	0 %	60 %	20 %	20 %	219847005
47	NC_011831	ATCCC	2	10	74200	74209	20 %	20 %	0 %	60 %	219847008
48	NC_011831	CCGAT	2	10	74523	74532	20 %	20 %	20 %	40 %	219847008
49	NC_011831	CATGT	2	10	75353	75362	20 %	40 %	20 %	20 %	219847008
50	NC_011831	GCGCC	2	10	77730	77739	0 %	0 %	40 %	60 %	219847012
51	NC_011831	CTGGT	2	10	79084	79093	0 %	40 %	40 %	20 %	219847012
52	NC_011831	GGTGA	2	10	79813	79822	20 %	20 %	60 %	0 %	219847012
53	NC_011831	GGTAC	2	10	79887	79896	20 %	20 %	40 %	20 %	219847012
54	NC_011831	ATTAC	2	10	81526	81535	40 %	40 %	0 %	20 %	219847013
55	NC_011831	CAAGT	2	10	81751	81760	40 %	20 %	20 %	20 %	219847013
56	NC_011831	TGGGG	2	10	85285	85294	0 %	20 %	80 %	0 %	219847014
57	NC_011831	CGCAG	2	10	87710	87719	20 %	0 %	40 %	40 %	219847017
58	NC_011831	ACGCG	2	10	92842	92851	20 %	0 %	40 %	40 %	219847022
59	NC_011831	AACGG	2	10	92913	92922	40 %	0 %	40 %	20 %	219847022
60	NC_011831	GCGGA	2	10	92959	92968	20 %	0 %	60 %	20 %	219847022
61	NC_011831	CCGAT	2	10	96035	96044	20 %	20 %	20 %	40 %	219847025
62	NC_011831	CGGCC	2	10	98223	98232	0 %	0 %	40 %	60 %	219847026
63	NC_011831	CCGTA	2	10	101098	101107	20 %	20 %	20 %	40 %	219847028
64	NC_011831	CAACC	2	10	101650	101659	40 %	0 %	0 %	60 %	219847028
65	NC_011831	CATCT	2	10	102908	102917	20 %	40 %	0 %	40 %	219847030
66	NC_011831	ACGTA	2	10	105846	105855	40 %	20 %	20 %	20 %	219847032
67	NC_011831	TGCAG	2	10	105976	105985	20 %	20 %	40 %	20 %	219847032
68	NC_011831	GGTAG	2	10	106379	106388	20 %	20 %	60 %	0 %	219847032
69	NC_011831	TGGGG	2	10	106642	106651	0 %	20 %	80 %	0 %	219847032
70	NC_011831	CGCCA	2	10	107117	107126	20 %	0 %	20 %	60 %	219847033
71	NC_011831	AACCA	2	10	115712	115721	60 %	0 %	0 %	40 %	219847038
72	NC_011831	CCAAC	2	10	116522	116531	40 %	0 %	0 %	60 %	219847038
73	NC_011831	TCCAG	2	10	121099	121108	20 %	20 %	20 %	40 %	219847042
74	NC_011831	GCGTC	2	10	122667	122676	0 %	20 %	40 %	40 %	219847042
75	NC_011831	CACGT	2	10	122834	122843	20 %	20 %	20 %	40 %	219847042
76	NC_011831	CGTAG	2	10	123987	123996	20 %	20 %	40 %	20 %	219847044
77	NC_011831	GATGG	2	10	124145	124154	20 %	20 %	60 %	0 %	219847044
78	NC_011831	GCGCC	2	10	126076	126085	0 %	0 %	40 %	60 %	219847045
79	NC_011831	TCCCA	2	10	132708	132717	20 %	20 %	0 %	60 %	219847049
80	NC_011831	AGCGG	2	10	133280	133289	20 %	0 %	60 %	20 %	219847050
81	NC_011831	CTGAG	2	10	134580	134589	20 %	20 %	40 %	20 %	219847051
82	NC_011831	ATCGC	2	10	136747	136756	20 %	20 %	20 %	40 %	219847052
83	NC_011831	AATCG	2	10	137866	137875	40 %	20 %	20 %	20 %	219847052
84	NC_011831	GGCTT	2	10	139113	139122	0 %	40 %	40 %	20 %	219847053
85	NC_011831	GAAGA	2	10	139571	139580	60 %	0 %	40 %	0 %	219847054
86	NC_011831	CGTGC	2	10	140746	140755	0 %	20 %	40 %	40 %	219847055
87	NC_011831	GCACG	2	10	140832	140841	20 %	0 %	40 %	40 %	219847055
88	NC_011831	AGCCG	2	10	143257	143266	20 %	0 %	40 %	40 %	219847056
89	NC_011831	CTATT	2	10	148737	148746	20 %	60 %	0 %	20 %	219847060
90	NC_011831	GCTCA	2	10	149647	149656	20 %	20 %	20 %	40 %	219847061
91	NC_011831	CCCAA	2	10	151790	151799	40 %	0 %	0 %	60 %	219847062
92	NC_011831	GTCCG	2	10	152991	153000	0 %	20 %	40 %	40 %	219847063
93	NC_011831	TGGGC	2	10	153597	153606	0 %	20 %	60 %	20 %	219847063
94	NC_011831	TCATG	2	10	153741	153750	20 %	40 %	20 %	20 %	219847063
95	NC_011831	GCCAG	2	10	155252	155261	20 %	0 %	40 %	40 %	219847065
96	NC_011831	CGAGC	2	10	155851	155860	20 %	0 %	40 %	40 %	219847066
97	NC_011831	GGCCC	2	10	157654	157663	0 %	0 %	40 %	60 %	219847067
98	NC_011831	CGTGC	2	10	162511	162520	0 %	20 %	40 %	40 %	219847071
99	NC_011831	ACCCG	2	10	163701	163710	20 %	0 %	20 %	60 %	219847072
100	NC_011831	ATGGT	2	10	164019	164028	20 %	40 %	40 %	0 %	219847072
101	NC_011831	ACAGC	2	10	167873	167882	40 %	0 %	20 %	40 %	219847076
102	NC_011831	CACCG	2	10	169153	169162	20 %	0 %	20 %	60 %	219847077
103	NC_011831	TGCGC	2	10	170620	170629	0 %	20 %	40 %	40 %	219847077
104	NC_011831	CGAGC	2	10	170967	170976	20 %	0 %	40 %	40 %	219847077
105	NC_011831	TTGGG	2	10	173354	173363	0 %	40 %	60 %	0 %	219847080
106	NC_011831	CGGTA	2	10	177077	177086	20 %	20 %	40 %	20 %	219847083
107	NC_011831	CGAGG	2	10	181584	181593	20 %	0 %	60 %	20 %	219847086
108	NC_011831	TGATC	2	10	182796	182805	20 %	40 %	20 %	20 %	219847087
109	NC_011831	TAGGT	2	10	182991	183000	20 %	40 %	40 %	0 %	219847087
110	NC_011831	GGCGT	2	10	184077	184086	0 %	20 %	60 %	20 %	219847089
111	NC_011831	TTGCG	2	10	184132	184141	0 %	40 %	40 %	20 %	219847089
112	NC_011831	CGTTG	2	10	185935	185944	0 %	40 %	40 %	20 %	219847092
113	NC_011831	CGGAA	2	10	189080	189089	40 %	0 %	40 %	20 %	219847095
114	NC_011831	CAGCG	2	10	194105	194114	20 %	0 %	40 %	40 %	219847099
115	NC_011831	GGGTC	2	10	196501	196510	0 %	20 %	60 %	20 %	219847099
116	NC_011831	GCGTG	2	10	200983	200992	0 %	20 %	60 %	20 %	219847103
117	NC_011831	GCGGG	2	10	203902	203911	0 %	0 %	80 %	20 %	219847106
118	NC_011831	TCAGC	2	10	204291	204300	20 %	20 %	20 %	40 %	219847107
119	NC_011831	GCCCT	2	10	206689	206698	0 %	20 %	20 %	60 %	219847109
120	NC_011831	TGCGC	2	10	207017	207026	0 %	20 %	40 %	40 %	219847110
121	NC_011831	AGGAA	2	10	207115	207124	60 %	0 %	40 %	0 %	219847110
122	NC_011831	ACCAG	2	10	207341	207350	40 %	0 %	20 %	40 %	219847110
123	NC_011831	CACCG	2	10	209581	209590	20 %	0 %	20 %	60 %	219847113
124	NC_011831	GATCC	2	10	212047	212056	20 %	20 %	20 %	40 %	219847114
125	NC_011831	CTGGC	2	10	212418	212427	0 %	20 %	40 %	40 %	219847114
126	NC_011831	GTACC	2	10	214938	214947	20 %	20 %	20 %	40 %	219847115
127	NC_011831	TTACG	2	10	217759	217768	20 %	40 %	20 %	20 %	219847119
128	NC_011831	TGATC	2	10	218258	218267	20 %	40 %	20 %	20 %	219847119
129	NC_011831	TACCG	2	10	218958	218967	20 %	20 %	20 %	40 %	219847120
130	NC_011831	TCTGG	2	10	220842	220851	0 %	40 %	40 %	20 %	219847122
131	NC_011831	ACCCA	2	10	225221	225230	40 %	0 %	0 %	60 %	219847129
132	NC_011831	AGCAA	2	10	225461	225470	60 %	0 %	20 %	20 %	219847129
133	NC_011831	TTGGG	2	10	226408	226417	0 %	40 %	60 %	0 %	219847130
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141	NC_011831	CAGTG	2	10	235626	235635	20 %	20 %	40 %	20 %	219847140
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