MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 59472

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011831	TGT	3	9	299	307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219846957
2	NC_011831	AGG	2	6	356	361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219846957
3	NC_011831	TTG	2	6	376	381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219846957
4	NC_011831	GCG	2	6	475	480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219846957
5	NC_011831	CGC	2	6	678	683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846957
6	NC_011831	TGT	2	6	818	823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219846957
7	NC_011831	TCA	2	6	829	834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219846957
8	NC_011831	CAG	2	6	874	879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846957
9	NC_011831	TGC	2	6	917	922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846957
10	NC_011831	GAT	2	6	928	933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846957
11	NC_011831	CGG	2	6	1304	1309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219846957
12	NC_011831	CGG	2	6	1342	1347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219846957
13	NC_011831	TGG	2	6	1515	1520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219846957
14	NC_011831	ACC	2	6	1531	1536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219846957
15	NC_011831	ATG	2	6	1627	1632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846957
16	NC_011831	AAT	2	6	1782	1787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219846958
17	NC_011831	CCA	2	6	1833	1838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219846958
18	NC_011831	ACA	2	6	1864	1869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219846958
19	NC_011831	CAT	2	6	1937	1942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219846958
20	NC_011831	CCG	2	6	1976	1981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846958
21	NC_011831	CAA	2	6	1991	1996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219846958
22	NC_011831	TCG	2	6	1997	2002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846958
23	NC_011831	CGG	2	6	2024	2029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219846958
24	NC_011831	CGG	2	6	2039	2044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219846958
25	NC_011831	TAC	2	6	2070	2075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219846958
26	NC_011831	TTC	2	6	2127	2132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219846958
27	NC_011831	CGT	2	6	2171	2176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846958
28	NC_011831	GCC	2	6	2214	2219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846958
29	NC_011831	AAT	2	6	2238	2243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219846958
30	NC_011831	GCT	2	6	2263	2268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846958
31	NC_011831	AAT	2	6	2550	2555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219846958
32	NC_011831	CAC	2	6	2598	2603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219846958
33	NC_011831	TGA	2	6	2609	2614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846958
34	NC_011831	GCC	2	6	2616	2621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846958
35	NC_011831	TCA	2	6	2623	2628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219846958
36	NC_011831	GCC	2	6	2652	2657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846958
37	NC_011831	GCA	2	6	2692	2697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846958
38	NC_011831	CTT	2	6	2699	2704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219846958
39	NC_011831	GTC	2	6	2727	2732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846958
40	NC_011831	ATC	2	6	2746	2751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219846958
41	NC_011831	ATG	2	6	2758	2763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846958
42	NC_011831	CAG	3	9	2786	2794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846958
43	NC_011831	GTT	2	6	2906	2911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219846958
44	NC_011831	TGC	2	6	3054	3059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846958
45	NC_011831	GAG	2	6	3141	3146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219846958
46	NC_011831	AGC	2	6	3346	3351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846959
47	NC_011831	TCT	2	6	3355	3360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219846959
48	NC_011831	GCA	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846959
49	NC_011831	GTT	2	6	3454	3459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219846959
50	NC_011831	CGG	2	6	3675	3680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219846959
51	NC_011831	GCT	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846959
52	NC_011831	AAT	2	6	3752	3757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219846959
53	NC_011831	CCA	2	6	3878	3883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219846959
54	NC_011831	GGT	2	6	3905	3910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219846959
55	NC_011831	GGT	2	6	4028	4033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219846959
56	NC_011831	GGT	2	6	4199	4204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219846959
57	NC_011831	TAC	2	6	4240	4245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219846959
58	NC_011831	GGT	2	6	4316	4321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219846959
59	NC_011831	GGT	2	6	4396	4401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219846959
60	NC_011831	GTC	2	6	4430	4435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846960
61	NC_011831	GTC	2	6	4519	4524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846960
62	NC_011831	GTG	2	6	4537	4542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219846960
63	NC_011831	CCG	2	6	4617	4622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846960
64	NC_011831	CTC	2	6	4642	4647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219846960
65	NC_011831	ATC	2	6	4662	4667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219846960
66	NC_011831	GAT	2	6	4677	4682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846960
67	NC_011831	ACC	2	6	4700	4705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219846960
68	NC_011831	CTG	2	6	4770	4775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846960
69	NC_011831	TCA	2	6	4849	4854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219846960
70	NC_011831	TCG	2	6	5158	5163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846960
71	NC_011831	TGG	2	6	5198	5203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219846960
72	NC_011831	CTT	2	6	5241	5246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219846960
73	NC_011831	CGC	2	6	5249	5254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846960
74	NC_011831	CCA	2	6	5310	5315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219846960
75	NC_011831	ACA	2	6	5451	5456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219846961
76	NC_011831	CGC	2	6	5470	5475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846961
77	NC_011831	TCA	2	6	5533	5538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219846961
78	NC_011831	CTG	2	6	5561	5566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846961
79	NC_011831	CGA	2	6	5575	5580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846961
80	NC_011831	ACG	2	6	5622	5627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846961
81	NC_011831	TTA	2	6	5723	5728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219846961
82	NC_011831	GCT	2	6	5821	5826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846961
83	NC_011831	ACG	2	6	5962	5967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846961
84	NC_011831	CGA	2	6	5968	5973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846961
85	NC_011831	GTT	2	6	6014	6019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219846961
86	NC_011831	ACG	2	6	6259	6264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846961
87	NC_011831	GAA	2	6	6275	6280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219846961
88	NC_011831	CGC	2	6	6311	6316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846961
89	NC_011831	CGG	2	6	6317	6322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219846961
90	NC_011831	CCG	2	6	6437	6442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846961
91	NC_011831	CTC	2	6	6467	6472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219846961
92	NC_011831	GAG	2	6	6503	6508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219846961
93	NC_011831	TGA	3	9	6565	6573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846961
94	NC_011831	CGT	2	6	6649	6654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846961
95	NC_011831	GGT	2	6	6662	6667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219846961
96	NC_011831	GAT	2	6	6691	6696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846961
97	NC_011831	CAT	2	6	6746	6751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219846961
98	NC_011831	CCG	2	6	6888	6893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846961
99	NC_011831	GCC	2	6	6942	6947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846961
100	NC_011831	CAG	2	6	7062	7067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846962
101	NC_011831	CCA	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219846962
102	NC_011831	CGA	2	6	7121	7126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846962
103	NC_011831	CAG	2	6	7134	7139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846962
104	NC_011831	GCC	2	6	7185	7190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846962
105	NC_011831	ACG	2	6	7247	7252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846962
106	NC_011831	ATC	2	6	7288	7293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219846962
107	NC_011831	GAT	2	6	7302	7307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846962
108	NC_011831	CCG	2	6	7343	7348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846962
109	NC_011831	CAT	2	6	7459	7464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219846963
110	NC_011831	CCA	3	9	7499	7507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219846963
111	NC_011831	GAC	2	6	7585	7590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846963
112	NC_011831	TGA	2	6	7600	7605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846963
113	NC_011831	ATC	3	9	7963	7971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219846964
114	NC_011831	TCG	2	6	7984	7989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846964
115	NC_011831	GCT	2	6	8006	8011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846964
116	NC_011831	GAT	2	6	8177	8182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846964
117	NC_011831	ACG	2	6	8225	8230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846964
118	NC_011831	AGA	2	6	8246	8251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219846964
119	NC_011831	TAA	2	6	8432	8437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219846965
120	NC_011831	TGT	2	6	8626	8631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219846965
121	NC_011831	GGT	2	6	8657	8662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219846965
122	NC_011831	CTG	2	6	8793	8798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846965
123	NC_011831	TCT	2	6	8813	8818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219846965
124	NC_011831	GAT	2	6	8826	8831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846965
125	NC_011831	GAT	2	6	8913	8918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846965
126	NC_011831	TCA	2	6	8921	8926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219846965
127	NC_011831	GGT	2	6	9067	9072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219846965
128	NC_011831	TCA	2	6	9074	9079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219846965
129	NC_011831	CTG	2	6	9291	9296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846966
130	NC_011831	TCG	2	6	9336	9341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846966
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133	NC_011831	CGC	2	6	9384	9389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846966
134	NC_011831	TGA	2	6	9391	9396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846966
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136	NC_011831	ACC	2	6	9427	9432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219846966
137	NC_011831	CGC	2	6	9641	9646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846966
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151	NC_011831	GTG	2	6	10625	10630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219846966
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500	NC_011831	TGT	2	6	37237	37242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219846979

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