MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 82252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011831	AC	3	6	197997	198002	50 %	0 %	0 %	50 %	219847100
3502	NC_011831	GCG	2	6	198018	198023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847100
3503	NC_011831	GAG	2	6	198079	198084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219847100
3504	NC_011831	CGG	2	6	198185	198190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847100
3505	NC_011831	CGG	2	6	198252	198257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847100
3506	NC_011831	CTT	2	6	198333	198338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847100
3507	NC_011831	GCG	2	6	198409	198414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847100
3508	NC_011831	ACT	2	6	198457	198462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847100
3509	NC_011831	GGT	2	6	198621	198626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847100
3510	NC_011831	CGCT	2	8	198649	198656	0 %	25 %	25 %	50 %	219847100
3511	NC_011831	TCA	3	9	198662	198670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847100
3512	NC_011831	ATA	2	6	198700	198705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847100
3513	NC_011831	GGC	2	6	198906	198911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847101
3514	NC_011831	CGG	2	6	199008	199013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847101
3515	NC_011831	GT	3	6	199016	199021	0 %	50 %	50 %	0 %	219847101
3516	NC_011831	CAC	2	6	199037	199042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847101
3517	NC_011831	TTG	2	6	199051	199056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847101
3518	NC_011831	CGG	3	9	199070	199078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847101
3519	NC_011831	TTG	2	6	199095	199100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847101
3520	NC_011831	GTA	2	6	199617	199622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847102
3521	NC_011831	GAA	2	6	199652	199657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847102
3522	NC_011831	AAC	2	6	199798	199803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847102
3523	NC_011831	GGC	2	6	199808	199813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847102
3524	NC_011831	ATC	2	6	199846	199851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847102
3525	NC_011831	GCC	2	6	199924	199929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847102
3526	NC_011831	CGA	2	6	200025	200030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847102
3527	NC_011831	TGT	2	6	200032	200037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847102
3528	NC_011831	CGG	2	6	200120	200125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847102
3529	NC_011831	ACT	2	6	200205	200210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847102
3530	NC_011831	GTCT	2	8	200253	200260	0 %	50 %	25 %	25 %	219847102
3531	NC_011831	TTGAGC	2	12	200266	200277	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219847102
3532	NC_011831	CG	3	6	200313	200318	0 %	0 %	50 %	50 %	219847102
3533	NC_011831	ATC	2	6	200370	200375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847102
3534	NC_011831	CGT	2	6	200406	200411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847102
3535	NC_011831	GGT	2	6	200441	200446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847102
3536	NC_011831	GTG	2	6	200512	200517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847102
3537	NC_011831	CATG	2	8	200549	200556	25 %	25 %	25 %	25 %	219847102
3538	NC_011831	GAT	2	6	200603	200608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847103
3539	NC_011831	CCTT	2	8	200651	200658	0 %	50 %	0 %	50 %	219847103
3540	NC_011831	TGC	2	6	200664	200669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847103
3541	NC_011831	GC	3	6	200668	200673	0 %	0 %	50 %	50 %	219847103
3542	NC_011831	TAG	2	6	200736	200741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847103
3543	NC_011831	GGT	3	9	200791	200799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847103
3544	NC_011831	GCT	2	6	200824	200829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847103
3545	NC_011831	GCGTG	2	10	200983	200992	0 %	20 %	60 %	20 %	219847103
3546	NC_011831	CG	3	6	201045	201050	0 %	0 %	50 %	50 %	219847103
3547	NC_011831	CGGA	2	8	201057	201064	25 %	0 %	50 %	25 %	219847103
3548	NC_011831	GGC	2	6	201088	201093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847103
3549	NC_011831	GTT	2	6	201112	201117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847103
3550	NC_011831	GTT	2	6	201139	201144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847103
3551	NC_011831	GCC	2	6	201278	201283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847103
3552	NC_011831	TC	3	6	201286	201291	0 %	50 %	0 %	50 %	219847103
3553	NC_011831	GTT	2	6	201298	201303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847103
3554	NC_011831	GAC	2	6	201427	201432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847103
3555	NC_011831	GCTG	2	8	201520	201527	0 %	25 %	50 %	25 %	219847103
3556	NC_011831	GCCG	2	8	201538	201545	0 %	0 %	50 %	50 %	219847103
3557	NC_011831	TCG	2	6	201783	201788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847104
3558	NC_011831	GAA	2	6	201791	201796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847104
3559	NC_011831	GCT	2	6	201822	201827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847104
3560	NC_011831	TGG	2	6	201881	201886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847104
3561	NC_011831	GCC	2	6	201978	201983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847104
3562	NC_011831	CTT	2	6	201997	202002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847104
3563	NC_011831	AAT	2	6	202061	202066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847104
3564	NC_011831	TCC	2	6	202086	202091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847104
3565	NC_011831	GAA	2	6	202096	202101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847104
3566	NC_011831	ATGG	2	8	202522	202529	25 %	25 %	50 %	0 %	219847105
3567	NC_011831	GTG	2	6	202530	202535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847105
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3569	NC_011831	CG	3	6	202839	202844	0 %	0 %	50 %	50 %	219847105
3570	NC_011831	CGG	2	6	202851	202856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847105
3571	NC_011831	CGT	2	6	202857	202862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847105
3572	NC_011831	TTA	2	6	202868	202873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847105
3573	NC_011831	GCGA	2	8	202928	202935	25 %	0 %	50 %	25 %	219847105
3574	NC_011831	TTA	2	6	202948	202953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847105
3575	NC_011831	GTG	2	6	202981	202986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847105
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3580	NC_011831	TCG	2	6	203115	203120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847105
3581	NC_011831	TGC	2	6	203145	203150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847105
3582	NC_011831	CGG	2	6	203161	203166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847105
3583	NC_011831	TGCTCG	2	12	203175	203186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847105
3584	NC_011831	GCT	2	6	203197	203202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847105
3585	NC_011831	CGT	2	6	203216	203221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847105
3586	NC_011831	GCC	2	6	203226	203231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847105
3587	NC_011831	AACC	2	8	203239	203246	50 %	0 %	0 %	50 %	219847105
3588	NC_011831	CGA	2	6	203285	203290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847106
3589	NC_011831	GT	3	6	203361	203366	0 %	50 %	50 %	0 %	219847106
3590	NC_011831	GGTG	2	8	203410	203417	0 %	25 %	75 %	0 %	219847106
3591	NC_011831	CGG	2	6	203418	203423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847106
3592	NC_011831	CGT	2	6	203605	203610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847106
3593	NC_011831	GGC	2	6	203625	203630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847106
3594	NC_011831	CAC	2	6	203684	203689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847106
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3598	NC_011831	ATG	2	6	203761	203766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847106
3599	NC_011831	CAT	3	9	203781	203789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847106
3600	NC_011831	CAC	2	6	203800	203805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847106
3601	NC_011831	AGA	2	6	203822	203827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847106
3602	NC_011831	GCGGG	2	10	203902	203911	0 %	0 %	80 %	20 %	219847106
3603	NC_011831	ATA	2	6	203919	203924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847106
3604	NC_011831	TCG	2	6	203932	203937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847106
3605	NC_011831	TG	3	6	203963	203968	0 %	50 %	50 %	0 %	219847106
3606	NC_011831	TCA	2	6	203992	203997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847107
3607	NC_011831	GCA	2	6	204032	204037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847107
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3609	NC_011831	ACC	2	6	204113	204118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847107
3610	NC_011831	GCA	2	6	204153	204158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847107
3611	NC_011831	TCAGC	2	10	204291	204300	20 %	20 %	20 %	40 %	219847107
3612	NC_011831	CAG	2	6	204438	204443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847107
3613	NC_011831	CGT	2	6	204477	204482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847107
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3617	NC_011831	TGG	2	6	204599	204604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847108
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3619	NC_011831	TTC	2	6	204705	204710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847108
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3621	NC_011831	GAC	2	6	204897	204902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847108
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3623	NC_011831	GC	3	6	205036	205041	0 %	0 %	50 %	50 %	219847108
3624	NC_011831	GCA	2	6	205163	205168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847108
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3659	NC_011831	CG	3	6	206758	206763	0 %	0 %	50 %	50 %	219847109
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3730	NC_011831	TGA	2	6	210358	210363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847113
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3732	NC_011831	CGC	2	6	210495	210500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847113
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3739	NC_011831	TCACGA	2	12	210926	210937	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219847114
3740	NC_011831	ACG	2	6	210976	210981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847114
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3742	NC_011831	GCA	2	6	211069	211074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847114
3743	NC_011831	TTG	2	6	211099	211104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847114
3744	NC_011831	CTC	2	6	211192	211197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847114
3745	NC_011831	CTG	2	6	211294	211299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847114
3746	NC_011831	GAT	2	6	211323	211328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847114
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3748	NC_011831	GGT	2	6	211555	211560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847114
3749	NC_011831	CTG	2	6	211603	211608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847114
3750	NC_011831	CTG	2	6	211654	211659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847114
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3763	NC_011831	TTGG	2	8	212235	212242	0 %	50 %	50 %	0 %	219847114
3764	NC_011831	TTG	2	6	212245	212250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847114
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3785	NC_011831	GCT	2	6	213471	213476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847115
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3857	NC_011831	G	6	6	217313	217318	0 %	0 %	100 %	0 %	219847118
3858	NC_011831	AAC	2	6	217412	217417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847118
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3983	NC_011831	ATC	2	6	223241	223246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847125
3984	NC_011831	AGC	2	6	223256	223261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847125
3985	NC_011831	GGT	2	6	223368	223373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847125
3986	NC_011831	TCG	2	6	223405	223410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847125
3987	NC_011831	GAG	2	6	223459	223464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219847126
3988	NC_011831	CCGC	2	8	223493	223500	0 %	0 %	25 %	75 %	219847126
3989	NC_011831	GGCAGG	2	12	223503	223514	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	219847126
3990	NC_011831	CGC	3	9	223531	223539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847126
3991	NC_011831	GCC	2	6	223559	223564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847126
3992	NC_011831	TCGCCC	2	12	223581	223592	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	219847126
3993	NC_011831	CCTC	2	8	223597	223604	0 %	25 %	0 %	75 %	219847126
3994	NC_011831	CTG	2	6	223610	223615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847126
3995	NC_011831	CGC	3	9	223627	223635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847126
3996	NC_011831	GAC	2	6	223655	223660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847126
3997	NC_011831	GCC	2	6	223676	223681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847126
3998	NC_011831	C	7	7	223686	223692	0 %	0 %	0 %	100 %	219847126
3999	NC_011831	C	6	6	223697	223702	0 %	0 %	0 %	100 %	219847126
4000	NC_011831	CGC	3	9	223735	223743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847126

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