MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 82252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011831	TGGGG	2	10	85285	85294	0 %	20 %	80 %	0 %	219847014
1502	NC_011831	TGC	2	6	85348	85353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847014
1503	NC_011831	TGC	2	6	85464	85469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847014
1504	NC_011831	CAG	3	9	85616	85624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847014
1505	NC_011831	GC	3	6	85645	85650	0 %	0 %	50 %	50 %	219847014
1506	NC_011831	AGCG	2	8	85653	85660	25 %	0 %	50 %	25 %	219847014
1507	NC_011831	TGA	2	6	85663	85668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847014
1508	NC_011831	CGG	3	9	85671	85679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847014
1509	NC_011831	AAC	2	6	85681	85686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847014
1510	NC_011831	TGC	2	6	85701	85706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847014
1511	NC_011831	TGC	2	6	85720	85725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847014
1512	NC_011831	CAC	2	6	85735	85740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847014
1513	NC_011831	GAA	2	6	85746	85751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847014
1514	NC_011831	GGT	2	6	85952	85957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847015
1515	NC_011831	GCA	2	6	85967	85972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847015
1516	NC_011831	GT	3	6	86009	86014	0 %	50 %	50 %	0 %	219847015
1517	NC_011831	GCG	2	6	86150	86155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847015
1518	NC_011831	CAG	2	6	86210	86215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847015
1519	NC_011831	GCA	3	9	86261	86269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847015
1520	NC_011831	AAC	2	6	86297	86302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847015
1521	NC_011831	GC	3	6	86306	86311	0 %	0 %	50 %	50 %	219847015
1522	NC_011831	TGG	2	6	86313	86318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847015
1523	NC_011831	TGC	2	6	86368	86373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847015
1524	NC_011831	CG	3	6	86430	86435	0 %	0 %	50 %	50 %	219847015
1525	NC_011831	TGA	2	6	86467	86472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847015
1526	NC_011831	GCA	2	6	86572	86577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847016
1527	NC_011831	GATC	2	8	86601	86608	25 %	25 %	25 %	25 %	219847016
1528	NC_011831	CGG	2	6	86648	86653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847016
1529	NC_011831	ATCG	2	8	86674	86681	25 %	25 %	25 %	25 %	219847016
1530	NC_011831	TGC	2	6	86700	86705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847016
1531	NC_011831	ATT	2	6	86716	86721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847016
1532	NC_011831	TGT	2	6	86730	86735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847016
1533	NC_011831	TGA	2	6	86778	86783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847016
1534	NC_011831	TTGCCG	2	12	86809	86820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847016
1535	NC_011831	GGT	2	6	86947	86952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847016
1536	NC_011831	TGC	2	6	86960	86965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847016
1537	NC_011831	GTT	2	6	87004	87009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847016
1538	NC_011831	GGC	2	6	87029	87034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847016
1539	NC_011831	TAC	2	6	87050	87055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847016
1540	NC_011831	CAT	2	6	87126	87131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847016
1541	NC_011831	GAT	2	6	87171	87176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847016
1542	NC_011831	ATC	2	6	87193	87198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847016
1543	NC_011831	TGGT	2	8	87233	87240	0 %	50 %	50 %	0 %	219847016
1544	NC_011831	CGG	2	6	87294	87299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847016
1545	NC_011831	CA	3	6	87468	87473	50 %	0 %	0 %	50 %	219847017
1546	NC_011831	GTGC	2	8	87539	87546	0 %	25 %	50 %	25 %	219847017
1547	NC_011831	CAC	2	6	87554	87559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847017
1548	NC_011831	TCGATC	2	12	87563	87574	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219847017
1549	NC_011831	TGA	2	6	87669	87674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847017
1550	NC_011831	CGCAG	2	10	87710	87719	20 %	0 %	40 %	40 %	219847017
1551	NC_011831	GCT	2	6	87756	87761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847017
1552	NC_011831	CGC	2	6	87831	87836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847017
1553	NC_011831	GGT	2	6	87849	87854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847017
1554	NC_011831	ATC	2	6	87866	87871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847017
1555	NC_011831	CTG	2	6	87872	87877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847017
1556	NC_011831	CGC	2	6	87906	87911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847017
1557	NC_011831	TTGT	2	8	87931	87938	0 %	75 %	25 %	0 %	219847017
1558	NC_011831	TCA	2	6	87971	87976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847017
1559	NC_011831	GAA	2	6	87979	87984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847017
1560	NC_011831	GGT	2	6	88035	88040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847017
1561	NC_011831	ATT	2	6	88044	88049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847017
1562	NC_011831	CCGGCG	2	12	88096	88107	0 %	0 %	50 %	50 %	219847017
1563	NC_011831	TGC	2	6	88188	88193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847017
1564	NC_011831	ATC	2	6	88243	88248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847017
1565	NC_011831	CG	3	6	88262	88267	0 %	0 %	50 %	50 %	219847017
1566	NC_011831	GCAG	2	8	88305	88312	25 %	0 %	50 %	25 %	219847017
1567	NC_011831	ACC	2	6	88383	88388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847017
1568	NC_011831	GAA	2	6	88402	88407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847017
1569	NC_011831	GCGTTG	2	12	88417	88428	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	219847017
1570	NC_011831	CA	3	6	88431	88436	50 %	0 %	0 %	50 %	219847017
1571	NC_011831	GTG	2	6	88577	88582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847017
1572	NC_011831	GGT	2	6	88603	88608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847017
1573	NC_011831	GGGC	2	8	88657	88664	0 %	0 %	75 %	25 %	219847017
1574	NC_011831	ATC	2	6	88666	88671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847017
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1578	NC_011831	GGCT	2	8	88903	88910	0 %	25 %	50 %	25 %	219847018
1579	NC_011831	ATG	2	6	88924	88929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847018
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1581	NC_011831	GCA	2	6	89040	89045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847018
1582	NC_011831	ACA	2	6	89063	89068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847018
1583	NC_011831	CGA	2	6	89409	89414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847019
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1585	NC_011831	GTG	2	6	89455	89460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847019
1586	NC_011831	TCA	2	6	89522	89527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847019
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1588	NC_011831	TGA	2	6	89724	89729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847019
1589	NC_011831	CG	3	6	89757	89762	0 %	0 %	50 %	50 %	219847019
1590	NC_011831	AGA	2	6	89766	89771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847019
1591	NC_011831	CGC	2	6	89776	89781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847019
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1593	NC_011831	ACGA	2	8	90048	90055	50 %	0 %	25 %	25 %	219847020
1594	NC_011831	TGA	2	6	90137	90142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847020
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1597	NC_011831	GCG	2	6	90286	90291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847020
1598	NC_011831	TGA	2	6	90338	90343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847020
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1604	NC_011831	GCG	2	6	90857	90862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847021
1605	NC_011831	GTG	2	6	90885	90890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847021
1606	NC_011831	GTTG	2	8	90904	90911	0 %	50 %	50 %	0 %	219847021
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1616	NC_011831	CGCC	2	8	91556	91563	0 %	0 %	25 %	75 %	219847021
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1624	NC_011831	T	6	6	91942	91947	0 %	100 %	0 %	0 %	219847022
1625	NC_011831	AGGT	2	8	91949	91956	25 %	25 %	50 %	0 %	219847022
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1632	NC_011831	CGT	2	6	92277	92282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847022
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1991	NC_011831	CGA	2	6	112883	112888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847036
1992	NC_011831	GC	3	6	112913	112918	0 %	0 %	50 %	50 %	219847036
1993	NC_011831	CGG	2	6	112979	112984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847036
1994	NC_011831	GCT	2	6	113038	113043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847036
1995	NC_011831	CAG	2	6	113077	113082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847036
1996	NC_011831	CGG	2	6	113153	113158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847036
1997	NC_011831	ACG	2	6	113169	113174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847036
1998	NC_011831	CGC	2	6	113191	113196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847036
1999	NC_011831	CG	3	6	113283	113288	0 %	0 %	50 %	50 %	219847036
2000	NC_011831	TTG	2	6	113289	113294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847036

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