MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 82252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011831	GTG	2	6	56092	56097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219846990
1002	NC_011831	AGT	2	6	56156	56161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846990
1003	NC_011831	TGT	2	6	56218	56223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219846990
1004	NC_011831	ATC	2	6	56253	56258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219846990
1005	NC_011831	ACG	2	6	56335	56340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846990
1006	NC_011831	TGG	2	6	56393	56398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219846990
1007	NC_011831	TG	3	6	56453	56458	0 %	50 %	50 %	0 %	219846990
1008	NC_011831	TATCTT	2	12	56484	56495	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	219846990
1009	NC_011831	CATAT	2	10	56496	56505	40 %	40 %	0 %	20 %	219846990
1010	NC_011831	ACA	2	6	56612	56617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219846991
1011	NC_011831	GATCT	2	10	56626	56635	20 %	40 %	20 %	20 %	219846991
1012	NC_011831	CTG	2	6	56717	56722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846991
1013	NC_011831	CAG	2	6	56815	56820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846991
1014	NC_011831	CAG	2	6	56905	56910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846991
1015	NC_011831	CGG	2	6	56931	56936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219846991
1016	NC_011831	CAC	2	6	56949	56954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219846991
1017	NC_011831	CCG	2	6	56984	56989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846991
1018	NC_011831	GCC	2	6	57041	57046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846991
1019	NC_011831	CA	3	6	57132	57137	50 %	0 %	0 %	50 %	219846991
1020	NC_011831	ACG	2	6	57227	57232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846991
1021	NC_011831	TGA	2	6	57341	57346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846991
1022	NC_011831	TCG	2	6	57417	57422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846991
1023	NC_011831	GAG	2	6	57571	57576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219846991
1024	NC_011831	GAT	2	6	57616	57621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846991
1025	NC_011831	AGA	2	6	57668	57673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219846991
1026	NC_011831	CAA	2	6	57675	57680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219846991
1027	NC_011831	TGA	2	6	57705	57710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846991
1028	NC_011831	GCT	2	6	57740	57745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846991
1029	NC_011831	TGC	2	6	57835	57840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846991
1030	NC_011831	ACG	2	6	57887	57892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846991
1031	NC_011831	CGC	2	6	57898	57903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846991
1032	NC_011831	GAT	2	6	57907	57912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846991
1033	NC_011831	GTG	2	6	57975	57980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219846991
1034	NC_011831	GGA	2	6	57987	57992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219846991
1035	NC_011831	AT	3	6	58210	58215	50 %	50 %	0 %	0 %	219846992
1036	NC_011831	C	6	6	58257	58262	0 %	0 %	0 %	100 %	219846992
1037	NC_011831	GCA	2	6	58301	58306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846992
1038	NC_011831	AGG	2	6	58327	58332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219846992
1039	NC_011831	GGT	2	6	58333	58338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219846992
1040	NC_011831	CTC	2	6	58352	58357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219846992
1041	NC_011831	TG	3	6	58392	58397	0 %	50 %	50 %	0 %	219846992
1042	NC_011831	GT	3	6	58461	58466	0 %	50 %	50 %	0 %	219846992
1043	NC_011831	TGA	2	6	58483	58488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846992
1044	NC_011831	ACCG	2	8	58514	58521	25 %	0 %	25 %	50 %	219846992
1045	NC_011831	GT	4	8	58548	58555	0 %	50 %	50 %	0 %	219846992
1046	NC_011831	GCG	2	6	58582	58587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219846992
1047	NC_011831	ACG	2	6	58623	58628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846992
1048	NC_011831	GCA	2	6	58703	58708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846992
1049	NC_011831	CGT	2	6	58730	58735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846992
1050	NC_011831	G	6	6	58783	58788	0 %	0 %	100 %	0 %	219846992
1051	NC_011831	CCG	2	6	58831	58836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846992
1052	NC_011831	TTG	2	6	58875	58880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219846992
1053	NC_011831	CAG	2	6	58904	58909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846992
1054	NC_011831	TG	3	6	58916	58921	0 %	50 %	50 %	0 %	219846992
1055	NC_011831	GAT	2	6	58973	58978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846992
1056	NC_011831	GTC	2	6	59033	59038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846992
1057	NC_011831	CAC	2	6	59100	59105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219846992
1058	NC_011831	GCTT	2	8	59130	59137	0 %	50 %	25 %	25 %	219846992
1059	NC_011831	TGC	2	6	59182	59187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846992
1060	NC_011831	GC	3	6	59221	59226	0 %	0 %	50 %	50 %	219846992
1061	NC_011831	TCT	2	6	59284	59289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219846992
1062	NC_011831	CCA	2	6	59305	59310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219846992
1063	NC_011831	TG	3	6	59321	59326	0 %	50 %	50 %	0 %	219846992
1064	NC_011831	GTC	2	6	59361	59366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846992
1065	NC_011831	GTG	2	6	59457	59462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219846992
1066	NC_011831	GGT	2	6	59503	59508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219846992
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1070	NC_011831	GTC	2	6	59667	59672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846993
1071	NC_011831	TGG	2	6	59712	59717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219846993
1072	NC_011831	TACC	2	8	59752	59759	25 %	25 %	0 %	50 %	219846993
1073	NC_011831	CCTTG	2	10	59767	59776	0 %	40 %	20 %	40 %	219846993
1074	NC_011831	ACC	2	6	59809	59814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219846993
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1080	NC_011831	GCC	2	6	60050	60055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846993
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1082	NC_011831	GTC	2	6	60086	60091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846993
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1085	NC_011831	GCAG	2	8	60298	60305	25 %	0 %	50 %	25 %	219846993
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1087	NC_011831	GC	3	6	60394	60399	0 %	0 %	50 %	50 %	219846993
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1093	NC_011831	TTG	2	6	60746	60751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219846993
1094	NC_011831	GCC	2	6	60976	60981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846994
1095	NC_011831	CACAC	2	10	60991	61000	40 %	0 %	0 %	60 %	219846994
1096	NC_011831	AC	3	6	61003	61008	50 %	0 %	0 %	50 %	219846994
1097	NC_011831	CAC	2	6	61069	61074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219846994
1098	NC_011831	CGG	2	6	61080	61085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219846994
1099	NC_011831	TCG	2	6	61125	61130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846994
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1103	NC_011831	GT	3	6	61430	61435	0 %	50 %	50 %	0 %	219846994
1104	NC_011831	GC	3	6	61448	61453	0 %	0 %	50 %	50 %	219846994
1105	NC_011831	GAT	2	6	61477	61482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846994
1106	NC_011831	GGTC	2	8	61684	61691	0 %	25 %	50 %	25 %	219846995
1107	NC_011831	CAT	2	6	61699	61704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219846995
1108	NC_011831	CAC	2	6	62614	62619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219846996
1109	NC_011831	TCG	2	6	62640	62645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846996
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1111	NC_011831	CGC	2	6	62735	62740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846996
1112	NC_011831	GCA	2	6	62859	62864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846996
1113	NC_011831	TCG	2	6	62874	62879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846996
1114	NC_011831	CTT	3	9	62882	62890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219846996
1115	NC_011831	AGC	2	6	62922	62927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846996
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1117	NC_011831	GCTC	2	8	62986	62993	0 %	25 %	25 %	50 %	219846996
1118	NC_011831	GGCC	2	8	63058	63065	0 %	0 %	50 %	50 %	219846996
1119	NC_011831	TCA	2	6	63123	63128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219846996
1120	NC_011831	CG	3	6	63168	63173	0 %	0 %	50 %	50 %	219846996
1121	NC_011831	ATA	2	6	63174	63179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219846996
1122	NC_011831	CGG	2	6	63202	63207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219846996
1123	NC_011831	CCA	2	6	63220	63225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219846996
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1125	NC_011831	CCCA	2	8	63263	63270	25 %	0 %	0 %	75 %	219846996
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1500	NC_011831	ACG	2	6	85192	85197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847014

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