MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 82252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011831	GTGC	2	8	26805	26812	0 %	25 %	50 %	25 %	219846971
502	NC_011831	TCCAT	2	10	26827	26836	20 %	40 %	0 %	40 %	219846971
503	NC_011831	GTC	2	6	27175	27180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846972
504	NC_011831	CGA	2	6	27181	27186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846972
505	NC_011831	GCC	2	6	27249	27254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846972
506	NC_011831	GCG	2	6	27330	27335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219846972
507	NC_011831	TTC	2	6	27374	27379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219846972
508	NC_011831	GGC	3	9	27386	27394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219846972
509	NC_011831	CG	3	6	27453	27458	0 %	0 %	50 %	50 %	219846972
510	NC_011831	ACC	2	6	27485	27490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219846972
511	NC_011831	CCA	2	6	27520	27525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219846972
512	NC_011831	GC	3	6	27601	27606	0 %	0 %	50 %	50 %	219846972
513	NC_011831	GCCG	2	8	27634	27641	0 %	0 %	50 %	50 %	219846972
514	NC_011831	TTCA	2	8	27665	27672	25 %	50 %	0 %	25 %	219846972
515	NC_011831	GCC	2	6	27771	27776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846972
516	NC_011831	ACT	2	6	27946	27951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219846973
517	NC_011831	ACG	2	6	28091	28096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846973
518	NC_011831	TGA	2	6	28125	28130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846973
519	NC_011831	CGA	2	6	28188	28193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846973
520	NC_011831	CTTA	2	8	28204	28211	25 %	50 %	0 %	25 %	219846973
521	NC_011831	GTA	2	6	28291	28296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846973
522	NC_011831	TCG	2	6	28322	28327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846973
523	NC_011831	CGG	2	6	28383	28388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219846973
524	NC_011831	TCT	2	6	28425	28430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219846973
525	NC_011831	TGA	2	6	28504	28509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846973
526	NC_011831	TCG	2	6	28568	28573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846973
527	NC_011831	GAT	2	6	28587	28592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846973
528	NC_011831	TAG	2	6	28599	28604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846973
529	NC_011831	ATA	2	6	28607	28612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219846973
530	NC_011831	GCA	2	6	28747	28752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846974
531	NC_011831	TTTAG	2	10	28767	28776	20 %	60 %	20 %	0 %	219846974
532	NC_011831	ATA	2	6	28803	28808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219846974
533	NC_011831	CGG	2	6	28813	28818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219846974
534	NC_011831	GGT	2	6	28858	28863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219846974
535	NC_011831	GATC	2	8	28876	28883	25 %	25 %	25 %	25 %	219846974
536	NC_011831	GCCAG	2	10	28906	28915	20 %	0 %	40 %	40 %	219846974
537	NC_011831	CGA	2	6	28918	28923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846974
538	NC_011831	TTG	2	6	28998	29003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219846974
539	NC_011831	TTC	2	6	29027	29032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219846974
540	NC_011831	AGC	2	6	29063	29068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846974
541	NC_011831	CGT	2	6	29110	29115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846974
542	NC_011831	GAGC	2	8	29155	29162	25 %	0 %	50 %	25 %	219846974
543	NC_011831	GC	3	6	29180	29185	0 %	0 %	50 %	50 %	219846974
544	NC_011831	ACGA	2	8	29207	29214	50 %	0 %	25 %	25 %	219846974
545	NC_011831	GTC	2	6	29223	29228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846974
546	NC_011831	GT	3	6	29251	29256	0 %	50 %	50 %	0 %	219846974
547	NC_011831	CGG	2	6	29437	29442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219846974
548	NC_011831	GCA	2	6	29472	29477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846974
549	NC_011831	CATG	2	8	29775	29782	25 %	25 %	25 %	25 %	219846975
550	NC_011831	GAT	2	6	29786	29791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846975
551	NC_011831	GGC	2	6	29806	29811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219846975
552	NC_011831	CCA	2	6	29904	29909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219846975
553	NC_011831	GTGG	2	8	29999	30006	0 %	25 %	75 %	0 %	219846975
554	NC_011831	CGG	2	6	30162	30167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219846975
555	NC_011831	GCC	2	6	30203	30208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846975
556	NC_011831	GT	3	6	30240	30245	0 %	50 %	50 %	0 %	219846975
557	NC_011831	CG	3	6	30255	30260	0 %	0 %	50 %	50 %	219846975
558	NC_011831	GCC	2	6	30281	30286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846975
559	NC_011831	AC	3	6	30426	30431	50 %	0 %	0 %	50 %	219846975
560	NC_011831	GGT	2	6	30434	30439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219846975
561	NC_011831	CAA	2	6	30527	30532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219846975
562	NC_011831	TTC	2	6	30593	30598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219846975
563	NC_011831	GCCG	2	8	30637	30644	0 %	0 %	50 %	50 %	219846975
564	NC_011831	GGA	2	6	30660	30665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219846975
565	NC_011831	CCG	2	6	30684	30689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219846975
566	NC_011831	TGC	2	6	30781	30786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846975
567	NC_011831	GGTT	2	8	30787	30794	0 %	50 %	50 %	0 %	219846975
568	NC_011831	ATC	2	6	31009	31014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219846976
569	NC_011831	GTC	2	6	31059	31064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846976
570	NC_011831	CAG	2	6	31105	31110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846976
571	NC_011831	CCGATC	2	12	31133	31144	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219846976
572	NC_011831	ATC	2	6	31228	31233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219846976
573	NC_011831	CCAA	2	8	31243	31250	50 %	0 %	0 %	50 %	219846976
574	NC_011831	GTC	2	6	31264	31269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846976
575	NC_011831	GT	3	6	31286	31291	0 %	50 %	50 %	0 %	219846976
576	NC_011831	GTG	2	6	31355	31360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219846976
577	NC_011831	TGA	3	9	31440	31448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846976
578	NC_011831	GCT	2	6	31507	31512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846976
579	NC_011831	CGAA	2	8	31516	31523	50 %	0 %	25 %	25 %	219846976
580	NC_011831	GAA	2	6	31566	31571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219846976
581	NC_011831	CGT	2	6	31623	31628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846976
582	NC_011831	ATGCG	2	10	31631	31640	20 %	20 %	40 %	20 %	219846976
583	NC_011831	GTTG	2	8	31793	31800	0 %	50 %	50 %	0 %	219846977
584	NC_011831	AGA	2	6	31826	31831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219846977
585	NC_011831	CGACGG	2	12	31882	31893	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219846977
586	NC_011831	ACGGCG	2	12	31956	31967	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219846977
587	NC_011831	GGCT	2	8	32045	32052	0 %	25 %	50 %	25 %	219846977
588	NC_011831	AGC	2	6	32116	32121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846977
589	NC_011831	CTG	2	6	32127	32132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846977
590	NC_011831	GTT	2	6	32176	32181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219846977
591	NC_011831	GCT	2	6	32198	32203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846977
592	NC_011831	CCGGCA	2	12	32208	32219	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	219846977
593	NC_011831	CGA	2	6	32299	32304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846977
594	NC_011831	CT	3	6	32328	32333	0 %	50 %	0 %	50 %	219846977
595	NC_011831	CGA	2	6	32374	32379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846977
596	NC_011831	GCTC	2	8	32451	32458	0 %	25 %	25 %	50 %	219846977
597	NC_011831	GCCG	2	8	32495	32502	0 %	0 %	50 %	50 %	219846977
598	NC_011831	CAC	2	6	32506	32511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219846977
599	NC_011831	GAC	2	6	32573	32578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846977
600	NC_011831	GGT	2	6	32769	32774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219846977
601	NC_011831	TGA	2	6	32858	32863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846977
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603	NC_011831	GTC	2	6	33099	33104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846977
604	NC_011831	TGG	2	6	33127	33132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219846977
605	NC_011831	GAT	2	6	33177	33182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846977
606	NC_011831	TGG	2	6	33223	33228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219846977
607	NC_011831	CGACGC	2	12	33295	33306	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	219846977
608	NC_011831	GAC	3	9	33338	33346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846977
609	NC_011831	CGG	2	6	33352	33357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219846977
610	NC_011831	ACGGCA	2	12	33366	33377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219846977
611	NC_011831	CGTTAC	2	12	33424	33435	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219846977
612	NC_011831	TTGG	2	8	33472	33479	0 %	50 %	50 %	0 %	219846977
613	NC_011831	GAGT	2	8	33572	33579	25 %	25 %	50 %	0 %	219846977
614	NC_011831	GTC	2	6	33631	33636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846977
615	NC_011831	TGG	2	6	33659	33664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219846977
616	NC_011831	TGA	2	6	33665	33670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846977
617	NC_011831	CCA	2	6	33961	33966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219846978
618	NC_011831	TCG	2	6	34046	34051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219846978
619	NC_011831	GTG	2	6	34071	34076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219846978
620	NC_011831	GTT	2	6	34077	34082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219846978
621	NC_011831	AAG	2	6	34130	34135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219846978
622	NC_011831	GTA	2	6	34187	34192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219846978
623	NC_011831	AACA	2	8	34238	34245	75 %	0 %	0 %	25 %	219846978
624	NC_011831	AAG	2	6	34402	34407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219846978
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626	NC_011831	GGC	2	6	34444	34449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219846978
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