MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 82252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011831	GGAT	2	8	337754	337761	25 %	25 %	50 %	0 %	219847217
6002	NC_011831	GCC	2	6	337783	337788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847217
6003	NC_011831	GGT	2	6	337852	337857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847217
6004	NC_011831	GC	4	8	337865	337872	0 %	0 %	50 %	50 %	219847217
6005	NC_011831	GCC	2	6	337874	337879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847217
6006	NC_011831	GC	3	6	337903	337908	0 %	0 %	50 %	50 %	219847217
6007	NC_011831	TCG	2	6	337913	337918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847217
6008	NC_011831	TCT	2	6	337932	337937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847217
6009	NC_011831	AACA	2	8	337975	337982	75 %	0 %	0 %	25 %	219847217
6010	NC_011831	GGCATT	2	12	338065	338076	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219847217
6011	NC_011831	CAC	2	6	338089	338094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847217
6012	NC_011831	TGG	2	6	338163	338168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847217
6013	NC_011831	CCGCTG	2	12	338175	338186	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	219847217
6014	NC_011831	ACC	2	6	338204	338209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847217
6015	NC_011831	TCG	2	6	338219	338224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847217
6016	NC_011831	CTG	2	6	338256	338261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847217
6017	NC_011831	CG	3	6	338271	338276	0 %	0 %	50 %	50 %	219847217
6018	NC_011831	CTC	2	6	338321	338326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847218
6019	NC_011831	GTC	2	6	338431	338436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847218
6020	NC_011831	TC	3	6	338444	338449	0 %	50 %	0 %	50 %	219847218
6021	NC_011831	CAC	2	6	338460	338465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847218
6022	NC_011831	TCGG	2	8	338493	338500	0 %	25 %	50 %	25 %	219847218
6023	NC_011831	GAA	2	6	338525	338530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847218
6024	NC_011831	TGAA	2	8	338532	338539	50 %	25 %	25 %	0 %	219847218
6025	NC_011831	ACAA	2	8	338564	338571	75 %	0 %	0 %	25 %	219847218
6026	NC_011831	CAC	2	6	338653	338658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847218
6027	NC_011831	TCG	3	9	338769	338777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847218
6028	NC_011831	GGCG	2	8	338824	338831	0 %	0 %	75 %	25 %	219847218
6029	NC_011831	CGA	2	6	338843	338848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847218
6030	NC_011831	GTG	2	6	338923	338928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847218
6031	NC_011831	CAC	2	6	338941	338946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847218
6032	NC_011831	ATG	2	6	339282	339287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847219
6033	NC_011831	CTGCG	2	10	339364	339373	0 %	20 %	40 %	40 %	219847219
6034	NC_011831	ACC	2	6	339413	339418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847219
6035	NC_011831	CCA	2	6	339453	339458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847219
6036	NC_011831	ATG	2	6	339470	339475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847219
6037	NC_011831	GAT	2	6	339505	339510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847219
6038	NC_011831	GTGC	2	8	339515	339522	0 %	25 %	50 %	25 %	219847219
6039	NC_011831	CTG	2	6	339550	339555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847219
6040	NC_011831	GCT	2	6	339573	339578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847219
6041	NC_011831	GC	3	6	339585	339590	0 %	0 %	50 %	50 %	219847219
6042	NC_011831	TGT	2	6	339665	339670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847219
6043	NC_011831	GAGCT	2	10	339715	339724	20 %	20 %	40 %	20 %	219847219
6044	NC_011831	CTT	2	6	339759	339764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847219
6045	NC_011831	GTT	2	6	339813	339818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847219
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6047	NC_011831	GTT	2	6	339875	339880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847219
6048	NC_011831	GGATT	2	10	339900	339909	20 %	40 %	40 %	0 %	219847219
6049	NC_011831	TACA	2	8	339943	339950	50 %	25 %	0 %	25 %	219847219
6050	NC_011831	CGAG	2	8	339954	339961	25 %	0 %	50 %	25 %	219847219
6051	NC_011831	TAGC	2	8	339972	339979	25 %	25 %	25 %	25 %	219847219
6052	NC_011831	AAT	2	6	340045	340050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847219
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6055	NC_011831	CAG	2	6	340198	340203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847219
6056	NC_011831	CAA	2	6	340225	340230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847219
6057	NC_011831	CCG	2	6	340287	340292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847219
6058	NC_011831	AGA	2	6	340305	340310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847219
6059	NC_011831	CGTC	2	8	340335	340342	0 %	25 %	25 %	50 %	219847219
6060	NC_011831	GATG	2	8	340346	340353	25 %	25 %	50 %	0 %	219847219
6061	NC_011831	TGC	2	6	340355	340360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847219
6062	NC_011831	CTT	2	6	340425	340430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847220
6063	NC_011831	AGAT	2	8	340482	340489	50 %	25 %	25 %	0 %	219847220
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6065	NC_011831	GCT	2	6	340605	340610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847220
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6069	NC_011831	CGATGG	2	12	340753	340764	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219847220
6070	NC_011831	CTGA	2	8	340777	340784	25 %	25 %	25 %	25 %	219847220
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6074	NC_011831	CTC	2	6	341048	341053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847220
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6085	NC_011831	TGC	2	6	341849	341854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847221
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6087	NC_011831	CAG	2	6	341914	341919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847221
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6089	NC_011831	ACC	2	6	342080	342085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847221
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6095	NC_011831	C	6	6	342398	342403	0 %	0 %	0 %	100 %	219847221
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6101	NC_011831	ATA	2	6	342602	342607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847222
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6109	NC_011831	CGA	2	6	342854	342859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847222
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6116	NC_011831	CG	3	6	343146	343151	0 %	0 %	50 %	50 %	219847222
6117	NC_011831	GCA	2	6	343164	343169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847222
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6121	NC_011831	TTTC	2	8	343795	343802	0 %	75 %	0 %	25 %	219847223
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6353	NC_011831	CCGA	2	8	357892	357899	25 %	0 %	25 %	50 %	219847238
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6474	NC_011831	TAC	2	6	363979	363984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847242
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6485	NC_011831	AAC	2	6	364501	364506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847242
6486	NC_011831	ACTA	2	8	364511	364518	50 %	25 %	0 %	25 %	219847242
6487	NC_011831	GGC	2	6	364541	364546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847242
6488	NC_011831	CGT	2	6	364587	364592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847242
6489	NC_011831	TAA	2	6	364666	364671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847242
6490	NC_011831	GTGGC	2	10	364701	364710	0 %	20 %	60 %	20 %	219847242
6491	NC_011831	GAC	3	9	364741	364749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847242
6492	NC_011831	GTG	2	6	364770	364775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847242
6493	NC_011831	C	6	6	364793	364798	0 %	0 %	0 %	100 %	219847242
6494	NC_011831	GCA	2	6	364860	364865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847242
6495	NC_011831	TGT	2	6	364894	364899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847242
6496	NC_011831	CTA	2	6	364915	364920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847242
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6498	NC_011831	CTT	2	6	364948	364953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847242
6499	NC_011831	CAA	2	6	364960	364965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847242
6500	NC_011831	CCG	2	6	364974	364979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847242

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