MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 82252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_011831	ACC	3	9	310186	310194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847197
5503	NC_011831	GAT	2	6	310200	310205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847197
5504	NC_011831	ACG	2	6	310256	310261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847197
5505	NC_011831	TGA	2	6	310358	310363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847197
5506	NC_011831	TCAGC	2	10	310392	310401	20 %	20 %	20 %	40 %	219847197
5507	NC_011831	ATCG	2	8	310410	310417	25 %	25 %	25 %	25 %	219847197
5508	NC_011831	TCGTA	2	10	310490	310499	20 %	40 %	20 %	20 %	219847197
5509	NC_011831	GTG	2	6	310502	310507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847197
5510	NC_011831	CGG	2	6	310533	310538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847197
5511	NC_011831	GGC	2	6	310751	310756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847197
5512	NC_011831	AACG	2	8	310777	310784	50 %	0 %	25 %	25 %	219847197
5513	NC_011831	GTC	2	6	310792	310797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847197
5514	NC_011831	GATC	2	8	310905	310912	25 %	25 %	25 %	25 %	219847197
5515	NC_011831	GAC	2	6	310978	310983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847197
5516	NC_011831	TGA	2	6	311043	311048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847197
5517	NC_011831	GAA	2	6	311088	311093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847197
5518	NC_011831	AAG	2	6	311110	311115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847197
5519	NC_011831	AGC	2	6	311142	311147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847197
5520	NC_011831	T	6	6	311185	311190	0 %	100 %	0 %	0 %	219847197
5521	NC_011831	TAC	2	6	311368	311373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847198
5522	NC_011831	TCA	2	6	311391	311396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847198
5523	NC_011831	CGG	2	6	311423	311428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847198
5524	NC_011831	TCA	3	9	311606	311614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847198
5525	NC_011831	CTT	2	6	311676	311681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847198
5526	NC_011831	GCCG	2	8	311683	311690	0 %	0 %	50 %	50 %	219847198
5527	NC_011831	TGG	2	6	311753	311758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847198
5528	NC_011831	CGG	2	6	311778	311783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847198
5529	NC_011831	ACG	2	6	311836	311841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847198
5530	NC_011831	GGT	2	6	311903	311908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847198
5531	NC_011831	CGTAA	2	10	311969	311978	40 %	20 %	20 %	20 %	219847198
5532	NC_011831	TCC	2	6	311983	311988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847198
5533	NC_011831	ACC	2	6	312032	312037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847198
5534	NC_011831	GAT	2	6	312117	312122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847198
5535	NC_011831	C	6	6	312140	312145	0 %	0 %	0 %	100 %	219847198
5536	NC_011831	CGAG	2	8	312180	312187	25 %	0 %	50 %	25 %	219847198
5537	NC_011831	CAG	2	6	312231	312236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847198
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5539	NC_011831	ATT	2	6	312343	312348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847198
5540	NC_011831	A	6	6	312493	312498	100 %	0 %	0 %	0 %	219847198
5541	NC_011831	G	6	6	312516	312521	0 %	0 %	100 %	0 %	219847198
5542	NC_011831	CAG	2	6	312522	312527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847198
5543	NC_011831	AGA	2	6	312539	312544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847198
5544	NC_011831	CGTT	2	8	312554	312561	0 %	50 %	25 %	25 %	219847198
5545	NC_011831	AGC	2	6	312577	312582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847198
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5547	NC_011831	GGA	2	6	312666	312671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219847198
5548	NC_011831	CGT	2	6	312902	312907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847198
5549	NC_011831	GTG	2	6	312909	312914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847198
5550	NC_011831	CAA	2	6	312930	312935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847198
5551	NC_011831	GCC	2	6	312971	312976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847198
5552	NC_011831	TAT	2	6	312996	313001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847198
5553	NC_011831	AAACT	2	10	313013	313022	60 %	20 %	0 %	20 %	219847198
5554	NC_011831	AC	3	6	313032	313037	50 %	0 %	0 %	50 %	219847198
5555	NC_011831	TTG	2	6	313042	313047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847198
5556	NC_011831	TCG	2	6	313065	313070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847198
5557	NC_011831	GTT	2	6	313125	313130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847198
5558	NC_011831	ACT	2	6	313132	313137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847198
5559	NC_011831	TGA	2	6	313173	313178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847198
5560	NC_011831	TCG	2	6	313184	313189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847198
5561	NC_011831	ATC	2	6	313205	313210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847198
5562	NC_011831	GTT	2	6	313263	313268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847198
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5564	NC_011831	TTCT	2	8	313294	313301	0 %	75 %	0 %	25 %	219847198
5565	NC_011831	TGC	2	6	313328	313333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847198
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5574	NC_011831	A	6	6	313845	313850	100 %	0 %	0 %	0 %	219847198
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5589	NC_011831	TGC	2	6	314881	314886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847200
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5591	NC_011831	CTCGGT	2	12	314968	314979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847200
5592	NC_011831	ATC	2	6	314987	314992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847200
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5594	NC_011831	CCGC	2	8	315213	315220	0 %	0 %	25 %	75 %	219847200
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5602	NC_011831	ACC	2	6	315544	315549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847200
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5607	NC_011831	GCC	2	6	315725	315730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847200
5608	NC_011831	CGGT	2	8	315779	315786	0 %	25 %	50 %	25 %	219847200
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5610	NC_011831	TGGG	2	8	315958	315965	0 %	25 %	75 %	0 %	219847200
5611	NC_011831	AGT	2	6	316062	316067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847200
5612	NC_011831	CTGA	2	8	316072	316079	25 %	25 %	25 %	25 %	219847200
5613	NC_011831	ATC	2	6	316135	316140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847200
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5616	NC_011831	CGGG	2	8	316297	316304	0 %	0 %	75 %	25 %	219847201
5617	NC_011831	GCA	2	6	316326	316331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847201
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5621	NC_011831	ACCC	2	8	316454	316461	25 %	0 %	0 %	75 %	219847201
5622	NC_011831	AAGTT	2	10	316488	316497	40 %	40 %	20 %	0 %	219847201
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5625	NC_011831	GTC	2	6	316636	316641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847201
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5744	NC_011831	TCA	2	6	322720	322725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847206
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5858	NC_011831	CCA	2	6	328631	328636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847209
5859	NC_011831	ATCG	2	8	328665	328672	25 %	25 %	25 %	25 %	219847209
5860	NC_011831	TCGTAG	2	12	328678	328689	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219847209
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