MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 82252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011831	TGG	2	6	254232	254237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847154
4502	NC_011831	TCA	2	6	254366	254371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847154
4503	NC_011831	ATT	2	6	254388	254393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847154
4504	NC_011831	AGC	2	6	254439	254444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847154
4505	NC_011831	TCG	2	6	254479	254484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847154
4506	NC_011831	TGC	2	6	254497	254502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847154
4507	NC_011831	ACG	2	6	254507	254512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847154
4508	NC_011831	ATGG	2	8	254516	254523	25 %	25 %	50 %	0 %	219847154
4509	NC_011831	CAA	2	6	254642	254647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847154
4510	NC_011831	CTC	2	6	254760	254765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847154
4511	NC_011831	AGC	2	6	254952	254957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847155
4512	NC_011831	CGC	2	6	255008	255013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847155
4513	NC_011831	CCAA	2	8	255019	255026	50 %	0 %	0 %	50 %	219847155
4514	NC_011831	CGA	2	6	255156	255161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847155
4515	NC_011831	TGA	2	6	255166	255171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847155
4516	NC_011831	TTC	2	6	255188	255193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847155
4517	NC_011831	TCGGTG	2	12	255216	255227	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	219847155
4518	NC_011831	CTG	2	6	255318	255323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847155
4519	NC_011831	GTC	2	6	255351	255356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847155
4520	NC_011831	ACT	2	6	255365	255370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847155
4521	NC_011831	CAG	2	6	255497	255502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847155
4522	NC_011831	GC	3	6	255561	255566	0 %	0 %	50 %	50 %	219847155
4523	NC_011831	GCA	2	6	255598	255603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847155
4524	NC_011831	GGT	2	6	255708	255713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847155
4525	NC_011831	GCA	2	6	255759	255764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847155
4526	NC_011831	GTA	2	6	255783	255788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847155
4527	NC_011831	CG	3	6	255796	255801	0 %	0 %	50 %	50 %	219847155
4528	NC_011831	ATC	2	6	255911	255916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847155
4529	NC_011831	ACC	2	6	255957	255962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847155
4530	NC_011831	CGA	2	6	256065	256070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847155
4531	NC_011831	AGC	2	6	256274	256279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847155
4532	NC_011831	AAT	2	6	256349	256354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847155
4533	NC_011831	CGG	2	6	256368	256373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847155
4534	NC_011831	TCC	2	6	256406	256411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847155
4535	NC_011831	TGCC	2	8	256466	256473	0 %	25 %	25 %	50 %	219847155
4536	NC_011831	GC	3	6	256475	256480	0 %	0 %	50 %	50 %	219847155
4537	NC_011831	GGT	2	6	256497	256502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847155
4538	NC_011831	TCG	2	6	256503	256508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847155
4539	NC_011831	CGGG	2	8	256583	256590	0 %	0 %	75 %	25 %	219847155
4540	NC_011831	CAA	2	6	256607	256612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847155
4541	NC_011831	CAA	2	6	256619	256624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847155
4542	NC_011831	TGA	2	6	256712	256717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847155
4543	NC_011831	CAA	2	6	256774	256779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847155
4544	NC_011831	CGG	2	6	256846	256851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847156
4545	NC_011831	GCC	2	6	256889	256894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847156
4546	NC_011831	AGC	2	6	256939	256944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847156
4547	NC_011831	TCA	2	6	256949	256954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847156
4548	NC_011831	CGG	2	6	256976	256981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847156
4549	NC_011831	CAC	2	6	256983	256988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847156
4550	NC_011831	AATCA	2	10	256993	257002	60 %	20 %	0 %	20 %	219847156
4551	NC_011831	TGG	2	6	257025	257030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847156
4552	NC_011831	CG	3	6	257073	257078	0 %	0 %	50 %	50 %	219847156
4553	NC_011831	CGG	2	6	257085	257090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847156
4554	NC_011831	TGT	2	6	257109	257114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847156
4555	NC_011831	ACC	2	6	257115	257120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847156
4556	NC_011831	ACT	2	6	257183	257188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847156
4557	NC_011831	ATC	2	6	257297	257302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847156
4558	NC_011831	CCG	2	6	257316	257321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847157
4559	NC_011831	CTG	2	6	257477	257482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847157
4560	NC_011831	GATC	2	8	257528	257535	25 %	25 %	25 %	25 %	219847157
4561	NC_011831	GAC	2	6	257675	257680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847157
4562	NC_011831	AAG	2	6	257725	257730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847157
4563	NC_011831	TGC	2	6	257775	257780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847157
4564	NC_011831	ACC	2	6	257787	257792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847157
4565	NC_011831	TCGA	2	8	257811	257818	25 %	25 %	25 %	25 %	219847157
4566	NC_011831	CATGC	2	10	257890	257899	20 %	20 %	20 %	40 %	219847157
4567	NC_011831	CCA	2	6	257912	257917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847157
4568	NC_011831	CTC	2	6	257934	257939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847157
4569	NC_011831	CGA	2	6	257945	257950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847157
4570	NC_011831	ATC	2	6	258009	258014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847157
4571	NC_011831	CGA	2	6	258051	258056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847157
4572	NC_011831	CCG	2	6	258072	258077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847157
4573	NC_011831	AAG	2	6	258142	258147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847157
4574	NC_011831	CAG	2	6	258156	258161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847157
4575	NC_011831	CAT	2	6	258171	258176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847157
4576	NC_011831	TCC	2	6	258177	258182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219847158
4577	NC_011831	GGC	2	6	258281	258286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847158
4578	NC_011831	AAACG	2	10	258302	258311	60 %	0 %	20 %	20 %	219847158
4579	NC_011831	GTG	2	6	258373	258378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847158
4580	NC_011831	GC	3	6	258452	258457	0 %	0 %	50 %	50 %	219847158
4581	NC_011831	ATA	3	9	258516	258524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219847158
4582	NC_011831	GTA	2	6	258567	258572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847158
4583	NC_011831	AAG	2	6	258630	258635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219847158
4584	NC_011831	A	6	6	258704	258709	100 %	0 %	0 %	0 %	219847158
4585	NC_011831	GTC	2	6	258894	258899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847158
4586	NC_011831	CGGC	2	8	258910	258917	0 %	0 %	50 %	50 %	219847158
4587	NC_011831	CAAG	2	8	259015	259022	50 %	0 %	25 %	25 %	219847158
4588	NC_011831	ACC	2	6	259028	259033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847158
4589	NC_011831	GTAAC	2	10	259039	259048	40 %	20 %	20 %	20 %	219847158
4590	NC_011831	CAG	2	6	259159	259164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847158
4591	NC_011831	CTG	2	6	259368	259373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847159
4592	NC_011831	CTA	2	6	259396	259401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847159
4593	NC_011831	CTG	2	6	259500	259505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847159
4594	NC_011831	CTG	3	9	259548	259556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847159
4595	NC_011831	CGG	2	6	259568	259573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847159
4596	NC_011831	ACC	3	9	259578	259586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219847159
4597	NC_011831	TGC	2	6	259603	259608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847159
4598	NC_011831	CTGACC	2	12	259644	259655	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219847159
4599	NC_011831	TTG	2	6	259689	259694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847159
4600	NC_011831	TGC	2	6	259699	259704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847159
4601	NC_011831	TTG	2	6	259722	259727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847159
4602	NC_011831	AGC	2	6	259779	259784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847159
4603	NC_011831	AGCGGC	2	12	259824	259835	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219847159
4604	NC_011831	TTG	2	6	259851	259856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847159
4605	NC_011831	TTG	2	6	259863	259868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219847159
4606	NC_011831	GCT	2	6	259882	259887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847159
4607	NC_011831	GGC	2	6	259914	259919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847159
4608	NC_011831	CGGAT	2	10	259944	259953	20 %	20 %	40 %	20 %	219847159
4609	NC_011831	CTG	2	6	259971	259976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847159
4610	NC_011831	CGG	2	6	260113	260118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847159
4611	NC_011831	GC	3	6	260142	260147	0 %	0 %	50 %	50 %	219847159
4612	NC_011831	CTT	2	6	260210	260215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219847159
4613	NC_011831	ATC	2	6	260298	260303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219847159
4614	NC_011831	TGC	2	6	260328	260333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847159
4615	NC_011831	CTG	2	6	260337	260342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847159
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4617	NC_011831	CAA	2	6	260454	260459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219847159
4618	NC_011831	GCT	2	6	260629	260634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847159
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4986	NC_011831	GCC	2	6	281396	281401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847175
4987	NC_011831	GAAC	2	8	281715	281722	50 %	0 %	25 %	25 %	219847176
4988	NC_011831	GCG	2	6	281761	281766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219847176
4989	NC_011831	GCC	2	6	281857	281862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219847176
4990	NC_011831	ATT	2	6	281977	281982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219847176
4991	NC_011831	ATG	2	6	282010	282015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847176
4992	NC_011831	GCT	2	6	282081	282086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847176
4993	NC_011831	ACGGT	2	10	282089	282098	20 %	20 %	40 %	20 %	219847176
4994	NC_011831	GAT	2	6	282102	282107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847176
4995	NC_011831	TGA	2	6	282167	282172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219847176
4996	NC_011831	TG	3	6	282177	282182	0 %	50 %	50 %	0 %	219847176
4997	NC_011831	TGG	2	6	282215	282220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219847176
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4999	NC_011831	CTG	2	6	282457	282462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219847176
5000	NC_011831	AGC	2	6	282516	282521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219847176

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