MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742401

Total Repeats: 191

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011738	CACTC	2	10	1315	1324	20 %	20 %	0 %	60 %	218442613
2	NC_011738	TCTCT	2	10	1517	1526	0 %	60 %	0 %	40 %	218442613
3	NC_011738	CATCC	2	10	3507	3516	20 %	20 %	0 %	60 %	218442614
4	NC_011738	CCACT	2	10	4302	4311	20 %	20 %	0 %	60 %	218442614
5	NC_011738	ATCCC	2	10	6247	6256	20 %	20 %	0 %	60 %	218442616
6	NC_011738	CGTCT	2	10	6618	6627	0 %	40 %	20 %	40 %	218442616
7	NC_011738	CGATT	2	10	8750	8759	20 %	40 %	20 %	20 %	218442618
8	NC_011738	GATGA	2	10	9073	9082	40 %	20 %	40 %	0 %	218442618
9	NC_011738	ATTAG	2	10	9714	9723	40 %	40 %	20 %	0 %	218442618
10	NC_011738	GGGTC	2	10	10060	10069	0 %	20 %	60 %	20 %	218442618
11	NC_011738	TTAAT	2	10	12702	12711	40 %	60 %	0 %	0 %	218442620
12	NC_011738	GTTGA	2	10	14428	14437	20 %	40 %	40 %	0 %	218442622
13	NC_011738	TTTTC	2	10	16398	16407	0 %	80 %	0 %	20 %	218442623
14	NC_011738	GGTTT	2	10	16554	16563	0 %	60 %	40 %	0 %	218442623
15	NC_011738	AAAAC	2	10	22756	22765	80 %	0 %	0 %	20 %	218442628
16	NC_011738	ATTTT	2	10	23656	23665	20 %	80 %	0 %	0 %	218442628
17	NC_011738	ACTTG	2	10	24227	24236	20 %	40 %	20 %	20 %	218442628
18	NC_011738	TTATT	2	10	28260	28269	20 %	80 %	0 %	0 %	218442632
19	NC_011738	ATTTT	2	10	28350	28359	20 %	80 %	0 %	0 %	218442632
20	NC_011738	GTAAT	2	10	28662	28671	40 %	40 %	20 %	0 %	218442632
21	NC_011738	ATCCC	2	10	34057	34066	20 %	20 %	0 %	60 %	218442633
22	NC_011738	CGTCT	2	10	34428	34437	0 %	40 %	20 %	40 %	218442633
23	NC_011738	CCAAG	2	10	38871	38880	40 %	0 %	20 %	40 %	218442637
24	NC_011738	CTAAC	2	10	39397	39406	40 %	20 %	0 %	40 %	218442637
25	NC_011738	CACAG	2	10	39851	39860	40 %	0 %	20 %	40 %	218442638
26	NC_011738	CGAGA	2	10	56057	56066	40 %	0 %	40 %	20 %	218442652
27	NC_011738	TAGTC	2	10	58193	58202	20 %	40 %	20 %	20 %	218442653
28	NC_011738	CATTT	2	10	58900	58909	20 %	60 %	0 %	20 %	218442655
29	NC_011738	ACAGA	2	10	59385	59394	60 %	0 %	20 %	20 %	218442655
30	NC_011738	ATTCT	2	10	66644	66653	20 %	60 %	0 %	20 %	218442661
31	NC_011738	GAAAA	2	10	67128	67137	80 %	0 %	20 %	0 %	218442662
32	NC_011738	TAGTC	2	10	67895	67904	20 %	40 %	20 %	20 %	218442662
33	NC_011738	ACAAA	2	10	71709	71718	80 %	0 %	0 %	20 %	218442667
34	NC_011738	GAGTG	2	10	72049	72058	20 %	20 %	60 %	0 %	218442667
35	NC_011738	ATCCC	2	10	73642	73651	20 %	20 %	0 %	60 %	218442668
36	NC_011738	ACCAT	2	10	76320	76329	40 %	20 %	0 %	40 %	218442670
37	NC_011738	CGTAT	2	10	76719	76728	20 %	40 %	20 %	20 %	218442670
38	NC_011738	TTGAT	2	10	78100	78109	20 %	60 %	20 %	0 %	218442672
39	NC_011738	CCATT	2	10	78280	78289	20 %	40 %	0 %	40 %	218442672
40	NC_011738	CTTAT	2	10	79364	79373	20 %	60 %	0 %	20 %	218442672
41	NC_011738	CCTGT	2	10	81835	81844	0 %	40 %	20 %	40 %	218442675
42	NC_011738	ATTTT	2	10	82653	82662	20 %	80 %	0 %	0 %	218442676
43	NC_011738	AAAAG	2	10	87364	87373	80 %	0 %	20 %	0 %	218442679
44	NC_011738	CGCTC	2	10	95566	95575	0 %	20 %	20 %	60 %	218442688
45	NC_011738	ATTTA	2	10	97556	97565	40 %	60 %	0 %	0 %	218442690
46	NC_011738	GACTA	2	10	99763	99772	40 %	20 %	20 %	20 %	218442693
47	NC_011738	TTTTC	2	10	100530	100539	0 %	80 %	0 %	20 %	218442693
48	NC_011738	TAAAA	2	10	103193	103202	80 %	20 %	0 %	0 %	218442698
49	NC_011738	AATTT	2	10	103972	103981	40 %	60 %	0 %	0 %	218442699
50	NC_011738	GGGTT	2	10	105038	105047	0 %	40 %	60 %	0 %	218442700
51	NC_011738	TGCAA	2	10	106420	106429	40 %	20 %	20 %	20 %	218442702
52	NC_011738	GGGAA	2	10	108225	108234	40 %	0 %	60 %	0 %	218442704
53	NC_011738	TAATT	2	10	110375	110384	40 %	60 %	0 %	0 %	218442706
54	NC_011738	ATTTC	2	10	111479	111488	20 %	60 %	0 %	20 %	218442707
55	NC_011738	AGCAG	2	10	111603	111612	40 %	0 %	40 %	20 %	218442708
56	NC_011738	AATCT	2	10	114376	114385	40 %	40 %	0 %	20 %	218442711
57	NC_011738	GTTAA	2	10	114738	114747	40 %	40 %	20 %	0 %	218442711
58	NC_011738	TTAAT	2	10	114757	114766	40 %	60 %	0 %	0 %	218442711
59	NC_011738	ATCTT	2	10	118872	118881	20 %	60 %	0 %	20 %	218442713
60	NC_011738	AATTT	2	10	119022	119031	40 %	60 %	0 %	0 %	218442713
61	NC_011738	CAAAC	2	10	119365	119374	60 %	0 %	0 %	40 %	218442714
62	NC_011738	AATTA	2	10	121693	121702	60 %	40 %	0 %	0 %	218442715
63	NC_011738	TTATT	2	10	123233	123242	20 %	80 %	0 %	0 %	218442716
64	NC_011738	TGGTT	2	10	125167	125176	0 %	60 %	40 %	0 %	218442716
65	NC_011738	AAGTT	2	10	126310	126319	40 %	40 %	20 %	0 %	218442716
66	NC_011738	ATGGT	2	10	129951	129960	20 %	40 %	40 %	0 %	218442718
67	NC_011738	AAAAT	2	10	130538	130547	80 %	20 %	0 %	0 %	218442718
68	NC_011738	TGAAA	2	10	132160	132169	60 %	20 %	20 %	0 %	218442720
69	NC_011738	GATCG	2	10	133148	133157	20 %	20 %	40 %	20 %	218442721
70	NC_011738	CAACC	2	10	134661	134670	40 %	0 %	0 %	60 %	218442722
71	NC_011738	AAAAC	2	10	135884	135893	80 %	0 %	0 %	20 %	218442723
72	NC_011738	ACCAA	2	10	136671	136680	60 %	0 %	0 %	40 %	218442724
73	NC_011738	TAAAT	2	10	137355	137364	60 %	40 %	0 %	0 %	218442724
74	NC_011738	ATTGT	2	10	138014	138023	20 %	60 %	20 %	0 %	218442725
75	NC_011738	AGGTA	2	10	141391	141400	40 %	20 %	40 %	0 %	218442725
76	NC_011738	CAAAG	2	10	141787	141796	60 %	0 %	20 %	20 %	218442725
77	NC_011738	TTAAC	2	10	142797	142806	40 %	40 %	0 %	20 %	218442726
78	NC_011738	CGTTT	2	10	145726	145735	0 %	60 %	20 %	20 %	218442726
79	NC_011738	AGTTT	2	10	147770	147779	20 %	60 %	20 %	0 %	218442727
80	NC_011738	TTGCT	2	10	151563	151572	0 %	60 %	20 %	20 %	218442728
81	NC_011738	GGGAC	2	10	152471	152480	20 %	0 %	60 %	20 %	218442728
82	NC_011738	AGTTT	2	10	155102	155111	20 %	60 %	20 %	0 %	218442729
83	NC_011738	AATTT	2	10	156895	156904	40 %	60 %	0 %	0 %	218442731
84	NC_011738	ATGCA	2	10	157139	157148	40 %	20 %	20 %	20 %	218442731
85	NC_011738	GTATT	2	10	157679	157688	20 %	60 %	20 %	0 %	218442731
86	NC_011738	CTGTG	2	10	158008	158017	0 %	40 %	40 %	20 %	218442731
87	NC_011738	CTTGA	2	10	158789	158798	20 %	40 %	20 %	20 %	218442731
88	NC_011738	GTATT	2	10	159597	159606	20 %	60 %	20 %	0 %	218442731
89	NC_011738	TTATC	2	10	165788	165797	20 %	60 %	0 %	20 %	218442732
90	NC_011738	AAATC	2	10	165865	165874	60 %	20 %	0 %	20 %	218442732
91	NC_011738	CACCC	2	10	168183	168192	20 %	0 %	0 %	80 %	218442732
92	NC_011738	GATAA	2	10	170102	170111	60 %	20 %	20 %	0 %	218442732
93	NC_011738	ATTGA	2	10	170801	170810	40 %	40 %	20 %	0 %	218442732
94	NC_011738	TTCTG	2	10	171691	171700	0 %	60 %	20 %	20 %	218442732
95	NC_011738	TCTGT	2	10	172307	172316	0 %	60 %	20 %	20 %	218442732
96	NC_011738	TGCCA	2	10	172605	172614	20 %	20 %	20 %	40 %	218442732
97	NC_011738	AGTGG	2	10	173218	173227	20 %	20 %	60 %	0 %	218442732
98	NC_011738	GCGAA	2	10	174294	174303	40 %	0 %	40 %	20 %	218442733
99	NC_011738	ATTTG	2	10	175069	175078	20 %	60 %	20 %	0 %	218442733
100	NC_011738	AGATA	2	10	179305	179314	60 %	20 %	20 %	0 %	218442736
101	NC_011738	TTTAT	2	10	180104	180113	20 %	80 %	0 %	0 %	218442737
102	NC_011738	TTTAC	2	10	180498	180507	20 %	60 %	0 %	20 %	218442737
103	NC_011738	CTAAA	2	10	181871	181880	60 %	20 %	0 %	20 %	218442738
104	NC_011738	AATTT	2	10	183437	183446	40 %	60 %	0 %	0 %	218442739
105	NC_011738	GACAG	2	10	184150	184159	40 %	0 %	40 %	20 %	218442739
106	NC_011738	TGGAA	2	10	189683	189692	40 %	20 %	40 %	0 %	218442741
107	NC_011738	TGGAA	2	10	190387	190396	40 %	20 %	40 %	0 %	218442741
108	NC_011738	CGATT	2	10	191813	191822	20 %	40 %	20 %	20 %	218442742
109	NC_011738	CTTTT	2	10	192647	192656	0 %	80 %	0 %	20 %	218442742
110	NC_011738	CCTAT	2	10	193894	193903	20 %	40 %	0 %	40 %	218442743
111	NC_011738	TAATT	2	10	196994	197003	40 %	60 %	0 %	0 %	218442746
112	NC_011738	GGCGA	2	10	197607	197616	20 %	0 %	60 %	20 %	218442747
113	NC_011738	CGTTA	2	10	199769	199778	20 %	40 %	20 %	20 %	218442749
114	NC_011738	TGTGG	2	10	201257	201266	0 %	40 %	60 %	0 %	218442750
115	NC_011738	TTATT	2	10	202732	202741	20 %	80 %	0 %	0 %	218442751
116	NC_011738	GATTG	2	10	202943	202952	20 %	40 %	40 %	0 %	218442751
117	NC_011738	ATAAA	2	10	203067	203076	80 %	20 %	0 %	0 %	218442751
118	NC_011738	AGGAG	2	10	208546	208555	40 %	0 %	60 %	0 %	218442757
119	NC_011738	TTTAT	2	10	209750	209759	20 %	80 %	0 %	0 %	218442758
120	NC_011738	TTGAT	2	10	210471	210480	20 %	60 %	20 %	0 %	218442758
121	NC_011738	GGTCA	2	10	212199	212208	20 %	20 %	40 %	20 %	218442760
122	NC_011738	TCAAA	2	10	212821	212830	60 %	20 %	0 %	20 %	218442760
123	NC_011738	GTTAT	2	10	215168	215177	20 %	60 %	20 %	0 %	218442762
124	NC_011738	AATTA	2	10	215970	215979	60 %	40 %	0 %	0 %	218442763
125	NC_011738	ATATA	2	10	216009	216018	60 %	40 %	0 %	0 %	218442763
126	NC_011738	ATTGA	2	10	218626	218635	40 %	40 %	20 %	0 %	218442765
127	NC_011738	CCTAT	2	10	218864	218873	20 %	40 %	0 %	40 %	218442765
128	NC_011738	CAGAA	2	10	223107	223116	60 %	0 %	20 %	20 %	218442769
129	NC_011738	TCGAG	2	10	223913	223922	20 %	20 %	40 %	20 %	218442770
130	NC_011738	AGGGA	2	10	225535	225544	40 %	0 %	60 %	0 %	218442772
131	NC_011738	GGGAT	2	10	228693	228702	20 %	20 %	60 %	0 %	218442773
132	NC_011738	TAAAT	2	10	230272	230281	60 %	40 %	0 %	0 %	218442774
133	NC_011738	TAAAA	2	10	230355	230364	80 %	20 %	0 %	0 %	218442775
134	NC_011738	TCAAA	2	10	233428	233437	60 %	20 %	0 %	20 %	218442776
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.