MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742401

Total Repeats: 5417

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011738	ATG	2	6	181897	181902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442738
3002	NC_011738	ACA	3	9	182010	182018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442738
3003	NC_011738	T	7	7	182082	182088	0 %	100 %	0 %	0 %	218442738
3004	NC_011738	TTTA	2	8	182103	182110	25 %	75 %	0 %	0 %	218442738
3005	NC_011738	GA	3	6	182131	182136	50 %	0 %	50 %	0 %	218442738
3006	NC_011738	C	6	6	182230	182235	0 %	0 %	0 %	100 %	218442738
3007	NC_011738	AGA	2	6	182271	182276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442738
3008	NC_011738	TTA	3	9	182298	182306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442738
3009	NC_011738	TTA	2	6	182369	182374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442738
3010	NC_011738	AAC	2	6	182397	182402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442738
3011	NC_011738	ATT	2	6	182424	182429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442738
3012	NC_011738	CAA	2	6	182461	182466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442738
3013	NC_011738	T	6	6	182488	182493	0 %	100 %	0 %	0 %	218442738
3014	NC_011738	TCC	2	6	182496	182501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442738
3015	NC_011738	TTA	2	6	182563	182568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442738
3016	NC_011738	GAA	2	6	182581	182586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442738
3017	NC_011738	CT	3	6	182686	182691	0 %	50 %	0 %	50 %	218442738
3018	NC_011738	GCT	3	9	182713	182721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442738
3019	NC_011738	ATT	2	6	182745	182750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442738
3020	NC_011738	TGA	2	6	182757	182762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442738
3021	NC_011738	A	6	6	182831	182836	100 %	0 %	0 %	0 %	218442738
3022	NC_011738	CGT	2	6	182899	182904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442738
3023	NC_011738	TTG	2	6	182915	182920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442738
3024	NC_011738	A	6	6	182926	182931	100 %	0 %	0 %	0 %	218442738
3025	NC_011738	ATT	2	6	182938	182943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442738
3026	NC_011738	TACT	2	8	182962	182969	25 %	50 %	0 %	25 %	218442738
3027	NC_011738	GAA	2	6	182980	182985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442738
3028	NC_011738	CAAG	2	8	183006	183013	50 %	0 %	25 %	25 %	218442738
3029	NC_011738	A	6	6	183041	183046	100 %	0 %	0 %	0 %	218442738
3030	NC_011738	GAA	2	6	183223	183228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442739
3031	NC_011738	A	6	6	183247	183252	100 %	0 %	0 %	0 %	218442739
3032	NC_011738	T	7	7	183261	183267	0 %	100 %	0 %	0 %	218442739
3033	NC_011738	CTTA	2	8	183271	183278	25 %	50 %	0 %	25 %	218442739
3034	NC_011738	TGA	2	6	183355	183360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442739
3035	NC_011738	AAT	2	6	183383	183388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442739
3036	NC_011738	T	6	6	183396	183401	0 %	100 %	0 %	0 %	218442739
3037	NC_011738	TTGG	2	8	183408	183415	0 %	50 %	50 %	0 %	218442739
3038	NC_011738	AATTT	2	10	183437	183446	40 %	60 %	0 %	0 %	218442739
3039	NC_011738	AAT	2	6	183526	183531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442739
3040	NC_011738	TGC	2	6	183604	183609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442739
3041	NC_011738	GAAT	2	8	183612	183619	50 %	25 %	25 %	0 %	218442739
3042	NC_011738	TGA	2	6	183649	183654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442739
3043	NC_011738	AGC	2	6	183751	183756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442739
3044	NC_011738	A	6	6	183822	183827	100 %	0 %	0 %	0 %	218442739
3045	NC_011738	T	6	6	183841	183846	0 %	100 %	0 %	0 %	218442739
3046	NC_011738	CT	3	6	183906	183911	0 %	50 %	0 %	50 %	218442739
3047	NC_011738	T	7	7	183943	183949	0 %	100 %	0 %	0 %	218442739
3048	NC_011738	ATG	2	6	184074	184079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442739
3049	NC_011738	AGA	2	6	184105	184110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442739
3050	NC_011738	CGA	2	6	184126	184131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442739
3051	NC_011738	GACAG	2	10	184150	184159	40 %	0 %	40 %	20 %	218442739
3052	NC_011738	ACA	2	6	184177	184182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442739
3053	NC_011738	AAT	2	6	184184	184189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442739
3054	NC_011738	TGG	2	6	184313	184318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442739
3055	NC_011738	ACA	2	6	184363	184368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442739
3056	NC_011738	TATG	2	8	184393	184400	25 %	50 %	25 %	0 %	218442739
3057	NC_011738	ATTT	2	8	184425	184432	25 %	75 %	0 %	0 %	218442739
3058	NC_011738	TCC	2	6	184558	184563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442739
3059	NC_011738	TGGT	2	8	184567	184574	0 %	50 %	50 %	0 %	218442739
3060	NC_011738	TCC	2	6	184591	184596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442739
3061	NC_011738	ACT	2	6	184604	184609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442739
3062	NC_011738	GAT	2	6	184631	184636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442739
3063	NC_011738	CTC	2	6	184653	184658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442739
3064	NC_011738	GCA	2	6	184681	184686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442739
3065	NC_011738	CTG	2	6	184697	184702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442739
3066	NC_011738	A	6	6	184713	184718	100 %	0 %	0 %	0 %	218442739
3067	NC_011738	GAT	2	6	184784	184789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442739
3068	NC_011738	GAG	2	6	184884	184889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442739
3069	NC_011738	TTTG	2	8	184894	184901	0 %	75 %	25 %	0 %	218442739
3070	NC_011738	ATT	2	6	184923	184928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442739
3071	NC_011738	ACT	2	6	184970	184975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442739
3072	NC_011738	AGT	2	6	185023	185028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442739
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3074	NC_011738	GGA	2	6	185195	185200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442739
3075	NC_011738	TGC	2	6	185212	185217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442739
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3077	NC_011738	GACA	2	8	188638	188645	50 %	0 %	25 %	25 %	218442740
3078	NC_011738	T	6	6	188651	188656	0 %	100 %	0 %	0 %	218442740
3079	NC_011738	TCC	2	6	189502	189507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442741
3080	NC_011738	TTAA	2	8	189572	189579	50 %	50 %	0 %	0 %	218442741
3081	NC_011738	CAA	2	6	189611	189616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442741
3082	NC_011738	T	6	6	189640	189645	0 %	100 %	0 %	0 %	218442741
3083	NC_011738	TGGAA	2	10	189683	189692	40 %	20 %	40 %	0 %	218442741
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3088	NC_011738	T	6	6	189823	189828	0 %	100 %	0 %	0 %	218442741
3089	NC_011738	AGT	2	6	189901	189906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442741
3090	NC_011738	A	6	6	189972	189977	100 %	0 %	0 %	0 %	218442741
3091	NC_011738	TCAT	2	8	190050	190057	25 %	50 %	0 %	25 %	218442741
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3094	NC_011738	GGA	2	6	190244	190249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442741
3095	NC_011738	A	6	6	190297	190302	100 %	0 %	0 %	0 %	218442741
3096	NC_011738	TTC	2	6	190335	190340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442741
3097	NC_011738	TGGAA	2	10	190387	190396	40 %	20 %	40 %	0 %	218442741
3098	NC_011738	TTG	2	6	190401	190406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442741
3099	NC_011738	GGC	2	6	190440	190445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442741
3100	NC_011738	ATT	2	6	190487	190492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442741
3101	NC_011738	ATG	2	6	190494	190499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442741
3102	NC_011738	CAAA	2	8	190555	190562	75 %	0 %	0 %	25 %	218442741
3103	NC_011738	A	6	6	190587	190592	100 %	0 %	0 %	0 %	218442741
3104	NC_011738	ATT	2	6	190640	190645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442741
3105	NC_011738	TAA	2	6	190690	190695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442741
3106	NC_011738	TAT	2	6	190696	190701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442741
3107	NC_011738	ATT	2	6	190725	190730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442741
3108	NC_011738	AGA	2	6	190816	190821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442741
3109	NC_011738	CAAT	2	8	190931	190938	50 %	25 %	0 %	25 %	218442741
3110	NC_011738	A	8	8	190939	190946	100 %	0 %	0 %	0 %	218442741
3111	NC_011738	TCAT	2	8	190960	190967	25 %	50 %	0 %	25 %	218442741
3112	NC_011738	AGA	2	6	191011	191016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442741
3113	NC_011738	GGAT	2	8	191054	191061	25 %	25 %	50 %	0 %	218442741
3114	NC_011738	A	6	6	191067	191072	100 %	0 %	0 %	0 %	218442741
3115	NC_011738	AATT	2	8	191074	191081	50 %	50 %	0 %	0 %	218442741
3116	NC_011738	AGCT	2	8	191101	191108	25 %	25 %	25 %	25 %	218442741
3117	NC_011738	TCA	2	6	191388	191393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442742
3118	NC_011738	CAA	2	6	191402	191407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442742
3119	NC_011738	ATCA	2	8	191471	191478	50 %	25 %	0 %	25 %	218442742
3120	NC_011738	TAG	2	6	191492	191497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442742
3121	NC_011738	GTT	2	6	191518	191523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442742
3122	NC_011738	TTA	2	6	191593	191598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442742
3123	NC_011738	GTAA	2	8	191605	191612	50 %	25 %	25 %	0 %	218442742
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3125	NC_011738	TA	3	6	191767	191772	50 %	50 %	0 %	0 %	218442742
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3498	NC_011738	ATTA	2	8	210557	210564	50 %	50 %	0 %	0 %	218442758
3499	NC_011738	AAAT	2	8	210567	210574	75 %	25 %	0 %	0 %	218442758
3500	NC_011738	A	7	7	210648	210654	100 %	0 %	0 %	0 %	218442758

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