MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742401

Total Repeats: 5417

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011738	GCA	2	6	27922	27927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442631
502	NC_011738	TTC	2	6	27972	27977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442631
503	NC_011738	CTT	3	9	27980	27988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442631
504	NC_011738	AAC	2	6	28012	28017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442631
505	NC_011738	TCA	2	6	28039	28044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442631
506	NC_011738	TTATT	2	10	28260	28269	20 %	80 %	0 %	0 %	218442632
507	NC_011738	ATTTT	2	10	28350	28359	20 %	80 %	0 %	0 %	218442632
508	NC_011738	CTC	2	6	28365	28370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442632
509	NC_011738	AGC	2	6	28379	28384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442632
510	NC_011738	TTA	2	6	28478	28483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442632
511	NC_011738	A	7	7	28530	28536	100 %	0 %	0 %	0 %	218442632
512	NC_011738	TTG	2	6	28583	28588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442632
513	NC_011738	A	7	7	28595	28601	100 %	0 %	0 %	0 %	218442632
514	NC_011738	TAA	2	6	28649	28654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442632
515	NC_011738	GTAAT	2	10	28662	28671	40 %	40 %	20 %	0 %	218442632
516	NC_011738	ATCCC	2	10	34057	34066	20 %	20 %	0 %	60 %	218442633
517	NC_011738	T	6	6	34093	34098	0 %	100 %	0 %	0 %	218442633
518	NC_011738	AGT	2	6	34102	34107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442633
519	NC_011738	TTAA	2	8	34115	34122	50 %	50 %	0 %	0 %	218442633
520	NC_011738	TAA	2	6	34140	34145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442633
521	NC_011738	AAT	2	6	34252	34257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442633
522	NC_011738	ACT	2	6	34288	34293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442633
523	NC_011738	TCT	2	6	34303	34308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442633
524	NC_011738	TAA	2	6	34356	34361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442633
525	NC_011738	CGTCT	2	10	34428	34437	0 %	40 %	20 %	40 %	218442633
526	NC_011738	TTC	2	6	34525	34530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442633
527	NC_011738	TA	3	6	34539	34544	50 %	50 %	0 %	0 %	218442633
528	NC_011738	TTGA	2	8	34548	34555	25 %	50 %	25 %	0 %	218442633
529	NC_011738	CTT	2	6	34584	34589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442633
530	NC_011738	CAA	2	6	34605	34610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442633
531	NC_011738	T	6	6	34705	34710	0 %	100 %	0 %	0 %	218442633
532	NC_011738	GAA	2	6	34799	34804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442633
533	NC_011738	TTC	2	6	34894	34899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442633
534	NC_011738	T	7	7	34968	34974	0 %	100 %	0 %	0 %	218442633
535	NC_011738	ATGGTA	2	12	35048	35059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442633
536	NC_011738	ATA	2	6	35060	35065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442633
537	NC_011738	TCT	2	6	35086	35091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442633
538	NC_011738	AAT	2	6	35121	35126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442633
539	NC_011738	TGG	2	6	36316	36321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442634
540	NC_011738	A	6	6	36322	36327	100 %	0 %	0 %	0 %	218442634
541	NC_011738	ATT	2	6	36340	36345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442634
542	NC_011738	ATA	3	9	36346	36354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442634
543	NC_011738	CAA	2	6	36381	36386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442634
544	NC_011738	ATT	2	6	36469	36474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442634
545	NC_011738	TAT	2	6	36477	36482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442634
546	NC_011738	A	6	6	36499	36504	100 %	0 %	0 %	0 %	218442634
547	NC_011738	A	7	7	36528	36534	100 %	0 %	0 %	0 %	218442634
548	NC_011738	T	6	6	36572	36577	0 %	100 %	0 %	0 %	218442634
549	NC_011738	GGAG	2	8	36578	36585	25 %	0 %	75 %	0 %	218442634
550	NC_011738	AGCG	2	8	36587	36594	25 %	0 %	50 %	25 %	218442634
551	NC_011738	A	7	7	36679	36685	100 %	0 %	0 %	0 %	218442634
552	NC_011738	AG	3	6	37562	37567	50 %	0 %	50 %	0 %	218442635
553	NC_011738	G	6	6	37573	37578	0 %	0 %	100 %	0 %	218442635
554	NC_011738	TGA	2	6	37601	37606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442635
555	NC_011738	A	6	6	37939	37944	100 %	0 %	0 %	0 %	218442636
556	NC_011738	TGTC	2	8	37950	37957	0 %	50 %	25 %	25 %	218442636
557	NC_011738	TTTA	2	8	37959	37966	25 %	75 %	0 %	0 %	218442636
558	NC_011738	TAA	2	6	38037	38042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442636
559	NC_011738	TGAAGA	2	12	38064	38075	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	218442636
560	NC_011738	A	6	6	38179	38184	100 %	0 %	0 %	0 %	218442636
561	NC_011738	A	9	9	38199	38207	100 %	0 %	0 %	0 %	218442636
562	NC_011738	GAAA	2	8	38222	38229	75 %	0 %	25 %	0 %	218442636
563	NC_011738	TTTA	2	8	38289	38296	25 %	75 %	0 %	0 %	218442636
564	NC_011738	ATA	2	6	38313	38318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442636
565	NC_011738	GAT	2	6	38321	38326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442636
566	NC_011738	A	6	6	38381	38386	100 %	0 %	0 %	0 %	218442636
567	NC_011738	AAG	2	6	38418	38423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442636
568	NC_011738	GTT	2	6	38454	38459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442636
569	NC_011738	ATTT	2	8	38469	38476	25 %	75 %	0 %	0 %	218442636
570	NC_011738	CAT	2	6	38524	38529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442636
571	NC_011738	AGA	2	6	38581	38586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442636
572	NC_011738	TAAA	2	8	38631	38638	75 %	25 %	0 %	0 %	218442636
573	NC_011738	TGG	2	6	38648	38653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442636
574	NC_011738	TGC	2	6	38719	38724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442636
575	NC_011738	A	6	6	38729	38734	100 %	0 %	0 %	0 %	218442636
576	NC_011738	A	6	6	38836	38841	100 %	0 %	0 %	0 %	218442637
577	NC_011738	TCA	2	6	38851	38856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442637
578	NC_011738	CCAAG	2	10	38871	38880	40 %	0 %	20 %	40 %	218442637
579	NC_011738	TCA	2	6	38943	38948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442637
580	NC_011738	GAA	2	6	38991	38996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442637
581	NC_011738	CTA	2	6	39166	39171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442637
582	NC_011738	TAA	2	6	39212	39217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442637
583	NC_011738	TAAA	2	8	39316	39323	75 %	25 %	0 %	0 %	218442637
584	NC_011738	TGC	2	6	39374	39379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442637
585	NC_011738	CTAAC	2	10	39397	39406	40 %	20 %	0 %	40 %	218442637
586	NC_011738	ATT	2	6	39462	39467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442637
587	NC_011738	AATC	2	8	39486	39493	50 %	25 %	0 %	25 %	218442637
588	NC_011738	ACCC	2	8	39542	39549	25 %	0 %	0 %	75 %	218442637
589	NC_011738	AT	3	6	39558	39563	50 %	50 %	0 %	0 %	218442637
590	NC_011738	ATC	2	6	39605	39610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442637
591	NC_011738	AAAG	2	8	39657	39664	75 %	0 %	25 %	0 %	218442637
592	NC_011738	ATTA	2	8	39670	39677	50 %	50 %	0 %	0 %	218442637
593	NC_011738	TAA	2	6	39683	39688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442638
594	NC_011738	ACC	2	6	39721	39726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442638
595	NC_011738	CAA	2	6	39773	39778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442638
596	NC_011738	TCGCTT	2	12	39779	39790	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	218442638
597	NC_011738	GGA	2	6	39835	39840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442638
598	NC_011738	CACAG	2	10	39851	39860	40 %	0 %	20 %	40 %	218442638
599	NC_011738	TTC	2	6	39882	39887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442638
600	NC_011738	CAA	3	9	39959	39967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442638
601	NC_011738	GAA	2	6	40050	40055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442639
602	NC_011738	GAT	2	6	40095	40100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442639
603	NC_011738	T	8	8	40108	40115	0 %	100 %	0 %	0 %	218442639
604	NC_011738	TCA	2	6	40134	40139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442639
605	NC_011738	AAG	2	6	40171	40176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442639
606	NC_011738	CAA	2	6	42381	42386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442640
607	NC_011738	T	6	6	42408	42413	0 %	100 %	0 %	0 %	218442640
608	NC_011738	T	6	6	42443	42448	0 %	100 %	0 %	0 %	218442640
609	NC_011738	ATC	2	6	42525	42530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442640
610	NC_011738	AC	3	6	42574	42579	50 %	0 %	0 %	50 %	218442640
611	NC_011738	CT	3	6	42585	42590	0 %	50 %	0 %	50 %	218442640
612	NC_011738	ATT	2	6	42615	42620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442640
613	NC_011738	CTA	2	6	42628	42633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442640
614	NC_011738	TCT	2	6	42642	42647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442640
615	NC_011738	TTC	2	6	42741	42746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442640
616	NC_011738	CTT	2	6	42779	42784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442640
617	NC_011738	TAA	2	6	42824	42829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442640
618	NC_011738	CTT	2	6	42854	42859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442640
619	NC_011738	T	9	9	42898	42906	0 %	100 %	0 %	0 %	218442640
620	NC_011738	TGAAAG	2	12	42996	43007	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	218442640
621	NC_011738	TCA	2	6	43051	43056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442640
622	NC_011738	CTGA	2	8	43118	43125	25 %	25 %	25 %	25 %	218442640
623	NC_011738	CTA	2	6	43172	43177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442640
624	NC_011738	A	6	6	43219	43224	100 %	0 %	0 %	0 %	218442640
625	NC_011738	A	6	6	43256	43261	100 %	0 %	0 %	0 %	218442640
626	NC_011738	GGAA	2	8	43281	43288	50 %	0 %	50 %	0 %	218442640
627	NC_011738	AAC	2	6	47010	47015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442641
628	NC_011738	AAG	2	6	47091	47096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442641
629	NC_011738	TCA	2	6	47110	47115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442641
630	NC_011738	A	6	6	47123	47128	100 %	0 %	0 %	0 %	218442641
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