MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742401

Total Repeats: 5417

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011738	TTAC	2	8	302691	302698	25 %	50 %	0 %	25 %	218442830
5002	NC_011738	GAA	2	6	302706	302711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442830
5003	NC_011738	A	7	7	302734	302740	100 %	0 %	0 %	0 %	218442830
5004	NC_011738	TCA	2	6	302777	302782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442830
5005	NC_011738	AAC	2	6	302791	302796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442830
5006	NC_011738	TTA	2	6	302800	302805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442830
5007	NC_011738	TTAT	2	8	302827	302834	25 %	75 %	0 %	0 %	218442830
5008	NC_011738	ATT	2	6	302890	302895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442830
5009	NC_011738	AGA	2	6	302918	302923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442830
5010	NC_011738	CGG	2	6	302990	302995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442830
5011	NC_011738	TTA	2	6	303090	303095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442830
5012	NC_011738	GATA	2	8	303128	303135	50 %	25 %	25 %	0 %	218442830
5013	NC_011738	TTC	2	6	303167	303172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442830
5014	NC_011738	TAACT	2	10	303176	303185	40 %	40 %	0 %	20 %	218442830
5015	NC_011738	AGTC	2	8	303191	303198	25 %	25 %	25 %	25 %	218442830
5016	NC_011738	ATC	2	6	303216	303221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442830
5017	NC_011738	TTC	2	6	303341	303346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442830
5018	NC_011738	TGC	2	6	303359	303364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442830
5019	NC_011738	GCC	2	6	303380	303385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218442830
5020	NC_011738	GTT	2	6	303400	303405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442830
5021	NC_011738	ATC	2	6	303453	303458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442830
5022	NC_011738	A	6	6	303466	303471	100 %	0 %	0 %	0 %	218442830
5023	NC_011738	GCT	2	6	303492	303497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442830
5024	NC_011738	ATTTA	2	10	303500	303509	40 %	60 %	0 %	0 %	218442830
5025	NC_011738	TGAT	2	8	303511	303518	25 %	50 %	25 %	0 %	218442830
5026	NC_011738	ATT	2	6	303605	303610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442830
5027	NC_011738	ATT	2	6	303624	303629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442830
5028	NC_011738	TGT	2	6	303666	303671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442830
5029	NC_011738	A	7	7	303696	303702	100 %	0 %	0 %	0 %	218442830
5030	NC_011738	TTTA	2	8	303745	303752	25 %	75 %	0 %	0 %	218442830
5031	NC_011738	CGT	2	6	303921	303926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442830
5032	NC_011738	ATAA	2	8	303960	303967	75 %	25 %	0 %	0 %	218442830
5033	NC_011738	AGA	2	6	304001	304006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442830
5034	NC_011738	A	6	6	304064	304069	100 %	0 %	0 %	0 %	218442830
5035	NC_011738	CAG	2	6	304263	304268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442830
5036	NC_011738	TTG	2	6	304288	304293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442830
5037	NC_011738	AGC	2	6	304312	304317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442830
5038	NC_011738	AGC	2	6	304322	304327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442830
5039	NC_011738	T	6	6	304377	304382	0 %	100 %	0 %	0 %	218442830
5040	NC_011738	TTTC	2	8	304453	304460	0 %	75 %	0 %	25 %	218442830
5041	NC_011738	T	7	7	304466	304472	0 %	100 %	0 %	0 %	218442830
5042	NC_011738	TGA	2	6	304538	304543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442830
5043	NC_011738	AGA	2	6	304559	304564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442830
5044	NC_011738	GAA	3	9	304581	304589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442830
5045	NC_011738	ATT	2	6	304601	304606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442830
5046	NC_011738	A	7	7	304742	304748	100 %	0 %	0 %	0 %	218442831
5047	NC_011738	A	6	6	304751	304756	100 %	0 %	0 %	0 %	218442831
5048	NC_011738	CAA	2	6	304803	304808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442831
5049	NC_011738	A	6	6	304812	304817	100 %	0 %	0 %	0 %	218442831
5050	NC_011738	ATA	2	6	304822	304827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442831
5051	NC_011738	AGA	2	6	304859	304864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442831
5052	NC_011738	CT	4	8	304873	304880	0 %	50 %	0 %	50 %	218442831
5053	NC_011738	TCA	2	6	304907	304912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442831
5054	NC_011738	AGCA	2	8	304922	304929	50 %	0 %	25 %	25 %	218442831
5055	NC_011738	AAT	2	6	305052	305057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442831
5056	NC_011738	TTA	2	6	305151	305156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442831
5057	NC_011738	TCTG	2	8	305163	305170	0 %	50 %	25 %	25 %	218442831
5058	NC_011738	GCG	2	6	305268	305273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442831
5059	NC_011738	TGGT	2	8	305276	305283	0 %	50 %	50 %	0 %	218442831
5060	NC_011738	TAC	2	6	305316	305321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442831
5061	NC_011738	ATT	2	6	305437	305442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442831
5062	NC_011738	TCGCCC	2	12	305492	305503	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	218442831
5063	NC_011738	GGAAC	2	10	305526	305535	40 %	0 %	40 %	20 %	218442831
5064	NC_011738	ACTG	2	8	305555	305562	25 %	25 %	25 %	25 %	218442831
5065	NC_011738	AAC	2	6	305563	305568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442831
5066	NC_011738	A	6	6	305571	305576	100 %	0 %	0 %	0 %	218442831
5067	NC_011738	TTG	2	6	305634	305639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442831
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5069	NC_011738	T	6	6	305724	305729	0 %	100 %	0 %	0 %	218442831
5070	NC_011738	TC	3	6	305756	305761	0 %	50 %	0 %	50 %	218442831
5071	NC_011738	A	6	6	305762	305767	100 %	0 %	0 %	0 %	218442831
5072	NC_011738	AAC	2	6	305804	305809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442831
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5074	NC_011738	C	6	6	305926	305931	0 %	0 %	0 %	100 %	218442831
5075	NC_011738	TGA	2	6	306100	306105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442831
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5079	NC_011738	AAT	2	6	306213	306218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442831
5080	NC_011738	TCA	2	6	306251	306256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442831
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5082	NC_011738	TC	3	6	306318	306323	0 %	50 %	0 %	50 %	218442831
5083	NC_011738	ATT	2	6	306364	306369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442831
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5088	NC_011738	TTAT	2	8	306688	306695	25 %	75 %	0 %	0 %	218442831
5089	NC_011738	GCTCAA	2	12	306759	306770	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	218442831
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5091	NC_011738	CAA	2	6	306939	306944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442831
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5093	NC_011738	TC	3	6	307044	307049	0 %	50 %	0 %	50 %	218442831
5094	NC_011738	T	6	6	307083	307088	0 %	100 %	0 %	0 %	218442831
5095	NC_011738	AAGC	2	8	307108	307115	50 %	0 %	25 %	25 %	218442831
5096	NC_011738	AG	3	6	307304	307309	50 %	0 %	50 %	0 %	218442831
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5102	NC_011738	AGT	2	6	307782	307787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442831
5103	NC_011738	GGT	2	6	307872	307877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442831
5104	NC_011738	TTAG	2	8	307899	307906	25 %	50 %	25 %	0 %	218442831
5105	NC_011738	ATT	2	6	307984	307989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442831
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5108	NC_011738	CTTT	2	8	308091	308098	0 %	75 %	0 %	25 %	218442831
5109	NC_011738	CAA	2	6	308103	308108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442831
5110	NC_011738	TCT	2	6	308139	308144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442831
5111	NC_011738	CT	3	6	308202	308207	0 %	50 %	0 %	50 %	218442831
5112	NC_011738	TTG	2	6	308224	308229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442831
5113	NC_011738	TAG	2	6	308237	308242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442831
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5116	NC_011738	AAG	2	6	308323	308328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442831
5117	NC_011738	A	6	6	308371	308376	100 %	0 %	0 %	0 %	218442831
5118	NC_011738	TTTAA	2	10	308403	308412	40 %	60 %	0 %	0 %	218442831
5119	NC_011738	GTT	2	6	308438	308443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442831
5120	NC_011738	TAAT	2	8	308473	308480	50 %	50 %	0 %	0 %	218442831
5121	NC_011738	ATT	2	6	308490	308495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442831
5122	NC_011738	TCC	2	6	308690	308695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442831
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5252	NC_011738	CTA	2	6	317892	317897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442838
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