MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742402

Total Repeats: 429

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011737	TTGA	2	8	263	270	25 %	50 %	25 %	0 %	218442436
2	NC_011737	GTTG	2	8	411	418	0 %	50 %	50 %	0 %	218442436
3	NC_011737	AGCA	2	8	828	835	50 %	0 %	25 %	25 %	218442436
4	NC_011737	TTGG	2	8	1342	1349	0 %	50 %	50 %	0 %	218442436
5	NC_011737	AAAT	2	8	1512	1519	75 %	25 %	0 %	0 %	218442436
6	NC_011737	TAGA	2	8	1878	1885	50 %	25 %	25 %	0 %	218442436
7	NC_011737	GAAG	2	8	1948	1955	50 %	0 %	50 %	0 %	218442436
8	NC_011737	CCAA	2	8	2042	2049	50 %	0 %	0 %	50 %	218442436
9	NC_011737	AATT	2	8	2103	2110	50 %	50 %	0 %	0 %	218442436
10	NC_011737	GCTT	2	8	2515	2522	0 %	50 %	25 %	25 %	218442436
11	NC_011737	CAAA	2	8	2924	2931	75 %	0 %	0 %	25 %	218442436
12	NC_011737	TGAA	2	8	3963	3970	50 %	25 %	25 %	0 %	218442436
13	NC_011737	TTAG	2	8	4022	4029	25 %	50 %	25 %	0 %	218442436
14	NC_011737	AATT	2	8	5954	5961	50 %	50 %	0 %	0 %	218442439
15	NC_011737	TAAA	2	8	6257	6264	75 %	25 %	0 %	0 %	218442439
16	NC_011737	AAGA	2	8	6362	6369	75 %	0 %	25 %	0 %	218442439
17	NC_011737	ATTT	2	8	6431	6438	25 %	75 %	0 %	0 %	218442439
18	NC_011737	TAAA	2	8	6497	6504	75 %	25 %	0 %	0 %	218442439
19	NC_011737	ATCA	2	8	6921	6928	50 %	25 %	0 %	25 %	218442439
20	NC_011737	TTGG	2	8	7051	7058	0 %	50 %	50 %	0 %	218442439
21	NC_011737	GAAA	2	8	7496	7503	75 %	0 %	25 %	0 %	218442439
22	NC_011737	TCTA	2	8	8196	8203	25 %	50 %	0 %	25 %	218442439
23	NC_011737	ATTA	2	8	8259	8266	50 %	50 %	0 %	0 %	218442439
24	NC_011737	AATT	2	8	8367	8374	50 %	50 %	0 %	0 %	218442439
25	NC_011737	TTCA	2	8	8475	8482	25 %	50 %	0 %	25 %	218442439
26	NC_011737	AACG	2	8	8774	8781	50 %	0 %	25 %	25 %	218442440
27	NC_011737	ATCT	2	8	9105	9112	25 %	50 %	0 %	25 %	218442440
28	NC_011737	TAAC	2	8	9128	9135	50 %	25 %	0 %	25 %	218442440
29	NC_011737	TGAA	2	8	9953	9960	50 %	25 %	25 %	0 %	218442441
30	NC_011737	AATT	2	8	10032	10039	50 %	50 %	0 %	0 %	218442441
31	NC_011737	TGCT	2	8	10497	10504	0 %	50 %	25 %	25 %	218442441
32	NC_011737	AATG	2	8	10526	10533	50 %	25 %	25 %	0 %	218442441
33	NC_011737	TACT	2	8	10737	10744	25 %	50 %	0 %	25 %	218442442
34	NC_011737	GAAG	2	8	10819	10826	50 %	0 %	50 %	0 %	218442442
35	NC_011737	ATCT	2	8	11038	11045	25 %	50 %	0 %	25 %	218442442
36	NC_011737	TAAT	2	8	11181	11188	50 %	50 %	0 %	0 %	218442442
37	NC_011737	AAAC	2	8	11629	11636	75 %	0 %	0 %	25 %	218442443
38	NC_011737	TGCT	2	8	11686	11693	0 %	50 %	25 %	25 %	218442443
39	NC_011737	TAAA	2	8	12889	12896	75 %	25 %	0 %	0 %	218442445
40	NC_011737	AAGT	2	8	12931	12938	50 %	25 %	25 %	0 %	218442445
41	NC_011737	GTTT	2	8	12975	12982	0 %	75 %	25 %	0 %	218442445
42	NC_011737	CTGC	2	8	13084	13091	0 %	25 %	25 %	50 %	218442445
43	NC_011737	GTAT	2	8	13220	13227	25 %	50 %	25 %	0 %	218442445
44	NC_011737	AGAA	2	8	13308	13315	75 %	0 %	25 %	0 %	218442445
45	NC_011737	ATTA	2	8	14448	14455	50 %	50 %	0 %	0 %	218442447
46	NC_011737	TGGC	2	8	15360	15367	0 %	25 %	50 %	25 %	218442448
47	NC_011737	GCAA	2	8	16262	16269	50 %	0 %	25 %	25 %	218442448
48	NC_011737	AATT	2	8	16838	16845	50 %	50 %	0 %	0 %	218442448
49	NC_011737	ACCA	2	8	17109	17116	50 %	0 %	0 %	50 %	218442448
50	NC_011737	CCAG	2	8	17139	17146	25 %	0 %	25 %	50 %	218442448
51	NC_011737	TAAG	2	8	17426	17433	50 %	25 %	25 %	0 %	218442448
52	NC_011737	TGAT	2	8	17501	17508	25 %	50 %	25 %	0 %	218442448
53	NC_011737	TTTA	2	8	17960	17967	25 %	75 %	0 %	0 %	218442449
54	NC_011737	ATTG	2	8	18020	18027	25 %	50 %	25 %	0 %	218442449
55	NC_011737	CGGA	2	8	18203	18210	25 %	0 %	50 %	25 %	218442449
56	NC_011737	ATCA	2	8	21172	21179	50 %	25 %	0 %	25 %	218442451
57	NC_011737	TATT	2	8	21182	21189	25 %	75 %	0 %	0 %	218442451
58	NC_011737	CTCG	2	8	21196	21203	0 %	25 %	25 %	50 %	218442451
59	NC_011737	TTAA	2	8	21985	21992	50 %	50 %	0 %	0 %	218442452
60	NC_011737	ATAG	2	8	22024	22031	50 %	25 %	25 %	0 %	218442452
61	NC_011737	TGCT	2	8	24112	24119	0 %	50 %	25 %	25 %	218442455
62	NC_011737	TATC	2	8	24167	24174	25 %	50 %	0 %	25 %	218442455
63	NC_011737	GAAT	2	8	25008	25015	50 %	25 %	25 %	0 %	218442457
64	NC_011737	TGGA	2	8	28134	28141	25 %	25 %	50 %	0 %	218442459
65	NC_011737	GCAA	2	8	29867	29874	50 %	0 %	25 %	25 %	218442461
66	NC_011737	TGCT	2	8	29875	29882	0 %	50 %	25 %	25 %	218442461
67	NC_011737	TGAA	2	8	29899	29906	50 %	25 %	25 %	0 %	218442461
68	NC_011737	GATT	2	8	29989	29996	25 %	50 %	25 %	0 %	218442461
69	NC_011737	TATT	2	8	31534	31541	25 %	75 %	0 %	0 %	218442464
70	NC_011737	CTTC	2	8	32407	32414	0 %	50 %	0 %	50 %	218442465
71	NC_011737	AGTT	2	8	32507	32514	25 %	50 %	25 %	0 %	218442465
72	NC_011737	CTTT	2	8	32594	32601	0 %	75 %	0 %	25 %	218442465
73	NC_011737	AAAT	2	8	32722	32729	75 %	25 %	0 %	0 %	218442465
74	NC_011737	AATA	2	8	32903	32910	75 %	25 %	0 %	0 %	218442465
75	NC_011737	TCTA	2	8	32973	32980	25 %	50 %	0 %	25 %	218442465
76	NC_011737	AAGC	2	8	33130	33137	50 %	0 %	25 %	25 %	218442465
77	NC_011737	ATTC	2	8	33258	33265	25 %	50 %	0 %	25 %	218442465
78	NC_011737	GATT	2	8	33836	33843	25 %	50 %	25 %	0 %	218442467
79	NC_011737	AGGA	2	8	34456	34463	50 %	0 %	50 %	0 %	218442468
80	NC_011737	CGAT	2	8	34467	34474	25 %	25 %	25 %	25 %	218442468
81	NC_011737	CTAG	2	8	34939	34946	25 %	25 %	25 %	25 %	218442469
82	NC_011737	TTGA	2	8	35074	35081	25 %	50 %	25 %	0 %	218442469
83	NC_011737	TATC	2	8	35083	35090	25 %	50 %	0 %	25 %	218442469
84	NC_011737	AAAC	2	8	35454	35461	75 %	0 %	0 %	25 %	218442469
85	NC_011737	TTTA	2	8	35544	35551	25 %	75 %	0 %	0 %	218442469
86	NC_011737	ACAA	2	8	35748	35755	75 %	0 %	0 %	25 %	218442469
87	NC_011737	AATT	2	8	36472	36479	50 %	50 %	0 %	0 %	218442470
88	NC_011737	AATT	2	8	36664	36671	50 %	50 %	0 %	0 %	218442470
89	NC_011737	TTCT	2	8	37596	37603	0 %	75 %	0 %	25 %	218442470
90	NC_011737	GATT	2	8	37985	37992	25 %	50 %	25 %	0 %	218442470
91	NC_011737	AGTA	2	8	38883	38890	50 %	25 %	25 %	0 %	218442470
92	NC_011737	AATA	2	8	39198	39205	75 %	25 %	0 %	0 %	218442470
93	NC_011737	ATTT	2	8	39400	39407	25 %	75 %	0 %	0 %	218442470
94	NC_011737	GAAT	2	8	40089	40096	50 %	25 %	25 %	0 %	218442471
95	NC_011737	GAAG	2	8	40151	40158	50 %	0 %	50 %	0 %	218442471
96	NC_011737	ATGA	2	8	40815	40822	50 %	25 %	25 %	0 %	218442472
97	NC_011737	ATTG	2	8	41449	41456	25 %	50 %	25 %	0 %	218442473
98	NC_011737	ATTT	2	8	41462	41469	25 %	75 %	0 %	0 %	218442473
99	NC_011737	ATAA	2	8	41625	41632	75 %	25 %	0 %	0 %	218442473
100	NC_011737	TGGT	2	8	41836	41843	0 %	50 %	50 %	0 %	218442474
101	NC_011737	TTCT	2	8	42503	42510	0 %	75 %	0 %	25 %	218442474
102	NC_011737	ATAA	2	8	42815	42822	75 %	25 %	0 %	0 %	218442474
103	NC_011737	TCTT	2	8	43138	43145	0 %	75 %	0 %	25 %	218442475
104	NC_011737	GAGT	2	8	43584	43591	25 %	25 %	50 %	0 %	218442475
105	NC_011737	AATC	2	8	44836	44843	50 %	25 %	0 %	25 %	218442477
106	NC_011737	TTAA	2	8	45271	45278	50 %	50 %	0 %	0 %	218442477
107	NC_011737	AAAG	2	8	45712	45719	75 %	0 %	25 %	0 %	218442478
108	NC_011737	ACAA	2	8	45772	45779	75 %	0 %	0 %	25 %	218442478
109	NC_011737	AGAT	2	8	45866	45873	50 %	25 %	25 %	0 %	218442478
110	NC_011737	GCTT	2	8	46081	46088	0 %	50 %	25 %	25 %	218442478
111	NC_011737	GATT	2	8	47110	47117	25 %	50 %	25 %	0 %	218442479
112	NC_011737	ATGT	2	8	47474	47481	25 %	50 %	25 %	0 %	218442479
113	NC_011737	CTTA	2	8	48200	48207	25 %	50 %	0 %	25 %	218442480
114	NC_011737	ATAG	2	8	48390	48397	50 %	25 %	25 %	0 %	218442480
115	NC_011737	AGGA	2	8	48553	48560	50 %	0 %	50 %	0 %	218442480
116	NC_011737	TCGG	2	8	48620	48627	0 %	25 %	50 %	25 %	218442480
117	NC_011737	ATCT	2	8	48805	48812	25 %	50 %	0 %	25 %	218442480
118	NC_011737	TCTT	2	8	48859	48866	0 %	75 %	0 %	25 %	218442480
119	NC_011737	GTTG	2	8	50309	50316	0 %	50 %	50 %	0 %	218442481
120	NC_011737	AATT	2	8	51374	51381	50 %	50 %	0 %	0 %	218442481
121	NC_011737	GGTT	2	8	51496	51503	0 %	50 %	50 %	0 %	218442481
122	NC_011737	GGTT	2	8	51643	51650	0 %	50 %	50 %	0 %	218442481
123	NC_011737	ATCT	2	8	52584	52591	25 %	50 %	0 %	25 %	218442482
124	NC_011737	TAGA	2	8	53185	53192	50 %	25 %	25 %	0 %	218442482
125	NC_011737	ATTG	2	8	53213	53220	25 %	50 %	25 %	0 %	218442482
126	NC_011737	TTTA	2	8	53365	53372	25 %	75 %	0 %	0 %	218442482
127	NC_011737	CTTT	2	8	54383	54390	0 %	75 %	0 %	25 %	218442483
128	NC_011737	ATTG	2	8	54843	54850	25 %	50 %	25 %	0 %	218442483
129	NC_011737	TCTG	2	8	56216	56223	0 %	50 %	25 %	25 %	218442484
130	NC_011737	TCAA	2	8	57503	57510	50 %	25 %	0 %	25 %	218442485
131	NC_011737	CCTT	2	8	57601	57608	0 %	50 %	0 %	50 %	218442485
132	NC_011737	CGAG	2	8	57664	57671	25 %	0 %	50 %	25 %	218442485
133	NC_011737	CAAA	2	8	57868	57875	75 %	0 %	0 %	25 %	218442485
134	NC_011737	AATT	2	8	57888	57895	50 %	50 %	0 %	0 %	218442485
135	NC_011737	GAAA	2	8	58128	58135	75 %	0 %	25 %	0 %	218442485
136	NC_011737	AATT	2	8	58283	58290	50 %	50 %	0 %	0 %	218442485
137	NC_011737	CTTT	2	8	58333	58340	0 %	75 %	0 %	25 %	218442485
138	NC_011737	CTCA	2	8	58382	58389	25 %	25 %	0 %	50 %	218442485
139	NC_011737	GGAA	2	8	58637	58644	50 %	0 %	50 %	0 %	218442485
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.