MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742405

Total Repeats: 164

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011733	TAT	2	6	780	785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442326
2	NC_011733	TCC	2	6	881	886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442326
3	NC_011733	TAA	2	6	898	903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442326
4	NC_011733	TCT	2	6	923	928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442326
5	NC_011733	AGA	2	6	931	936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442326
6	NC_011733	ATT	2	6	938	943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442326
7	NC_011733	ATC	2	6	976	981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442326
8	NC_011733	TAA	2	6	1065	1070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442326
9	NC_011733	CAA	2	6	1104	1109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442326
10	NC_011733	TAA	2	6	1162	1167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442326
11	NC_011733	TTC	2	6	1209	1214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442326
12	NC_011733	TCA	2	6	1418	1423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442326
13	NC_011733	TCT	2	6	1586	1591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442326
14	NC_011733	AGA	2	6	1657	1662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442326
15	NC_011733	ATC	2	6	1777	1782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442326
16	NC_011733	TCT	2	6	1850	1855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442326
17	NC_011733	ATG	2	6	1892	1897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442326
18	NC_011733	ATT	2	6	2128	2133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442327
19	NC_011733	AGA	2	6	2139	2144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442327
20	NC_011733	AAC	2	6	2182	2187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442327
21	NC_011733	TAT	2	6	2262	2267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442327
22	NC_011733	ACA	2	6	2268	2273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442327
23	NC_011733	TCT	2	6	2400	2405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442327
24	NC_011733	TGA	2	6	2520	2525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442327
25	NC_011733	CTT	2	6	2848	2853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442327
26	NC_011733	TCA	2	6	2896	2901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442327
27	NC_011733	TCA	2	6	2950	2955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442327
28	NC_011733	AGT	2	6	2979	2984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442327
29	NC_011733	TAG	2	6	2990	2995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442327
30	NC_011733	GTT	2	6	3067	3072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442327
31	NC_011733	GTA	2	6	3161	3166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442327
32	NC_011733	CAA	2	6	3176	3181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442327
33	NC_011733	ATT	2	6	3274	3279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442327
34	NC_011733	AGT	3	9	3280	3288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442327
35	NC_011733	AGA	2	6	3563	3568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442328
36	NC_011733	TTA	2	6	3608	3613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442328
37	NC_011733	TGA	2	6	3623	3628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442328
38	NC_011733	TAA	2	6	3801	3806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442328
39	NC_011733	TTG	2	6	7463	7468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442329
40	NC_011733	GCC	2	6	7494	7499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218442329
41	NC_011733	AAT	2	6	7541	7546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442329
42	NC_011733	AAT	2	6	7550	7555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442329
43	NC_011733	TCC	2	6	7556	7561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442329
44	NC_011733	TAT	2	6	7570	7575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442329
45	NC_011733	TAT	2	6	7627	7632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442329
46	NC_011733	GTT	2	6	7783	7788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442329
47	NC_011733	CAT	2	6	7799	7804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442329
48	NC_011733	GAT	2	6	7821	7826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442329
49	NC_011733	TTA	2	6	7833	7838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442329
50	NC_011733	CAG	2	6	7852	7857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442329
51	NC_011733	TGT	2	6	7896	7901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442329
52	NC_011733	TCA	2	6	8103	8108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442329
53	NC_011733	GGA	2	6	8109	8114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442329
54	NC_011733	ATT	2	6	8183	8188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442329
55	NC_011733	TTC	2	6	8201	8206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442329
56	NC_011733	GGA	2	6	8211	8216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442329
57	NC_011733	CTT	2	6	8224	8229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442329
58	NC_011733	GAG	2	6	8238	8243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442329
59	NC_011733	GTT	2	6	8245	8250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442329
60	NC_011733	TGT	2	6	8310	8315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442329
61	NC_011733	ACT	2	6	8426	8431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442329
62	NC_011733	AGA	2	6	8540	8545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442329
63	NC_011733	GTC	2	6	8627	8632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442329
64	NC_011733	CTG	2	6	8644	8649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442329
65	NC_011733	CTG	2	6	8743	8748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442329
66	NC_011733	TTC	2	6	8777	8782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442329
67	NC_011733	TCA	2	6	8802	8807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442329
68	NC_011733	TCC	2	6	8865	8870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442329
69	NC_011733	TGG	2	6	8935	8940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442329
70	NC_011733	CAT	2	6	8990	8995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442329
71	NC_011733	GCG	2	6	8997	9002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442329
72	NC_011733	TTC	2	6	9047	9052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442329
73	NC_011733	TAA	2	6	9092	9097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442329
74	NC_011733	AGT	2	6	9203	9208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442329
75	NC_011733	CAG	2	6	9209	9214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442329
76	NC_011733	CCA	2	6	9265	9270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442329
77	NC_011733	CAT	2	6	9448	9453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442329
78	NC_011733	TCA	2	6	9522	9527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442329
79	NC_011733	GAT	2	6	9607	9612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442329
80	NC_011733	GAT	2	6	10038	10043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442330
81	NC_011733	AAG	2	6	10150	10155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442330
82	NC_011733	TTA	2	6	10181	10186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442331
83	NC_011733	TGT	2	6	10216	10221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442331
84	NC_011733	CTC	2	6	10256	10261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442331
85	NC_011733	AAT	2	6	10290	10295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442331
86	NC_011733	TAG	2	6	10436	10441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442331
87	NC_011733	ATT	2	6	10685	10690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442331
88	NC_011733	TGT	2	6	10922	10927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442331
89	NC_011733	ATT	2	6	11792	11797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442332
90	NC_011733	TAT	2	6	11809	11814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442332
91	NC_011733	AAT	2	6	11889	11894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442332
92	NC_011733	ATT	2	6	11990	11995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442332
93	NC_011733	ACA	2	6	12027	12032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442332
94	NC_011733	ATT	2	6	12041	12046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442332
95	NC_011733	CAT	2	6	12103	12108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442332
96	NC_011733	ATT	2	6	12119	12124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442332
97	NC_011733	ATT	2	6	12134	12139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442332
98	NC_011733	CTG	2	6	12232	12237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442332
99	NC_011733	TAT	2	6	12371	12376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442332
100	NC_011733	ATT	2	6	12393	12398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442332
101	NC_011733	AAT	2	6	12497	12502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442332
102	NC_011733	TAA	2	6	12583	12588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442332
103	NC_011733	AAG	2	6	12712	12717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442332
104	NC_011733	ATT	2	6	12741	12746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442332
105	NC_011733	AAT	2	6	12747	12752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442332
106	NC_011733	AGA	2	6	12755	12760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442332
107	NC_011733	TAA	2	6	12767	12772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442332
108	NC_011733	ATT	2	6	13239	13244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442333
109	NC_011733	ATC	3	9	13287	13295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442333
110	NC_011733	TGC	2	6	13524	13529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442333
111	NC_011733	TAA	2	6	13587	13592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442333
112	NC_011733	TTA	2	6	13594	13599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442333
113	NC_011733	TAA	2	6	13744	13749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442334
114	NC_011733	TCA	2	6	13763	13768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442334
115	NC_011733	ATG	2	6	13816	13821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442334
116	NC_011733	GCC	2	6	13892	13897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218442335
117	NC_011733	ATG	2	6	14142	14147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442335
118	NC_011733	ATT	2	6	14195	14200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442336
119	NC_011733	ACC	2	6	14222	14227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442336
120	NC_011733	CCA	2	6	14276	14281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442336
121	NC_011733	ATA	2	6	14311	14316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442336
122	NC_011733	ATT	2	6	14409	14414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442336
123	NC_011733	TTG	2	6	14453	14458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442336
124	NC_011733	CTT	2	6	14509	14514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442336
125	NC_011733	CTT	2	6	14566	14571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442336
126	NC_011733	TAA	2	6	14624	14629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442336
127	NC_011733	ATT	2	6	15118	15123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442337
128	NC_011733	TGA	2	6	15320	15325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442337
129	NC_011733	ATT	2	6	15424	15429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442337
130	NC_011733	TAA	2	6	15451	15456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442337
131	NC_011733	CTG	3	9	15982	15990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442338
132	NC_011733	AGA	2	6	16113	16118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442338
133	NC_011733	CAT	2	6	16308	16313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442339
134	NC_011733	CAA	2	6	16515	16520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442339
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137	NC_011733	ATC	2	6	16713	16718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442340
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142	NC_011733	TCA	2	6	16957	16962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442340
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159	NC_011733	TTG	2	6	17861	17866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442341
160	NC_011733	AAG	2	6	17867	17872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442341
161	NC_011733	CTG	3	9	17884	17892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442341
162	NC_011733	CAG	2	6	17917	17922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442341
163	NC_011733	TAT	2	6	17959	17964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442341
164	NC_011733	CCA	2	6	18000	18005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442341

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.