MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742404

Total Repeats: 212

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011732	CAG	2	6	288	293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442306
2	NC_011732	TCC	2	6	326	331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442306
3	NC_011732	GTT	2	6	379	384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442306
4	NC_011732	GTA	2	6	425	430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442306
5	NC_011732	ATC	2	6	485	490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442306
6	NC_011732	CCA	2	6	584	589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442306
7	NC_011732	TGG	2	6	617	622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442306
8	NC_011732	TGC	2	6	634	639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442306
9	NC_011732	CCA	2	6	686	691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442306
10	NC_011732	AAT	2	6	694	699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442306
11	NC_011732	TCA	2	6	800	805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442306
12	NC_011732	TCT	2	6	930	935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442306
13	NC_011732	CCA	2	6	1016	1021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442306
14	NC_011732	AGA	2	6	1046	1051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442306
15	NC_011732	CAA	2	6	1065	1070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442306
16	NC_011732	TCT	2	6	1175	1180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442306
17	NC_011732	AGG	2	6	1267	1272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442306
18	NC_011732	TAT	2	6	1293	1298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442306
19	NC_011732	GCA	2	6	1431	1436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442306
20	NC_011732	CTC	2	6	1528	1533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442306
21	NC_011732	CTT	2	6	1576	1581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442306
22	NC_011732	TCT	2	6	1676	1681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442306
23	NC_011732	CGA	2	6	1754	1759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442306
24	NC_011732	AGG	2	6	1840	1845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442306
25	NC_011732	TAA	2	6	1900	1905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442306
26	NC_011732	TAA	2	6	1947	1952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442306
27	NC_011732	TAA	2	6	1980	1985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442306
28	NC_011732	GAT	2	6	2025	2030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442306
29	NC_011732	TAT	2	6	2049	2054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442306
30	NC_011732	GCT	2	6	2061	2066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442306
31	NC_011732	CGC	2	6	2244	2249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218442306
32	NC_011732	AGG	2	6	2309	2314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442306
33	NC_011732	AAG	2	6	2683	2688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442307
34	NC_011732	GAT	2	6	2846	2851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442307
35	NC_011732	TAT	2	6	2931	2936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442307
36	NC_011732	GAA	2	6	2945	2950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442307
37	NC_011732	AGC	2	6	3002	3007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442307
38	NC_011732	TCA	2	6	3050	3055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442307
39	NC_011732	GAT	2	6	3060	3065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442307
40	NC_011732	TAA	2	6	3132	3137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442307
41	NC_011732	AGA	2	6	3170	3175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442307
42	NC_011732	TGG	2	6	3195	3200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442307
43	NC_011732	CAT	2	6	3210	3215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442307
44	NC_011732	CAA	2	6	3249	3254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442307
45	NC_011732	TAA	2	6	3277	3282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442307
46	NC_011732	CTT	2	6	3688	3693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442308
47	NC_011732	TTG	2	6	3694	3699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442308
48	NC_011732	ATA	2	6	3756	3761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442308
49	NC_011732	AAT	2	6	3791	3796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442308
50	NC_011732	ATA	2	6	3957	3962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442308
51	NC_011732	TTC	2	6	4121	4126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442308
52	NC_011732	AAG	2	6	6137	6142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442309
53	NC_011732	CAT	2	6	6218	6223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442309
54	NC_011732	TCC	2	6	6293	6298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442309
55	NC_011732	CAA	2	6	6542	6547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442309
56	NC_011732	TCG	2	6	6994	6999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442310
57	NC_011732	AGC	2	6	7554	7559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442311
58	NC_011732	GCC	2	6	7664	7669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218442311
59	NC_011732	GCT	2	6	8215	8220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442311
60	NC_011732	GGA	2	6	8332	8337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442311
61	NC_011732	CTT	2	6	8366	8371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442311
62	NC_011732	GAA	2	6	8416	8421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442311
63	NC_011732	TTA	2	6	8501	8506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442311
64	NC_011732	TCT	2	6	8563	8568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442311
65	NC_011732	ACA	2	6	8573	8578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442311
66	NC_011732	ACA	2	6	8593	8598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442311
67	NC_011732	TAA	2	6	8646	8651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442311
68	NC_011732	ACA	2	6	8660	8665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442311
69	NC_011732	AAG	2	6	8693	8698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442311
70	NC_011732	TAA	2	6	8931	8936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442311
71	NC_011732	GCG	3	9	9061	9069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442311
72	NC_011732	GAC	2	6	9077	9082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442311
73	NC_011732	TAG	2	6	9155	9160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442311
74	NC_011732	GCA	2	6	9171	9176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442311
75	NC_011732	CGG	2	6	9331	9336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442311
76	NC_011732	ATC	2	6	9392	9397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442311
77	NC_011732	ACG	2	6	9432	9437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442311
78	NC_011732	GTC	2	6	9595	9600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442311
79	NC_011732	TCT	2	6	9616	9621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442311
80	NC_011732	GAT	2	6	9724	9729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442311
81	NC_011732	ATG	2	6	9731	9736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442311
82	NC_011732	CTT	2	6	9740	9745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442311
83	NC_011732	GAC	2	6	9973	9978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442311
84	NC_011732	GAC	2	6	9985	9990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442311
85	NC_011732	GAC	2	6	9997	10002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442311
86	NC_011732	GAC	2	6	10009	10014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442311
87	NC_011732	GAC	2	6	10042	10047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442311
88	NC_011732	GAC	2	6	10051	10056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442311
89	NC_011732	ACT	2	6	10060	10065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442311
90	NC_011732	AGA	2	6	10101	10106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442311
91	NC_011732	TCC	3	9	10137	10145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442311
92	NC_011732	GGA	2	6	10160	10165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442311
93	NC_011732	ATA	2	6	10169	10174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442311
94	NC_011732	GTC	2	6	10195	10200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442311
95	NC_011732	GTC	2	6	10204	10209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442311
96	NC_011732	GTC	2	6	10261	10266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442311
97	NC_011732	GTC	2	6	10273	10278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442311
98	NC_011732	ATA	2	6	10304	10309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442311
99	NC_011732	TTC	2	6	10362	10367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442311
100	NC_011732	CGA	2	6	10967	10972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442312
101	NC_011732	CTC	2	6	10977	10982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442312
102	NC_011732	CCG	2	6	11066	11071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218442312
103	NC_011732	ACG	2	6	11107	11112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442312
104	NC_011732	CAA	2	6	11115	11120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442312
105	NC_011732	GAA	3	9	11223	11231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442312
106	NC_011732	AAT	2	6	11325	11330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442312
107	NC_011732	GTT	2	6	11523	11528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442312
108	NC_011732	GAA	2	6	11598	11603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442312
109	NC_011732	ACG	2	6	11734	11739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442312
110	NC_011732	GAG	2	6	11761	11766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442312
111	NC_011732	TGT	2	6	11789	11794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442312
112	NC_011732	TGG	2	6	11867	11872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442313
113	NC_011732	TGA	2	6	11888	11893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442313
114	NC_011732	CAA	3	9	11916	11924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442313
115	NC_011732	GGC	2	6	11942	11947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442313
116	NC_011732	GCC	2	6	12030	12035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218442313
117	NC_011732	TGT	2	6	12169	12174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442313
118	NC_011732	AGA	2	6	12284	12289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442313
119	NC_011732	TTC	2	6	12292	12297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442313
120	NC_011732	GAA	2	6	12325	12330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442313
121	NC_011732	TGA	2	6	12511	12516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442314
122	NC_011732	TCT	2	6	12578	12583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442314
123	NC_011732	ATC	2	6	12591	12596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442314
124	NC_011732	TGA	2	6	12727	12732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442315
125	NC_011732	ATG	2	6	12734	12739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442315
126	NC_011732	TTA	2	6	12792	12797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442315
127	NC_011732	TCC	2	6	13408	13413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442316
128	NC_011732	TCA	2	6	13427	13432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442316
129	NC_011732	TGG	2	6	13441	13446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442316
130	NC_011732	AAT	2	6	13468	13473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442316
131	NC_011732	AGA	2	6	13550	13555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442316
132	NC_011732	TTC	2	6	13600	13605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442316
133	NC_011732	TGT	2	6	13628	13633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442316
134	NC_011732	AAC	2	6	13737	13742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442316
135	NC_011732	TTC	2	6	13889	13894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442316
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139	NC_011732	GTG	2	6	14200	14205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442316
140	NC_011732	TTC	2	6	14254	14259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442316
141	NC_011732	TTC	2	6	14320	14325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442316
142	NC_011732	TCT	2	6	14438	14443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442316
143	NC_011732	TCA	2	6	14444	14449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442316
144	NC_011732	ATT	2	6	14474	14479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442316
145	NC_011732	ATC	2	6	14509	14514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442316
146	NC_011732	AAT	2	6	14515	14520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442316
147	NC_011732	TCA	2	6	14570	14575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442316
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149	NC_011732	AGA	2	6	15679	15684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442317
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151	NC_011732	AAT	2	6	16459	16464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442318
152	NC_011732	GAT	2	6	16471	16476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442318
153	NC_011732	CTT	2	6	16553	16558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442318
154	NC_011732	TTG	2	6	16587	16592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442318
155	NC_011732	TAC	2	6	16638	16643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442319
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158	NC_011732	AAC	2	6	16988	16993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442319
159	NC_011732	TGT	2	6	17006	17011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442319
160	NC_011732	TTG	2	6	18002	18007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442320
161	NC_011732	CAA	2	6	18142	18147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442320
162	NC_011732	ATT	2	6	18208	18213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442320
163	NC_011732	CGT	3	9	18255	18263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442320
164	NC_011732	ATG	2	6	18268	18273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442320
165	NC_011732	CAT	2	6	18334	18339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442320
166	NC_011732	GGC	2	6	18758	18763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442321
167	NC_011732	CAA	2	6	18882	18887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442321
168	NC_011732	CAT	2	6	19053	19058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442321
169	NC_011732	GTG	2	6	19063	19068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442321
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177	NC_011732	TGA	2	6	19864	19869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442322
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179	NC_011732	CTT	2	6	20030	20035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442322
180	NC_011732	TTC	2	6	20117	20122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442322
181	NC_011732	GTC	2	6	20265	20270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442322
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212	NC_011732	TCT	3	9	22426	22434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442324

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.