MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742403

Total Repeats: 306

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011730	TAG	2	6	370	375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442242
2	NC_011730	AAT	2	6	378	383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442242
3	NC_011730	TTG	2	6	417	422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442242
4	NC_011730	TGT	2	6	448	453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442242
5	NC_011730	GTC	2	6	528	533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442242
6	NC_011730	TTA	2	6	589	594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442242
7	NC_011730	GAC	2	6	627	632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442242
8	NC_011730	TGA	2	6	883	888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442243
9	NC_011730	CGT	2	6	1011	1016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442243
10	NC_011730	GCC	2	6	1125	1130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218442243
11	NC_011730	TGA	2	6	1252	1257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442243
12	NC_011730	GAT	2	6	1259	1264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442243
13	NC_011730	TTC	2	6	1294	1299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442243
14	NC_011730	GGA	2	6	1407	1412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442243
15	NC_011730	TTA	2	6	1428	1433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442243
16	NC_011730	GCG	2	6	1557	1562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442243
17	NC_011730	TTC	2	6	1679	1684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442243
18	NC_011730	CGA	2	6	1690	1695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442243
19	NC_011730	TTC	2	6	1815	1820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442244
20	NC_011730	AAT	2	6	1920	1925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442244
21	NC_011730	ACG	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442244
22	NC_011730	AGA	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442244
23	NC_011730	CGA	2	6	2273	2278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442245
24	NC_011730	TAA	2	6	2287	2292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442245
25	NC_011730	GTT	2	6	2325	2330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442245
26	NC_011730	ATA	2	6	2336	2341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442245
27	NC_011730	GTT	2	6	2418	2423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442246
28	NC_011730	CTG	2	6	2460	2465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442246
29	NC_011730	TGT	2	6	2480	2485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442246
30	NC_011730	ATT	2	6	2539	2544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442246
31	NC_011730	TTC	2	6	2551	2556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442246
32	NC_011730	CTG	2	6	2676	2681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442246
33	NC_011730	AAT	2	6	2693	2698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442246
34	NC_011730	GAT	2	6	2701	2706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442246
35	NC_011730	CTT	2	6	2724	2729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442246
36	NC_011730	GTT	2	6	2817	2822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442246
37	NC_011730	TAA	2	6	2902	2907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442246
38	NC_011730	ACT	2	6	2929	2934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442246
39	NC_011730	TTG	2	6	2992	2997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442246
40	NC_011730	GAT	2	6	3795	3800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442247
41	NC_011730	ATG	2	6	3816	3821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442247
42	NC_011730	TCT	2	6	3867	3872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442247
43	NC_011730	AGA	2	6	3887	3892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442247
44	NC_011730	TTA	2	6	3915	3920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442247
45	NC_011730	TCA	2	6	4054	4059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442248
46	NC_011730	ATT	2	6	4166	4171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442248
47	NC_011730	CTC	2	6	4180	4185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442248
48	NC_011730	ATT	2	6	4274	4279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442249
49	NC_011730	CAA	2	6	4322	4327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442249
50	NC_011730	TAC	2	6	4394	4399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442249
51	NC_011730	ATT	2	6	4400	4405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442249
52	NC_011730	CTG	2	6	4551	4556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442249
53	NC_011730	TTC	2	6	4894	4899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442250
54	NC_011730	TCA	2	6	4951	4956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442250
55	NC_011730	GCA	2	6	4978	4983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442250
56	NC_011730	ACC	2	6	5008	5013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442250
57	NC_011730	CCG	2	6	5027	5032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218442250
58	NC_011730	GAA	2	6	5086	5091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442250
59	NC_011730	ATT	2	6	5422	5427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442251
60	NC_011730	AAC	2	6	5442	5447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442251
61	NC_011730	CAG	2	6	5501	5506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442251
62	NC_011730	GCC	2	6	5630	5635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218442251
63	NC_011730	CCA	2	6	5743	5748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442251
64	NC_011730	CGA	2	6	5749	5754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442251
65	NC_011730	AAC	2	6	5847	5852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442251
66	NC_011730	TTA	2	6	5881	5886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442251
67	NC_011730	GAT	2	6	5942	5947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442251
68	NC_011730	GTA	2	6	6006	6011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442251
69	NC_011730	TAC	2	6	6369	6374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442251
70	NC_011730	AAC	2	6	6427	6432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442251
71	NC_011730	ATT	2	6	6461	6466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442251
72	NC_011730	ATT	2	6	6527	6532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442251
73	NC_011730	GCT	2	6	6704	6709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442251
74	NC_011730	GCG	2	6	6710	6715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442251
75	NC_011730	TCT	2	6	6743	6748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442251
76	NC_011730	TAG	2	6	6810	6815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442251
77	NC_011730	TCA	2	6	6833	6838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442251
78	NC_011730	TAA	3	9	6874	6882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442251
79	NC_011730	AAC	2	6	6909	6914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442251
80	NC_011730	CTC	2	6	6947	6952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442251
81	NC_011730	CAC	2	6	7165	7170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442251
82	NC_011730	TAG	2	6	7393	7398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442251
83	NC_011730	TAC	2	6	7406	7411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442251
84	NC_011730	ATT	2	6	7690	7695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442251
85	NC_011730	TAG	2	6	7729	7734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442251
86	NC_011730	ATT	2	6	7752	7757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442251
87	NC_011730	GCA	2	6	7775	7780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442251
88	NC_011730	AGA	2	6	7936	7941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442251
89	NC_011730	ATC	2	6	7951	7956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442251
90	NC_011730	CAT	2	6	7983	7988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442251
91	NC_011730	CCT	2	6	8031	8036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442251
92	NC_011730	CTT	2	6	8127	8132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442251
93	NC_011730	GAA	2	6	8165	8170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442251
94	NC_011730	CAT	2	6	8177	8182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442251
95	NC_011730	AAC	2	6	8199	8204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442251
96	NC_011730	AAT	2	6	8281	8286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442251
97	NC_011730	GAA	2	6	8411	8416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442251
98	NC_011730	GAA	2	6	8428	8433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442251
99	NC_011730	AAG	2	6	8496	8501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442251
100	NC_011730	GAA	2	6	8548	8553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442251
101	NC_011730	AGA	2	6	8557	8562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442251
102	NC_011730	CAG	2	6	8597	8602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442251
103	NC_011730	ATG	2	6	8637	8642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442251
104	NC_011730	ATA	2	6	8664	8669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442251
105	NC_011730	GGA	2	6	8678	8683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442251
106	NC_011730	ATT	2	6	8684	8689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442251
107	NC_011730	AGA	2	6	8755	8760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442251
108	NC_011730	TTG	2	6	8960	8965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442252
109	NC_011730	TCC	2	6	8997	9002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218442252
110	NC_011730	CCG	2	6	9058	9063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218442252
111	NC_011730	GAC	2	6	9079	9084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442252
112	NC_011730	TAA	2	6	9088	9093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442252
113	NC_011730	CTT	2	6	9211	9216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442252
114	NC_011730	CTT	2	6	9328	9333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442252
115	NC_011730	AAT	2	6	9350	9355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442252
116	NC_011730	AAG	2	6	9440	9445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442252
117	NC_011730	AAT	2	6	9458	9463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442252
118	NC_011730	CTA	2	6	9711	9716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442252
119	NC_011730	ATC	2	6	9750	9755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442252
120	NC_011730	TCA	2	6	9762	9767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442252
121	NC_011730	GAA	2	6	9876	9881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442252
122	NC_011730	CAT	2	6	9907	9912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442252
123	NC_011730	TGT	2	6	9990	9995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442252
124	NC_011730	TTG	5	15	10022	10036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442252
125	NC_011730	TGA	2	6	10344	10349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442252
126	NC_011730	CCA	2	6	10406	10411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442252
127	NC_011730	TAA	3	9	10427	10435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442252
128	NC_011730	TGT	2	6	10548	10553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442252
129	NC_011730	TAA	2	6	10562	10567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442252
130	NC_011730	AGA	2	6	10653	10658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442252
131	NC_011730	GTT	2	6	10874	10879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442252
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.