MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 chromosome

Total Repeats: 101350

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011729	GAT	2	6	198535	198540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437190
3502	NC_011729	TGT	2	6	198634	198639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437190
3503	NC_011729	AAT	2	6	198694	198699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437190
3504	NC_011729	ATTAT	2	10	198792	198801	40 %	60 %	0 %	0 %	218437190
3505	NC_011729	ATC	2	6	198812	198817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437190
3506	NC_011729	GCT	2	6	199311	199316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437191
3507	NC_011729	ATC	2	6	199349	199354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437191
3508	NC_011729	GAAC	2	8	199404	199411	50 %	0 %	25 %	25 %	218437191
3509	NC_011729	CGG	2	6	199450	199455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218437191
3510	NC_011729	TGT	3	9	199507	199515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437191
3511	NC_011729	TGT	3	9	199590	199598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437191
3512	NC_011729	T	6	6	199938	199943	0 %	100 %	0 %	0 %	218437192
3513	NC_011729	A	6	6	199990	199995	100 %	0 %	0 %	0 %	218437192
3514	NC_011729	T	6	6	200135	200140	0 %	100 %	0 %	0 %	218437192
3515	NC_011729	TTG	2	6	200214	200219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437192
3516	NC_011729	AAT	2	6	200289	200294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437192
3517	NC_011729	AGG	2	6	200298	200303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437192
3518	NC_011729	AAAGA	2	10	200333	200342	80 %	0 %	20 %	0 %	218437192
3519	NC_011729	TAA	2	6	200432	200437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437192
3520	NC_011729	ATA	2	6	200461	200466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437192
3521	NC_011729	ACA	2	6	200475	200480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437192
3522	NC_011729	CTC	2	6	200552	200557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437192
3523	NC_011729	TCA	2	6	200561	200566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437192
3524	NC_011729	T	6	6	200592	200597	0 %	100 %	0 %	0 %	218437192
3525	NC_011729	ATT	2	6	200598	200603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437192
3526	NC_011729	A	6	6	200606	200611	100 %	0 %	0 %	0 %	218437192
3527	NC_011729	ATC	2	6	200631	200636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437192
3528	NC_011729	AGG	2	6	200661	200666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437192
3529	NC_011729	GTT	2	6	200722	200727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437192
3530	NC_011729	TTCTAT	2	12	200733	200744	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	218437192
3531	NC_011729	AATT	2	8	200789	200796	50 %	50 %	0 %	0 %	218437192
3532	NC_011729	AATT	2	8	200857	200864	50 %	50 %	0 %	0 %	218437193
3533	NC_011729	T	6	6	200905	200910	0 %	100 %	0 %	0 %	218437193
3534	NC_011729	TTAAGA	2	12	200967	200978	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218437193
3535	NC_011729	TTA	2	6	201001	201006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437193
3536	NC_011729	A	6	6	201141	201146	100 %	0 %	0 %	0 %	218437193
3537	NC_011729	CT	3	6	201152	201157	0 %	50 %	0 %	50 %	218437193
3538	NC_011729	GGT	2	6	201206	201211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218437193
3539	NC_011729	AATT	2	8	201251	201258	50 %	50 %	0 %	0 %	218437193
3540	NC_011729	TTC	2	6	201320	201325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437193
3541	NC_011729	T	8	8	201350	201357	0 %	100 %	0 %	0 %	218437193
3542	NC_011729	AGA	2	6	201371	201376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437193
3543	NC_011729	TAT	2	6	201458	201463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437193
3544	NC_011729	AATA	2	8	201489	201496	75 %	25 %	0 %	0 %	218437193
3545	NC_011729	CGG	2	6	201520	201525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218437193
3546	NC_011729	GGC	2	6	201599	201604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218437193
3547	NC_011729	AAT	2	6	201621	201626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437193
3548	NC_011729	ATC	2	6	201635	201640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437193
3549	NC_011729	ACC	2	6	201695	201700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218437193
3550	NC_011729	AATT	2	8	201710	201717	50 %	50 %	0 %	0 %	218437193
3551	NC_011729	CTT	2	6	201793	201798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437193
3552	NC_011729	TTG	2	6	202063	202068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437193
3553	NC_011729	TTG	2	6	202197	202202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437194
3554	NC_011729	AACATC	2	12	202230	202241	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	218437194
3555	NC_011729	AAC	2	6	202242	202247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437194
3556	NC_011729	CGA	2	6	202287	202292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437194
3557	NC_011729	ACA	2	6	202630	202635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437195
3558	NC_011729	TGGG	2	8	202735	202742	0 %	25 %	75 %	0 %	218437195
3559	NC_011729	CTGG	2	8	202746	202753	0 %	25 %	50 %	25 %	218437195
3560	NC_011729	GTT	2	6	202856	202861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437195
3561	NC_011729	T	6	6	202878	202883	0 %	100 %	0 %	0 %	218437195
3562	NC_011729	AT	3	6	202885	202890	50 %	50 %	0 %	0 %	218437195
3563	NC_011729	AAC	2	6	202897	202902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437195
3564	NC_011729	T	6	6	202950	202955	0 %	100 %	0 %	0 %	218437195
3565	NC_011729	TTA	2	6	202971	202976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437195
3566	NC_011729	TTA	2	6	203031	203036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437195
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3569	NC_011729	GCC	2	6	203098	203103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218437195
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3571	NC_011729	AGA	2	6	203225	203230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437195
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3573	NC_011729	TAT	2	6	203734	203739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437196
3574	NC_011729	ATCT	2	8	203762	203769	25 %	50 %	0 %	25 %	218437196
3575	NC_011729	TTG	2	6	203784	203789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437196
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3577	NC_011729	TAG	2	6	203898	203903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437196
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3579	NC_011729	TTA	2	6	204034	204039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437196
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3581	NC_011729	T	6	6	204235	204240	0 %	100 %	0 %	0 %	218437196
3582	NC_011729	CTT	2	6	204285	204290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437196
3583	NC_011729	GCT	2	6	204572	204577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437197
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3585	NC_011729	CCGT	2	8	204669	204676	0 %	25 %	25 %	50 %	218437197
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3587	NC_011729	TCGCAT	2	12	204721	204732	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218437197
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3590	NC_011729	AGA	2	6	204895	204900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437197
3591	NC_011729	TTAA	2	8	204956	204963	50 %	50 %	0 %	0 %	218437197
3592	NC_011729	AAG	2	6	204981	204986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437197
3593	NC_011729	TC	3	6	205006	205011	0 %	50 %	0 %	50 %	218437197
3594	NC_011729	T	6	6	205027	205032	0 %	100 %	0 %	0 %	218437197
3595	NC_011729	GAAT	2	8	205084	205091	50 %	25 %	25 %	0 %	218437197
3596	NC_011729	AGA	2	6	205093	205098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437197
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3598	NC_011729	AGG	2	6	205266	205271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437197
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3602	NC_011729	TAA	2	6	205475	205480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437198
3603	NC_011729	A	7	7	205479	205485	100 %	0 %	0 %	0 %	218437198
3604	NC_011729	AGG	2	6	205538	205543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437198
3605	NC_011729	CCG	2	6	205632	205637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218437198
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3607	NC_011729	CAA	2	6	205653	205658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437198
3608	NC_011729	A	6	6	205687	205692	100 %	0 %	0 %	0 %	218437198
3609	NC_011729	CAA	2	6	205704	205709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437198
3610	NC_011729	ACA	2	6	205713	205718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437198
3611	NC_011729	AGTC	2	8	205736	205743	25 %	25 %	25 %	25 %	218437198
3612	NC_011729	AGA	2	6	205760	205765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437198
3613	NC_011729	TTA	2	6	205830	205835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437198
3614	NC_011729	GAC	2	6	205862	205867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437198
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3616	NC_011729	G	6	6	205953	205958	0 %	0 %	100 %	0 %	218437198
3617	NC_011729	CAG	2	6	205960	205965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437198
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3619	NC_011729	TTGT	2	8	206112	206119	0 %	75 %	25 %	0 %	218437198
3620	NC_011729	TGA	2	6	206205	206210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437199
3621	NC_011729	A	6	6	206215	206220	100 %	0 %	0 %	0 %	218437199
3622	NC_011729	T	7	7	206302	206308	0 %	100 %	0 %	0 %	218437199
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3624	NC_011729	TTA	2	6	206403	206408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437199
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3994	NC_011729	TGCGGG	2	12	232159	232170	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	218437219
3995	NC_011729	ATT	2	6	232211	232216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437219
3996	NC_011729	AGA	2	6	232225	232230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218437219
3997	NC_011729	GAC	2	6	232303	232308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437219
3998	NC_011729	TGG	2	6	232317	232322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218437219
3999	NC_011729	ACA	2	6	232324	232329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437219
4000	NC_011729	AAT	2	6	232411	232416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437219

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