MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 chromosome

Total Repeats: 101350

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011729	CAT	2	6	259895	259900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437244
4502	NC_011729	ATC	2	6	260109	260114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437244
4503	NC_011729	AAT	2	6	260222	260227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437244
4504	NC_011729	GAATA	2	10	260258	260267	60 %	20 %	20 %	0 %	218437244
4505	NC_011729	AAT	2	6	260338	260343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437244
4506	NC_011729	TAAATT	2	12	260411	260422	50 %	50 %	0 %	0 %	218437244
4507	NC_011729	TAC	2	6	260424	260429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218437244
4508	NC_011729	TGT	2	6	260558	260563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437244
4509	NC_011729	ATA	2	6	260577	260582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437244
4510	NC_011729	CAG	2	6	260615	260620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437244
4511	NC_011729	CCT	2	6	260623	260628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437244
4512	NC_011729	TAA	2	6	260639	260644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437244
4513	NC_011729	CAA	2	6	260666	260671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437244
4514	NC_011729	GGAG	2	8	260679	260686	25 %	0 %	75 %	0 %	218437244
4515	NC_011729	TAA	2	6	260757	260762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437244
4516	NC_011729	T	6	6	260797	260802	0 %	100 %	0 %	0 %	218437244
4517	NC_011729	GTTTT	2	10	260818	260827	0 %	80 %	20 %	0 %	218437244
4518	NC_011729	TTA	2	6	260938	260943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437244
4519	NC_011729	A	6	6	260961	260966	100 %	0 %	0 %	0 %	218437244
4520	NC_011729	GGTT	2	8	261032	261039	0 %	50 %	50 %	0 %	218437244
4521	NC_011729	TAT	2	6	261113	261118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437244
4522	NC_011729	GAAAT	2	10	261165	261174	60 %	20 %	20 %	0 %	218437244
4523	NC_011729	AATT	2	8	261209	261216	50 %	50 %	0 %	0 %	218437244
4524	NC_011729	TCC	2	6	261252	261257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218437244
4525	NC_011729	TTG	2	6	261285	261290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437244
4526	NC_011729	CCA	2	6	261298	261303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218437244
4527	NC_011729	TAG	2	6	261304	261309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437244
4528	NC_011729	AAATT	2	10	261313	261322	60 %	40 %	0 %	0 %	218437244
4529	NC_011729	T	6	6	262553	262558	0 %	100 %	0 %	0 %	218437245
4530	NC_011729	CTG	2	6	262584	262589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437245
4531	NC_011729	TTA	2	6	262590	262595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437245
4532	NC_011729	TGG	2	6	262606	262611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218437245
4533	NC_011729	T	7	7	262617	262623	0 %	100 %	0 %	0 %	218437245
4534	NC_011729	ATT	2	6	262694	262699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437245
4535	NC_011729	AAT	2	6	262705	262710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437245
4536	NC_011729	ATG	2	6	262716	262721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437245
4537	NC_011729	TAGATG	2	12	262741	262752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437245
4538	NC_011729	TTC	2	6	262795	262800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437245
4539	NC_011729	GCA	2	6	262838	262843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437245
4540	NC_011729	T	6	6	262876	262881	0 %	100 %	0 %	0 %	218437245
4541	NC_011729	GTC	2	6	262884	262889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218437245
4542	NC_011729	AAT	2	6	262898	262903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218437245
4543	NC_011729	AGG	2	6	262942	262947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437245
4544	NC_011729	TCT	2	6	262948	262953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437245
4545	NC_011729	TGG	2	6	263094	263099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218437245
4546	NC_011729	GAT	2	6	263107	263112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218437245
4547	NC_011729	T	6	6	263130	263135	0 %	100 %	0 %	0 %	218437245
4548	NC_011729	CAA	2	6	263159	263164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437245
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4550	NC_011729	TTTA	2	8	263244	263251	25 %	75 %	0 %	0 %	218437245
4551	NC_011729	TTTA	2	8	263269	263276	25 %	75 %	0 %	0 %	218437245
4552	NC_011729	TTA	2	6	263343	263348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437245
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4554	NC_011729	A	6	6	263472	263477	100 %	0 %	0 %	0 %	218437245
4555	NC_011729	GTT	2	6	263597	263602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218437245
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4557	NC_011729	TAGA	2	8	263899	263906	50 %	25 %	25 %	0 %	218437245
4558	NC_011729	TCT	2	6	264062	264067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437246
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4560	NC_011729	AATTA	2	10	264161	264170	60 %	40 %	0 %	0 %	218437246
4561	NC_011729	ATT	2	6	264270	264275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218437246
4562	NC_011729	A	6	6	264277	264282	100 %	0 %	0 %	0 %	218437246
4563	NC_011729	ATTT	2	8	264295	264302	25 %	75 %	0 %	0 %	218437246
4564	NC_011729	CAATA	2	10	264315	264324	60 %	20 %	0 %	20 %	218437246
4565	NC_011729	A	6	6	264391	264396	100 %	0 %	0 %	0 %	218437246
4566	NC_011729	CTT	2	6	264442	264447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437246
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4572	NC_011729	GGA	2	6	264734	264739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218437246
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4586	NC_011729	A	7	7	265555	265561	100 %	0 %	0 %	0 %	218437247
4587	NC_011729	AG	3	6	265576	265581	50 %	0 %	50 %	0 %	218437247
4588	NC_011729	CAA	2	6	265589	265594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437247
4589	NC_011729	AATC	2	8	265603	265610	50 %	25 %	0 %	25 %	218437247
4590	NC_011729	ACA	2	6	265613	265618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437247
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4601	NC_011729	AAC	2	6	266094	266099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218437247
4602	NC_011729	CGG	2	6	266115	266120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218437247
4603	NC_011729	TAGA	2	8	266142	266149	50 %	25 %	25 %	0 %	218437247
4604	NC_011729	AGC	2	6	266317	266322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218437247
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4607	NC_011729	T	6	6	266362	266367	0 %	100 %	0 %	0 %	218437247
4608	NC_011729	T	6	6	266388	266393	0 %	100 %	0 %	0 %	218437247
4609	NC_011729	AGAT	2	8	266523	266530	50 %	25 %	25 %	0 %	218437247
4610	NC_011729	CT	3	6	266545	266550	0 %	50 %	0 %	50 %	218437247
4611	NC_011729	TCTTT	2	10	266606	266615	0 %	80 %	0 %	20 %	218437247
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4613	NC_011729	ACTCC	2	10	266629	266638	20 %	20 %	0 %	60 %	218437247
4614	NC_011729	TCT	2	6	266648	266653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218437247
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4619	NC_011729	GA	3	6	266947	266952	50 %	0 %	50 %	0 %	218437247
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