MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 chromosome

Total Repeats: 81742

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011726	GTT	2	6	193721	193726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245086
3502	NC_011726	CTT	2	6	193748	193753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245086
3503	NC_011726	TAAA	2	8	193863	193870	75 %	25 %	0 %	0 %	218245086
3504	NC_011726	AAAG	2	8	193876	193883	75 %	0 %	25 %	0 %	218245086
3505	NC_011726	G	6	6	193908	193913	0 %	0 %	100 %	0 %	218245086
3506	NC_011726	TTAA	2	8	193936	193943	50 %	50 %	0 %	0 %	218245086
3507	NC_011726	CTA	2	6	194024	194029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245086
3508	NC_011726	CTT	2	6	194078	194083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245086
3509	NC_011726	A	7	7	194098	194104	100 %	0 %	0 %	0 %	218245086
3510	NC_011726	AGATG	2	10	194361	194370	40 %	20 %	40 %	0 %	218245087
3511	NC_011726	T	7	7	194474	194480	0 %	100 %	0 %	0 %	218245087
3512	NC_011726	TCT	2	6	194482	194487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245087
3513	NC_011726	ATC	2	6	194492	194497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245087
3514	NC_011726	A	6	6	194521	194526	100 %	0 %	0 %	0 %	218245087
3515	NC_011726	GAA	2	6	194548	194553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245087
3516	NC_011726	ATT	2	6	194573	194578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245087
3517	NC_011726	ATT	2	6	194608	194613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245087
3518	NC_011726	TGA	2	6	194628	194633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245087
3519	NC_011726	AC	3	6	194694	194699	50 %	0 %	0 %	50 %	218245087
3520	NC_011726	GTTT	2	8	194841	194848	0 %	75 %	25 %	0 %	218245087
3521	NC_011726	TTA	2	6	194849	194854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245087
3522	NC_011726	AGA	2	6	194880	194885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245087
3523	NC_011726	ACC	2	6	195022	195027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218245087
3524	NC_011726	GCC	2	6	195083	195088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218245087
3525	NC_011726	G	7	7	195181	195187	0 %	0 %	100 %	0 %	218245087
3526	NC_011726	ATA	2	6	195215	195220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245087
3527	NC_011726	TGC	2	6	195237	195242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245087
3528	NC_011726	TTATT	2	10	195327	195336	20 %	80 %	0 %	0 %	218245087
3529	NC_011726	TAT	2	6	195420	195425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245087
3530	NC_011726	CCTC	2	8	195463	195470	0 %	25 %	0 %	75 %	218245087
3531	NC_011726	G	6	6	195528	195533	0 %	0 %	100 %	0 %	218245087
3532	NC_011726	TCGGT	2	10	195536	195545	0 %	40 %	40 %	20 %	218245087
3533	NC_011726	GGT	2	6	195793	195798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245088
3534	NC_011726	G	6	6	195821	195826	0 %	0 %	100 %	0 %	218245088
3535	NC_011726	GAA	2	6	195878	195883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245088
3536	NC_011726	GGA	2	6	195934	195939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218245088
3537	NC_011726	GGT	2	6	195961	195966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245088
3538	NC_011726	AAG	2	6	196011	196016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245088
3539	NC_011726	CCG	2	6	196045	196050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218245088
3540	NC_011726	GAA	2	6	196091	196096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245088
3541	NC_011726	A	6	6	196113	196118	100 %	0 %	0 %	0 %	218245088
3542	NC_011726	ATT	2	6	196159	196164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245088
3543	NC_011726	GTC	2	6	196167	196172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245088
3544	NC_011726	ATC	2	6	196185	196190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245088
3545	NC_011726	AGT	2	6	196214	196219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245088
3546	NC_011726	GCA	3	9	196238	196246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245088
3547	NC_011726	AGA	2	6	196291	196296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218245088
3548	NC_011726	CAA	2	6	196343	196348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245088
3549	NC_011726	ACTT	2	8	196362	196369	25 %	50 %	0 %	25 %	218245088
3550	NC_011726	ATT	2	6	196376	196381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245088
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3552	NC_011726	A	6	6	196535	196540	100 %	0 %	0 %	0 %	218245088
3553	NC_011726	CTT	4	12	196639	196650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245089
3554	NC_011726	TCA	2	6	196696	196701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245089
3555	NC_011726	GTA	2	6	196707	196712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218245089
3556	NC_011726	TACC	2	8	196774	196781	25 %	25 %	0 %	50 %	218245089
3557	NC_011726	GTT	2	6	196803	196808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245089
3558	NC_011726	C	6	6	196834	196839	0 %	0 %	0 %	100 %	218245089
3559	NC_011726	TTG	2	6	196852	196857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245089
3560	NC_011726	CAATTA	2	12	196875	196886	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	218245089
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3564	NC_011726	ATT	2	6	197057	197062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218245089
3565	NC_011726	ACA	2	6	197074	197079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245089
3566	NC_011726	ATA	2	6	197083	197088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245089
3567	NC_011726	A	7	7	197122	197128	100 %	0 %	0 %	0 %	218245089
3568	NC_011726	T	6	6	197154	197159	0 %	100 %	0 %	0 %	218245089
3569	NC_011726	ATTG	2	8	197406	197413	25 %	50 %	25 %	0 %	218245090
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3571	NC_011726	CAAT	2	8	197600	197607	50 %	25 %	0 %	25 %	218245090
3572	NC_011726	TTGTT	2	10	197617	197626	0 %	80 %	20 %	0 %	218245090
3573	NC_011726	CAT	2	6	197676	197681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245090
3574	NC_011726	GTTTC	2	10	197901	197910	0 %	60 %	20 %	20 %	218245091
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3576	NC_011726	A	7	7	197935	197941	100 %	0 %	0 %	0 %	218245091
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3579	NC_011726	TTCGG	2	10	198113	198122	0 %	40 %	40 %	20 %	218245091
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3583	NC_011726	C	7	7	198285	198291	0 %	0 %	0 %	100 %	218245091
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3588	NC_011726	GTCG	2	8	198539	198546	0 %	25 %	50 %	25 %	218245091
3589	NC_011726	TC	3	6	198573	198578	0 %	50 %	0 %	50 %	218245091
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3593	NC_011726	TTG	2	6	198736	198741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218245091
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3595	NC_011726	T	10	10	198841	198850	0 %	100 %	0 %	0 %	218245092
3596	NC_011726	TCT	2	6	198853	198858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245092
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3603	NC_011726	TAAG	2	8	199133	199140	50 %	25 %	25 %	0 %	218245093
3604	NC_011726	C	6	6	199156	199161	0 %	0 %	0 %	100 %	218245093
3605	NC_011726	GCT	2	6	199179	199184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245093
3606	NC_011726	A	6	6	199191	199196	100 %	0 %	0 %	0 %	218245093
3607	NC_011726	GAC	2	6	199216	199221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245093
3608	NC_011726	CTC	2	6	199252	199257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218245093
3609	NC_011726	GTG	2	6	199290	199295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218245093
3610	NC_011726	TAA	2	6	199298	199303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245093
3611	NC_011726	ATC	2	6	199329	199334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245093
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3613	NC_011726	AAC	2	6	199410	199415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218245093
3614	NC_011726	CCA	2	6	199434	199439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218245093
3615	NC_011726	ACT	2	6	199586	199591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218245093
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3619	NC_011726	GGGA	2	8	199795	199802	25 %	0 %	75 %	0 %	218245093
3620	NC_011726	ATA	2	6	199807	199812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218245093
3621	NC_011726	CGG	2	6	199822	199827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218245093
3622	NC_011726	CTAC	2	8	199857	199864	25 %	25 %	0 %	50 %	218245093
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3992	NC_011726	GA	3	6	221923	221928	50 %	0 %	50 %	0 %	218245118
3993	NC_011726	ATCACC	2	12	222129	222140	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	218245119
3994	NC_011726	TCG	2	6	222149	222154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218245119
3995	NC_011726	CA	3	6	222172	222177	50 %	0 %	0 %	50 %	218245119
3996	NC_011726	T	7	7	222178	222184	0 %	100 %	0 %	0 %	218245119
3997	NC_011726	CTT	2	6	222326	222331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245120
3998	NC_011726	TTC	2	6	222352	222357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218245120
3999	NC_011726	ACG	2	6	222425	222430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218245120
4000	NC_011726	TTCC	2	8	222517	222524	0 %	50 %	0 %	50 %	218245120

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